EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. MS4A12[ENSG00000071203.5]
Enhancers that regulate MS4A12[ENSG00000071203.5]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr11 60221945 60226095 enh1802 60260251 34156
Blood (Karpas-422)
chr11 60242565 60253875 enh1803 60260251 6376
Blood (OCI-LY7) Spleen Peripheral Blood (MM.1S) Blood (Karpas-422)
chr11 60263396 60268075 enh67808 60260251 3145
Neural Stem Cells (H9)
chr11 60329930 60334030 enh86070 60260251 69679
Colon (HCT116)
Transcript facotrs that regulate MS4A12[ENSG00000071203.5]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr11 60263952 60263958 HiNF-A TRANSFAC yes 60260251 3701 39111699
chr11 60263953 60263964 BATF JASPAR yes 60260251 3702 39111700
chr11 60263967 60263971 YY1 TRANSFAC yes 60260251 3716 39111701
chr11 60263995 60264004 NKX2-8 JASPAR yes 60260251 3744 39111702
chr11 60263995 60264005 NKX2-3 JASPAR yes 60260251 3744 39111703
chr11 60263996 60264004 ISL2 JASPAR yes 60260251 3745 39111704
chr11 60263996 60264005 NKX3-2 JASPAR yes 60260251 3745 39111705
chr11 60263999 60264008 HIC2 JASPAR yes 60260251 3748 39111706
chr11 60264002 60264006 LFA1 TRANSFAC yes 60260251 3751 39111707
chr11 60264003 60264013 BHLHE22 JASPAR yes 60260251 3752 39111708
chr11 60264015 60264019 NFE TRANSFAC yes 60260251 3764 39111709
chr11 60264015 60264020 GATA1 TRANSFAC yes 60260251 3764 39111710
chr11 60264015 60264021 GATA3 JASPAR yes 60260251 3764 39111711
chr11 60264026 60264036 EN2 JASPAR yes 60260251 3775 39111712
chr11 60264026 60264036 GBX1 JASPAR yes 60260251 3775 39111713
chr11 60264026 60264036 GSX1 JASPAR yes 60260251 3775 39111714
chr11 60264027 60264031 H1TF2 TRANSFAC yes 60260251 3776 39111715
chr11 60264027 60264031 NFE TRANSFAC yes 60260251 3776 39111716
chr11 60264027 60264031 SRF TRANSFAC yes 60260251 3776 39111717
chr11 60264027 60264035 BSX JASPAR yes 60260251 3776 39111718
chr11 60264027 60264035 DLX6 JASPAR yes 60260251 3776 39111719
chr11 60264027 60264035 MSX1 JASPAR yes 60260251 3776 39111720
chr11 60264027 60264035 MSX2 JASPAR yes 60260251 3776 39111721
chr11 60264027 60264044 BCL6B JASPAR yes 60260251 3776 39111722
chr11 60264029 60264037 HOXA5 JASPAR yes 60260251 3778 39111723
chr11 60264037 60264046 SRY JASPAR yes 60260251 3786 39111724
chr11 60264040 60264055 SOX21 JASPAR yes 60260251 3789 39111725
chr11 60264108 60264120 FOXI1 JASPAR yes 60260251 3857 39111726
chr11 60264111 60264115 YY1 TRANSFAC yes 60260251 3860 39111727
chr11 60264113 60264125 FOXC2 JASPAR yes 60260251 3862 39111728
chr11 60264114 60264125 FOXB1 JASPAR yes 60260251 3863 39111729
chr11 60264114 60264125 FOXC1 JASPAR yes 60260251 3863 39111730
chr11 60264121 60264125 TEAD2 TRANSFAC yes 60260251 3870 39111731
chr11 60264123 60264126 MYB TRANSFAC yes 60260251 3872 39111732
chr11 60264130 60264141 RUNX1 JASPAR yes 60260251 3879 39111733
chr11 60264150 60264159 SRY JASPAR yes 60260251 3899 39111734
chr11 60264153 60264168 SOX21 JASPAR yes 60260251 3902 39111735
chr11 60264153 60264169 SOX4 JASPAR yes 60260251 3902 39111736
chr11 60264153 60264169 SOX8 JASPAR yes 60260251 3902 39111737
chr11 60264158 60264162 TEAD2 TRANSFAC yes 60260251 3907 39111738
chr11 60264160 60264171 PROP1 JASPAR yes 60260251 3909 39111739
chr11 60264162 60264176 GATA2 JASPAR yes 60260251 3911 39111740
chr11 60264166 60264174 GATA3 JASPAR yes 60260251 3915 39111741
chr11 60264178 60264192 RORA JASPAR yes 60260251 3927 39111742
chr11 60264186 60264190 ESR1 TRANSFAC yes 60260251 3935 39111743
chr11 60264196 60264200 H1TF2 TRANSFAC yes 60260251 3945 39111744
chr11 60264196 60264200 NFE TRANSFAC yes 60260251 3945 39111745
chr11 60264196 60264200 SRF TRANSFAC yes 60260251 3945 39111746
chr11 60264223 60264234 TBX2 JASPAR yes 60260251 3972 39111747
chr11 60264224 60264232 TBX15 JASPAR yes 60260251 3973 39111748
chr11 60264224 60264232 TBX1 JASPAR yes 60260251 3973 39111749
chr11 60264224 60264232 TBX4 JASPAR yes 60260251 3973 39111750
chr11 60264224 60264232 TBX5 JASPAR yes 60260251 3973 39111751
chr11 60264228 60264239 NRL JASPAR yes 60260251 3977 39111752
chr11 60264231 60264242 NFE2L2 JASPAR yes 60260251 3980 39111753
chr11 60264243 60264248 ETS2 TRANSFAC yes 60260251 3992 39111754
chr11 60264245 60264253 EHF JASPAR yes 60260251 3994 39111755
chr11 60264246 60264257 STAT1 JASPAR yes 60260251 3995 39111756
chr11 60264262 60264267 ETS2 TRANSFAC yes 60260251 4011 39111757
chr11 60264266 60264281 IRF9 JASPAR yes 60260251 4015 39111758
chr11 60264275 60264280 ETS2 TRANSFAC yes 60260251 4024 39111759
chr11 60264329 60264337 EHF JASPAR yes 60260251 4078 39111760
chr11 60264341 60264360 PAX5 JASPAR yes 60260251 4090 39111761
chr11 60264345 60264350 MYC TRANSFAC yes 60260251 4094 39111762
chr11 60264348 60264354 NFIC JASPAR yes 60260251 4097 39111763
chr11 60264366 60264376 GSX1 JASPAR yes 60260251 4115 39111764
chr11 60264407 60264411 ESR1 TRANSFAC yes 60260251 4156 39111765
chr11 60264450 60264456 MZF1 JASPAR yes 60260251 4199 39111766
chr11 60264468 60264482 ZIC1 JASPAR yes 60260251 4217 39111767
chr11 60264497 60264501 H1TF2 TRANSFAC yes 60260251 4246 39111768
chr11 60264497 60264501 NFE TRANSFAC yes 60260251 4246 39111769
chr11 60264497 60264501 SRF TRANSFAC yes 60260251 4246 39111770
chr11 60264508 60264518 SREBF2 JASPAR yes 60260251 4257 39111771
chr11 60264553 60264568 JUND JASPAR yes 60260251 4302 39111772
chr11 60264554 60264567 JUN JASPAR yes 60260251 4303 39111773
chr11 60264555 60264562 JUN TRANSFAC yes 60260251 4304 39111774
chr11 60264585 60264600 RUNX2 JASPAR yes 60260251 4334 39111775
chr11 60264586 60264596 RUNX3 JASPAR yes 60260251 4335 39111776
chr11 60264593 60264605 PKNOX1 JASPAR yes 60260251 4342 39111777
chr11 60264593 60264605 PKNOX2 JASPAR yes 60260251 4342 39111778
chr11 60264607 60264627 RREB1 JASPAR yes 60260251 4356 39111779
chr11 60264622 60264627 TFAP2A TRANSFAC yes 60260251 4371 39111780
chr11 60264622 60264628 MZF1 JASPAR yes 60260251 4371 39111781
chr11 60264646 60264650 NFE TRANSFAC yes 60260251 4395 39111782
chr11 60264649 60264664 RFX5 JASPAR yes 60260251 4398 39111783
chr11 60264650 60264655 MYC TRANSFAC yes 60260251 4399 39111784
chr11 60264664 60264668 YY1 TRANSFAC yes 60260251 4413 39111785
chr11 60264686 60264699 POU2F2 JASPAR yes 60260251 4435 39111786
chr11 60264686 60264700 POU1F1 JASPAR yes 60260251 4435 39111787
chr11 60264687 60264699 POU3F1 JASPAR yes 60260251 4436 39111788
chr11 60264687 60264699 POU3F2 JASPAR yes 60260251 4436 39111789
chr11 60264687 60264700 POU3F3 JASPAR yes 60260251 4436 39111790
chr11 60264688 60264692 YY1 TRANSFAC yes 60260251 4437 39111791
chr11 60264688 60264700 POU2F1 JASPAR yes 60260251 4437 39111792
chr11 60264689 60264696 POU2F1 TRANSFAC yes 60260251 4438 39111793
chr11 60264689 60264696 POU2F2C TRANSFAC yes 60260251 4438 39111794
chr11 60264689 60264696 POU2F2 TRANSFAC yes 60260251 4438 39111795
chr11 60264689 60264697 POU2F1 TRANSFAC yes 60260251 4438 39111796
chr11 60264689 60264698 POU3F4 JASPAR yes 60260251 4438 39111797
chr11 60264689 60264698 POU5F1B JASPAR yes 60260251 4438 39111798
chr11 60264691 60264705 POU4F1 JASPAR yes 60260251 4440 39111799
chr11 60264691 60264707 POU4F2 JASPAR yes 60260251 4440 39111800
chr11 60264691 60264707 POU4F3 JASPAR yes 60260251 4440 39111801
chr11 60264698 60264708 HESX1 JASPAR yes 60260251 4447 39111802
chr11 60264698 60264708 RAX JASPAR yes 60260251 4447 39111803
chr11 60264704 60264716 PKNOX1 JASPAR yes 60260251 4453 39111804
chr11 60264704 60264716 PKNOX2 JASPAR yes 60260251 4453 39111805
chr11 60264704 60264716 TGIF1 JASPAR yes 60260251 4453 39111806
chr11 60264704 60264716 TGIF2 JASPAR yes 60260251 4453 39111807
chr11 60264704 60264718 RXRB JASPAR yes 60260251 4453 39111808
chr11 60264704 60264718 RXRG JASPAR yes 60260251 4453 39111809
chr11 60264707 60264711 YY1 TRANSFAC yes 60260251 4456 39111810
chr11 60264714 60264718 YY1 TRANSFAC yes 60260251 4463 39111811
chr11 60264726 60264741 FOXP1 JASPAR yes 60260251 4475 39111812
chr11 60264730 60264751 IRF1 JASPAR yes 60260251 4479 39111813
chr11 60264732 60264747 STAT2 JASPAR yes 60260251 4481 39111814
chr11 60264733 60264747 STAT1 JASPAR yes 60260251 4482 39111815
chr11 60264746 60264751 GATA2 JASPAR yes 60260251 4495 39111816
chr11 60264748 60264766 IRF2 JASPAR yes 60260251 4497 39111817
chr11 60264753 60264768 IRF9 JASPAR yes 60260251 4502 39111818
chr11 60264777 60264784 NKX3-1 JASPAR yes 60260251 4526 39111819
chr11 60264783 60264800 RARA JASPAR yes 60260251 4532 39111820
chr11 60264787 60264802 JUND JASPAR yes 60260251 4536 39111821
chr11 60264788 60264798 POU6F2 JASPAR yes 60260251 4537 39111822
chr11 60264788 60264801 JUN JASPAR yes 60260251 4537 39111823
chr11 60264789 60264802 ATF4 JASPAR yes 60260251 4538 39111824
chr11 60264789 60264803 ATF7 JASPAR yes 60260251 4538 39111825
chr11 60264789 60264803 BATF3 JASPAR yes 60260251 4538 39111826
chr11 60264790 60264802 JDP2 JASPAR yes 60260251 4539 39111827
chr11 60264790 60264805 JUND JASPAR yes 60260251 4539 39111828
chr11 60264819 60264840 IRF1 JASPAR yes 60260251 4568 39111829
chr11 60264823 60264837 STAT1 JASPAR yes 60260251 4572 39111830
chr11 60264823 60264838 STAT2 JASPAR yes 60260251 4572 39111831
chr11 60264823 60264841 IRF2 JASPAR yes 60260251 4572 39111832
chr11 60264848 60264864 ZNF143 JASPAR yes 60260251 4597 39111833
chr11 60264862 60264871 CDX1 JASPAR yes 60260251 4611 39111834
chr11 60264862 60264873 CDX2 JASPAR yes 60260251 4611 39111835
chr11 60264876 60264881 H4TF1 TRANSFAC yes 60260251 4625 39111836
chr11 60264895 60264906 FOXH1 JASPAR yes 60260251 4644 39111837
chr11 60264914 60264932 ESR2 JASPAR yes 60260251 4663 39111838
chr11 60264939 60264951 TFAP2A JASPAR yes 60260251 4688 39111839
chr11 60264939 60264951 TFAP2B JASPAR yes 60260251 4688 39111840
chr11 60264939 60264951 TFAP2C JASPAR yes 60260251 4688 39111841
chr11 60264953 60264973 TP53 JASPAR yes 60260251 4702 39111842
chr11 60264956 60264967 STAT1 JASPAR yes 60260251 4705 39111843
chr11 60264967 60264973 TCF4 TRANSFAC yes 60260251 4716 39111844
chr11 60264974 60264991 PAX1 JASPAR yes 60260251 4723 39111845
chr11 60264974 60264991 PAX9 JASPAR yes 60260251 4723 39111846
chr11 60264986 60264990 ESR1 TRANSFAC yes 60260251 4735 39111847
chr11 60264990 60264995 ETS2 TRANSFAC yes 60260251 4739 39111848
chr11 60264990 60264998 FEV JASPAR yes 60260251 4739 39111849
chr11 60264995 60265007 POU2F1 JASPAR yes 60260251 4744 39111850
chr11 60264995 60265008 POU3F3 JASPAR yes 60260251 4744 39111851
chr11 60264995 60265009 POU1F1 JASPAR yes 60260251 4744 39111852
chr11 60264996 60265008 POU3F1 JASPAR yes 60260251 4745 39111853
chr11 60264996 60265008 POU3F2 JASPAR yes 60260251 4745 39111854
chr11 60264996 60265009 POU2F2 JASPAR yes 60260251 4745 39111855
chr11 60265030 60265040 MEOX2 JASPAR yes 60260251 4779 39111856
chr11 60265031 60265041 POU6F2 JASPAR yes 60260251 4780 39111857
chr11 60265041 60265055 SPI1 JASPAR yes 60260251 4790 39111858
chr11 60265061 60265071 MZF1 JASPAR yes 60260251 4810 39111859
chr11 60265074 60265078 YY1 TRANSFAC yes 60260251 4823 39111860
chr11 60265074 60265085 HOXC12 JASPAR yes 60260251 4823 39111861
chr11 60265100 60265104 YY1 TRANSFAC yes 60260251 4849 39111862
chr11 60265117 60265121 TEAD2 TRANSFAC yes 60260251 4866 39111863
chr11 60265132 60265152 TBX19 JASPAR yes 60260251 4881 39111864
chr11 60265140 60265144 H1TF2 TRANSFAC yes 60260251 4889 39111865
chr11 60265140 60265144 NFE TRANSFAC yes 60260251 4889 39111866
chr11 60265140 60265144 SRF TRANSFAC yes 60260251 4889 39111867
chr11 60265195 60265199 YY1 TRANSFAC yes 60260251 4944 39111868
chr11 60265211 60265226 PRDM1 JASPAR yes 60260251 4960 39111869
chr11 60265228 60265232 YY1 TRANSFAC yes 60260251 4977 39111870
chr11 60265228 60265242 IRF7 JASPAR yes 60260251 4977 39111871
chr11 60265233 60265237 YY1 TRANSFAC yes 60260251 4982 39111872
chr11 60265239 60265251 PBX1 JASPAR yes 60260251 4988 39111873
SNPs associated with MS4A12[ENSG00000071203.5], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr11 60266408 rs10792280 G A 0 Thyroid 2.53061e-30 2020336
Details of MS4A12[ENSG00000071203.5]
Back to top
Genomic Location chr11:60260251-60274903[+]
TSS 60260251
Gene Name MS4A12
Ensembl ID ENSG00000071203.5
ENTREZID 54860
Uniprot
Q9NXJ0
Protein Name
Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12
Expression levels of MS4A12[ENSG00000071203.5]
Back to top