Enhancers that have rs55647233[chr12:48815501]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr12 48811985 48816415 enh95448

Transcript factors that have rs55647233[chr12:48815501]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr12 48813268 48815996 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029255
chr12 48813286 48816261 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029256
chr12 48813311 48816785 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029257
chr12 48813376 48816971 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108029258
chr12 48813428 48816720 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029259
chr12 48813429 48816084 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029260
chr12 48813440 48815763 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029261
chr12 48813458 48816135 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029262
chr12 48813465 48815756 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029263
chr12 48813481 48815687 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029264
chr12 48813483 48816314 STAT3 GTRD no Blood (OCI-LY7) 108029265
chr12 48813501 48816057 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029266
chr12 48813512 48816027 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029267
chr12 48813538 48816560 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029268
chr12 48813590 48815886 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029269
chr12 48813598 48816774 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029270
chr12 48813607 48818787 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029272
chr12 48813609 48816184 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029273
chr12 48813626 48815828 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029274
chr12 48813656 48815684 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029276
chr12 48813692 48816934 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029277
chr12 48813697 48815602 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029278
chr12 48813702 48815676 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029279
chr12 48813722 48816013 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029280
chr12 48813723 48815636 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029281
chr12 48813731 48816036 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029282
chr12 48813743 48815879 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029283
chr12 48813752 48816191 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108029284
chr12 48813753 48815706 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029285
chr12 48813755 48815869 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029286
chr12 48813755 48815930 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029287
chr12 48813764 48816104 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029288
chr12 48813766 48816052 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029289
chr12 48813776 48817003 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108029290
chr12 48813780 48816095 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029291
chr12 48813790 48815628 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029292
chr12 48813790 48816098 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029293
chr12 48813799 48815690 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029294
chr12 48813800 48815886 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029295
chr12 48813808 48816339 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108029296
chr12 48813812 48816103 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108029297
chr12 48813819 48815757 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029299
chr12 48813820 48815777 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029300
chr12 48813824 48819707 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029301
chr12 48813835 48816014 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029302
chr12 48813847 48815717 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029303
chr12 48813864 48815728 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029304
chr12 48813869 48815749 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029306
chr12 48813869 48815943 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029307
chr12 48813885 48816219 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108029308
chr12 48813898 48815698 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029309
chr12 48813898 48815789 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029310
chr12 48813909 48815937 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029312
chr12 48813915 48816206 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029313
chr12 48813930 48816071 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029315
chr12 48813962 48816059 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029317
chr12 48813962 48816084 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108029318
chr12 48813962 48816745 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029319
chr12 48813965 48815691 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029320
chr12 48813967 48816168 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108029321
chr12 48813970 48815747 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029322
chr12 48813987 48815825 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029323
chr12 48813988 48816121 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108029324
chr12 48813991 48816077 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029326
chr12 48814007 48815716 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029327
chr12 48814019 48815730 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029329
chr12 48814021 48815848 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029330
chr12 48814025 48816212 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029331
chr12 48814032 48815755 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029332
chr12 48814034 48815659 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029333
chr12 48814035 48815884 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029334
chr12 48814059 48815926 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029336
chr12 48814062 48816022 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029337
chr12 48814079 48815853 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029338
chr12 48814093 48815912 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029339
chr12 48814111 48815621 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029340
chr12 48814130 48815999 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029341
chr12 48814181 48815921 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029344
chr12 48814188 48815706 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029345
chr12 48814192 48816097 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108029346
chr12 48814196 48815981 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029347
chr12 48814205 48815930 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029348
chr12 48814210 48815752 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029349
chr12 48814219 48815532 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029350
chr12 48814224 48815909 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029351
chr12 48814228 48816232 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029352
chr12 48814256 48816370 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029355
chr12 48814283 48816191 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108029357
chr12 48814303 48816063 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029358
chr12 48814309 48815738 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029359
chr12 48814321 48816586 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029361
chr12 48814337 48815689 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029363
chr12 48814348 48816134 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029364
chr12 48814356 48815520 CTCF GTRD no Spleen 108029365
chr12 48814359 48816192 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108029366
chr12 48814362 48815683 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029367
chr12 48814367 48815829 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108029369
chr12 48814371 48816258 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108029370
chr12 48814378 48815638 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029371
chr12 48814381 48815535 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029372
chr12 48814400 48815841 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029376
chr12 48814400 48815929 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108029377
chr12 48814400 48815951 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108029378
chr12 48814404 48815607 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029379
chr12 48814404 48815912 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108029380
chr12 48814407 48815776 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029382
chr12 48814409 48815697 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029383
chr12 48814412 48816212 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029385
chr12 48814416 48815597 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029386
chr12 48814416 48815612 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029387
chr12 48814425 48815917 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029388
chr12 48814434 48816228 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108029391
chr12 48814441 48815735 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029393
chr12 48814445 48815842 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029394
chr12 48814456 48815910 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029395
chr12 48814457 48815680 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029397
chr12 48814461 48815665 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029399
chr12 48814462 48816047 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029400
chr12 48814469 48815736 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108029401
chr12 48814478 48815659 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029403
chr12 48814478 48815738 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029404
chr12 48814502 48815700 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108029406
chr12 48814506 48815654 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029407
chr12 48814506 48815705 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029408
chr12 48814507 48815744 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108029409
chr12 48814512 48815931 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029411
chr12 48814513 48816115 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108029412
chr12 48814514 48815596 CTCF GTRD no Lung 108029413
chr12 48814515 48815934 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029414
chr12 48814516 48815830 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108029415
chr12 48814522 48815696 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029417
chr12 48814524 48815630 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029418
chr12 48814524 48815690 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029419
chr12 48814527 48816313 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108029420
chr12 48814529 48815855 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108029421
chr12 48814535 48815671 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029423
chr12 48814536 48815828 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029424
chr12 48814548 48816036 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108029428
chr12 48814550 48815746 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029430
chr12 48814563 48815758 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029433
chr12 48814943 48816069 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108029443
chr12 48815059 48815658 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029444
chr12 48815078 48815754 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029445
chr12 48815086 48815785 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108029446
chr12 48815086 48815788 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029447
chr12 48815096 48815592 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029448
chr12 48815116 48815568 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029449
chr12 48815117 48815617 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029450
chr12 48815118 48815710 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029451
chr12 48815124 48815664 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029452
chr12 48815149 48815783 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108029453
chr12 48815153 48815772 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108029454
chr12 48815157 48815721 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029455
chr12 48815173 48815595 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029456
chr12 48815178 48815554 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029457
chr12 48815189 48815786 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029458
chr12 48815194 48815608 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029459
chr12 48815197 48815627 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029460
chr12 48815208 48815708 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029461
chr12 48815214 48815606 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029462
chr12 48815223 48816013 P63 GTRD no Skin (Keratinocyte) 108029463
chr12 48815226 48815715 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108029464
chr12 48815230 48815999 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108029465
chr12 48815235 48815629 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029466
chr12 48815250 48815903 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029467
chr12 48815293 48815747 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029468
chr12 48815324 48815695 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108029469
chr12 48815325 48815762 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108029470
chr12 48815500 48815513 NFKB1 JASPAR yes 120742936
chr12 48815500 48815513 NFKB2 JASPAR yes 120742937

Genes associated with rs55647233[chr12:48815501], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More