EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista6956[chr10:29977181-29977518]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista6956[chr10:29977181-29977518]
Back to top
Tissue distribution of vista6956
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista6956[chr10:29977181-29977518]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr10 29977180 29977193 SMAD2 JASPAR yes 21068015
chr10 29977180 29977193 SMAD2 JASPAR yes 126339233
chr10 29977184 29977188 NFE TRANSFAC yes 21068016
chr10 29977184 29977188 NFE TRANSFAC yes 126339234
chr10 29977187 29977202 TFAP2A JASPAR yes 21068017
chr10 29977187 29977202 TFAP2C JASPAR yes 21068018
chr10 29977187 29977202 TFAP2A JASPAR yes 126339235
chr10 29977187 29977202 TFAP2C JASPAR yes 126339236
chr10 29977189 29977202 TFAP2A JASPAR yes 21068019
chr10 29977189 29977202 TFAP2B JASPAR yes 21068020
chr10 29977189 29977202 TFAP2C JASPAR yes 21068021
chr10 29977189 29977202 TFAP2A JASPAR yes 126339237
chr10 29977189 29977202 TFAP2B JASPAR yes 126339238
chr10 29977189 29977202 TFAP2C JASPAR yes 126339239
chr10 29977189 29977204 TFAP2A JASPAR yes 21068022
chr10 29977189 29977204 TFAP2C JASPAR yes 21068023
chr10 29977189 29977204 TFAP2A JASPAR yes 126339240
chr10 29977189 29977204 TFAP2C JASPAR yes 126339241
chr10 29977192 29977203 EBF1 JASPAR yes 21068024
chr10 29977192 29977203 EBF1 JASPAR yes 126339242
chr10 29977200 29977212 PBX1 JASPAR yes 21068025
chr10 29977200 29977212 PBX1 JASPAR yes 126339243
chr10 29977207 29977213 YY1 JASPAR yes 21068026
chr10 29977207 29977213 YY1 JASPAR yes 126339244
chr10 29977218 29977229 EBF1 JASPAR yes 21068027
chr10 29977218 29977229 EBF1 JASPAR yes 126339245
chr10 29977242 29977256 XBP1 JASPAR yes 21068028
chr10 29977242 29977256 XBP1 JASPAR yes 126339246
chr10 29977243 29977257 CREB3 JASPAR yes 21068029
chr10 29977243 29977257 CREB3L1 JASPAR yes 21068030
chr10 29977243 29977257 CREB3 JASPAR yes 126339247
chr10 29977243 29977257 CREB3L1 JASPAR yes 126339248
chr10 29977248 29977253 ATF1 TRANSFAC yes 21068031
chr10 29977248 29977253 ATF1 TRANSFAC yes 126339249
chr10 29977253 29977268 HNF4G JASPAR yes 21068032
chr10 29977253 29977268 HNF4G JASPAR yes 126339250
chr10 29977254 29977268 NR2F1 JASPAR yes 21068033
chr10 29977254 29977268 RXRB JASPAR yes 21068034
chr10 29977254 29977268 RXRG JASPAR yes 21068035
chr10 29977254 29977268 NR2F1 JASPAR yes 126339251
chr10 29977254 29977268 RXRB JASPAR yes 126339252
chr10 29977254 29977268 RXRG JASPAR yes 126339253
chr10 29977254 29977269 HNF4A JASPAR yes 21068036
chr10 29977254 29977269 HNF4A JASPAR yes 126339254
chr10 29977257 29977277 ESR1 JASPAR yes 21068037
chr10 29977257 29977277 ESR1 JASPAR yes 126339255
chr10 29977259 29977270 ESRRA JASPAR yes 21068038
chr10 29977259 29977270 ESRRA JASPAR yes 126339256
chr10 29977259 29977272 NR2F1 JASPAR yes 21068039
chr10 29977259 29977272 NR2F1 JASPAR yes 126339257
chr10 29977260 29977278 ESR2 JASPAR yes 21068040
chr10 29977260 29977278 ESR2 JASPAR yes 126339258
chr10 29977260 29977280 PPARG JASPAR yes 21068041
chr10 29977260 29977280 PPARG JASPAR yes 126339259
chr10 29977261 29977269 NR4A2 JASPAR yes 21068042
chr10 29977261 29977269 NR4A2 JASPAR yes 126339260
chr10 29977262 29977277 ESR2 JASPAR yes 21068043
chr10 29977262 29977277 ESR2 JASPAR yes 126339261
chr10 29977263 29977267 ESR1 TRANSFAC yes 21068044
chr10 29977263 29977267 ESR1 TRANSFAC yes 126339262
chr10 29977276 29977287 USF1 JASPAR yes 21068045
chr10 29977276 29977287 USF2 JASPAR yes 21068046
chr10 29977276 29977287 USF1 JASPAR yes 126339263
chr10 29977276 29977287 USF2 JASPAR yes 126339264
chr10 29977304 29977316 INSM1 JASPAR yes 21068047
chr10 29977304 29977316 INSM1 JASPAR yes 126339265
chr10 29977310 29977314 LFA1 TRANSFAC yes 21068048
chr10 29977310 29977314 LFA1 TRANSFAC yes 126339266
chr10 29977351 29977356 H4TF1 TRANSFAC yes 21068049
chr10 29977351 29977356 H4TF1 TRANSFAC yes 126339267
chr10 29977366 29977387 IRF1 JASPAR yes 21068050
chr10 29977366 29977387 IRF1 JASPAR yes 126339268
chr10 29977375 29977381 LEF1 TRANSFAC yes 21068051
chr10 29977375 29977381 SOX10 JASPAR yes 21068052
chr10 29977375 29977381 LEF1 TRANSFAC yes 126339269
chr10 29977375 29977381 SOX10 JASPAR yes 126339270
chr10 29977381 29977385 YY1 TRANSFAC yes 21068053
chr10 29977381 29977385 YY1 TRANSFAC yes 126339271
chr10 29977385 29977388 MYB TRANSFAC yes 21068054
chr10 29977385 29977388 MYB TRANSFAC yes 126339272
chr10 29977405 29977420 FOXA1 JASPAR yes 21068055
chr10 29977405 29977420 FOXA1 JASPAR yes 126339273
chr10 29977409 29977413 YY1 TRANSFAC yes 21068056
chr10 29977409 29977413 YY1 TRANSFAC yes 126339274
chr10 29977409 29977420 FOXA1 JASPAR yes 21068057
chr10 29977409 29977420 FOXA1 JASPAR yes 126339275
chr10 29977421 29977427 NFIC JASPAR yes 21068058
chr10 29977421 29977427 NFIC JASPAR yes 126339276
chr10 29977453 29977459 TCF4 TRANSFAC yes 21068059
chr10 29977453 29977459 TCF4 TRANSFAC yes 126339277
chr10 29977456 29977477 IRF1 JASPAR yes 21068060
chr10 29977456 29977477 IRF1 JASPAR yes 126339278
chr10 29977458 29977465 SPIB JASPAR yes 21068061
chr10 29977458 29977465 SPIB JASPAR yes 126339279
chr10 29977500 29977511 FLI1 JASPAR yes 21068062
chr10 29977500 29977511 FLI1 JASPAR yes 126339280
chr10 29977500 29977513 ELF3 JASPAR yes 21068063
chr10 29977500 29977513 ELF3 JASPAR yes 126339281
chr10 29977501 29977512 ELF5 JASPAR yes 21068064
chr10 29977501 29977512 ELF5 JASPAR yes 126339282
chr10 29977501 29977514 ELF1 JASPAR yes 21068065
chr10 29977501 29977514 ELF1 JASPAR yes 126339283
chr10 29977501 29977515 SPI1 JASPAR yes 21068066
chr10 29977501 29977515 SPIC JASPAR yes 21068067
chr10 29977501 29977515 SPI1 JASPAR yes 126339284
chr10 29977501 29977515 SPIC JASPAR yes 126339285
chr10 29977506 29977517 FOXP2 JASPAR yes 21068068
chr10 29977506 29977517 FOXP2 JASPAR yes 126339286
chr10 29977507 29977515 FOXD1 JASPAR yes 21068069
chr10 29977507 29977515 FOXO3 JASPAR yes 21068070
chr10 29977507 29977515 FOXD1 JASPAR yes 126339287
chr10 29977507 29977515 FOXO3 JASPAR yes 126339288
chr10 29977508 29977515 FOXD2 JASPAR yes 21068071
chr10 29977508 29977515 FOXI1 JASPAR yes 21068072
chr10 29977508 29977515 FOXL1 JASPAR yes 21068073
chr10 29977508 29977515 FOXO4 JASPAR yes 21068074
chr10 29977508 29977515 FOXO6 JASPAR yes 21068075
chr10 29977508 29977515 FOXP3 JASPAR yes 21068076
chr10 29977508 29977515 FOXD2 JASPAR yes 126339289
chr10 29977508 29977515 FOXI1 JASPAR yes 126339290
chr10 29977508 29977515 FOXL1 JASPAR yes 126339291
chr10 29977508 29977515 FOXO4 JASPAR yes 126339292
chr10 29977508 29977515 FOXO6 JASPAR yes 126339293
chr10 29977508 29977515 FOXP3 JASPAR yes 126339294
chr10 29977508 29977516 FOXO3 JASPAR yes 21068077
chr10 29977508 29977516 FOXO3 JASPAR yes 126339295
chr10 29977517 29977532 NR2C2 JASPAR yes 21068078
chr10 29977517 29977532 NR2C2 JASPAR yes 126339296
SNP sites on vista6956[chr10:29977181-29977518]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr10 29977265 rs569446331 G GTCTGA
ESR1 ESR2 ESRRA HNF4A HNF4G NR2F1 NR4A2 PPARG RXRB RXRG
1297909
chr10 29977344 rs7901774 C T no 1297910
chr10 29977363 rs144976510 C T no 1297911
chr10 29977431 rs4749479 G A no 1297912
Genes possibly regulated by vista6956[chr10:29977181-29977518]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr10 29746267 30025710 - SVIL ENSG00000197321.10 30025710 0.9 0.99 9710 51808
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista6956[chr10:29977181-29977518]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results