EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista24529[chr17:33572314-33572864]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista24529[chr17:33572314-33572864]
Back to top
Tissue distribution of vista24529
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista24529[chr17:33572314-33572864]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr17 33572070 33572901 POLR2A UCSC Txn Factor no Conserved 108251235
chr17 33572263 33572519 CEBPB UCSC Txn Factor no Conserved 108251248
chr17 33572340 33572348 FOXC1 JASPAR yes 21225108
chr17 33572354 33572360 SOX10 JASPAR yes 21225109
chr17 33572357 33572362 ETS2 TRANSFAC yes 21225110
chr17 33572357 33572371 JUN JASPAR yes 21225111
chr17 33572360 33572371 FOSL2 JASPAR yes 21225112
chr17 33572360 33572371 JUNB JASPAR yes 21225113
chr17 33572361 33572372 FOS JASPAR yes 21225114
chr17 33572361 33572372 JUND JASPAR yes 21225115
chr17 33572361 33572372 NFE2 JASPAR yes 21225116
chr17 33572362 33572371 JDP2 JASPAR yes 21225117
chr17 33572362 33572376 JUN JASPAR yes 21225118
chr17 33572374 33572384 SREBF1 JASPAR yes 21225119
chr17 33572374 33572384 SREBF2 JASPAR yes 21225120
chr17 33572375 33572390 NR2C2 JASPAR yes 21225121
chr17 33572377 33572394 RXRA JASPAR yes 21225122
chr17 33572389 33572395 ZNF354C JASPAR yes 21225123
chr17 33572392 33572398 YY1 JASPAR yes 21225124
chr17 33572402 33572407 H4TF1 TRANSFAC yes 21225125
chr17 33572402 33572415 ATF4 JASPAR yes 21225126
chr17 33572425 33572439 STAT1 JASPAR yes 21225127
chr17 33572425 33572439 STAT1 JASPAR yes 53997466
chr17 33572425 33572440 STAT2 JASPAR yes 21225128
chr17 33572425 33572440 STAT2 JASPAR yes 53997467
chr17 33572436 33572452 POU4F2 JASPAR yes 21225129
chr17 33572436 33572452 POU4F3 JASPAR yes 21225130
chr17 33572436 33572452 POU4F2 JASPAR yes 53997468
chr17 33572436 33572452 POU4F3 JASPAR yes 53997469
chr17 33572438 33572442 TEAD2 TRANSFAC yes 21225131
chr17 33572438 33572442 TEAD2 TRANSFAC yes 53997470
chr17 33572438 33572443 TBP TRANSFAC yes 21225132
chr17 33572438 33572443 TBP TRANSFAC yes 53997471
chr17 33572438 33572444 TMF TRANSFAC yes 21225133
chr17 33572438 33572444 TMF TRANSFAC yes 53997472
chr17 33572438 33572452 POU4F1 JASPAR yes 21225134
chr17 33572438 33572452 POU4F1 JASPAR yes 53997473
chr17 33572438 33572453 HNF1A JASPAR yes 21225135
chr17 33572438 33572453 HNF1A JASPAR yes 53997474
chr17 33572439 33572452 HNF1B JASPAR yes 21225136
chr17 33572439 33572452 HNF1B JASPAR yes 53997475
chr17 33572439 33572453 POU4F1 JASPAR yes 21225137
chr17 33572439 33572453 POU4F1 JASPAR yes 53997476
chr17 33572439 33572455 POU4F2 JASPAR yes 21225138
chr17 33572439 33572455 POU4F3 JASPAR yes 21225139
chr17 33572439 33572455 POU4F2 JASPAR yes 53997477
chr17 33572439 33572455 POU4F3 JASPAR yes 53997478
chr17 33572440 33572456 POU4F3 JASPAR yes 21225140
chr17 33572440 33572456 POU4F3 JASPAR yes 53997479
chr17 33572442 33572454 FOXI1 JASPAR yes 21225141
chr17 33572442 33572454 FOXI1 JASPAR yes 53997480
chr17 33572442 33572456 POU4F1 JASPAR yes 21225142
chr17 33572442 33572456 POU4F1 JASPAR yes 53997481
chr17 33572443 33572457 FOXF2 JASPAR yes 21225143
chr17 33572443 33572457 ONECUT3 JASPAR yes 21225144
chr17 33572443 33572457 FOXF2 JASPAR yes 53997482
chr17 33572443 33572457 ONECUT3 JASPAR yes 53997483
chr17 33572445 33572449 YY1 TRANSFAC yes 21225145
chr17 33572445 33572449 YY1 TRANSFAC yes 53997484
chr17 33572445 33572460 MEF2A JASPAR yes 21225146
chr17 33572445 33572460 MEF2A JASPAR yes 53997485
chr17 33572446 33572461 MEF2C JASPAR yes 21225147
chr17 33572446 33572461 MEF2C JASPAR yes 53997486
chr17 33572449 33572453 YY1 TRANSFAC yes 21225148
chr17 33572449 33572453 YY1 TRANSFAC yes 53997487
chr17 33572451 33572466 HSF1 JASPAR yes 21225149
chr17 33572451 33572466 HSF1 JASPAR yes 53997488
chr17 33572452 33572465 HSF1 JASPAR yes 21225150
chr17 33572452 33572465 HSF2 JASPAR yes 21225151
chr17 33572452 33572465 HSF4 JASPAR yes 21225152
chr17 33572452 33572465 HSF1 JASPAR yes 53997489
chr17 33572452 33572465 HSF2 JASPAR yes 53997490
chr17 33572452 33572465 HSF4 JASPAR yes 53997491
chr17 33572457 33572470 POU2F2 JASPAR yes 21225153
chr17 33572457 33572470 POU2F2 JASPAR yes 53997492
chr17 33572463 33572479 POU4F2 JASPAR yes 21225154
chr17 33572463 33572479 POU4F3 JASPAR yes 21225155
chr17 33572463 33572479 POU4F2 JASPAR yes 53997493
chr17 33572463 33572479 POU4F3 JASPAR yes 53997494
chr17 33572465 33572469 YY1 TRANSFAC yes 21225156
chr17 33572465 33572469 YY1 TRANSFAC yes 53997495
chr17 33572468 33572483 MEF2A JASPAR yes 21225157
chr17 33572468 33572483 MEF2A JASPAR yes 53997496
chr17 33572469 33572484 MEF2C JASPAR yes 21225158
chr17 33572469 33572484 MEF2C JASPAR yes 53997497
chr17 33572472 33572476 YY1 TRANSFAC yes 21225159
chr17 33572472 33572476 YY1 TRANSFAC yes 53997498
chr17 33572490 33572501 RUNX1 JASPAR yes 21225160
chr17 33572490 33572501 RUNX1 JASPAR yes 53997499
chr17 33572494 33572513 PAX5 JASPAR yes 21225161
chr17 33572494 33572513 PAX5 JASPAR yes 53997500
chr17 33572496 33572506 HMBOX1 JASPAR yes 21225162
chr17 33572496 33572506 HMBOX1 JASPAR yes 53997501
chr17 33572498 33572501 MYB TRANSFAC yes 21225163
chr17 33572498 33572501 MYB TRANSFAC yes 53997502
chr17 33572499 33572513 PAX6 JASPAR yes 21225164
chr17 33572499 33572513 PAX6 JASPAR yes 53997503
chr17 33572507 33572517 NFATC3 JASPAR yes 21225165
chr17 33572507 33572517 NFATC3 JASPAR yes 53997504
chr17 33572509 33572516 NFATC2 JASPAR yes 21225166
chr17 33572509 33572516 NFATC2 JASPAR yes 53997505
chr17 33572510 33572520 RELA JASPAR yes 21225167
chr17 33572510 33572520 RELA JASPAR yes 53997506
chr17 33572514 33572532 SRF JASPAR yes 21225168
chr17 33572514 33572532 SRF JASPAR yes 53997507
chr17 33572516 33572532 SRF JASPAR yes 21225169
chr17 33572516 33572532 SRF JASPAR yes 53997508
chr17 33572521 33572529 GATA3 JASPAR yes 21225170
chr17 33572521 33572529 GATA5 JASPAR yes 21225171
chr17 33572521 33572529 GATA3 JASPAR yes 53997509
chr17 33572521 33572529 GATA5 JASPAR yes 53997510
chr17 33572544 33572548 NFE TRANSFAC yes 21225172
chr17 33572544 33572548 NFE TRANSFAC yes 53997511
chr17 33572559 33572575 SOX4 JASPAR yes 21225173
chr17 33572559 33572575 SOX4 JASPAR yes 53997512
chr17 33572562 33572566 YY1 TRANSFAC yes 21225174
chr17 33572562 33572566 YY1 TRANSFAC yes 53997513
chr17 33572575 33572584 SRY JASPAR yes 21225175
chr17 33572575 33572584 SRY JASPAR yes 53997514
chr17 33572585 33572598 DUXA JASPAR yes 21225176
chr17 33572585 33572598 DUXA JASPAR yes 53997515
chr17 33572586 33572597 DUX4 JASPAR yes 21225177
chr17 33572586 33572597 PHOX2A JASPAR yes 21225178
chr17 33572586 33572597 DUX4 JASPAR yes 53997516
chr17 33572586 33572597 PHOX2A JASPAR yes 53997517
chr17 33572588 33572593 MYB TRANSFAC yes 21225179
chr17 33572588 33572593 MYB TRANSFAC yes 53997518
chr17 33572590 33572596 JUN TRANSFAC yes 21225180
chr17 33572590 33572596 JUN TRANSFAC yes 53997519
chr17 33572593 33572603 TFEC JASPAR yes 21225181
chr17 33572593 33572603 TFEC JASPAR yes 53997520
chr17 33572606 33572621 LEF1 JASPAR yes 21225182
chr17 33572606 33572621 LEF1 JASPAR yes 53997521
chr17 33572607 33572621 TCF7L2 JASPAR yes 21225183
chr17 33572607 33572621 TCF7L2 JASPAR yes 53997522
chr17 33572619 33572637 ESR1 JASPAR yes 21225184
chr17 33572619 33572637 ESR1 JASPAR yes 53997523
chr17 33572620 33572632 PKNOX2 JASPAR yes 21225185
chr17 33572620 33572632 TGIF1 JASPAR yes 21225186
chr17 33572620 33572632 TGIF2 JASPAR yes 21225187
chr17 33572620 33572632 PKNOX2 JASPAR yes 53997524
chr17 33572620 33572632 TGIF1 JASPAR yes 53997525
chr17 33572620 33572632 TGIF2 JASPAR yes 53997526
chr17 33572626 33572630 NFE TRANSFAC yes 21225188
chr17 33572626 33572630 NFE TRANSFAC yes 53997527
chr17 33572628 33572643 MAFK JASPAR yes 21225189
chr17 33572628 33572643 MAFK JASPAR yes 53997528
chr17 33572639 33572648 SOX9 JASPAR yes 21225190
chr17 33572639 33572648 SOX9 JASPAR yes 53997529
chr17 33572640 33572655 FOXP1 JASPAR yes 21225191
chr17 33572640 33572655 FOXP1 JASPAR yes 53997530
chr17 33572640 33572661 IRF1 JASPAR yes 21225192
chr17 33572640 33572661 IRF1 JASPAR yes 53997531
chr17 33572641 33572650 SRY JASPAR yes 21225193
chr17 33572641 33572650 SRY JASPAR yes 53997532
chr17 33572643 33572651 FOXO3 JASPAR yes 21225194
chr17 33572643 33572651 FOXO3 JASPAR yes 53997533
chr17 33572644 33572658 IRF8 JASPAR yes 21225195
chr17 33572644 33572658 IRF8 JASPAR yes 53997534
chr17 33572656 33572671 SOX21 JASPAR yes 21225196
chr17 33572656 33572671 SOX21 JASPAR yes 53997535
chr17 33572659 33572675 ZNF143 JASPAR yes 21225197
chr17 33572659 33572675 ZNF143 JASPAR yes 53997536
chr17 33572675 33572679 H1TF2 TRANSFAC yes 21225198
chr17 33572675 33572679 NFE TRANSFAC yes 21225199
chr17 33572675 33572679 SRF TRANSFAC yes 21225200
chr17 33572675 33572679 H1TF2 TRANSFAC yes 53997537
chr17 33572675 33572679 NFE TRANSFAC yes 53997538
chr17 33572675 33572679 SRF TRANSFAC yes 53997539
chr17 33572675 33572681 NFYC TRANSFAC yes 21225201
chr17 33572675 33572681 NFYC TRANSFAC yes 53997540
chr17 33572679 33572700 IRF1 JASPAR yes 21225202
chr17 33572679 33572700 IRF1 JASPAR yes 53997541
chr17 33572681 33572696 PRDM1 JASPAR yes 21225203
chr17 33572681 33572696 PRDM1 JASPAR yes 53997542
chr17 33572686 33572691 ETS2 TRANSFAC yes 21225204
chr17 33572686 33572691 ETS2 TRANSFAC yes 53997543
chr17 33572690 33572700 HOXA13 JASPAR yes 21225205
chr17 33572690 33572700 HOXB13 JASPAR yes 21225206
chr17 33572690 33572700 HOXC10 JASPAR yes 21225207
chr17 33572690 33572700 HOXD13 JASPAR yes 21225208
chr17 33572690 33572700 HOXA13 JASPAR yes 53997544
chr17 33572690 33572700 HOXB13 JASPAR yes 53997545
chr17 33572690 33572700 HOXC10 JASPAR yes 53997546
chr17 33572690 33572700 HOXD13 JASPAR yes 53997547
chr17 33572690 33572701 HOXA10 JASPAR yes 21225209
chr17 33572690 33572701 HOXA10 JASPAR yes 53997548
chr17 33572691 33572700 CDX1 JASPAR yes 21225210
chr17 33572691 33572700 CDX1 JASPAR yes 53997549
chr17 33572723 33572728 GATA2 JASPAR yes 21225211
chr17 33572723 33572728 GATA2 JASPAR yes 53997550
chr17 33572723 33572737 ONECUT1 JASPAR yes 21225212
chr17 33572723 33572737 ONECUT2 JASPAR yes 21225213
chr17 33572723 33572737 ONECUT3 JASPAR yes 21225214
chr17 33572723 33572737 ONECUT1 JASPAR yes 53997551
chr17 33572723 33572737 ONECUT2 JASPAR yes 53997552
chr17 33572723 33572737 ONECUT3 JASPAR yes 53997553
chr17 33572726 33572736 CUX1 JASPAR yes 21225215
chr17 33572726 33572736 CUX2 JASPAR yes 21225216
chr17 33572726 33572736 CUX1 JASPAR yes 53997554
chr17 33572726 33572736 CUX2 JASPAR yes 53997555
chr17 33572757 33572766 HIC2 JASPAR yes 21225217
chr17 33572757 33572766 HIC2 JASPAR yes 53997556
chr17 33572760 33572764 LFA1 TRANSFAC yes 21225218
chr17 33572760 33572764 LFA1 TRANSFAC yes 53997557
chr17 33572763 33572767 YY1 TRANSFAC yes 21225219
chr17 33572763 33572767 YY1 TRANSFAC yes 53997558
chr17 33572770 33572779 SRY JASPAR yes 21225220
chr17 33572770 33572779 SRY JASPAR yes 53997559
chr17 33572772 33572780 FOXO3 JASPAR yes 21225221
chr17 33572772 33572780 FOXO3 JASPAR yes 53997560
chr17 33572794 33572804 HOXB13 JASPAR yes 21225222
chr17 33572794 33572804 HOXB13 JASPAR yes 53997561
chr17 33572812 33572832 TP53 JASPAR yes 21225223
chr17 33572812 33572832 TP53 JASPAR yes 53997562
chr17 33572825 33572841 SRF JASPAR yes 21225224
chr17 33572825 33572841 SRF JASPAR yes 53997563
chr17 33572825 33572843 SRF JASPAR yes 21225225
chr17 33572825 33572843 SRF JASPAR yes 53997564
chr17 33572828 33572834 LEF1 TRANSFAC yes 21225226
chr17 33572828 33572834 SOX10 JASPAR yes 21225227
chr17 33572828 33572834 LEF1 TRANSFAC yes 53997565
chr17 33572828 33572834 SOX10 JASPAR yes 53997566
chr17 33572836 33572848 BHLHE23 JASPAR yes 21225228
chr17 33572836 33572848 BHLHE23 JASPAR yes 53997567
chr17 33572837 33572847 BHLHE22 JASPAR yes 21225229
chr17 33572837 33572847 NEUROD2 JASPAR yes 21225230
chr17 33572837 33572847 NEUROG2 JASPAR yes 21225231
chr17 33572837 33572847 OLIG1 JASPAR yes 21225232
chr17 33572837 33572847 OLIG2 JASPAR yes 21225233
chr17 33572837 33572847 OLIG3 JASPAR yes 21225234
chr17 33572837 33572847 BHLHE22 JASPAR yes 53997568
chr17 33572837 33572847 NEUROD2 JASPAR yes 53997569
chr17 33572837 33572847 NEUROG2 JASPAR yes 53997570
chr17 33572837 33572847 OLIG1 JASPAR yes 53997571
chr17 33572837 33572847 OLIG2 JASPAR yes 53997572
chr17 33572837 33572847 OLIG3 JASPAR yes 53997573
chr17 33572840 33572861 IRF1 JASPAR yes 21225235
chr17 33572840 33572861 IRF1 JASPAR yes 53997574
chr17 33572845 33572860 FOXP1 JASPAR yes 21225236
chr17 33572845 33572860 FOXP1 JASPAR yes 53997575
chr17 33572845 33572866 IRF1 JASPAR yes 21225237
chr17 33572845 33572866 IRF1 JASPAR yes 53997576
chr17 33572846 33572861 FOXP1 JASPAR yes 21225238
chr17 33572846 33572861 FOXP1 JASPAR yes 53997577
chr17 33572847 33572862 FOXP1 JASPAR yes 21225239
chr17 33572847 33572862 FOXP1 JASPAR yes 53997578
chr17 33572851 33572866 FOXP1 JASPAR yes 21225240
chr17 33572851 33572866 FOXP1 JASPAR yes 53997579
chr17 33572858 33572865 SPIB JASPAR yes 21225241
chr17 33572858 33572865 SPIB JASPAR yes 53997580
SNP sites on vista24529[chr17:33572314-33572864]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr17 33572545 rs11657549 C G
NFE POLR2A
4843409
chr17 33572656 rs139273746 C A
IRF1 IRF8 POLR2A SOX21
4843410
chr17 33572661 rs150060179 A G
IRF1 POLR2A SOX21 ZNF143
4843411
chr17 33572846 rs35157082 CT C
BHLHE22 BHLHE23 FOXP1 IRF1 NEUROD2 NEUROG2 OLIG1 OLIG2 OLIG3 POLR2A
4843412
chr17 33572846 rs397807952 CT C
BHLHE22 BHLHE23 FOXP1 IRF1 NEUROD2 NEUROG2 OLIG1 OLIG2 OLIG3 POLR2A
4843413
chr17 33572846 rs550130036 CT C
BHLHE22 BHLHE23 FOXP1 IRF1 NEUROD2 NEUROG2 OLIG1 OLIG2 OLIG3 POLR2A
4843414
Genes possibly regulated by vista24529[chr17:33572314-33572864]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr17 33474836 33516364 + UNC45B ENSG00000141161.7 33474836 0.99 1.0 15659 2522
chr17 33519539 33521412 - SLC35G3 ENSG00000164729.6 33521412 0.92 0.0 15660 49098
chr17 33570055 33600674 + SLFN5 ENSG00000166750.5 33570055 0.91 1.0 15661 97741
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista24529[chr17:33572314-33572864]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results