Enhancers that have rs116168180[chr1:112918955]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr1 112916465 112921135 enh108362
chr1 112918897 112919196 vista2975

Transcript factors that have rs116168180[chr1:112918955]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr1 112918946 112918956 HOXA13 JASPAR yes 31568571
chr1 112918946 112918956 HOXB13 JASPAR yes 31568572
chr1 112918946 112918956 HOXD13 JASPAR yes 31568573
chr1 112918946 112918956 HOXA13 JASPAR yes 118352883
chr1 112918946 112918956 HOXB13 JASPAR yes 118352884
chr1 112918946 112918956 HOXD13 JASPAR yes 118352885
chr1 112918947 112918957 ALX3 JASPAR yes 31568574
chr1 112918947 112918957 ESX1 JASPAR yes 31568575
chr1 112918947 112918957 GSX1 JASPAR yes 31568576
chr1 112918947 112918957 GSX2 JASPAR yes 31568577
chr1 112918947 112918957 LBX2 JASPAR yes 31568578
chr1 112918947 112918957 MIXL1 JASPAR yes 31568579
chr1 112918947 112918957 RAX JASPAR yes 31568580
chr1 112918947 112918957 ALX3 JASPAR yes 118352886
chr1 112918947 112918957 ESX1 JASPAR yes 118352887
chr1 112918947 112918957 GSX1 JASPAR yes 118352888
chr1 112918947 112918957 GSX2 JASPAR yes 118352889
chr1 112918947 112918957 LBX2 JASPAR yes 118352890
chr1 112918947 112918957 MIXL1 JASPAR yes 118352891
chr1 112918947 112918957 RAX JASPAR yes 118352892
chr1 112918948 112918956 BARX1 JASPAR yes 31568581
chr1 112918948 112918956 BSX JASPAR yes 31568582
chr1 112918948 112918956 DLX6 JASPAR yes 31568583
chr1 112918948 112918956 ISX JASPAR yes 31568584
chr1 112918948 112918956 LBX1 JASPAR yes 31568585
chr1 112918948 112918956 LHX9 JASPAR yes 31568586
chr1 112918948 112918956 MSX1 JASPAR yes 31568587
chr1 112918948 112918956 MSX2 JASPAR yes 31568588
chr1 112918948 112918956 NKX6-2 JASPAR yes 31568589
chr1 112918948 112918956 PRRX1 JASPAR yes 31568590
chr1 112918948 112918956 RAX2 JASPAR yes 31568591
chr1 112918948 112918956 SHOX JASPAR yes 31568592
chr1 112918948 112918956 UNCX JASPAR yes 31568593
chr1 112918948 112918956 BARX1 JASPAR yes 118352893
chr1 112918948 112918956 BSX JASPAR yes 118352894
chr1 112918948 112918956 DLX6 JASPAR yes 118352895
chr1 112918948 112918956 ISX JASPAR yes 118352896
chr1 112918948 112918956 LBX1 JASPAR yes 118352897
chr1 112918948 112918956 LHX9 JASPAR yes 118352898
chr1 112918948 112918956 MSX1 JASPAR yes 118352899
chr1 112918948 112918956 MSX2 JASPAR yes 118352900
chr1 112918948 112918956 NKX6-2 JASPAR yes 118352901
chr1 112918948 112918956 PRRX1 JASPAR yes 118352902
chr1 112918948 112918956 RAX2 JASPAR yes 118352903
chr1 112918948 112918956 SHOX JASPAR yes 118352904
chr1 112918948 112918956 UNCX JASPAR yes 118352905
chr1 112918953 112918968 JUND JASPAR yes 31568594
chr1 112918953 112918968 JUND JASPAR yes 118352906

Genes associated with rs116168180[chr1:112918955], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More