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Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of enh55923[chr6:107535885-107547635]
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Tissue distribution of enh55923
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Transcription factor that possibly regulate enh55923[chr6:107535885-107547635]
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Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr6 107535892 107535909 RARA JASPAR yes 104089512
chr6 107535893 107535897 ESR1 TRANSFAC yes 104089513
chr6 107535900 107535911 ESRRA JASPAR yes 104089514
chr6 107535900 107535913 NR2F1 JASPAR yes 104089515
chr6 107535902 107535910 NR4A2 JASPAR yes 104089516
chr6 107535904 107535908 ESR1 TRANSFAC yes 104089517
chr6 107535905 107535915 TFAP4 JASPAR yes 104089518
chr6 107535922 107535928 SP1 TRANSFAC yes 104089519
chr6 107535922 107535932 SP1 JASPAR yes 104089520
chr6 107535932 107535944 YY1 JASPAR yes 104089521
chr6 107535946 107535950 LFA1 TRANSFAC yes 104089522
chr6 107535964 107535968 ESR1 TRANSFAC yes 104089523
chr6 107535968 107535979 PHOX2A JASPAR yes 104089524
chr6 107535968 107535979 PROP1 JASPAR yes 104089525
chr6 107535976 107535988 POU3F2 JASPAR yes 104089526
chr6 107535976 107535989 POU3F3 JASPAR yes 104089527
chr6 107535985 107535988 MYB TRANSFAC yes 104089528
chr6 107535994 107536014 RREB1 JASPAR yes 104089529
chr6 107536048 107536055 JUN TRANSFAC yes 104089530
chr6 107536061 107536072 E2F6 JASPAR yes 104089531
chr6 107536064 107536072 TBX15 JASPAR yes 104089532
chr6 107536084 107536087 MYB TRANSFAC yes 104089533
chr6 107536091 107536111 TBX19 JASPAR yes 104089534
chr6 107536093 107536105 PKNOX1 JASPAR yes 104089535
chr6 107536093 107536109 T JASPAR yes 104089536
chr6 107536094 107536103 SNAI2 JASPAR yes 104089537
chr6 107536094 107536104 FIGLA JASPAR yes 104089538
chr6 107536094 107536104 ID4 JASPAR yes 104089539
chr6 107536094 107536104 TCF3 JASPAR yes 104089540
chr6 107536094 107536104 TCF4 JASPAR yes 104089541
chr6 107536096 107536105 ZEB1 JASPAR yes 104089542
chr6 107536097 107536105 TBX5 JASPAR yes 104089543
chr6 107536103 107536119 ZNF143 JASPAR yes 104089544
chr6 107536108 107536118 SP1 JASPAR yes 104089545
chr6 107536111 107536120 HIC2 JASPAR yes 104089546
chr6 107536127 107536138 PHOX2A JASPAR yes 104089547
chr6 107536127 107536138 PROP1 JASPAR yes 104089548
chr6 107536129 107536139 HOXD13 JASPAR yes 104089549
chr6 107536136 107536143 NKX3-1 JASPAR yes 104089550
chr6 107536140 107536144 YY1 TRANSFAC yes 104089551
chr6 107536156 107536166 TEAD4 JASPAR yes 104089552
chr6 107536159 107536177 SRF JASPAR yes 104089553
chr6 107536161 107536170 NKX3-2 JASPAR yes 104089554
chr6 107536201 107536206 GATA2 JASPAR yes 104089555
chr6 107536231 107536240 SOX9 JASPAR yes 104089556
chr6 107536232 107536248 SOX8 JASPAR yes 104089557
chr6 107536266 107536270 YY1 TRANSFAC yes 104089558
chr6 107536273 107536277 TEAD2 TRANSFAC yes 104089559
chr6 107536273 107536278 TBP TRANSFAC yes 104089560
chr6 107536273 107536279 TMF TRANSFAC yes 104089561
chr6 107536280 107536284 TEAD2 TRANSFAC yes 104089562
chr6 107536282 107536285 MYB TRANSFAC yes 104089563
chr6 107536286 107536293 NKX3-1 JASPAR yes 104089564
chr6 107536291 107536302 PROP1 JASPAR yes 104089565
chr6 107536297 107536301 TEAD2 TRANSFAC yes 104089566
chr6 107536297 107536302 TBP TRANSFAC yes 104089567
chr6 107536297 107536303 TMF TRANSFAC yes 104089568
chr6 107536313 107536317 YY1 TRANSFAC yes 104089569
chr6 107536333 107536345 MEF2A JASPAR yes 104089570
chr6 107536333 107536345 MEF2D JASPAR yes 104089571
chr6 107536387 107536391 YY1 TRANSFAC yes 104089572
chr6 107536436 107536450 SPIC JASPAR yes 104089573
chr6 107536459 107536472 SMAD2 JASPAR yes 104089574
chr6 107536462 107536472 TBR1 JASPAR yes 104089575
chr6 107536463 107536473 TBX21 JASPAR yes 104089576
chr6 107536464 107536472 MGA JASPAR yes 104089577
chr6 107536464 107536472 TBX15 JASPAR yes 104089578
chr6 107536464 107536472 TBX1 JASPAR yes 104089579
chr6 107536464 107536472 TBX4 JASPAR yes 104089580
chr6 107536464 107536472 TBX5 JASPAR yes 104089581
chr6 107536464 107536473 ZEB1 JASPAR yes 104089582
chr6 107536464 107536476 PKNOX1 JASPAR yes 104089583
chr6 107536464 107536476 TGIF1 JASPAR yes 104089584
chr6 107536464 107536477 ZBTB18 JASPAR yes 104089585
chr6 107536465 107536475 FIGLA JASPAR yes 104089586
chr6 107536465 107536475 ID4 JASPAR yes 104089587
chr6 107536465 107536475 TCF3 JASPAR yes 104089588
chr6 107536465 107536475 TCF4 JASPAR yes 104089589
chr6 107536466 107536475 SNAI2 JASPAR yes 104089590
chr6 107536467 107536472 USF2 TRANSFAC yes 104089591
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chr6 107536471 107536487 RFX3 JASPAR yes 104089593
chr6 107536471 107536487 RFX4 JASPAR yes 104089594
chr6 107536489 107536510 ZNF263 JASPAR yes 104089595
chr6 107536496 107536503 CEBPA TRANSFAC yes 104089596
chr6 107536497 107536508 E2F6 JASPAR yes 104089597
chr6 107536503 107536523 PPARG JASPAR yes 104089598
chr6 107536546 107536562 SOX4 JASPAR yes 104089599
chr6 107536559 107536563 NFE TRANSFAC yes 104089600
chr6 107536568 107536580 CREB1 JASPAR yes 104089601
chr6 107536590 107536593 MYB TRANSFAC yes 104089602
chr6 107536596 107536602 TBP TRANSFAC yes 104089603
chr6 107536597 107536612 FOXP1 JASPAR yes 104089604
chr6 107536603 107536609 TBP TRANSFAC yes 104089605
chr6 107536606 107536621 STAT2 JASPAR yes 104089606
chr6 107536621 107536632 FOXH1 JASPAR yes 104089607
chr6 107536625 107536629 YY1 TRANSFAC yes 104089608
chr6 107536661 107536679 MAFF JASPAR yes 104089609
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chr6 107536675 107536679 YY1 TRANSFAC yes 104089615
chr6 107536676 107536686 HOXA13 JASPAR yes 104089616
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chr6 107536676 107536686 HOXC10 JASPAR yes 104089618
chr6 107536676 107536686 HOXD11 JASPAR yes 104089619
chr6 107536676 107536686 HOXD13 JASPAR yes 104089620
chr6 107536676 107536687 HOXC13 JASPAR yes 104089621
chr6 107536676 107536687 HOXD12 JASPAR yes 104089622
chr6 107536677 107536686 CDX1 JASPAR yes 104089623
chr6 107536703 107536711 HOXA5 JASPAR yes 104089624
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chr6 107536768 107536783 PRDM1 JASPAR yes 104089634
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chr6 107536786 107536793 FOXO6 JASPAR yes 104089645
chr6 107536786 107536793 FOXP3 JASPAR yes 104089646
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chr6 107536869 107536875 TBP TRANSFAC yes 104089659
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chr6 107536880 107536885 TBP TRANSFAC yes 104089661
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chr6 107536916 107536926 MEF2A JASPAR yes 104089667
chr6 107536916 107536930 ONECUT1 JASPAR yes 104089668
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chr6 107536920 107536935 HNF1A JASPAR yes 104089673
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chr6 107536921 107536937 POU4F2 JASPAR yes 104089676
chr6 107536921 107536937 POU4F3 JASPAR yes 104089677
chr6 107536925 107536941 POU4F2 JASPAR yes 104089678
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chr6 107536926 107536936 PAX7 JASPAR yes 104089680
chr6 107536927 107536941 POU4F1 JASPAR yes 104089681
chr6 107536927 107536942 HNF1A JASPAR yes 104089682
chr6 107536927 107536942 MEF2A JASPAR yes 104089683
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chr6 107536937 107536953 POU4F2 JASPAR yes 104089698
chr6 107536938 107536954 SOX8 JASPAR yes 104089699
chr6 107536946 107536957 PHOX2A JASPAR yes 104089700
chr6 107536946 107536957 PROP1 JASPAR yes 104089701
chr6 107536955 107536958 MYB TRANSFAC yes 104089702
chr6 107536975 107536988 DUXA JASPAR yes 104089703
chr6 107536976 107536987 DUX4 JASPAR yes 104089704
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chr6 107539183 107539189 ZNF354C JASPAR yes 104090111
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chr6 107545094 107545109 RFX5 JASPAR yes 104091117
chr6 107545115 107545128 SCRT2 JASPAR yes 104091118
chr6 107545130 107545135 SP1 TRANSFAC yes 104091119
chr6 107545131 107545151 PPARG JASPAR yes 104091120
chr6 107545144 107545148 YY1 TRANSFAC yes 104091121
chr6 107545155 107545174 CTCF JASPAR yes 104091122
chr6 107545167 107545171 NFE TRANSFAC yes 104091123
chr6 107545182 107545186 LFA1 TRANSFAC yes 104091124
chr6 107545185 107545189 YY1 TRANSFAC yes 104091125
chr6 107545191 107545211 TBX19 JASPAR yes 104091126
chr6 107545193 107545209 T JASPAR yes 104091127
chr6 107545200 107545210 TBX21 JASPAR yes 104091128
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chr6 107545200 107545211 TBX2 JASPAR yes 104091130
chr6 107545200 107545213 EOMES JASPAR yes 104091131
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chr6 107545206 107545221 ZIC4 JASPAR yes 104091139
chr6 107545225 107545242 BCL6B JASPAR yes 104091140
chr6 107545275 107545293 NR3C1 JASPAR yes 104091141
chr6 107545300 107545306 MZF1 JASPAR yes 104091142
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chr6 107545335 107545348 JUN JASPAR yes 104091145
chr6 107545349 107545354 TFAP2A TRANSFAC yes 104091146
chr6 107545349 107545355 MZF1 JASPAR yes 104091147
chr6 107545380 107545401 IRF1 JASPAR yes 104091148
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chr6 107545383 107545397 IRF8 JASPAR yes 104091151
chr6 107545384 107545398 STAT1 JASPAR yes 104091152
chr6 107545384 107545399 STAT2 JASPAR yes 104091153
chr6 107545384 107545402 IRF2 JASPAR yes 104091154
chr6 107545385 107545397 IRF1 JASPAR yes 104091155
chr6 107545396 107545404 NR4A2 JASPAR yes 104091156
chr6 107545399 107545415 SOX8 JASPAR yes 104091157
chr6 107545420 107545430 MYF6 JASPAR yes 104091158
chr6 107545422 107545427 MYC TRANSFAC yes 104091159
chr6 107545439 107545460 ZNF263 JASPAR yes 104091160
chr6 107545441 107545445 YY1 TRANSFAC yes 104091161
chr6 107545445 107545466 ZNF263 JASPAR yes 104091162
chr6 107545448 107545469 ZNF263 JASPAR yes 104091163
chr6 107545464 107545475 CDX2 JASPAR yes 104091164
chr6 107545465 107545475 MNX1 JASPAR yes 104091165
chr6 107545465 107545476 HOXA10 JASPAR yes 104091166
chr6 107545466 107545475 CDX1 JASPAR yes 104091167
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chr6 107545492 107545496 YY1 TRANSFAC yes 104091171
chr6 107545505 107545520 HNF1A JASPAR yes 104091172
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chr6 107545507 107545519 HNF1B JASPAR yes 104091174
chr6 107545507 107545523 POU4F3 JASPAR yes 104091175
chr6 107545509 107545523 POU4F1 JASPAR yes 104091176
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chr6 107545510 107545524 POU4F1 JASPAR yes 104091178
chr6 107545510 107545526 POU4F2 JASPAR yes 104091179
chr6 107545510 107545526 POU4F3 JASPAR yes 104091180
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chr6 107545511 107545522 PHOX2A JASPAR yes 104091182
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chr6 107545563 107545573 RELA JASPAR yes 104091191
chr6 107545563 107545573 REL JASPAR yes 104091192
chr6 107545567 107545573 ZNF354C JASPAR yes 104091193
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chr6 107547084 107547090 TBP TRANSFAC yes 104091521
chr6 107547120 107547128 FOXC1 JASPAR yes 104091522
chr6 107547122 107547129 NKX3-1 JASPAR yes 104091523
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SNP sites on enh55923[chr6:107535885-107547635]
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chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr6 107536470 rs147397545 C G
FIGLA ID4 MGA PKNOX1 SMAD2 SNAI2 TBR1 TBX1 TBX15 TBX21 TBX4 TBX5 TCF3 TCF4 TGIF1 USF2 ZBTB18 ZEB1
9239814
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FOXP1 TBP
9239815
chr6 107536822 rs6919118 T C
PRDM1
9239816
chr6 107536847 rs139641671 C T no 9239817
chr6 107536946 rs60506103 T C
PHOX2A POU1F1 POU2F1 POU3F3 POU4F2 PROP1 SOX8
9239818
chr6 107537007 rs17068076 T C
MEF2A
9239819
chr6 107537039 rs72939809 G C
HNF1A IRF1 IRF7 MEF2A
9239820
chr6 107537168 rs552808121 C T no 9239821
chr6 107537169 rs145168701 C T no 9239822
chr6 107537514 rs143947249 T C
MEF2A MEF2B MEF2C MEF2D
9239823
chr6 107537604 rs148623826 G C no 9239824
chr6 107537631 rs6568476 T C,G
CEBPB CEBPD CEBPE CEBPG
9239825
chr6 107537687 rs141392074 A C
FOXC2 FOXP1 FOXP2 IRF1 IRF7 MEF2C RREB1 RUNX2
9239826
chr6 107537734 rs6568477 C T no 9239827
chr6 107537736 rs76161285 C A,T
IRF9
9239828
chr6 107537750 rs185006664 C T
IRF9
9239829
chr6 107537908 rs113221085 T C
RARA
9239830
chr6 107537990 rs73525728 G C
MAZ RREB1 SP1 ZNF263
9239831
chr6 107538077 rs146855123 T C
FOXB1 MEF2A
9239832
chr6 107538109 rs7741724 G A
IRF1 IRF9 PRDM1 SPIC STAT1 STAT2
9239833
chr6 107538205 rs10456855 C T no 9239834
chr6 107538247 rs10457162 G A,T no 9239835
chr6 107538287 rs186368682 A G
MEF2C RREB1
9239836
chr6 107538368 rs73509118 C T no 9239837
chr6 107538436 rs547401464 T C
BCL6B GSC GSC2
9239838
chr6 107538477 rs7741987 A G
DUXA ZBTB18
9239839
chr6 107538756 rs145731942 A G
CDX1 CDX2 FOXP1 HOXA10 HOXA13 HOXB13 HOXD13 IRF1 STAT2 TBP
9239840
chr6 107538769 rs75803540 C A
IRF1 STAT2
9239841
chr6 107538895 rs78033788 A G
FOS FOSL1 FOSL2 JUN JUNB JUND
9239842
chr6 107538993 rs553807371 G A
ESR1 RORA
9239843
chr6 107539242 rs149141412 G A no 9239844
chr6 107539325 rs541077460 A G no 9239845
chr6 107539331 rs181028637 C T
YY1
9239846
chr6 107539438 rs142923225 A G no 9239847
chr6 107539445 rs1861419 G A no 9239848
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IRF1
9239849
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HSF1
9239850
chr6 107539599 rs4945774 C A
SMAD3
9239851
chr6 107539607 rs147006068 T C no 9239852
chr6 107539915 rs563771452 CT C
E2F6 PRDM1 ZNF263
9239853
chr6 107539989 rs543470468 C T
FOSL2 NFE2
9239854
chr6 107540024 rs150536770 G A,T
LUN1
9239855
chr6 107540095 rs139494290 C T no 9239856
chr6 107540120 rs527516208 G C
REST
9239857
chr6 107540160 rs368161897 G T no 9239858
chr6 107540209 rs6915343 C A
ESR1
9239859
chr6 107540211 rs6915653 G A
ESR1
9239860
chr6 107540240 rs569586453 T G no 9239861
chr6 107540255 rs535099320 T A
IRF2 NFE
9239862
chr6 107540257 rs143348447 T C
IRF2 NFE
9239863
chr6 107540279 rs566014752 A T
ALX3 GSX1 GSX2 IRF1 ISX LHX6 LMX1A LMX1B MIXL1 MNX1 NKX6-1 NKX6-2 NOTO ONECUT3 PAX3 PAX7 PHOX2A POU6F1 PROP1 PRRX1 RAX RAX2 SHOX UNCX VAX1
9239864
chr6 107540384 rs139068779 C T no 9239865
chr6 107540817 rs116962538 C T
DUXA
9239866
chr6 107540916 rs146874756 T C
RXRA
9239867
chr6 107541001 rs139700947 C T no 9239868
chr6 107541042 rs58213277 G A
FOXP2 GATA1 GATA2 GATA3 PTF SCRT1
9239869
chr6 107541055 rs569638411 A G
ATF4 POU4F1 POU4F2 POU4F3 YY1
9239870
chr6 107541144 rs566049684 A C
ETS2 HOXA10 HOXA13 HOXB13 HOXD13
9239871
chr6 107541244 rs182365384 T C,G no 9239872
chr6 107541315 rs34163709 TA T
SRF
9239873
chr6 107541348 rs36028245 T TTA no 9239874
chr6 107541348 rs72561574 T TTA no 9239875
chr6 107541397 rs76141739 G A no 9239876
chr6 107541471 rs142903420 G T
EMX1 EVX1 EVX2 HOXA2 HOXB3 NOTO POU1F1 POU3F1 POU3F2 POU3F3 POU3F4 POU6F2
9239877
chr6 107541557 rs151068032 T C
POU3F1 POU3F2 POU3F4 POU5F1B
9239878
chr6 107541578 rs568962090 CA C
POU2F2
9239879
chr6 107541657 rs140977129 G T
AR FOXI1 FOXP2
9239880
chr6 107541779 rs559235523 G GA
MYB
9239881
chr6 107541795 rs34660978 CA C
IRF1 LEF1
9239882
chr6 107541795 rs796211100 CA C
IRF1 LEF1
9239883
chr6 107541889 rs9398125 A C no 9239884
chr6 107541892 rs145727282 A G
NFATC3
9239885
chr6 107541981 rs552094388 A G
HOXA5 NOTO
9239886
chr6 107542087 rs9386625 G A no 9239887
chr6 107542089 rs141535861 G A no 9239888
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CEBPA CEBPB CEBPD CEBPE
9239890
chr6 107542272 rs563301747 C A no 9239891
chr6 107542274 rs147438926 C G
FOSL2
9239892
chr6 107542478 rs143638534 G A
SP1
9239893
chr6 107542518 rs551069259 C T
PAX5
9239894
chr6 107542522 rs143113062 G A,T
PAX5
9239895
chr6 107542547 rs61315837 A G
FOXP1 IRF1
9239896
chr6 107542677 rs11306502 CT C
ETS2 FEV FOXP1 IRF1 IRF2 NFKB1 REL RELA SPIC STAT2
9239897
chr6 107542677 rs397734458 CT C
ETS2 FEV FOXP1 IRF1 IRF2 NFKB1 REL RELA SPIC STAT2
9239898
chr6 107542845 rs115050293 C T
TP63 TP73
9239899
chr6 107543185 rs57515039 T C
POU1F1 POU2F1 POU2F2 POU3F1 POU3F2 POU3F3 POU3F4 POU5F1B
9239900
chr6 107543195 rs9386626 G A
E2F2 FOXP2
9239901
chr6 107543215 rs9386627 T C
H4TF1 IRF1 IRF8
9239902
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FOXC2 YY1 ZNF410
9239903
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FOXC2 RORA SRF TBP
9239904
chr6 107543402 rs9398126 T C
ESR1 NR2F1 NR4A2 RORA SRF
9239905
chr6 107543409 rs9480753 T A
TP53
9239906
chr6 107543468 rs150740285 C T no 9239907
chr6 107543581 rs12210932 G A
HIC2 LFA1
9239908
chr6 107543796 rs139134464 T C no 9239909
chr6 107543820 rs189500389 C T no 9239910
chr6 107543856 rs567984860 CA C
FOXP1 IRF1
9239911
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chr6 107544040 rs12191399 T C
FOSL2
9239914
chr6 107544041 rs575170961 G A
FOSL2
9239915
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CEBPA CEBPB
9239917
chr6 107544280 rs184174063 G A,C no 9239918
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chr6 107544309 rs567238695 C T
CREB1
9239920
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chr6 107544436 rs138104550 A AT
YY1
9239924
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chr6 107544741 rs148766338 A C
FOXA1 FOXC2 FOXI1 FOXP1 RREB1
9239926
chr6 107544832 rs185834594 C T no 9239927
chr6 107544951 rs538482645 T C no 9239928
chr6 107545115 rs574528150 A G
SCRT2
9239929
chr6 107545182 rs577439575 T C
LFA1
9239930
chr6 107545211 rs190600772 C A
EOMES TBR1 TBX19 TBX2 TBX20 ZIC1 ZIC4
9239931
chr6 107545245 rs576132877 T C no 9239932
chr6 107545267 rs147902784 T A no 9239933
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MZF1
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chr6 107545533 rs7771708 T C no 9239937
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chr6 107545640 rs141549529 G A
MEIS1 MEIS2 MEIS3
9239939
chr6 107545812 rs9386628 T G
FOXL1 MEF2A MEF2B MEF2D PRDM1
9239940
chr6 107545814 rs76815263 G T
MEF2A MEF2B MEF2D PRDM1
9239941
chr6 107546010 rs572177212 A G no 9239942
chr6 107546072 rs564462823 G T
ESR1
9239943
chr6 107546130 rs531566895 T C
ZBTB33
9239944
chr6 107546130 rs571068264 T TTGCAGTCATGCTGTTGGCCACGGC
ZBTB33
9239945
chr6 107546156 rs568178120 A G no 9239946
chr6 107546231 rs536860000 CCA C no 9239947
chr6 107546404 rs539053195 G A no 9239948
chr6 107546462 rs111360379 C T
HINFP SP1 ZNF263
9239949
chr6 107546469 rs111806954 C T no 9239950
chr6 107546477 rs111264699 T A,C
USF2
9239951
chr6 107546487 rs111576329 T C
ATF4
9239952
chr6 107546538 rs140868027 G A
HIC2 PAX5
9239953
chr6 107546769 rs187507832 G A,C no 9239954
chr6 107546788 rs73509140 A G
ALX3 BARX1 BSX EN1 EN2 ESX1 GBX1 GBX2 GSX1 HESX1 HOXA2 ISX LBX2 LHX2 LHX9 MIXL1 MSX1 MSX2 PLAG1 PRRX1 RAX RAX2 SHOX ZNF263
9239955
chr6 107547002 rs182921080 T G
IRF1 IRF9 STAT1
9239956
chr6 107547080 rs6568479 A G
FOXP1 NKX3-1
9239957
chr6 107547386 rs540845793 G A no 9239958
chr6 107547430 rs532852592 G A no 9239959
chr6 107547515 rs537695032 C CAAAAAAAAG no 9239960
Genes possibly regulated by enh55923[chr6:107535885-107547635]
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Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr6 107386386 107436473 - BEND3 ENSG00000178409.9 107436473 0.82 0.98 6843 588
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miRNAs possibly regulated by enh55923[chr6:107535885-107547635]
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Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
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