EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. USH1C[ENSG00000006611.11]
Enhancers that regulate USH1C[ENSG00000006611.11]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr11 17506045 17510470 enh50743 17565963 55493
Large Intestine
chr11 17558705 17562855 enh50744 17565963 3108
Large Intestine
Transcript facotrs that regulate USH1C[ENSG00000006611.11]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr11 17560963 17560966 MYB TRANSFAC yes 17565963 4997 37713783
chr11 17560969 17560979 MEF2A JASPAR yes 17565963 4984 37713784
chr11 17560982 17560995 DUXA JASPAR yes 17565963 4968 37713785
chr11 17561000 17561016 SOX8 JASPAR yes 17565963 4947 37713786
chr11 17561002 17561017 HNF1A JASPAR yes 17565963 4946 37713787
chr11 17561007 17561021 ONECUT3 JASPAR yes 17565963 4942 37713788
chr11 17561008 17561017 SOX9 JASPAR yes 17565963 4946 37713789
chr11 17561010 17561019 SRY JASPAR yes 17565963 4944 37713790
chr11 17561025 17561036 PROP1 JASPAR yes 17565963 4927 37713791
chr11 17561027 17561037 HOXC10 JASPAR yes 17565963 4926 37713792
chr11 17561027 17561037 HOXD13 JASPAR yes 17565963 4926 37713793
chr11 17561027 17561038 HOXC13 JASPAR yes 17565963 4925 37713794
chr11 17561028 17561038 GSX1 JASPAR yes 17565963 4925 37713795
chr11 17561028 17561038 GSX2 JASPAR yes 17565963 4925 37713796
chr11 17561028 17561038 HOXB3 JASPAR yes 17565963 4925 37713797
chr11 17561029 17561037 NKX6-1 JASPAR yes 17565963 4926 37713798
chr11 17561029 17561037 NKX6-2 JASPAR yes 17565963 4926 37713799
chr11 17561029 17561039 POU6F2 JASPAR yes 17565963 4924 37713800
chr11 17561035 17561050 HNF1A JASPAR yes 17565963 4913 37713801
chr11 17561036 17561049 HNF1B JASPAR yes 17565963 4914 37713802
chr11 17561089 17561100 DMRT3 JASPAR yes 17565963 4863 37713803
chr11 17561090 17561101 NFIL3 JASPAR yes 17565963 4862 37713804
chr11 17561091 17561103 DBP JASPAR yes 17565963 4860 37713805
chr11 17561091 17561103 HLF JASPAR yes 17565963 4860 37713806
chr11 17561113 17561122 NKX3-2 JASPAR yes 17565963 4841 37713807
chr11 17561133 17561138 GATA2 JASPAR yes 17565963 4825 37713808
chr11 17561134 17561140 ZNF354C JASPAR yes 17565963 4823 37713809
chr11 17561135 17561154 CTCF JASPAR yes 17565963 4809 37713810
chr11 17561146 17561150 LFA1 TRANSFAC yes 17565963 4813 37713811
chr11 17561245 17561249 YY1 TRANSFAC yes 17565963 4714 37713812
chr11 17561247 17561268 IRF1 JASPAR yes 17565963 4695 37713813
chr11 17561249 17561264 PRDM1 JASPAR yes 17565963 4699 37713814
chr11 17561249 17561264 STAT2 JASPAR yes 17565963 4699 37713815
chr11 17561250 17561264 STAT1 JASPAR yes 17565963 4699 37713816
chr11 17561251 17561265 IRF7 JASPAR yes 17565963 4698 37713817
chr11 17561251 17561265 IRF8 JASPAR yes 17565963 4698 37713818
chr11 17561256 17561260 YY1 TRANSFAC yes 17565963 4703 37713819
chr11 17561257 17561271 GATA2 JASPAR yes 17565963 4692 37713820
chr11 17561261 17561269 GATA5 JASPAR yes 17565963 4694 37713821
chr11 17561266 17561278 YY1 JASPAR yes 17565963 4685 37713822
chr11 17561269 17561290 IRF1 JASPAR yes 17565963 4673 37713823
chr11 17561270 17561291 IRF1 JASPAR yes 17565963 4672 37713824
chr11 17561274 17561295 IRF1 JASPAR yes 17565963 4668 37713825
chr11 17561275 17561290 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4673 37713826
chr11 17561280 17561301 IRF1 JASPAR yes 17565963 4662 37713827
chr11 17561282 17561297 STAT2 JASPAR yes 17565963 4666 37713828
chr11 17561284 17561296 IRF1 JASPAR yes 17565963 4667 37713829
chr11 17561284 17561298 IRF7 JASPAR yes 17565963 4665 37713830
chr11 17561284 17561299 IRF9 JASPAR yes 17565963 4664 37713831
chr11 17561286 17561307 IRF1 JASPAR yes 17565963 4656 37713832
chr11 17561288 17561303 PRDM1 JASPAR yes 17565963 4660 37713833
chr11 17561320 17561324 NFE TRANSFAC yes 17565963 4639 37713834
chr11 17561326 17561330 NFE TRANSFAC yes 17565963 4633 37713835
chr11 17561332 17561336 NFE TRANSFAC yes 17565963 4627 37713836
chr11 17561332 17561345 SMAD2 JASPAR yes 17565963 4618 37713837
chr11 17561333 17561354 IRF1 JASPAR yes 17565963 4609 37713838
chr11 17561335 17561350 PRDM1 JASPAR yes 17565963 4613 37713839
chr11 17561337 17561358 IRF1 JASPAR yes 17565963 4605 37713840
chr11 17561337 17561358 ZNF263 JASPAR yes 17565963 4605 37713841
chr11 17561339 17561360 IRF1 JASPAR yes 17565963 4603 37713842
chr11 17561341 17561356 PRDM1 JASPAR yes 17565963 4607 37713843
chr11 17561341 17561356 STAT2 JASPAR yes 17565963 4607 37713844
chr11 17561342 17561356 STAT1 JASPAR yes 17565963 4607 37713845
chr11 17561343 17561364 ZNF263 JASPAR yes 17565963 4599 37713846
chr11 17561344 17561359 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4604 37713847
chr11 17561348 17561369 IRF1 JASPAR yes 17565963 4594 37713848
chr11 17561350 17561365 STAT2 JASPAR yes 17565963 4598 37713849
chr11 17561351 17561365 SPIC JASPAR yes 17565963 4598 37713850
chr11 17561351 17561365 STAT1 JASPAR yes 17565963 4598 37713851
chr11 17561352 17561366 IRF7 JASPAR yes 17565963 4597 37713852
chr11 17561352 17561366 IRF8 JASPAR yes 17565963 4597 37713853
chr11 17561352 17561367 IRF9 JASPAR yes 17565963 4596 37713854
chr11 17561354 17561375 IRF1 JASPAR yes 17565963 4588 37713855
chr11 17561356 17561371 STAT2 JASPAR yes 17565963 4592 37713856
chr11 17561357 17561371 STAT1 JASPAR yes 17565963 4592 37713857
chr11 17561358 17561372 IRF7 JASPAR yes 17565963 4591 37713858
chr11 17561358 17561372 IRF8 JASPAR yes 17565963 4591 37713859
chr11 17561358 17561373 IRF9 JASPAR yes 17565963 4590 37713860
chr11 17561360 17561381 IRF1 JASPAR yes 17565963 4582 37713861
chr11 17561364 17561385 IRF1 JASPAR yes 17565963 4578 37713862
chr11 17561366 17561381 PRDM1 JASPAR yes 17565963 4582 37713863
chr11 17561366 17561381 STAT2 JASPAR yes 17565963 4582 37713864
chr11 17561367 17561381 SPIC JASPAR yes 17565963 4582 37713865
chr11 17561367 17561381 STAT1 JASPAR yes 17565963 4582 37713866
chr11 17561368 17561382 IRF7 JASPAR yes 17565963 4581 37713867
chr11 17561368 17561382 IRF8 JASPAR yes 17565963 4581 37713868
chr11 17561368 17561383 IRF9 JASPAR yes 17565963 4580 37713869
chr11 17561368 17561389 IRF1 JASPAR yes 17565963 4574 37713870
chr11 17561369 17561384 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4579 37713871
chr11 17561369 17561390 IRF1 JASPAR yes 17565963 4573 37713872
chr11 17561370 17561385 PRDM1 JASPAR yes 17565963 4578 37713873
chr11 17561370 17561391 IRF1 JASPAR yes 17565963 4572 37713874
chr11 17561374 17561395 IRF1 JASPAR yes 17565963 4568 37713875
chr11 17561375 17561390 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4573 37713876
chr11 17561375 17561396 IRF1 JASPAR yes 17565963 4567 37713877
chr11 17561376 17561397 IRF1 JASPAR yes 17565963 4566 37713878
chr11 17561377 17561392 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4571 37713879
chr11 17561377 17561398 IRF1 JASPAR yes 17565963 4565 37713880
chr11 17561379 17561394 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4569 37713881
chr11 17561380 17561395 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4568 37713882
chr11 17561381 17561396 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4567 37713883
chr11 17561382 17561397 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4566 37713884
chr11 17561383 17561398 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4565 37713885
chr11 17561384 17561399 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4564 37713886
chr11 17561385 17561400 FOXP1 JASPAR yes 17565963 4563 37713887
chr11 17561413 17561417 NFE TRANSFAC yes 17565963 4546 37713888
chr11 17561435 17561445 SREBF1 JASPAR yes 17565963 4518 37713889
chr11 17561435 17561445 SREBF2 JASPAR yes 17565963 4518 37713890
chr11 17561436 17561444 MGA JASPAR yes 17565963 4519 37713891
chr11 17561440 17561455 RUNX2 JASPAR yes 17565963 4508 37713892
chr11 17561516 17561525 SNAI2 JASPAR yes 17565963 4438 37713893
chr11 17561516 17561526 ID4 JASPAR yes 17565963 4437 37713894
chr11 17561516 17561526 TCF3 JASPAR yes 17565963 4437 37713895
chr11 17561516 17561526 TCF4 JASPAR yes 17565963 4437 37713896
chr11 17561531 17561539 TBX5 JASPAR yes 17565963 4424 37713897
chr11 17561531 17561540 ZEB1 JASPAR yes 17565963 4423 37713898
chr11 17561531 17561544 ZBTB18 JASPAR yes 17565963 4419 37713899
chr11 17561532 17561542 ID4 JASPAR yes 17565963 4421 37713900
chr11 17561532 17561542 TCF3 JASPAR yes 17565963 4421 37713901
chr11 17561532 17561542 TCF4 JASPAR yes 17565963 4421 37713902
chr11 17561534 17561539 USF2 TRANSFAC yes 17565963 4424 37713903
chr11 17561551 17561555 YY1 TRANSFAC yes 17565963 4408 37713904
chr11 17561570 17561589 PAX5 JASPAR yes 17565963 4374 37713905
chr11 17561621 17561629 TBX15 JASPAR yes 17565963 4334 37713906
chr11 17561648 17561653 H4TF1 TRANSFAC yes 17565963 4310 37713907
chr11 17561665 17561684 PAX5 JASPAR yes 17565963 4279 37713908
chr11 17561666 17561674 TBX5 JASPAR yes 17565963 4289 37713909
chr11 17561666 17561675 ZEB1 JASPAR yes 17565963 4288 37713910
chr11 17561668 17561677 SNAI2 JASPAR yes 17565963 4286 37713911
chr11 17561669 17561674 USF2 TRANSFAC yes 17565963 4289 37713912
chr11 17561682 17561697 MEF2C JASPAR yes 17565963 4266 37713913
chr11 17561684 17561699 STAT1 JASPAR yes 17565963 4264 37713914
chr11 17561686 17561697 STAT1 JASPAR yes 17565963 4266 37713915
chr11 17561695 17561704 NKX3-2 JASPAR yes 17565963 4259 37713916
chr11 17561702 17561713 RUNX1 JASPAR yes 17565963 4250 37713917
chr11 17561733 17561745 MEF2A JASPAR yes 17565963 4218 37713918
chr11 17561733 17561745 MEF2B JASPAR yes 17565963 4218 37713919
chr11 17561733 17561745 MEF2D JASPAR yes 17565963 4218 37713920
chr11 17561734 17561744 MEF2A JASPAR yes 17565963 4219 37713921
chr11 17561737 17561741 YY1 TRANSFAC yes 17565963 4222 37713922
chr11 17561749 17561767 MAFF JASPAR yes 17565963 4196 37713923
chr11 17561764 17561769 TFAP2A TRANSFAC yes 17565963 4194 37713924
chr11 17561764 17561770 MZF1 JASPAR yes 17565963 4193 37713925
chr11 17561767 17561772 GATA2 JASPAR yes 17565963 4191 37713926
chr11 17561776 17561786 BHLHE40 JASPAR yes 17565963 4177 37713927
chr11 17561776 17561786 CLOCK JASPAR yes 17565963 4177 37713928
chr11 17561776 17561786 HEY1 JASPAR yes 17565963 4177 37713929
chr11 17561776 17561786 MAX JASPAR yes 17565963 4177 37713930
chr11 17561776 17561786 MNT JASPAR yes 17565963 4177 37713931
chr11 17561778 17561783 MYC TRANSFAC yes 17565963 4180 37713932
chr11 17561778 17561783 USF1 TRANSFAC yes 17565963 4180 37713933
chr11 17561778 17561783 USF2 TRANSFAC yes 17565963 4180 37713934
chr11 17561778 17561788 TBX21 JASPAR yes 17565963 4175 37713935
chr11 17561778 17561789 TBX2 JASPAR yes 17565963 4174 37713936
chr11 17561778 17561791 EOMES JASPAR yes 17565963 4172 37713937
chr11 17561779 17561787 MGA JASPAR yes 17565963 4176 37713938
chr11 17561779 17561787 TBX1 JASPAR yes 17565963 4176 37713939
chr11 17561779 17561789 TBR1 JASPAR yes 17565963 4174 37713940
chr11 17561801 17561812 ESRRA JASPAR yes 17565963 4151 37713941
chr11 17561801 17561812 ESRRB JASPAR yes 17565963 4151 37713942
chr11 17561815 17561826 ESRRA JASPAR yes 17565963 4137 37713943
chr11 17561816 17561831 LEF1 JASPAR yes 17565963 4132 37713944
chr11 17561843 17561861 MAFF JASPAR yes 17565963 4102 37713945
chr11 17561864 17561868 YY1 TRANSFAC yes 17565963 4095 37713946
chr11 17561866 17561881 AR JASPAR yes 17565963 4082 37713947
chr11 17561890 17561909 PAX5 JASPAR yes 17565963 4054 37713948
chr11 17561893 17561898 SP1 TRANSFAC yes 17565963 4065 37713949
chr11 17561899 17561920 ZNF263 JASPAR yes 17565963 4043 37713950
chr11 17561902 17561923 ZNF263 JASPAR yes 17565963 4040 37713951
chr11 17561903 17561924 ZNF263 JASPAR yes 17565963 4039 37713952
chr11 17561913 17561918 ETS2 TRANSFAC yes 17565963 4045 37713953
chr11 17561914 17561935 ZNF263 JASPAR yes 17565963 4028 37713954
chr11 17561915 17561923 EHF JASPAR yes 17565963 4040 37713955
chr11 17561917 17561938 ZNF263 JASPAR yes 17565963 4025 37713956
chr11 17561962 17561983 REST JASPAR yes 17565963 3980 37713957
chr11 17561963 17561982 REST JASPAR yes 17565963 3981 37713958
chr11 17561966 17561970 NFE TRANSFAC yes 17565963 3993 37713959
chr11 17561993 17561997 NFE TRANSFAC yes 17565963 3966 37713960
chr11 17562001 17562016 JUND JASPAR yes 17565963 3947 37713961
chr11 17562002 17562015 JUN JASPAR yes 17565963 3948 37713962
chr11 17562003 17562017 ATF7 JASPAR yes 17565963 3946 37713963
chr11 17562004 17562016 JDP2 JASPAR yes 17565963 3947 37713964
chr11 17562004 17562019 JUND JASPAR yes 17565963 3944 37713965
chr11 17562005 17562013 NR4A2 JASPAR yes 17565963 3950 37713966
chr11 17562005 17562018 JUN JASPAR yes 17565963 3945 37713967
chr11 17562006 17562014 CREB1 JASPAR yes 17565963 3949 37713968
chr11 17562006 17562016 RORA JASPAR yes 17565963 3947 37713969
chr11 17562032 17562052 RREB1 JASPAR yes 17565963 3911 37713970
chr11 17562039 17562047 MGA JASPAR yes 17565963 3916 37713971
chr11 17562039 17562047 TBX15 JASPAR yes 17565963 3916 37713972
chr11 17562039 17562047 TBX1 JASPAR yes 17565963 3916 37713973
chr11 17562039 17562047 TBX4 JASPAR yes 17565963 3916 37713974
chr11 17562039 17562047 TBX5 JASPAR yes 17565963 3916 37713975
chr11 17562059 17562073 GATA2 JASPAR yes 17565963 3890 37713976
chr11 17562063 17562071 GATA3 JASPAR yes 17565963 3892 37713977
chr11 17562064 17562079 TFAP2C JASPAR yes 17565963 3884 37713978
chr11 17562147 17562168 ZNF263 JASPAR yes 17565963 3795 37713979
chr11 17562152 17562167 ZIC3 JASPAR yes 17565963 3796 37713980
chr11 17562153 17562174 ZNF263 JASPAR yes 17565963 3789 37713981
chr11 17562156 17562177 ZNF263 JASPAR yes 17565963 3786 37713982
chr11 17562166 17562187 ZNF263 JASPAR yes 17565963 3776 37713983
chr11 17562175 17562196 ZNF263 JASPAR yes 17565963 3767 37713984
chr11 17562199 17562210 FOXH1 JASPAR yes 17565963 3753 37713985
chr11 17562200 17562206 ZNF354C JASPAR yes 17565963 3757 37713986
chr11 17562207 17562223 ZNF143 JASPAR yes 17565963 3740 37713987
chr11 17562239 17562243 H1TF2 TRANSFAC yes 17565963 3720 37713988
chr11 17562239 17562243 NFE TRANSFAC yes 17565963 3720 37713989
chr11 17562239 17562243 SRF TRANSFAC yes 17565963 3720 37713990
chr11 17562257 17562261 NFE TRANSFAC yes 17565963 3702 37713991
chr11 17562267 17562272 ETS2 TRANSFAC yes 17565963 3691 37713992
chr11 17562273 17562276 MYB TRANSFAC yes 17565963 3687 37713993
chr11 17562276 17562287 DMRT3 JASPAR yes 17565963 3676 37713994
chr11 17562280 17562285 GATA2 JASPAR yes 17565963 3678 37713995
chr11 17562300 17562310 SREBF1 JASPAR yes 17565963 3653 37713996
chr11 17562317 17562332 TFAP2A JASPAR yes 17565963 3631 37713997
chr11 17562317 17562332 TFAP2C JASPAR yes 17565963 3631 37713998
chr11 17562359 17562363 H4TF2 TRANSFAC yes 17565963 3600 37713999
chr11 17562369 17562383 PLAG1 JASPAR yes 17565963 3580 37714000
chr11 17562385 17562396 FOXH1 JASPAR yes 17565963 3567 37714001
chr11 17562386 17562392 ZNF354C JASPAR yes 17565963 3571 37714002
chr11 17562415 17562420 ETS2 TRANSFAC yes 17565963 3543 37714003
chr11 17562422 17562435 POU3F3 JASPAR yes 17565963 3528 37714004
chr11 17562422 17562436 POU1F1 JASPAR yes 17565963 3527 37714005
chr11 17562423 17562435 POU3F1 JASPAR yes 17565963 3528 37714006
chr11 17562423 17562435 POU3F2 JASPAR yes 17565963 3528 37714007
chr11 17562423 17562436 POU2F2 JASPAR yes 17565963 3527 37714008
chr11 17562424 17562433 POU3F4 JASPAR yes 17565963 3530 37714009
chr11 17562424 17562433 POU5F1B JASPAR yes 17565963 3530 37714010
chr11 17562426 17562441 HNF1A JASPAR yes 17565963 3522 37714011
chr11 17562427 17562440 HNF1B JASPAR yes 17565963 3523 37714012
chr11 17562432 17562445 EOMES JASPAR yes 17565963 3518 37714013
chr11 17562434 17562444 TBR1 JASPAR yes 17565963 3519 37714014
chr11 17562434 17562445 TBX20 JASPAR yes 17565963 3518 37714015
chr11 17562434 17562445 TBX2 JASPAR yes 17565963 3518 37714016
chr11 17562435 17562445 TBX21 JASPAR yes 17565963 3518 37714017
chr11 17562436 17562444 MGA JASPAR yes 17565963 3519 37714018
chr11 17562436 17562444 TBX15 JASPAR yes 17565963 3519 37714019
chr11 17562436 17562444 TBX1 JASPAR yes 17565963 3519 37714020
chr11 17562436 17562444 TBX4 JASPAR yes 17565963 3519 37714021
chr11 17562436 17562444 TBX5 JASPAR yes 17565963 3519 37714022
chr11 17562439 17562454 STAT1 JASPAR yes 17565963 3509 37714023
chr11 17562446 17562464 NR3C1 JASPAR yes 17565963 3499 37714024
chr11 17562456 17562473 RARA JASPAR yes 17565963 3490 37714025
chr11 17562486 17562500 PLAG1 JASPAR yes 17565963 3463 37714026
chr11 17562488 17562494 SP1 TRANSFAC yes 17565963 3469 37714027
chr11 17562488 17562498 SP1 JASPAR yes 17565963 3465 37714028
chr11 17562499 17562503 YY1 TRANSFAC yes 17565963 3460 37714029
chr11 17562511 17562532 ZNF263 JASPAR yes 17565963 3431 37714030
chr11 17562524 17562538 EBF1 JASPAR yes 17565963 3425 37714031
chr11 17562525 17562532 SPIB JASPAR yes 17565963 3431 37714032
chr11 17562527 17562547 ESR1 JASPAR yes 17565963 3416 37714033
chr11 17562529 17562549 PPARG JASPAR yes 17565963 3414 37714034
chr11 17562530 17562548 ESR2 JASPAR yes 17565963 3415 37714035
chr11 17562530 17562550 PPARG JASPAR yes 17565963 3413 37714036
chr11 17562531 17562546 AR JASPAR yes 17565963 3417 37714037
chr11 17562531 17562548 NR3C1 JASPAR yes 17565963 3415 37714038
chr11 17562531 17562548 NR3C2 JASPAR yes 17565963 3415 37714039
chr11 17562531 17562549 ESR2 JASPAR yes 17565963 3414 37714040
chr11 17562532 17562547 ESR2 JASPAR yes 17565963 3416 37714041
chr11 17562533 17562548 AR JASPAR yes 17565963 3415 37714042
chr11 17562540 17562544 NFE TRANSFAC yes 17565963 3419 37714043
chr11 17562563 17562568 SP1 TRANSFAC yes 17565963 3395 37714044
chr11 17562563 17562583 TP63 JASPAR yes 17565963 3380 37714045
chr11 17562564 17562569 SP1 TRANSFAC yes 17565963 3394 37714046
chr11 17562564 17562573 HIC2 JASPAR yes 17565963 3390 37714047
chr11 17562567 17562571 LFA1 TRANSFAC yes 17565963 3392 37714048
chr11 17562575 17562590 TFAP2A JASPAR yes 17565963 3373 37714049
chr11 17562575 17562590 TFAP2C JASPAR yes 17565963 3373 37714050
chr11 17562577 17562592 TFAP2A JASPAR yes 17565963 3371 37714051
chr11 17562577 17562592 TFAP2C JASPAR yes 17565963 3371 37714052
chr11 17562578 17562589 TFAP2A JASPAR yes 17565963 3374 37714053
chr11 17562578 17562590 TFAP2A JASPAR yes 17565963 3373 37714054
chr11 17562578 17562590 TFAP2B JASPAR yes 17565963 3373 37714055
chr11 17562578 17562590 TFAP2C JASPAR yes 17565963 3373 37714056
chr11 17562589 17562599 TBR1 JASPAR yes 17565963 3364 37714057
chr11 17562589 17562600 TBX2 JASPAR yes 17565963 3363 37714058
chr11 17562590 17562600 TBX21 JASPAR yes 17565963 3363 37714059
chr11 17562591 17562599 MGA JASPAR yes 17565963 3364 37714060
chr11 17562591 17562599 TBX15 JASPAR yes 17565963 3364 37714061
chr11 17562591 17562599 TBX1 JASPAR yes 17565963 3364 37714062
chr11 17562591 17562599 TBX4 JASPAR yes 17565963 3364 37714063
chr11 17562591 17562599 TBX5 JASPAR yes 17565963 3364 37714064
chr11 17562591 17562606 SCRT1 JASPAR yes 17565963 3357 37714065
chr11 17562593 17562606 SCRT2 JASPAR yes 17565963 3357 37714066
chr11 17562597 17562615 IRF2 JASPAR yes 17565963 3348 37714067
chr11 17562602 17562616 IRF7 JASPAR yes 17565963 3347 37714068
chr11 17562603 17562621 SRF JASPAR yes 17565963 3342 37714069
chr11 17562632 17562637 GATA1 TRANSFAC yes 17565963 3326 37714070
chr11 17562643 17562664 ZNF263 JASPAR yes 17565963 3299 37714071
chr11 17562695 17562713 ESR1 JASPAR yes 17565963 3250 37714072
chr11 17562723 17562744 ZNF263 JASPAR yes 17565963 3219 37714073
chr11 17562727 17562731 NFE TRANSFAC yes 17565963 3232 37714074
chr11 17562727 17562732 GATA1 TRANSFAC yes 17565963 3231 37714075
chr11 17562727 17562733 GATA3 JASPAR yes 17565963 3230 37714076
chr11 17562738 17562744 MZF1 JASPAR yes 17565963 3219 37714077
chr11 17562747 17562761 STAT1 JASPAR yes 17565963 3202 37714078
chr11 17562752 17562756 YY1 TRANSFAC yes 17565963 3207 37714079
chr11 17562774 17562778 NFE TRANSFAC yes 17565963 3185 37714080
chr11 17562774 17562779 GATA1 TRANSFAC yes 17565963 3184 37714081
chr11 17562774 17562780 GATA3 JASPAR yes 17565963 3183 37714082
chr11 17562787 17562798 DMRT3 JASPAR yes 17565963 3165 37714083
chr11 17562795 17562801 TCF4 TRANSFAC yes 17565963 3162 37714084
chr11 17562796 17562810 ONECUT2 JASPAR yes 17565963 3153 37714085
chr11 17562798 17562809 FOXH1 JASPAR yes 17565963 3154 37714086
chr11 17562802 17562807 H4TF1 TRANSFAC yes 17565963 3156 37714087
chr11 17562803 17562811 FEV JASPAR yes 17565963 3152 37714088
chr11 17562805 17562810 ETS2 TRANSFAC yes 17565963 3153 37714089
chr11 17562805 17562819 TCF7L2 JASPAR yes 17565963 3144 37714090
chr11 17562809 17562820 HOXC12 JASPAR yes 17565963 3143 37714091
chr11 17562812 17562815 MYB TRANSFAC yes 17565963 3148 37714092
chr11 17562819 17562823 NFE TRANSFAC yes 17565963 3140 37714093
chr11 17562831 17562841 TEAD1 JASPAR yes 17565963 3122 37714094
chr11 17562831 17562841 TEAD4 JASPAR yes 17565963 3122 37714095
chr11 17562832 17562840 TEAD3 JASPAR yes 17565963 3123 37714096
chr11 17562841 17562845 NFE TRANSFAC yes 17565963 3118 37714097
SNPs associated with USH1C[ENSG00000006611.11], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr11 16880887 rs150624636 G A 634555 Esophagus 0.0782428 1878604
chr11 18479211 rs11605559 C T 913248 Heart 0.342821 1884524
chr11 17562568 rs7112757 G A,C 0 Pancreas 0.0104633 1881984
Details of USH1C[ENSG00000006611.11]
Back to top
Genomic Location chr11:17515442-17565963[-]
TSS 17565963
Gene Name USH1C
Ensembl ID ENSG00000006611.11
ENTREZID 10083
Uniprot
A0A0S2Z4U9
Q9Y6N9
A0A0S2Z4V1
Protein Name
Harmonin
Usher syndrome 1C
Expression levels of USH1C[ENSG00000006611.11]
Back to top