EnhancerDB
  1. Home
  2. SNP
  3. rs1552288[chr15:59689784]
Enhancers that have rs1552288[chr15:59689784]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr15 59684485 59707557 enh3625
Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Large Intestine Blood (OCI-LY7) Blood (GM12878) Placenta Thyroid Peripheral Blood (MM.1S) Blood (Karpas-422) Pancreas Spleen Stomach
Transcript factors that have rs1552288[chr15:59689784]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr15 59686998 59690284 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655820
chr15 59686998 59690284 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141851
chr15 59686998 59690284 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141852
chr15 59687318 59690878 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141854
chr15 59687328 59690751 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141855
chr15 59687390 59690175 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655822
chr15 59687390 59690175 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141856
chr15 59687410 59690204 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141857
chr15 59687418 59690667 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141858
chr15 59687455 59690024 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655823
chr15 59687455 59690024 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141859
chr15 59687459 59689800 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141860
chr15 59687464 59690174 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655824
chr15 59687464 59690174 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141861
chr15 59687507 59690213 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655825
chr15 59687507 59690213 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141862
chr15 59687528 59690353 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141864
chr15 59687533 59690507 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141865
chr15 59687538 59690647 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141866
chr15 59687542 59690333 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141867
chr15 59687562 59690229 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141868
chr15 59687605 59690206 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655826
chr15 59687605 59690206 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141869
chr15 59687608 59689903 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141870
chr15 59687624 59690664 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141871
chr15 59687626 59690677 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141872
chr15 59687637 59690122 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655827
chr15 59687637 59690122 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141873
chr15 59687648 59690304 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141874
chr15 59687655 59690284 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655828
chr15 59687655 59690284 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141875
chr15 59687676 59690653 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141877
chr15 59687691 59690188 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655830
chr15 59687691 59690188 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141878
chr15 59687709 59690048 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655831
chr15 59687709 59690048 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141879
chr15 59687712 59690255 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141880
chr15 59687716 59690246 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141881
chr15 59687739 59689788 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108141883
chr15 59687767 59690490 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141884
chr15 59687770 59690744 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141885
chr15 59687792 59690136 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141886
chr15 59687826 59690297 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655833
chr15 59687826 59690297 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141887
chr15 59687835 59690166 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141888
chr15 59687892 59690301 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141891
chr15 59688001 59690343 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141893
chr15 59688134 59690232 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141894
chr15 59688191 59690323 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141896
chr15 59688262 59689810 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655834
chr15 59688262 59689810 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141897
chr15 59688269 59689907 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141899
chr15 59688278 59690299 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141901
chr15 59688285 59690084 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655835
chr15 59688285 59690084 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141902
chr15 59688288 59690683 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108141903
chr15 59688291 59690274 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141904
chr15 59688295 59689844 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108141905
chr15 59688304 59690201 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655836
chr15 59688304 59690201 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141906
chr15 59688306 59689952 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141907
chr15 59688317 59690222 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141908
chr15 59688324 59689961 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655837
chr15 59688324 59689961 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141910
chr15 59688328 59690346 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141911
chr15 59688331 59689809 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655838
chr15 59688331 59689809 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141912
chr15 59688332 59690018 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141913
chr15 59688334 59689805 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108141914
chr15 59688337 59690262 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655839
chr15 59688337 59690262 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141915
chr15 59688345 59690185 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655840
chr15 59688345 59690185 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141916
chr15 59688347 59690101 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141918
chr15 59688347 59690103 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141919
chr15 59688348 59690271 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141921
chr15 59688366 59690299 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141926
chr15 59688367 59690203 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141927
chr15 59688369 59690336 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655845
chr15 59688369 59690336 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141928
chr15 59688371 59689957 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141929
chr15 59688373 59689820 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655847
chr15 59688373 59689820 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141931
chr15 59688373 59690133 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141932
chr15 59688373 59690239 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141933
chr15 59688377 59690281 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141934
chr15 59688383 59689864 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655848
chr15 59688383 59689864 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141935
chr15 59688391 59690086 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655849
chr15 59688391 59690086 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141936
chr15 59688393 59690240 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141937
chr15 59688403 59690252 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141939
chr15 59688405 59690299 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141940
chr15 59688406 59690077 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655851
chr15 59688406 59690077 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141941
chr15 59688408 59690292 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141942
chr15 59688422 59689867 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655852
chr15 59688422 59689867 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141944
chr15 59688422 59690310 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141945
chr15 59688435 59689871 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655853
chr15 59688435 59689871 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108141948
chr15 59688439 59690341 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141949
chr15 59688440 59690168 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141950
chr15 59688440 59690247 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108141951
chr15 59688444 59690201 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655854
chr15 59688444 59690201 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141953
chr15 59688459 59690213 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655855
chr15 59688459 59690213 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141955
chr15 59688468 59690335 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108141958
chr15 59688521 59690287 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141966
chr15 59688568 59690168 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141974
chr15 59688588 59690276 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108141976
chr15 59688620 59690237 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108141982
chr15 59688623 59690390 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108141983
chr15 59688627 59689927 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108141984
chr15 59688629 59690254 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141985
chr15 59688635 59690293 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21655863
chr15 59688635 59690293 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108141987
chr15 59688648 59690050 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141988
chr15 59688676 59690108 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108141993
chr15 59688693 59689989 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108142003
chr15 59688715 59690122 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108142008
chr15 59688771 59689905 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655875
chr15 59688771 59689905 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108142018
chr15 59688771 59690159 CTCF GTRD no Spleen 21655876
chr15 59688771 59690159 CTCF GTRD no Spleen 108142019
chr15 59688802 59689855 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108142024
chr15 59688814 59690225 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108142026
chr15 59688865 59690238 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108142037
chr15 59688873 59690159 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108142039
chr15 59688874 59689926 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21655885
chr15 59688874 59689926 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108142040
chr15 59689774 59689789 MEF2C JASPAR yes 23737662
chr15 59689775 59689790 MEF2A JASPAR yes 23737663
chr15 59689776 59689787 FOXC1 JASPAR yes 23737667
chr15 59689776 59689788 MEF2A JASPAR yes 23737668
chr15 59689784 59689788 TEAD2 TRANSFAC yes 23737669
chr15 59689784 59689789 TBP TRANSFAC yes 23737670
chr15 59689784 59689790 TFIID TRANSFAC yes 23737671
Genes associated with rs1552288[chr15:59689784], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More