EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista52994[chr6:106589555-106589870]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista52994[chr6:106589555-106589870]
Back to top
Tissue distribution of vista52994
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista52994[chr6:106589555-106589870]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr6 106589661 106589942 RUNX3 UCSC Txn Factor no Conserved 108541179
chr6 106589541 106589562 REST JASPAR yes 70411372
chr6 106589541 106589562 REST JASPAR yes 104014366
chr6 106589558 106589572 NR2F1 JASPAR yes 70411373
chr6 106589558 106589572 NR2F1 JASPAR yes 104014367
chr6 106589587 106589602 ZIC4 JASPAR yes 70411374
chr6 106589587 106589602 ZIC4 JASPAR yes 104014368
chr6 106589591 106589600 SNAI2 JASPAR yes 70411375
chr6 106589591 106589600 SNAI2 JASPAR yes 104014369
chr6 106589598 106589613 HSF1 JASPAR yes 70411376
chr6 106589598 106589613 HSF1 JASPAR yes 104014370
chr6 106589609 106589626 BCL6B JASPAR yes 70411377
chr6 106589609 106589626 BCL6B JASPAR yes 104014371
chr6 106589613 106589628 MEF2C JASPAR yes 70411378
chr6 106589613 106589628 MEF2C JASPAR yes 104014372
chr6 106589614 106589629 MEF2A JASPAR yes 70411379
chr6 106589614 106589629 MEF2A JASPAR yes 104014373
chr6 106589615 106589627 MEF2A JASPAR yes 70411380
chr6 106589615 106589627 MEF2B JASPAR yes 70411381
chr6 106589615 106589627 MEF2D JASPAR yes 70411382
chr6 106589615 106589627 MEF2A JASPAR yes 104014374
chr6 106589615 106589627 MEF2B JASPAR yes 104014375
chr6 106589615 106589627 MEF2D JASPAR yes 104014376
chr6 106589616 106589626 MEF2A JASPAR yes 70411383
chr6 106589616 106589626 MEF2A JASPAR yes 104014377
chr6 106589633 106589648 HSF1 JASPAR yes 70411384
chr6 106589633 106589648 HSF1 JASPAR yes 104014378
chr6 106589634 106589647 HSF1 JASPAR yes 70411385
chr6 106589634 106589647 HSF2 JASPAR yes 70411386
chr6 106589634 106589647 HSF4 JASPAR yes 70411387
chr6 106589634 106589647 HSF1 JASPAR yes 104014379
chr6 106589634 106589647 HSF2 JASPAR yes 104014380
chr6 106589634 106589647 HSF4 JASPAR yes 104014381
chr6 106589643 106589658 MEF2C JASPAR yes 70411388
chr6 106589643 106589658 MEF2C JASPAR yes 104014382
chr6 106589644 106589659 MEF2A JASPAR yes 70411389
chr6 106589644 106589659 MEF2A JASPAR yes 104014383
chr6 106589645 106589657 MEF2A JASPAR yes 70411390
chr6 106589645 106589657 MEF2B JASPAR yes 70411391
chr6 106589645 106589657 MEF2D JASPAR yes 70411392
chr6 106589645 106589657 MEF2A JASPAR yes 104014384
chr6 106589645 106589657 MEF2B JASPAR yes 104014385
chr6 106589645 106589657 MEF2D JASPAR yes 104014386
chr6 106589646 106589656 MEF2A JASPAR yes 70411393
chr6 106589646 106589656 MEF2A JASPAR yes 104014387
chr6 106589662 106589676 SPI1 JASPAR yes 70411394
chr6 106589662 106589676 SPI1 JASPAR yes 104014388
chr6 106589670 106589676 TCF4 TRANSFAC yes 70411395
chr6 106589670 106589676 TCF4 TRANSFAC yes 104014389
chr6 106589682 106589692 GSC JASPAR yes 70411396
chr6 106589682 106589692 GSC JASPAR yes 104014390
chr6 106589683 106589691 RHOXF1 JASPAR yes 70411397
chr6 106589683 106589691 RHOXF1 JASPAR yes 104014391
chr6 106589683 106589692 PITX3 JASPAR yes 70411398
chr6 106589683 106589692 PITX3 JASPAR yes 104014392
chr6 106589683 106589700 ESR1 JASPAR yes 70411399
chr6 106589683 106589700 ESR1 JASPAR yes 104014393
chr6 106589683 106589701 ESR1 JASPAR yes 70411400
chr6 106589683 106589701 ESR2 JASPAR yes 70411401
chr6 106589683 106589701 ESR1 JASPAR yes 104014394
chr6 106589683 106589701 ESR2 JASPAR yes 104014395
chr6 106589684 106589699 ESR2 JASPAR yes 70411402
chr6 106589684 106589699 ESR2 JASPAR yes 104014396
chr6 106589691 106589702 ESRRA JASPAR yes 70411403
chr6 106589691 106589702 ESRRA JASPAR yes 104014397
chr6 106589692 106589700 NR4A2 JASPAR yes 70411404
chr6 106589692 106589700 NR4A2 JASPAR yes 104014398
chr6 106589693 106589707 RXRG JASPAR yes 70411405
chr6 106589693 106589707 RXRG JASPAR yes 104014399
chr6 106589693 106589708 HNF4G JASPAR yes 70411406
chr6 106589693 106589708 HNF4G JASPAR yes 104014400
chr6 106589703 106589714 EBF1 JASPAR yes 70411407
chr6 106589703 106589714 EBF1 JASPAR yes 104014401
chr6 106589707 106589718 NFKB1 JASPAR yes 70411408
chr6 106589707 106589718 NFKB1 JASPAR yes 104014402
chr6 106589708 106589713 SP1 TRANSFAC yes 70411409
chr6 106589708 106589713 SP1 TRANSFAC yes 104014403
chr6 106589710 106589724 GLIS2 JASPAR yes 70411410
chr6 106589710 106589724 ZIC1 JASPAR yes 70411411
chr6 106589710 106589724 GLIS2 JASPAR yes 104014404
chr6 106589710 106589724 ZIC1 JASPAR yes 104014405
chr6 106589713 106589722 SP1 TRANSFAC yes 70411412
chr6 106589713 106589722 SP1 TRANSFAC yes 104014406
chr6 106589714 106589720 SP1 TRANSFAC yes 70411413
chr6 106589714 106589720 SP1 TRANSFAC yes 104014407
chr6 106589714 106589724 SP1 JASPAR yes 70411414
chr6 106589714 106589724 SP1 JASPAR yes 104014408
chr6 106589715 106589722 SP1 TRANSFAC yes 70411415
chr6 106589715 106589722 SP1 TRANSFAC yes 104014409
chr6 106589716 106589721 SP1 TRANSFAC yes 70411416
chr6 106589716 106589721 SP1 TRANSFAC yes 104014410
chr6 106589716 106589722 SP1 TRANSFAC yes 70411417
chr6 106589716 106589722 SP1 TRANSFAC yes 104014411
chr6 106589731 106589749 RARA JASPAR yes 70411418
chr6 106589731 106589749 RARA JASPAR yes 104014412
chr6 106589735 106589751 SOX4 JASPAR yes 70411419
chr6 106589735 106589751 SOX4 JASPAR yes 104014413
chr6 106589736 106589751 SOX21 JASPAR yes 70411420
chr6 106589736 106589751 SOX21 JASPAR yes 104014414
chr6 106589737 106589752 PRDM1 JASPAR yes 70411421
chr6 106589737 106589752 PRDM1 JASPAR yes 104014415
chr6 106589746 106589759 POU2F2 JASPAR yes 70411422
chr6 106589746 106589759 POU2F2 JASPAR yes 104014416
chr6 106589759 106589763 YY1 TRANSFAC yes 70411423
chr6 106589759 106589763 YY1 TRANSFAC yes 104014417
chr6 106589772 106589785 ZBTB18 JASPAR yes 70411424
chr6 106589772 106589785 ZBTB18 JASPAR yes 104014418
chr6 106589773 106589784 USF2 JASPAR yes 70411425
chr6 106589773 106589784 USF2 JASPAR yes 104014419
chr6 106589774 106589784 MAX JASPAR yes 70411426
chr6 106589774 106589784 MAX JASPAR yes 104014420
chr6 106589787 106589795 OTX1 JASPAR yes 70411427
chr6 106589787 106589795 OTX1 JASPAR yes 104014421
chr6 106589794 106589811 BCL6B JASPAR yes 70411428
chr6 106589794 106589811 BCL6B JASPAR yes 104014422
chr6 106589795 106589810 STAT1 JASPAR yes 70411429
chr6 106589795 106589810 STAT1 JASPAR yes 104014423
chr6 106589797 106589808 STAT1 JASPAR yes 70411430
chr6 106589797 106589808 STAT1 JASPAR yes 104014424
chr6 106589797 106589810 ELF1 JASPAR yes 70411431
chr6 106589797 106589810 ELF1 JASPAR yes 104014425
chr6 106589799 106589810 ETV2 JASPAR yes 70411432
chr6 106589799 106589810 ETV2 JASPAR yes 104014426
chr6 106589800 106589810 ERF JASPAR yes 70411433
chr6 106589800 106589810 ERG JASPAR yes 70411434
chr6 106589800 106589810 ETS1 JASPAR yes 70411435
chr6 106589800 106589810 ETV3 JASPAR yes 70411436
chr6 106589800 106589810 FEV JASPAR yes 70411437
chr6 106589800 106589810 FLI1 JASPAR yes 70411438
chr6 106589800 106589810 GABPA JASPAR yes 70411439
chr6 106589800 106589810 ERF JASPAR yes 104014427
chr6 106589800 106589810 ERG JASPAR yes 104014428
chr6 106589800 106589810 ETS1 JASPAR yes 104014429
chr6 106589800 106589810 ETV3 JASPAR yes 104014430
chr6 106589800 106589810 FEV JASPAR yes 104014431
chr6 106589800 106589810 FLI1 JASPAR yes 104014432
chr6 106589800 106589810 GABPA JASPAR yes 104014433
chr6 106589800 106589811 ELK4 JASPAR yes 70411440
chr6 106589800 106589811 FLI1 JASPAR yes 70411441
chr6 106589800 106589811 ELK4 JASPAR yes 104014434
chr6 106589800 106589811 FLI1 JASPAR yes 104014435
chr6 106589801 106589809 EHF JASPAR yes 70411442
chr6 106589801 106589809 FEV JASPAR yes 70411443
chr6 106589801 106589809 EHF JASPAR yes 104014436
chr6 106589801 106589809 FEV JASPAR yes 104014437
chr6 106589802 106589809 SPI1 JASPAR yes 70411444
chr6 106589802 106589809 SPI1 JASPAR yes 104014438
chr6 106589802 106589822 PPARG JASPAR yes 70411445
chr6 106589802 106589822 PPARG JASPAR yes 104014439
chr6 106589815 106589829 RXRB JASPAR yes 70411446
chr6 106589815 106589829 RXRG JASPAR yes 70411447
chr6 106589815 106589829 RXRB JASPAR yes 104014440
chr6 106589815 106589829 RXRG JASPAR yes 104014441
chr6 106589822 106589825 MYB TRANSFAC yes 70411448
chr6 106589822 106589825 MYB TRANSFAC yes 104014442
chr6 106589835 106589847 FOXI1 JASPAR yes 70411449
chr6 106589835 106589847 FOXI1 JASPAR yes 104014443
chr6 106589836 106589848 MEF2B JASPAR yes 70411450
chr6 106589836 106589848 MEF2D JASPAR yes 70411451
chr6 106589836 106589848 MEF2B JASPAR yes 104014444
chr6 106589836 106589848 MEF2D JASPAR yes 104014445
chr6 106589838 106589842 YY1 TRANSFAC yes 70411452
chr6 106589838 106589842 YY1 TRANSFAC yes 104014446
chr6 106589838 106589848 HOXA13 JASPAR yes 70411453
chr6 106589838 106589848 HOXB13 JASPAR yes 70411454
chr6 106589838 106589848 HOXD13 JASPAR yes 70411455
chr6 106589838 106589848 HOXA13 JASPAR yes 104014447
chr6 106589838 106589848 HOXB13 JASPAR yes 104014448
chr6 106589838 106589848 HOXD13 JASPAR yes 104014449
chr6 106589838 106589849 HOXA10 JASPAR yes 70411456
chr6 106589838 106589849 HOXA10 JASPAR yes 104014450
chr6 106589839 106589848 CDX1 JASPAR yes 70411457
chr6 106589839 106589848 CDX1 JASPAR yes 104014451
chr6 106589839 106589850 CDX2 JASPAR yes 70411458
chr6 106589839 106589850 CDX2 JASPAR yes 104014452
chr6 106589840 106589854 ONECUT2 JASPAR yes 70411459
chr6 106589840 106589854 ONECUT3 JASPAR yes 70411460
chr6 106589840 106589854 ONECUT2 JASPAR yes 104014453
chr6 106589840 106589854 ONECUT3 JASPAR yes 104014454
chr6 106589844 106589859 STAT2 JASPAR yes 70411461
chr6 106589844 106589859 STAT2 JASPAR yes 104014455
chr6 106589847 106589868 IRF1 JASPAR yes 70411462
chr6 106589847 106589868 IRF1 JASPAR yes 104014456
chr6 106589848 106589869 ZNF263 JASPAR yes 70411463
chr6 106589848 106589869 ZNF263 JASPAR yes 104014457
chr6 106589853 106589874 IRF1 JASPAR yes 70411464
chr6 106589853 106589874 IRF1 JASPAR yes 104014458
chr6 106589855 106589870 PRDM1 JASPAR yes 70411465
chr6 106589855 106589870 PRDM1 JASPAR yes 104014459
chr6 106589856 106589877 ZNF263 JASPAR yes 70411466
chr6 106589856 106589877 ZNF263 JASPAR yes 104014460
chr6 106589859 106589880 ZNF263 JASPAR yes 70411467
chr6 106589859 106589880 ZNF263 JASPAR yes 104014461
chr6 106589862 106589883 ZNF263 JASPAR yes 70411468
chr6 106589862 106589883 ZNF263 JASPAR yes 104014462
chr6 106589865 106589886 ZNF263 JASPAR yes 70411469
chr6 106589865 106589886 ZNF263 JASPAR yes 104014463
SNP sites on vista52994[chr6:106589555-106589870]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr6 106589597 rs560708313 G A
SNAI2 ZIC4
9232171
chr6 106589718 rs145270714 C T
GLIS2 NFKB1 RUNX3 SP1 ZIC1
9232172
chr6 106589786 rs147221140 G A
RUNX3
9232173
Genes possibly regulated by vista52994[chr6:106589555-106589870]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr6 106534195 106557814 + PRDM1 ENSG00000057657.10 106534195 0.89 0.97 6837 44640
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista52994[chr6:106589555-106589870]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results