EnhancerDB
  1. Home
  2. SNP
  3. rs115999153[chr1:89776427]
Enhancers that have rs115999153[chr1:89776427]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr1 89773625 89779735 enh12024
Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Brain (SK-N-MC) Large Intestine Lung Stomach Muscle (A673) Placenta Peripheral Blood (MM.1S) Blood (T-cell) Kidney
chr1 89776158 89776579 vista2369
VISTA
Transcript factors that have rs115999153[chr1:89776427]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr1 89774855 89776782 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107813448
chr1 89774855 89776782 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107813449
chr1 89776076 89776624 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107813451
chr1 89776261 89776737 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 107813452
chr1 89776287 89776523 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 107813453
chr1 89776391 89776758 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107813454
chr1 89776399 89776718 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107813455
chr1 89776418 89776429 FOXP2 JASPAR yes 30593286
chr1 89776418 89776429 FOXP2 JASPAR yes 118324672
chr1 89776419 89776427 FOXD1 JASPAR yes 30593287
chr1 89776419 89776427 FOXG1 JASPAR yes 30593288
chr1 89776419 89776427 FOXO3 JASPAR yes 30593289
chr1 89776419 89776427 FOXD1 JASPAR yes 118324673
chr1 89776419 89776427 FOXG1 JASPAR yes 118324674
chr1 89776419 89776427 FOXO3 JASPAR yes 118324675
chr1 89776420 89776427 FOXD2 JASPAR yes 30593290
chr1 89776420 89776427 FOXI1 JASPAR yes 30593291
chr1 89776420 89776427 FOXL1 JASPAR yes 30593292
chr1 89776420 89776427 FOXO4 JASPAR yes 30593293
chr1 89776420 89776427 FOXO6 JASPAR yes 30593294
chr1 89776420 89776427 FOXP3 JASPAR yes 30593295
chr1 89776420 89776427 FOXD2 JASPAR yes 118324676
chr1 89776420 89776427 FOXI1 JASPAR yes 118324677
chr1 89776420 89776427 FOXL1 JASPAR yes 118324678
chr1 89776420 89776427 FOXO4 JASPAR yes 118324679
chr1 89776420 89776427 FOXO6 JASPAR yes 118324680
chr1 89776420 89776427 FOXP3 JASPAR yes 118324681
chr1 89776420 89776428 FOXO3 JASPAR yes 30593296
chr1 89776420 89776428 FOXO3 JASPAR yes 118324682
chr1 89776420 89776435 STAT1 JASPAR yes 30593297
chr1 89776420 89776435 STAT1 JASPAR yes 118324683
chr1 89776422 89776433 STAT1 JASPAR yes 30593298
chr1 89776422 89776433 STAT1 JASPAR yes 118324684
chr1 89776424 89776435 ETV2 JASPAR yes 30593299
chr1 89776424 89776435 ETV2 JASPAR yes 118324685
chr1 89776425 89776435 ERF JASPAR yes 30593300
chr1 89776425 89776435 ERG JASPAR yes 30593301
chr1 89776425 89776435 ETS1 JASPAR yes 30593302
chr1 89776425 89776435 FEV JASPAR yes 30593303
chr1 89776425 89776435 FLI1 JASPAR yes 30593304
chr1 89776425 89776435 ERF JASPAR yes 118324686
chr1 89776425 89776435 ERG JASPAR yes 118324687
chr1 89776425 89776435 ETS1 JASPAR yes 118324688
chr1 89776425 89776435 FEV JASPAR yes 118324689
chr1 89776425 89776435 FLI1 JASPAR yes 118324690
chr1 89776425 89776436 ELK4 JASPAR yes 30593305
chr1 89776425 89776436 FLI1 JASPAR yes 30593306
chr1 89776425 89776436 ELK4 JASPAR yes 118324691
chr1 89776425 89776436 FLI1 JASPAR yes 118324692
chr1 89776426 89776434 FEV JASPAR yes 30593307
chr1 89776426 89776434 FEV JASPAR yes 118324693
chr1 89776427 89776438 NFKB1 JASPAR yes 30593308
chr1 89776427 89776438 NFKB1 JASPAR yes 118324694
Genes associated with rs115999153[chr1:89776427], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More