EnhancerDB
  1. Home
  2. SNP
  3. rs563545998[chr17:8827086]
Enhancers that have rs563545998[chr17:8827086]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr17 8820211 8831395 enh32075
Prostate (RWPE1) Astrocyte Bone (Osteoblast) Blood (GM12878) Colon (HCT116) Peripheral Blood (MM.1S) Blood (T-cell)
chr17 8827075 8827289 vista23931
VISTA
Transcript factors that have rs563545998[chr17:8827086]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr17 8825576 8830942 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21742439
chr17 8825576 8830942 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238058
chr17 8825576 8830942 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238059
chr17 8825576 8830942 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238060
chr17 8825576 8830942 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238061
chr17 8825576 8830942 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238062
chr17 8826588 8830980 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21742444
chr17 8826588 8830980 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238068
chr17 8826588 8830980 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238069
chr17 8826588 8830980 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238070
chr17 8826588 8830980 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238071
chr17 8826588 8830980 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238072
chr17 8826654 8830983 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21742445
chr17 8826654 8830983 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238073
chr17 8826654 8830983 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238074
chr17 8826654 8830983 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238075
chr17 8826654 8830983 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238076
chr17 8826654 8830983 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238077
chr17 8826763 8827357 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 21742446
chr17 8826763 8827357 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108238078
chr17 8826763 8827357 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108238079
chr17 8826763 8827357 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108238080
chr17 8826775 8827619 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21742447
chr17 8826775 8827619 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238081
chr17 8826775 8827619 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238082
chr17 8826775 8827619 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238083
chr17 8826800 8827491 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21742448
chr17 8826800 8827491 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238084
chr17 8826800 8827491 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238085
chr17 8826800 8827491 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238086
chr17 8826813 8830902 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21742449
chr17 8826813 8830902 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238087
chr17 8826813 8830902 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238088
chr17 8826813 8830902 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238089
chr17 8826813 8830902 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238090
chr17 8826813 8830902 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238091
chr17 8826825 8827428 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21742450
chr17 8826825 8827428 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238092
chr17 8826825 8827428 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238093
chr17 8826825 8827428 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238094
chr17 8826869 8827313 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21742451
chr17 8826869 8827313 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238095
chr17 8826869 8827313 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238096
chr17 8826869 8827313 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238097
chr17 8826899 8827353 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 21742452
chr17 8826899 8827353 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108238098
chr17 8826899 8827353 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108238099
chr17 8826899 8827353 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108238100
chr17 8826904 8827633 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21742453
chr17 8826904 8827633 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238101
chr17 8826904 8827633 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238102
chr17 8826904 8827633 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108238103
chr17 8827076 8827097 IRF1 JASPAR yes 21195775
chr17 8827076 8827097 IRF1 JASPAR yes 53006464
chr17 8827081 8827093 POU3F1 JASPAR yes 21195776
chr17 8827081 8827093 POU3F2 JASPAR yes 21195777
chr17 8827081 8827093 POU3F1 JASPAR yes 53006465
chr17 8827081 8827093 POU3F2 JASPAR yes 53006466
chr17 8827081 8827094 POU2F2 JASPAR yes 21195778
chr17 8827081 8827094 POU2F2 JASPAR yes 53006467
chr17 8827082 8827091 POU3F4 JASPAR yes 21195779
chr17 8827082 8827091 POU5F1B JASPAR yes 21195780
chr17 8827082 8827091 POU3F4 JASPAR yes 53006468
chr17 8827082 8827091 POU5F1B JASPAR yes 53006469
chr17 8827082 8827093 FOXB1 JASPAR yes 21195781
chr17 8827082 8827093 FOXB1 JASPAR yes 53006470
Genes associated with rs563545998[chr17:8827086], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More