EnhancerDB
  1. Home
  2. SNP
  3. rs544559331[chr6:12679317]
Enhancers that have rs544559331[chr6:12679317]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr6 12677645 12681795 enh55644
Large Intestine
Transcript factors that have rs544559331[chr6:12679317]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr6 12679301 12679317 POU4F3 JASPAR yes 99988485
chr6 12679305 12679321 POU4F2 JASPAR yes 99988488
chr6 12679305 12679321 POU4F3 JASPAR yes 99988489
chr6 12679307 12679321 POU4F1 JASPAR yes 99988492
chr6 12679307 12679322 HNF1A JASPAR yes 99988493
chr6 12679308 12679318 GSX1 JASPAR yes 99988494
chr6 12679308 12679318 GSX2 JASPAR yes 99988495
chr6 12679308 12679318 LHX2 JASPAR yes 99988496
chr6 12679308 12679318 LHX6 JASPAR yes 99988497
chr6 12679308 12679318 MNX1 JASPAR yes 99988498
chr6 12679308 12679318 NOTO JASPAR yes 99988499
chr6 12679308 12679318 POU6F1 JASPAR yes 99988500
chr6 12679308 12679318 RAX JASPAR yes 99988501
chr6 12679308 12679323 HNF1A JASPAR yes 99988502
chr6 12679309 12679317 ISX JASPAR yes 99988503
chr6 12679309 12679317 LMX1A JASPAR yes 99988504
chr6 12679309 12679317 LMX1B JASPAR yes 99988505
chr6 12679309 12679317 NKX6-1 JASPAR yes 99988506
chr6 12679309 12679317 NKX6-2 JASPAR yes 99988507
chr6 12679309 12679317 PRRX1 JASPAR yes 99988508
chr6 12679309 12679317 RAX2 JASPAR yes 99988509
chr6 12679309 12679317 SHOX JASPAR yes 99988510
chr6 12679309 12679317 UNCX JASPAR yes 99988511
chr6 12679309 12679317 VAX1 JASPAR yes 99988512
chr6 12679309 12679320 PHOX2A JASPAR yes 99988513
chr6 12679309 12679320 PROP1 JASPAR yes 99988514
chr6 12679309 12679323 POU4F1 JASPAR yes 99988515
chr6 12679309 12679325 POU4F2 JASPAR yes 99988516
chr6 12679309 12679325 POU4F3 JASPAR yes 99988517
chr6 12679310 12679320 PAX3 JASPAR yes 99988518
chr6 12679310 12679320 PAX7 JASPAR yes 99988519
chr6 12679310 12679321 PHOX2A JASPAR yes 99988520
chr6 12679310 12679321 PROP1 JASPAR yes 99988521
chr6 12679311 12679325 POU4F1 JASPAR yes 99988522
chr6 12679311 12679326 HNF1A JASPAR yes 99988523
chr6 12679312 12679322 GSX1 JASPAR yes 99988524
chr6 12679312 12679322 GSX2 JASPAR yes 99988525
chr6 12679312 12679322 LHX2 JASPAR yes 99988526
chr6 12679312 12679322 LHX6 JASPAR yes 99988527
chr6 12679312 12679322 MNX1 JASPAR yes 99988528
chr6 12679312 12679322 NOTO JASPAR yes 99988529
chr6 12679312 12679322 POU6F1 JASPAR yes 99988530
chr6 12679312 12679322 RAX JASPAR yes 99988531
chr6 12679312 12679327 HNF1A JASPAR yes 99988532
chr6 12679313 12679321 ISX JASPAR yes 99988533
chr6 12679313 12679321 LMX1A JASPAR yes 99988534
chr6 12679313 12679321 LMX1B JASPAR yes 99988535
chr6 12679313 12679321 NKX6-1 JASPAR yes 99988536
chr6 12679313 12679321 NKX6-2 JASPAR yes 99988537
chr6 12679313 12679321 PRRX1 JASPAR yes 99988538
chr6 12679313 12679321 RAX2 JASPAR yes 99988539
chr6 12679313 12679321 SHOX JASPAR yes 99988540
chr6 12679313 12679321 UNCX JASPAR yes 99988541
chr6 12679313 12679321 VAX1 JASPAR yes 99988542
chr6 12679313 12679324 PHOX2A JASPAR yes 99988543
chr6 12679313 12679324 PROP1 JASPAR yes 99988544
chr6 12679313 12679327 POU4F1 JASPAR yes 99988545
chr6 12679313 12679329 POU4F2 JASPAR yes 99988546
chr6 12679313 12679329 POU4F3 JASPAR yes 99988547
chr6 12679314 12679324 PAX3 JASPAR yes 99988548
chr6 12679314 12679324 PAX7 JASPAR yes 99988549
chr6 12679314 12679325 PHOX2A JASPAR yes 99988550
chr6 12679314 12679325 PROP1 JASPAR yes 99988551
chr6 12679315 12679329 POU4F1 JASPAR yes 99988552
chr6 12679315 12679330 HNF1A JASPAR yes 99988553
chr6 12679316 12679326 GSX1 JASPAR yes 99988554
chr6 12679316 12679326 GSX2 JASPAR yes 99988555
chr6 12679316 12679326 LHX2 JASPAR yes 99988556
chr6 12679316 12679326 LHX6 JASPAR yes 99988557
chr6 12679316 12679326 MNX1 JASPAR yes 99988558
chr6 12679316 12679326 NOTO JASPAR yes 99988559
chr6 12679316 12679326 POU6F1 JASPAR yes 99988560
chr6 12679316 12679326 RAX JASPAR yes 99988561
chr6 12679316 12679331 HNF1A JASPAR yes 99988562
chr6 12679317 12679325 ISX JASPAR yes 99988563
chr6 12679317 12679325 LMX1A JASPAR yes 99988564
chr6 12679317 12679325 LMX1B JASPAR yes 99988565
chr6 12679317 12679325 NKX6-1 JASPAR yes 99988566
chr6 12679317 12679325 NKX6-2 JASPAR yes 99988567
chr6 12679317 12679325 PRRX1 JASPAR yes 99988568
chr6 12679317 12679325 RAX2 JASPAR yes 99988569
chr6 12679317 12679325 SHOX JASPAR yes 99988570
chr6 12679317 12679325 UNCX JASPAR yes 99988571
chr6 12679317 12679325 VAX1 JASPAR yes 99988572
chr6 12679317 12679328 PHOX2A JASPAR yes 99988573
chr6 12679317 12679328 PROP1 JASPAR yes 99988574
chr6 12679317 12679331 POU4F1 JASPAR yes 99988575
chr6 12679317 12679333 POU4F2 JASPAR yes 99988576
chr6 12679317 12679333 POU4F3 JASPAR yes 99988577
Genes associated with rs544559331[chr6:12679317], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More