Enhancers that have rs55762977[chr17:73309338]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr17 73302368 73312615 enh17374

Transcript factors that have rs55762977[chr17:73309338]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr17 73307714 73313231 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21787342
chr17 73307714 73313231 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293606
chr17 73307714 73313231 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293607
chr17 73307729 73312720 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108293608
chr17 73307729 73312720 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108293609
chr17 73307755 73312771 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108293610
chr17 73307755 73312771 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108293611
chr17 73307779 73309354 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21787345
chr17 73307821 73313055 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21787357
chr17 73307821 73313055 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108293612
chr17 73307821 73313055 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108293613
chr17 73307845 73313117 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21787362
chr17 73307845 73313117 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293614
chr17 73307845 73313117 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293615
chr17 73307913 73313168 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21787374
chr17 73307913 73313168 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108293616
chr17 73307913 73313168 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108293617
chr17 73307926 73313489 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108293618
chr17 73307926 73313489 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108293619
chr17 73307938 73312735 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108293620
chr17 73307938 73312735 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108293621
chr17 73309022 73313112 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21787463
chr17 73309022 73313112 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293622
chr17 73309022 73313112 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293623
chr17 73309029 73313046 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21787464
chr17 73309029 73313046 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293624
chr17 73309029 73313046 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293625
chr17 73309065 73313037 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108293626
chr17 73309065 73313037 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108293627
chr17 73309092 73313142 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21787465
chr17 73309092 73313142 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293628
chr17 73309092 73313142 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293629
chr17 73309135 73309445 ZNF217 ENCODE Uniform TFBS no Epithelial (MCF-7) 21787466
chr17 73309152 73313077 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21787467
chr17 73309152 73313077 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293630
chr17 73309152 73313077 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293631
chr17 73309171 73312967 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21787468
chr17 73309171 73312967 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293632
chr17 73309171 73312967 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293633
chr17 73309185 73313159 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21787469
chr17 73309185 73313159 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293634
chr17 73309185 73313159 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293635
chr17 73309211 73312755 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108293636
chr17 73309211 73312755 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108293637
chr17 73309219 73311622 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21787470
chr17 73309219 73311622 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293638
chr17 73309225 73312597 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21787471
chr17 73309225 73312597 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293639
chr17 73309225 73312597 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108293640
chr17 73309285 73311241 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108293641
chr17 73309293 73312862 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 21787472
chr17 73309293 73312862 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108293642
chr17 73309293 73312862 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108293643
chr17 73309309 73310992 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108293644
chr17 73309313 73313146 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108293645
chr17 73309313 73313146 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108293646
chr17 73309326 73309339 SMAD2 JASPAR yes 55942940
chr17 73309336 73309345 ZEB1 JASPAR yes 55942941

Genes associated with rs55762977[chr17:73309338], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More