EnhancerDB
  1. Home
  2. SNP
  3. rs340135[chr19:6737239]
Enhancers that have rs340135[chr19:6737239]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
Transcript factors that have rs340135[chr19:6737239]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr19 6735077 6741855 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379623
chr19 6735185 6739335 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379624
chr19 6735269 6739626 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108379625
chr19 6735372 6741632 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379626
chr19 6735401 6741595 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379627
chr19 6735533 6741947 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379628
chr19 6735535 6741841 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379629
chr19 6735541 6741625 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379630
chr19 6735628 6739627 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379631
chr19 6735660 6741865 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379632
chr19 6735688 6739696 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379633
chr19 6735761 6741717 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379634
chr19 6735763 6739668 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379635
chr19 6735883 6739183 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379636
chr19 6735900 6738857 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379637
chr19 6735911 6739686 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379638
chr19 6735919 6739570 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379639
chr19 6735925 6740661 STAT3 GTRD no Blood (OCI-LY7) 108379640
chr19 6735943 6739667 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108379641
chr19 6735948 6739606 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379642
chr19 6735952 6739606 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379643
chr19 6735963 6741289 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379644
chr19 6736013 6738975 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379645
chr19 6736013 6739669 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379646
chr19 6736045 6739081 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379647
chr19 6736045 6739573 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379648
chr19 6736050 6738913 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379649
chr19 6736050 6739586 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379650
chr19 6736053 6741322 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379651
chr19 6736056 6739632 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379652
chr19 6736073 6739502 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379653
chr19 6736073 6739654 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379654
chr19 6736098 6739743 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379655
chr19 6736100 6739181 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108379656
chr19 6736104 6741505 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379657
chr19 6736104 6741539 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379658
chr19 6736109 6739612 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379659
chr19 6736116 6738999 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379660
chr19 6736124 6739347 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108379661
chr19 6736132 6741179 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379662
chr19 6736134 6738853 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379663
chr19 6736135 6739087 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379664
chr19 6736136 6738912 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379665
chr19 6736152 6741093 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379666
chr19 6736160 6741043 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379667
chr19 6736166 6738864 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108379668
chr19 6736166 6738928 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108379669
chr19 6736169 6739833 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379670
chr19 6736173 6738838 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379671
chr19 6736178 6741272 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108379672
chr19 6736180 6741135 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379673
chr19 6736185 6739276 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379674
chr19 6736187 6738923 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108379675
chr19 6736196 6739076 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379676
chr19 6736199 6739116 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108379677
chr19 6736204 6738933 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379678
chr19 6736243 6741283 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379679
chr19 6736250 6739003 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379680
chr19 6736252 6741178 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379681
chr19 6736252 6741498 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379682
chr19 6736258 6738917 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379683
chr19 6736265 6741226 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108379684
chr19 6736267 6739057 TEF1 GTRD no Bone (Osteoblast) 108379685
chr19 6736280 6739637 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379686
chr19 6736292 6739627 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379687
chr19 6736296 6739334 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379688
chr19 6736296 6739572 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379689
chr19 6736308 6738973 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379690
chr19 6736315 6739628 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379691
chr19 6736335 6738916 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379692
chr19 6736342 6739223 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379693
chr19 6736350 6739262 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379694
chr19 6736358 6738871 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379695
chr19 6736367 6739060 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108379696
chr19 6736392 6739637 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379697
chr19 6736399 6738849 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379698
chr19 6736413 6738876 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379699
chr19 6736415 6739077 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379700
chr19 6736423 6738871 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379701
chr19 6736509 6738888 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379702
chr19 6736953 6738991 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379703
chr19 6736975 6738952 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379704
chr19 6737008 6739033 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108379705
chr19 6737010 6738961 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379706
chr19 6737014 6738849 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379707
chr19 6737043 6738964 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379708
chr19 6737050 6738806 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379709
chr19 6737061 6739602 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379710
chr19 6737062 6739626 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108379711
chr19 6737080 6738887 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379712
chr19 6737085 6738878 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108379713
chr19 6737106 6738873 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108379714
chr19 6737133 6738930 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379715
chr19 6737149 6738814 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108379716
chr19 6737151 6738999 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108379717
chr19 6737154 6739350 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108379718
chr19 6737157 6739747 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379719
chr19 6737206 6738855 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379720
chr19 6737207 6738885 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108379721
chr19 6737209 6738842 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108379722
chr19 6737212 6738908 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108379723
Genes associated with rs340135[chr19:6737239], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr19 6729925 6737614 - GPR108 ENSG00000125734.9 6737614 0 Esophagus 4.74055e-28 16897
chr19 6729925 6737614 - GPR108 ENSG00000125734.9 6737614 0 Esophagus 6.0952e-45 16897
chr19 6729925 6737614 - GPR108 ENSG00000125734.9 6737614 0 Heart 2.31348e-30 16897
chr19 6729925 6737614 - GPR108 ENSG00000125734.9 6737614 0 Heart 3.15091e-32 16897
chr19 6729925 6737614 - GPR108 ENSG00000125734.9 6737614 0 Pancreas 4.67987e-11 16897
chr19 6729925 6737614 - GPR108 ENSG00000125734.9 6737614 0 Ovary 0.0399416 16897
chr19 6729925 6737614 - GPR108 ENSG00000125734.9 6737614 0 Thyroid 1.62913e-26 16897
chr19 6729925 6737614 - GPR108 ENSG00000125734.9 6737614 0 Liver 6.72148e-18 16897
chr19 6729925 6737614 - GPR108 ENSG00000125734.9 6737614 0 Lung 3.06065e-28 16897
chr19 6729925 6737614 - GPR108 ENSG00000125734.9 6737614 0 Adrenal 4.02034e-17 16897