EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista912[chr1:27762936-27763307]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista912[chr1:27762936-27763307]
Back to top
Tissue distribution of vista912
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista912[chr1:27762936-27763307]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 27762947 27762958 NFE2L2 JASPAR yes 27693579
chr1 27762947 27762958 NFE2L2 JASPAR yes 118257606
chr1 27762963 27762967 NFE TRANSFAC yes 27693580
chr1 27762963 27762967 NFE TRANSFAC yes 118257607
chr1 27762964 27762985 IRF1 JASPAR yes 27693581
chr1 27762964 27762985 IRF1 JASPAR yes 118257608
chr1 27762974 27762995 IRF1 JASPAR yes 27693582
chr1 27762974 27762995 IRF1 JASPAR yes 118257609
chr1 27762979 27763000 IRF1 JASPAR yes 27693583
chr1 27762979 27763000 IRF1 JASPAR yes 118257610
chr1 27762980 27762995 FOXP1 JASPAR yes 27693584
chr1 27762980 27762995 FOXP1 JASPAR yes 118257611
chr1 27762981 27763002 IRF1 JASPAR yes 27693585
chr1 27762981 27763002 IRF1 JASPAR yes 118257612
chr1 27762982 27762996 IRF7 JASPAR yes 27693586
chr1 27762982 27762996 IRF7 JASPAR yes 118257613
chr1 27762985 27763006 IRF1 JASPAR yes 27693587
chr1 27762985 27763006 IRF1 JASPAR yes 118257614
chr1 27762988 27763002 IRF7 JASPAR yes 27693588
chr1 27762988 27763002 IRF7 JASPAR yes 118257615
chr1 27762995 27763008 POU2F2 JASPAR yes 27693589
chr1 27762995 27763008 POU2F2 JASPAR yes 118257616
chr1 27763003 27763007 YY1 TRANSFAC yes 27693590
chr1 27763003 27763007 YY1 TRANSFAC yes 118257617
chr1 27763026 27763031 MYC TRANSFAC yes 27693591
chr1 27763026 27763031 MYC TRANSFAC yes 118257618
chr1 27763046 27763050 YY1 TRANSFAC yes 27693592
chr1 27763046 27763050 YY1 TRANSFAC yes 118257619
chr1 27763056 27763068 IRF1 JASPAR yes 27693593
chr1 27763056 27763068 IRF1 JASPAR yes 118257620
chr1 27763065 27763081 SRF JASPAR yes 27693594
chr1 27763065 27763081 SRF JASPAR yes 118257621
chr1 27763144 27763154 POU6F2 JASPAR yes 27693595
chr1 27763144 27763154 POU6F2 JASPAR yes 118257622
chr1 27763145 27763155 HOXA2 JASPAR yes 27693596
chr1 27763145 27763155 MEOX1 JASPAR yes 27693597
chr1 27763145 27763155 HOXA2 JASPAR yes 118257623
chr1 27763145 27763155 MEOX1 JASPAR yes 118257624
chr1 27763148 27763152 YY1 TRANSFAC yes 27693598
chr1 27763148 27763152 YY1 TRANSFAC yes 118257625
chr1 27763166 27763177 ELF5 JASPAR yes 27693599
chr1 27763166 27763177 ELF5 JASPAR yes 118257626
chr1 27763168 27763173 ETS2 TRANSFAC yes 27693600
chr1 27763168 27763173 ETS2 TRANSFAC yes 118257627
chr1 27763178 27763188 POU6F2 JASPAR yes 27693601
chr1 27763178 27763188 POU6F2 JASPAR yes 118257628
chr1 27763182 27763186 YY1 TRANSFAC yes 27693602
chr1 27763182 27763186 YY1 TRANSFAC yes 118257629
chr1 27763185 27763189 TEAD2 TRANSFAC yes 27693603
chr1 27763185 27763189 TEAD2 TRANSFAC yes 118257630
chr1 27763195 27763207 ZBTB7A JASPAR yes 27693604
chr1 27763195 27763207 ZBTB7A JASPAR yes 118257631
chr1 27763196 27763208 ZBTB7B JASPAR yes 27693605
chr1 27763196 27763208 ZBTB7C JASPAR yes 27693606
chr1 27763196 27763208 ZBTB7B JASPAR yes 118257632
chr1 27763196 27763208 ZBTB7C JASPAR yes 118257633
chr1 27763204 27763215 ELK4 JASPAR yes 27693607
chr1 27763204 27763215 FLI1 JASPAR yes 27693608
chr1 27763204 27763215 ELK4 JASPAR yes 118257634
chr1 27763204 27763215 FLI1 JASPAR yes 118257635
chr1 27763204 27763217 ELF3 JASPAR yes 27693609
chr1 27763204 27763217 ELF3 JASPAR yes 118257636
chr1 27763205 27763215 ELK1 JASPAR yes 27693610
chr1 27763205 27763215 ELK3 JASPAR yes 27693611
chr1 27763205 27763215 ERF JASPAR yes 27693612
chr1 27763205 27763215 ERG JASPAR yes 27693613
chr1 27763205 27763215 ETS1 JASPAR yes 27693614
chr1 27763205 27763215 ETV1 JASPAR yes 27693615
chr1 27763205 27763215 ETV3 JASPAR yes 27693616
chr1 27763205 27763215 ETV4 JASPAR yes 27693617
chr1 27763205 27763215 ETV6 JASPAR yes 27693618
chr1 27763205 27763215 FEV JASPAR yes 27693619
chr1 27763205 27763215 FLI1 JASPAR yes 27693620
chr1 27763205 27763215 GABPA JASPAR yes 27693621
chr1 27763205 27763215 ELK1 JASPAR yes 118257637
chr1 27763205 27763215 ELK3 JASPAR yes 118257638
chr1 27763205 27763215 ERF JASPAR yes 118257639
chr1 27763205 27763215 ERG JASPAR yes 118257640
chr1 27763205 27763215 ETS1 JASPAR yes 118257641
chr1 27763205 27763215 ETV1 JASPAR yes 118257642
chr1 27763205 27763215 ETV3 JASPAR yes 118257643
chr1 27763205 27763215 ETV4 JASPAR yes 118257644
chr1 27763205 27763215 ETV6 JASPAR yes 118257645
chr1 27763205 27763215 FEV JASPAR yes 118257646
chr1 27763205 27763215 FLI1 JASPAR yes 118257647
chr1 27763205 27763215 GABPA JASPAR yes 118257648
chr1 27763205 27763216 ELF5 JASPAR yes 27693622
chr1 27763205 27763216 ETV2 JASPAR yes 27693623
chr1 27763205 27763216 SPDEF JASPAR yes 27693624
chr1 27763205 27763216 ELF5 JASPAR yes 118257649
chr1 27763205 27763216 ETV2 JASPAR yes 118257650
chr1 27763205 27763216 SPDEF JASPAR yes 118257651
chr1 27763205 27763217 EHF JASPAR yes 27693625
chr1 27763205 27763217 ELF1 JASPAR yes 27693626
chr1 27763205 27763217 ELF4 JASPAR yes 27693627
chr1 27763205 27763217 EHF JASPAR yes 118257652
chr1 27763205 27763217 ELF1 JASPAR yes 118257653
chr1 27763205 27763217 ELF4 JASPAR yes 118257654
chr1 27763205 27763218 ELF1 JASPAR yes 27693628
chr1 27763205 27763218 ELF1 JASPAR yes 118257655
chr1 27763206 27763213 SPI1 JASPAR yes 27693629
chr1 27763206 27763213 SPI1 JASPAR yes 118257656
chr1 27763206 27763214 EHF JASPAR yes 27693630
chr1 27763206 27763214 FEV JASPAR yes 27693631
chr1 27763206 27763214 EHF JASPAR yes 118257657
chr1 27763206 27763214 FEV JASPAR yes 118257658
chr1 27763225 27763230 SP1 TRANSFAC yes 27693632
chr1 27763225 27763230 SP1 TRANSFAC yes 118257659
chr1 27763238 27763241 MYB TRANSFAC yes 27693633
chr1 27763238 27763241 MYB TRANSFAC yes 118257660
chr1 27763238 27763250 FOXI1 JASPAR yes 27693634
chr1 27763238 27763250 FOXI1 JASPAR yes 118257661
chr1 27763245 27763249 TEAD2 TRANSFAC yes 27693635
chr1 27763245 27763249 TEAD2 TRANSFAC yes 118257662
chr1 27763246 27763261 RUNX2 JASPAR yes 27693636
chr1 27763246 27763261 RUNX2 JASPAR yes 118257663
chr1 27763247 27763250 MYB TRANSFAC yes 27693637
chr1 27763247 27763250 MYB TRANSFAC yes 118257664
chr1 27763271 27763276 ETS2 TRANSFAC yes 27693638
chr1 27763271 27763276 ETS2 TRANSFAC yes 118257665
chr1 27763292 27763296 ESR1 TRANSFAC yes 27693639
chr1 27763292 27763296 ESR1 TRANSFAC yes 118257666
chr1 27763298 27763307 SRY JASPAR yes 27693640
chr1 27763298 27763307 SRY JASPAR yes 118257667
SNP sites on vista912[chr1:27762936-27763307]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 27762968 rs72653300 C T
IRF1
185765
chr1 27763036 rs74224110 A G no 185766
chr1 27763060 rs139685546 A G
IRF1
185767
Genes possibly regulated by vista912[chr1:27762936-27763307]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 27668513 27680421 + SYTL1 ENSG00000142765.13 27668513 0.84 1.0 387 5577
chr1 27681675 27693383 - MAP3K6 ENSG00000142733.10 27693383 0.78 1.0 388 30447
chr1 27695603 27701315 - FCN3 ENSG00000142748.8 27701315 0.99 1.0 389 38379
chr1 27705666 27709870 - CD164L2 ENSG00000174950.6 27709870 0.92 1.0 390 46934
chr1 27719148 27722318 + GPR3 ENSG00000181773.6 27719148 0.8 1.0 391 56212
chr1 27730730 27816669 - WASF2 ENSG00000158195.6 27816669 0.61 1.0 392 46638
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista912[chr1:27762936-27763307]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results