EnhancerDB
  1. Home
  2. SNP
  3. rs552561820[chr1:207025289]
Enhancers that have rs552561820[chr1:207025289]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr1 207025140 207025456 vista4811
VISTA
Transcript factors that have rs552561820[chr1:207025289]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr1 207017157 207027483 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21372925
chr1 207017157 207027483 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863903
chr1 207022977 207033275 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107863904
chr1 207022977 207033275 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107863905
chr1 207022977 207033275 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107863906
chr1 207022977 207033275 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107863907
chr1 207023061 207027472 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21373075
chr1 207023061 207027472 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863908
chr1 207023204 207026208 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863909
chr1 207023333 207026685 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863910
chr1 207023499 207026790 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863912
chr1 207023662 207026569 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863913
chr1 207023735 207025577 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863914
chr1 207023741 207025478 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863915
chr1 207023752 207025455 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863916
chr1 207023774 207026786 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863917
chr1 207023779 207027015 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863918
chr1 207023790 207025565 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863919
chr1 207023791 207025795 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863920
chr1 207023792 207025526 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863921
chr1 207023799 207025888 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863922
chr1 207023802 207025435 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863923
chr1 207023802 207026756 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863924
chr1 207023820 207025596 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863925
chr1 207023829 207025616 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863926
chr1 207023831 207025616 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863927
chr1 207023850 207025878 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863928
chr1 207023856 207026034 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863929
chr1 207023857 207025643 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863930
chr1 207023863 207025851 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863931
chr1 207023869 207025868 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863932
chr1 207023880 207025892 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863934
chr1 207023887 207025800 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863935
chr1 207023896 207025534 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863936
chr1 207023899 207026559 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863937
chr1 207023917 207025849 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863938
chr1 207023953 207025807 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863939
chr1 207023962 207025547 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863940
chr1 207023963 207025562 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863941
chr1 207023973 207025862 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863942
chr1 207023979 207026349 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863943
chr1 207023980 207025477 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863944
chr1 207024011 207025526 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863945
chr1 207024022 207025434 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863946
chr1 207024048 207025545 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863947
chr1 207024062 207025550 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863948
chr1 207024090 207026027 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863949
chr1 207024124 207025443 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863950
chr1 207024149 207025488 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863951
chr1 207024154 207025310 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863952
chr1 207024155 207025486 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863953
chr1 207024167 207025484 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863954
chr1 207024167 207025586 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863955
chr1 207024198 207025876 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863958
chr1 207024239 207025533 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863960
chr1 207024255 207028585 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107863961
chr1 207024271 207025535 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863962
chr1 207024281 207025478 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107863964
chr1 207024293 207026201 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863965
chr1 207024308 207029455 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107863966
chr1 207024452 207025448 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107863967
chr1 207024457 207026289 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863968
chr1 207024475 207026116 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107863969
chr1 207024633 207025478 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863970
chr1 207024701 207025839 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107863971
chr1 207024716 207027808 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107863972
chr1 207024726 207025364 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107863973
chr1 207024730 207025443 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107863974
chr1 207024755 207025552 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863975
chr1 207024779 207025456 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863976
chr1 207024795 207026211 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107863978
chr1 207024858 207025996 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863981
chr1 207024918 207025427 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863982
chr1 207024918 207026054 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107863983
chr1 207024965 207025618 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107863984
chr1 207024983 207027911 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107863985
chr1 207025030 207025947 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107863986
chr1 207025030 207026151 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107863987
chr1 207025032 207026690 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107863988
chr1 207025034 207026195 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863989
chr1 207025041 207026093 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863990
chr1 207025046 207027957 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107863991
chr1 207025053 207026365 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107863992
chr1 207025065 207026274 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107863993
chr1 207025070 207025991 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863994
chr1 207025072 207025412 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 107863995
chr1 207025077 207025882 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107863996
chr1 207025084 207025893 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107863997
chr1 207025085 207025967 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863998
chr1 207025089 207026128 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107863999
chr1 207025091 207026274 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864000
chr1 207025092 207025966 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864001
chr1 207025092 207029381 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864002
chr1 207025093 207026143 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864003
chr1 207025096 207026000 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864004
chr1 207025098 207026040 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864005
chr1 207025098 207026452 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864006
chr1 207025102 207028113 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864007
chr1 207025106 207025954 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864008
chr1 207025107 207025852 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864009
chr1 207025108 207026086 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864010
chr1 207025108 207026798 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864011
chr1 207025109 207025865 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864012
chr1 207025112 207026564 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864013
chr1 207025113 207026056 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864014
chr1 207025113 207028285 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864015
chr1 207025116 207025611 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864016
chr1 207025119 207025453 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864017
chr1 207025119 207026264 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864018
chr1 207025124 207026164 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864019
chr1 207025124 207029418 AR GTRD no Prostate (PC-3) 107864020
chr1 207025127 207026353 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864021
chr1 207025127 207026554 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864022
chr1 207025130 207026233 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864023
chr1 207025138 207025933 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864024
chr1 207025139 207026124 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864025
chr1 207025145 207025813 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107864026
chr1 207025145 207026118 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864027
chr1 207025148 207025931 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864028
chr1 207025149 207027345 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864029
chr1 207025151 207025464 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864030
chr1 207025152 207026103 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864031
chr1 207025153 207026187 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864032
chr1 207025166 207025574 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107864033
chr1 207025171 207025302 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 107864034
chr1 207025176 207025466 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 107864035
chr1 207025179 207026129 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864036
chr1 207025179 207026324 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864037
chr1 207025193 207025883 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864038
chr1 207025194 207027766 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107864039
chr1 207025198 207026033 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864040
chr1 207025199 207026033 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864041
chr1 207025209 207026072 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864042
chr1 207025212 207026088 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864043
chr1 207025220 207025931 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864044
chr1 207025231 207025902 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864045
chr1 207025234 207025965 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864046
chr1 207025234 207026000 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864047
chr1 207025249 207026192 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864048
chr1 207025266 207026051 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864049
chr1 207025269 207026049 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864050
chr1 207025286 207025298 BHLHE23 JASPAR yes 118444781
chr1 207025287 207025297 BHLHE22 JASPAR yes 118444782
chr1 207025287 207025297 NEUROD2 JASPAR yes 118444783
chr1 207025287 207025297 OLIG1 JASPAR yes 118444784
chr1 207025287 207025297 OLIG2 JASPAR yes 118444785
chr1 207025287 207025297 OLIG3 JASPAR yes 118444786
chr1 207025289 207025301 POU2F1 JASPAR yes 118444787
chr1 207025289 207025302 POU3F3 JASPAR yes 118444788
chr1 207025289 207025303 POU1F1 JASPAR yes 118444789
Genes associated with rs552561820[chr1:207025289], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More