EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. TRPC3[ENSG00000138741.6]
Enhancers that regulate TRPC3[ENSG00000138741.6]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr4 122802111 122802121 vista45775 122872909 70788
VISTA
chr4 122857525 122862115 enh21759 122872909 10794
Placenta Blood (T-cell)
chr4 122868336 122868638 vista45776 122872909 4271
VISTA
chr4 122869375 122869534 vista45777 122872909 3375
VISTA
chr4 122896485 122901495 enh8172 122872909 23576
Blood (OCI-LY7) Peripheral Blood (MM.1S) Blood (Karpas-422)
chr4 122908965 122913915 enh91563 122872909 36056
Bone Marrow (K562)
chr4 122917365 122924235 enh8173 122872909 44456
Blood (Karpas-422)
chr4 122924243 122928389 enh45722 122872909 51334
Muscle (Myotube)
chr4 122964245 122969036 enh95164 122872909 91336
Muscle (Myoblast) Brain (SK-N-MC) Epithelial (MCF-7)
Transcript facotrs that regulate TRPC3[ENSG00000138741.6]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr4 122868336 122868351 FOXP1 JASPAR yes 122872909 4558 49276586
chr4 122868337 122868352 FOXP1 JASPAR yes 122872909 4557 49276587
chr4 122868337 122868358 IRF1 JASPAR yes 122872909 4551 49276588
chr4 122868338 122868353 FOXP1 JASPAR yes 122872909 4556 49276589
chr4 122868338 122868359 IRF1 JASPAR yes 122872909 4550 49276590
chr4 122868339 122868354 FOXP1 JASPAR yes 122872909 4555 49276591
chr4 122868339 122868360 IRF1 JASPAR yes 122872909 4549 49276592
chr4 122868340 122868355 FOXP1 JASPAR yes 122872909 4554 49276593
chr4 122868340 122868361 IRF1 JASPAR yes 122872909 4548 49276594
chr4 122868341 122868356 FOXP1 JASPAR yes 122872909 4553 49276595
chr4 122868341 122868362 IRF1 JASPAR yes 122872909 4547 49276596
chr4 122868342 122868357 FOXP1 JASPAR yes 122872909 4552 49276597
chr4 122868342 122868363 IRF1 JASPAR yes 122872909 4546 49276598
chr4 122868343 122868358 FOXP1 JASPAR yes 122872909 4551 49276599
chr4 122868345 122868360 FOXP1 JASPAR yes 122872909 4549 49276600
chr4 122868345 122868366 IRF1 JASPAR yes 122872909 4543 49276601
chr4 122868359 122868374 FOXP1 JASPAR yes 122872909 4535 49276602
chr4 122868361 122868367 TBP TRANSFAC yes 122872909 4542 49276603
chr4 122868361 122868372 FOXC1 JASPAR yes 122872909 4537 49276604
chr4 122868361 122868373 FOXC2 JASPAR yes 122872909 4536 49276605
chr4 122868362 122868380 NR3C1 JASPAR yes 122872909 4529 49276606
chr4 122868403 122868418 HNF1A JASPAR yes 122872909 4491 49276607
chr4 122868404 122868417 HNF1B JASPAR yes 122872909 4492 49276608
chr4 122868406 122868424 IRF2 JASPAR yes 122872909 4485 49276609
chr4 122868410 122868425 HNF1A JASPAR yes 122872909 4484 49276610
chr4 122868418 122868422 TEAD2 TRANSFAC yes 122872909 4487 49276611
chr4 122868420 122868423 MYB TRANSFAC yes 122872909 4486 49276612
chr4 122868420 122868435 FOXP1 JASPAR yes 122872909 4474 49276613
chr4 122868450 122868453 MYB TRANSFAC yes 122872909 4456 49276614
chr4 122868465 122868480 HNF4G JASPAR yes 122872909 4429 49276615
chr4 122868466 122868480 NR2F1 JASPAR yes 122872909 4429 49276616
chr4 122868466 122868481 HNF4A JASPAR yes 122872909 4428 49276617
chr4 122868536 122868542 MAZ TRANSFAC yes 122872909 4367 49276618
chr4 122868536 122868547 E2F6 JASPAR yes 122872909 4362 49276619
chr4 122868538 122868546 SP1 TRANSFAC yes 122872909 4363 49276620
chr4 122868540 122868546 MAZ TRANSFAC yes 122872909 4363 49276621
chr4 122868540 122868551 E2F6 JASPAR yes 122872909 4358 49276622
chr4 122868543 122868554 NFKB1 JASPAR yes 122872909 4355 49276623
chr4 122868544 122868549 ETS2 TRANSFAC yes 122872909 4360 49276624
chr4 122868570 122868581 FOXA1 JASPAR yes 122872909 4328 49276625
chr4 122868570 122868585 FOXA1 JASPAR yes 122872909 4324 49276626
chr4 122868573 122868593 RREB1 JASPAR yes 122872909 4316 49276627
chr4 122868604 122868608 YY1 TRANSFAC yes 122872909 4301 49276628
chr4 122868633 122868636 MYB TRANSFAC yes 122872909 4273 49276629
chr4 122869381 122869387 TCF4 TRANSFAC yes 122872909 3522 49276630
chr4 122869396 122869404 FOXO3 JASPAR yes 122872909 3505 49276631
chr4 122869398 122869407 SOX9 JASPAR yes 122872909 3502 49276632
chr4 122869409 122869421 YY1 JASPAR yes 122872909 3488 49276633
chr4 122869416 122869430 GATA2 JASPAR yes 122872909 3479 49276634
chr4 122869421 122869435 RORA JASPAR yes 122872909 3474 49276635
chr4 122869424 122869434 RORA JASPAR yes 122872909 3475 49276636
chr4 122869426 122869441 NR2C2 JASPAR yes 122872909 3468 49276637
chr4 122869427 122869433 ESR1 TRANSFAC yes 122872909 3476 49276638
chr4 122869427 122869441 RXRB JASPAR yes 122872909 3468 49276639
chr4 122869429 122869433 ESR1 TRANSFAC yes 122872909 3476 49276640
chr4 122869432 122869446 ONECUT2 JASPAR yes 122872909 3463 49276641
chr4 122869432 122869446 ONECUT3 JASPAR yes 122872909 3463 49276642
chr4 122869456 122869477 IRF1 JASPAR yes 122872909 3432 49276643
chr4 122869458 122869473 PRDM1 JASPAR yes 122872909 3436 49276644
chr4 122869459 122869473 SPIC JASPAR yes 122872909 3436 49276645
chr4 122869470 122869481 DUX4 JASPAR yes 122872909 3428 49276646
chr4 122869474 122869480 YY1 JASPAR yes 122872909 3429 49276647
chr4 122869482 122869487 GATA2 JASPAR yes 122872909 3422 49276648
chr4 122869490 122869501 CEBPB JASPAR yes 122872909 3408 49276649
chr4 122869491 122869502 CEBPA JASPAR yes 122872909 3407 49276650
chr4 122869496 122869506 TEAD4 JASPAR yes 122872909 3403 49276651
chr4 122869513 122869534 IRF1 JASPAR yes 122872909 3375 49276652
chr4 122869515 122869530 STAT2 JASPAR yes 122872909 3379 49276653
chr4 122869518 122869533 FOXP1 JASPAR yes 122872909 3376 49276654
chr4 122869519 122869534 FOXP1 JASPAR yes 122872909 3375 49276655
SNPs associated with TRPC3[ENSG00000138741.6], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr4 122857568 rs6841843 C T 0 Heart 0.336698 7784785
chr4 122705811 rs75838156 G A 94371 Breast 0.0656937 7784617
chr4 122662452 rs149958807 C T 137730 Ovary 0.423357 7784484
chr4 122896490 rs9993043 T C 23581 Uterus 0.0455712 7784874
chr4 122899165 rs6838639 G A 26256 Thyroid 0.0137354 7784899
Details of TRPC3[ENSG00000138741.6]
Back to top
Genomic Location chr4:122800182-122872909[-]
TSS 122872909
Gene Name TRPC3
Ensembl ID ENSG00000138741.6
ENTREZID 7222
Uniprot
Q13507
Protein Name
Putative uncharacterized protein TRPC3
Short transient receptor potential channel 3
Transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 short isoform
Transient receptor potential cation channel subfamily C member 3 variant c
Expression levels of TRPC3[ENSG00000138741.6]
Back to top