EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista5453[chr1:229296726-229296995]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista5453[chr1:229296726-229296995]
Back to top
Tissue distribution of vista5453
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista5453[chr1:229296726-229296995]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 229296721 229296736 FOXP1 JASPAR yes 35968310
chr1 229296721 229296736 FOXP1 JASPAR yes 118475493
chr1 229296723 229296744 IRF1 JASPAR yes 35968311
chr1 229296723 229296744 IRF1 JASPAR yes 118475494
chr1 229296725 229296740 FOXP1 JASPAR yes 35968312
chr1 229296725 229296740 FOXP1 JASPAR yes 118475495
chr1 229296726 229296741 FOXP1 JASPAR yes 35968313
chr1 229296726 229296741 FOXP1 JASPAR yes 118475496
chr1 229296727 229296733 TBP TRANSFAC yes 35968314
chr1 229296727 229296733 TBP TRANSFAC yes 118475497
chr1 229296727 229296742 FOXP1 JASPAR yes 35968315
chr1 229296727 229296742 FOXP1 JASPAR yes 118475498
chr1 229296728 229296743 FOXP1 JASPAR yes 35968316
chr1 229296728 229296743 FOXP1 JASPAR yes 118475499
chr1 229296728 229296749 IRF1 JASPAR yes 35968317
chr1 229296728 229296749 IRF1 JASPAR yes 118475500
chr1 229296729 229296744 FOXP1 JASPAR yes 35968318
chr1 229296729 229296744 FOXP1 JASPAR yes 118475501
chr1 229296729 229296750 IRF1 JASPAR yes 35968319
chr1 229296729 229296750 IRF1 JASPAR yes 118475502
chr1 229296730 229296745 FOXP1 JASPAR yes 35968320
chr1 229296730 229296745 FOXP1 JASPAR yes 118475503
chr1 229296740 229296756 POU4F2 JASPAR yes 35968321
chr1 229296740 229296756 POU4F3 JASPAR yes 35968322
chr1 229296740 229296756 POU4F2 JASPAR yes 118475504
chr1 229296740 229296756 POU4F3 JASPAR yes 118475505
chr1 229296742 229296756 POU4F1 JASPAR yes 35968323
chr1 229296742 229296756 POU4F1 JASPAR yes 118475506
chr1 229296745 229296752 NKX3-1 JASPAR yes 35968324
chr1 229296745 229296752 NKX3-1 JASPAR yes 118475507
chr1 229296745 229296757 HNF1B JASPAR yes 35968325
chr1 229296745 229296757 HNF1B JASPAR yes 118475508
chr1 229296749 229296753 YY1 TRANSFAC yes 35968326
chr1 229296749 229296753 YY1 TRANSFAC yes 118475509
chr1 229296753 229296756 MYB TRANSFAC yes 35968327
chr1 229296753 229296756 MYB TRANSFAC yes 118475510
chr1 229296759 229296770 BATF JASPAR yes 35968328
chr1 229296759 229296770 BATF JASPAR yes 118475511
chr1 229296761 229296772 FOS JASPAR yes 35968329
chr1 229296761 229296772 FOS JASPAR yes 118475512
chr1 229296762 229296771 JDP2 JASPAR yes 35968330
chr1 229296762 229296771 JDP2 JASPAR yes 118475513
chr1 229296762 229296773 JUNB JASPAR yes 35968331
chr1 229296762 229296773 JUNB JASPAR yes 118475514
chr1 229296762 229296776 JUN JASPAR yes 35968332
chr1 229296762 229296776 JUN JASPAR yes 118475515
chr1 229296763 229296774 BATF JASPAR yes 35968333
chr1 229296763 229296774 BATF JASPAR yes 118475516
chr1 229296767 229296776 SOX9 JASPAR yes 35968334
chr1 229296767 229296776 SOX9 JASPAR yes 118475517
chr1 229296769 229296778 SRY JASPAR yes 35968335
chr1 229296769 229296778 SRY JASPAR yes 118475518
chr1 229296772 229296783 CEBPA JASPAR yes 35968336
chr1 229296772 229296783 CEBPA JASPAR yes 118475519
chr1 229296776 229296786 NKX2-3 JASPAR yes 35968337
chr1 229296776 229296786 NKX2-3 JASPAR yes 118475520
chr1 229296793 229296814 IRF1 JASPAR yes 35968338
chr1 229296793 229296814 IRF1 JASPAR yes 118475521
chr1 229296798 229296802 YY1 TRANSFAC yes 35968339
chr1 229296798 229296802 YY1 TRANSFAC yes 118475522
chr1 229296798 229296813 FOXP1 JASPAR yes 35968340
chr1 229296798 229296813 FOXP1 JASPAR yes 118475523
chr1 229296799 229296814 FOXP1 JASPAR yes 35968341
chr1 229296799 229296814 FOXP1 JASPAR yes 118475524
chr1 229296800 229296815 FOXP1 JASPAR yes 35968342
chr1 229296800 229296815 FOXP1 JASPAR yes 118475525
chr1 229296827 229296830 MYB TRANSFAC yes 35968343
chr1 229296827 229296830 MYB TRANSFAC yes 118475526
chr1 229296847 229296861 MTF1 JASPAR yes 35968344
chr1 229296847 229296861 MTF1 JASPAR yes 118475527
chr1 229296891 229296902 FOXB1 JASPAR yes 35968345
chr1 229296891 229296902 FOXB1 JASPAR yes 118475528
chr1 229296892 229296896 YY1 TRANSFAC yes 35968346
chr1 229296892 229296896 YY1 TRANSFAC yes 118475529
chr1 229296926 229296937 CDX2 JASPAR yes 35968347
chr1 229296926 229296937 CDX2 JASPAR yes 118475530
chr1 229296927 229296938 HOXA10 JASPAR yes 35968348
chr1 229296927 229296938 HOXA10 JASPAR yes 118475531
chr1 229296928 229296937 CDX1 JASPAR yes 35968349
chr1 229296928 229296937 CDX1 JASPAR yes 118475532
chr1 229296928 229296938 HOXA13 JASPAR yes 35968350
chr1 229296928 229296938 HOXB13 JASPAR yes 35968351
chr1 229296928 229296938 HOXD13 JASPAR yes 35968352
chr1 229296928 229296938 HOXA13 JASPAR yes 118475533
chr1 229296928 229296938 HOXB13 JASPAR yes 118475534
chr1 229296928 229296938 HOXD13 JASPAR yes 118475535
chr1 229296937 229296947 NKX2-3 JASPAR yes 35968353
chr1 229296937 229296947 NKX2-3 JASPAR yes 118475536
chr1 229296938 229296947 NKX2-8 JASPAR yes 35968354
chr1 229296938 229296947 NKX2-8 JASPAR yes 118475537
chr1 229296955 229296969 SPI1 JASPAR yes 35968355
chr1 229296955 229296969 SPI1 JASPAR yes 118475538
chr1 229296959 229296980 IRF1 JASPAR yes 35968356
chr1 229296959 229296980 IRF1 JASPAR yes 118475539
chr1 229296961 229296982 IRF1 JASPAR yes 35968357
chr1 229296961 229296982 IRF1 JASPAR yes 118475540
chr1 229296962 229296983 IRF1 JASPAR yes 35968358
chr1 229296962 229296983 IRF1 JASPAR yes 118475541
chr1 229296963 229296978 FOXP1 JASPAR yes 35968359
chr1 229296963 229296978 FOXP1 JASPAR yes 118475542
chr1 229296963 229296984 IRF1 JASPAR yes 35968360
chr1 229296963 229296984 IRF1 JASPAR yes 118475543
chr1 229296964 229296979 FOXP1 JASPAR yes 35968361
chr1 229296964 229296979 FOXP1 JASPAR yes 118475544
chr1 229296964 229296985 IRF1 JASPAR yes 35968362
chr1 229296964 229296985 IRF1 JASPAR yes 118475545
chr1 229296965 229296980 FOXP1 JASPAR yes 35968363
chr1 229296965 229296980 FOXP1 JASPAR yes 118475546
chr1 229296965 229296986 IRF1 JASPAR yes 35968364
chr1 229296965 229296986 IRF1 JASPAR yes 118475547
chr1 229296966 229296981 FOXP1 JASPAR yes 35968365
chr1 229296966 229296981 FOXP1 JASPAR yes 118475548
chr1 229296966 229296987 IRF1 JASPAR yes 35968366
chr1 229296966 229296987 IRF1 JASPAR yes 118475549
chr1 229296967 229296982 FOXP1 JASPAR yes 35968367
chr1 229296967 229296982 FOXP1 JASPAR yes 118475550
chr1 229296967 229296988 IRF1 JASPAR yes 35968368
chr1 229296967 229296988 IRF1 JASPAR yes 118475551
chr1 229296968 229296983 FOXP1 JASPAR yes 35968369
chr1 229296968 229296983 FOXP1 JASPAR yes 118475552
chr1 229296968 229296989 IRF1 JASPAR yes 35968370
chr1 229296968 229296989 IRF1 JASPAR yes 118475553
chr1 229296969 229296984 FOXP1 JASPAR yes 35968371
chr1 229296969 229296984 FOXP1 JASPAR yes 118475554
chr1 229296969 229296990 IRF1 JASPAR yes 35968372
chr1 229296969 229296990 IRF1 JASPAR yes 118475555
chr1 229296970 229296985 FOXP1 JASPAR yes 35968373
chr1 229296970 229296985 FOXP1 JASPAR yes 118475556
chr1 229296970 229296991 IRF1 JASPAR yes 35968374
chr1 229296970 229296991 IRF1 JASPAR yes 118475557
chr1 229296971 229296986 FOXP1 JASPAR yes 35968375
chr1 229296971 229296986 FOXP1 JASPAR yes 118475558
chr1 229296971 229296992 IRF1 JASPAR yes 35968376
chr1 229296971 229296992 IRF1 JASPAR yes 118475559
chr1 229296972 229296987 FOXP1 JASPAR yes 35968377
chr1 229296972 229296987 FOXP1 JASPAR yes 118475560
chr1 229296972 229296993 IRF1 JASPAR yes 35968378
chr1 229296972 229296993 IRF1 JASPAR yes 118475561
chr1 229296973 229296988 FOXP1 JASPAR yes 35968379
chr1 229296973 229296988 FOXP1 JASPAR yes 118475562
chr1 229296973 229296994 IRF1 JASPAR yes 35968380
chr1 229296973 229296994 IRF1 JASPAR yes 118475563
chr1 229296974 229296989 FOXP1 JASPAR yes 35968381
chr1 229296974 229296989 FOXP1 JASPAR yes 118475564
chr1 229296974 229296995 IRF1 JASPAR yes 35968382
chr1 229296974 229296995 IRF1 JASPAR yes 118475565
chr1 229296975 229296990 FOXP1 JASPAR yes 35968383
chr1 229296975 229296990 FOXP1 JASPAR yes 118475566
chr1 229296975 229296996 IRF1 JASPAR yes 35968384
chr1 229296975 229296996 IRF1 JASPAR yes 118475567
chr1 229296976 229296991 FOXP1 JASPAR yes 35968385
chr1 229296976 229296991 FOXP1 JASPAR yes 118475568
chr1 229296977 229296992 FOXP1 JASPAR yes 35968386
chr1 229296977 229296992 FOXP1 JASPAR yes 118475569
chr1 229296978 229296993 FOXP1 JASPAR yes 35968387
chr1 229296978 229296993 FOXP1 JASPAR yes 118475570
chr1 229296979 229296994 FOXP1 JASPAR yes 35968388
chr1 229296979 229296994 FOXP1 JASPAR yes 118475571
chr1 229296980 229296995 FOXP1 JASPAR yes 35968389
chr1 229296980 229296995 FOXP1 JASPAR yes 118475572
chr1 229296981 229296996 FOXP1 JASPAR yes 35968390
chr1 229296981 229296996 FOXP1 JASPAR yes 118475573
chr1 229296982 229296997 FOXP1 JASPAR yes 35968391
chr1 229296982 229296997 FOXP1 JASPAR yes 118475574
chr1 229296983 229296998 FOXP1 JASPAR yes 35968392
chr1 229296983 229296998 FOXP1 JASPAR yes 118475575
chr1 229296986 229297001 MEF2C JASPAR yes 35968393
chr1 229296986 229297001 MEF2C JASPAR yes 118475576
SNP sites on vista5453[chr1:229296726-229296995]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 229296728 rs375790245 T TA
FOXP1 IRF1 TBP
1008651
chr1 229296728 rs59320021 T TA,TAAA
FOXP1 IRF1 TBP
1008652
chr1 229296800 rs71697581 A AT,ATT,ATTT
FOXP1 IRF1 YY1
1008653
chr1 229296812 rs560799039 T A
FOXP1 IRF1
1008654
Genes possibly regulated by vista5453[chr1:229296726-229296995]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 229385383 229387557 + TMEM78 ENSG00000177800.2 229385383 0.93 0.96 1928 11612
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista5453[chr1:229296726-229296995]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results