EnhancerDB
  1. Home
  2. SNP
  3. rs564799478[chr1:230978861]
Enhancers that have rs564799478[chr1:230978861]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
Transcript factors that have rs564799478[chr1:230978861]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr1 230976248 230980928 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879034
chr1 230976578 230980468 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879035
chr1 230976674 230980528 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879037
chr1 230976995 230980478 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879038
chr1 230977091 230980576 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879039
chr1 230977183 230980116 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879040
chr1 230977253 230979967 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879041
chr1 230977358 230979856 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879043
chr1 230977468 230979888 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879045
chr1 230977520 230979489 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879046
chr1 230977521 230979966 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879047
chr1 230977587 230979871 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879050
chr1 230977638 230979695 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879051
chr1 230977653 230979775 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879052
chr1 230977669 230979723 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879053
chr1 230977707 230979729 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879056
chr1 230977713 230979713 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107879057
chr1 230977721 230979598 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879058
chr1 230977726 230979648 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879059
chr1 230977726 230979787 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879060
chr1 230977727 230979493 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107879061
chr1 230977738 230979571 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879062
chr1 230977739 230979880 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879063
chr1 230977768 230979544 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879065
chr1 230977786 230979482 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879066
chr1 230977791 230979766 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879067
chr1 230977794 230979432 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879068
chr1 230977795 230979672 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879069
chr1 230977806 230979713 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107879070
chr1 230977821 230979548 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879071
chr1 230977822 230979475 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107879072
chr1 230977830 230979409 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879074
chr1 230977830 230979410 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879075
chr1 230977830 230979545 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879076
chr1 230977840 230979607 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879077
chr1 230977843 230979589 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879078
chr1 230977866 230979676 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879079
chr1 230977872 230979703 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879080
chr1 230977877 230979780 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879081
chr1 230977893 230979458 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107879082
chr1 230977895 230979625 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879083
chr1 230977898 230979536 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879084
chr1 230977901 230979619 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879085
chr1 230977903 230979499 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107879086
chr1 230977911 230979041 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879087
chr1 230977912 230979529 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879088
chr1 230977913 230979127 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879089
chr1 230977929 230979432 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879090
chr1 230977930 230979413 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879091
chr1 230977934 230979601 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879093
chr1 230977954 230979524 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879094
chr1 230977965 230979600 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879095
chr1 230977969 230979781 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879096
chr1 230977979 230979394 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879098
chr1 230977984 230979466 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879099
chr1 230978014 230979758 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879100
chr1 230978019 230979359 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879101
chr1 230978021 230979496 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879102
chr1 230978037 230979474 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107879103
chr1 230978044 230979476 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879104
chr1 230978048 230979460 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107879105
chr1 230978052 230979562 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879106
chr1 230978054 230979339 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879108
chr1 230978056 230979543 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879109
chr1 230978061 230979688 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107879110
chr1 230978071 230979011 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879111
chr1 230978071 230979525 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879112
chr1 230978080 230979602 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879114
chr1 230978113 230979175 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 107879115
chr1 230978145 230979371 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107879116
chr1 230978225 230980269 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879118
chr1 230978398 230979560 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879119
chr1 230978419 230979778 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107879120
chr1 230978430 230979743 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879121
chr1 230978441 230979581 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879122
chr1 230978441 230979633 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879123
chr1 230978446 230979527 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107879124
chr1 230978451 230979477 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879125
chr1 230978451 230979583 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879126
chr1 230978453 230979562 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879127
chr1 230978459 230979445 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107879128
chr1 230978460 230979645 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879129
chr1 230978463 230979565 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879130
chr1 230978465 230980418 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879131
chr1 230978467 230979717 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107879132
chr1 230978470 230979466 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107879133
chr1 230978479 230979579 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107879134
chr1 230978481 230979750 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107879135
chr1 230978486 230979707 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879136
chr1 230978487 230979576 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879137
chr1 230978487 230979626 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107879138
chr1 230978488 230979521 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107879139
chr1 230978489 230979388 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879140
chr1 230978489 230979737 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879141
chr1 230978496 230979576 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107879142
chr1 230978496 230979696 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107879143
chr1 230978497 230979894 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107879144
chr1 230978499 230979533 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879145
chr1 230978500 230979683 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879146
chr1 230978501 230979753 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879147
chr1 230978503 230979492 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879148
chr1 230978504 230978969 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879149
chr1 230978505 230979546 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879150
chr1 230978505 230980449 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879151
chr1 230978506 230979295 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107879152
chr1 230978507 230979589 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879153
chr1 230978509 230979467 CTCF GTRD no Spleen 107879154
chr1 230978509 230979585 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879155
chr1 230978510 230979484 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107879156
chr1 230978511 230979548 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107879157
chr1 230978511 230979569 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879158
chr1 230978512 230979361 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107879159
chr1 230978513 230979547 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107879160
chr1 230978514 230979841 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879161
chr1 230978515 230979401 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107879162
chr1 230978517 230979614 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107879163
Genes associated with rs564799478[chr1:230978861], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More