EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. SCGN[ENSG00000079689.9]
Enhancers that regulate SCGN[ENSG00000079689.9]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr6 25568665 25573055 enh77840 25652464 79409
Muscle (A673) Brain (SK-N-MC)
chr6 25576845 25580995 enh108057 25652464 71469
Blood (T-cell)
chr6 25589605 25593755 enh95707 25652464 58709
Ovary
chr6 25597775 25597986 vista51391 25652464 54478
VISTA
chr6 25621385 25625535 enh88999 25652464 26929
Pancreas
chr6 25630252 25630438 vista51392 25652464 22026
VISTA
chr6 25634165 25644795 enh55699 25652464 7669
Pancreas Liver (HepG2) Large Intestine
chr6 25654085 25658235 enh89000 25652464 1621
Pancreas
chr6 25669785 25677675 enh89001 25652464 17321
Pancreas Stomach
chr6 25683585 25687735 enh114167 25652464 31121
Brain (SK-N-MC)
chr6 25712156 25717295 enh77841 25652464 59692
Muscle (A673) Brain (SK-N-SH)
chr6 25742185 25749495 enh55700 25652464 89721
Liver (HepG2) Large Intestine
Transcript facotrs that regulate SCGN[ENSG00000079689.9]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr6 25654088 25654103 RUNX2 JASPAR yes 25652464 1624 100870198
chr6 25654089 25654098 RUNX2 JASPAR yes 25652464 1625 100870199
chr6 25654089 25654099 RUNX3 JASPAR yes 25652464 1625 100870200
chr6 25654089 25654100 RUNX1 JASPAR yes 25652464 1625 100870201
chr6 25654100 25654104 YY1 TRANSFAC yes 25652464 1636 100870202
chr6 25654108 25654118 BARHL2 JASPAR yes 25652464 1644 100870203
chr6 25654110 25654114 YY1 TRANSFAC yes 25652464 1646 100870204
chr6 25654112 25654128 POU4F2 JASPAR yes 25652464 1648 100870205
chr6 25654112 25654128 POU4F3 JASPAR yes 25652464 1648 100870206
chr6 25654114 25654119 GATA2 JASPAR yes 25652464 1650 100870207
chr6 25654114 25654128 POU4F1 JASPAR yes 25652464 1650 100870208
chr6 25654115 25654129 POU4F1 JASPAR yes 25652464 1651 100870209
chr6 25654115 25654131 POU4F3 JASPAR yes 25652464 1651 100870210
chr6 25654118 25654122 YY1 TRANSFAC yes 25652464 1654 100870211
chr6 25654119 25654133 ONECUT3 JASPAR yes 25652464 1655 100870212
chr6 25654120 25654131 BATF JASPAR yes 25652464 1656 100870213
chr6 25654125 25654129 YY1 TRANSFAC yes 25652464 1661 100870214
chr6 25654126 25654136 HOXA13 JASPAR yes 25652464 1662 100870215
chr6 25654126 25654136 HOXB13 JASPAR yes 25652464 1662 100870216
chr6 25654126 25654136 HOXD13 JASPAR yes 25652464 1662 100870217
chr6 25654126 25654137 HOXA10 JASPAR yes 25652464 1662 100870218
chr6 25654127 25654136 CDX1 JASPAR yes 25652464 1663 100870219
chr6 25654151 25654162 STAT1 JASPAR yes 25652464 1687 100870220
chr6 25654151 25654162 STAT3 JASPAR yes 25652464 1687 100870221
chr6 25654212 25654216 H1TF2 TRANSFAC yes 25652464 1748 100870222
chr6 25654212 25654216 NFE TRANSFAC yes 25652464 1748 100870223
chr6 25654212 25654216 SRF TRANSFAC yes 25652464 1748 100870224
chr6 25654217 25654221 NFE TRANSFAC yes 25652464 1753 100870225
chr6 25654217 25654222 GATA1 TRANSFAC yes 25652464 1753 100870226
chr6 25654217 25654223 GATA3 JASPAR yes 25652464 1753 100870227
chr6 25654233 25654247 FOXF2 JASPAR yes 25652464 1769 100870228
chr6 25654243 25654254 ESRRA JASPAR yes 25652464 1779 100870229
chr6 25654243 25654254 ESRRB JASPAR yes 25652464 1779 100870230
chr6 25654254 25654268 POU1F1 JASPAR yes 25652464 1790 100870231
chr6 25654255 25654267 POU3F1 JASPAR yes 25652464 1791 100870232
chr6 25654255 25654267 POU3F2 JASPAR yes 25652464 1791 100870233
chr6 25654255 25654268 POU2F2 JASPAR yes 25652464 1791 100870234
chr6 25654261 25654279 RARA JASPAR yes 25652464 1797 100870235
chr6 25654283 25654287 NFE TRANSFAC yes 25652464 1819 100870236
chr6 25654312 25654318 HiNF-A TRANSFAC yes 25652464 1848 100870237
chr6 25654313 25654323 TFEC JASPAR yes 25652464 1849 100870238
chr6 25654335 25654340 TFAP2A TRANSFAC yes 25652464 1871 100870239
chr6 25654335 25654341 MZF1 JASPAR yes 25652464 1871 100870240
chr6 25654354 25654360 TCF4 TRANSFAC yes 25652464 1890 100870241
chr6 25654369 25654373 LFA1 TRANSFAC yes 25652464 1905 100870242
chr6 25654402 25654413 PHOX2A JASPAR yes 25652464 1938 100870243
chr6 25654404 25654409 MYB TRANSFAC yes 25652464 1940 100870244
chr6 25654414 25654426 PBX1 JASPAR yes 25652464 1950 100870245
chr6 25654426 25654432 GATA3 JASPAR yes 25652464 1962 100870246
chr6 25654433 25654447 GATA2 JASPAR yes 25652464 1969 100870247
chr6 25654437 25654445 GATA5 JASPAR yes 25652464 1973 100870248
chr6 25654445 25654455 TFAP4 JASPAR yes 25652464 1981 100870249
chr6 25654448 25654462 GATA2 JASPAR yes 25652464 1984 100870250
chr6 25654449 25654460 FOXP2 JASPAR yes 25652464 1985 100870251
chr6 25654449 25654463 FOXF2 JASPAR yes 25652464 1985 100870252
chr6 25654450 25654460 GATA1 TRANSFAC yes 25652464 1986 100870253
chr6 25654452 25654460 GATA3 JASPAR yes 25652464 1988 100870254
chr6 25654474 25654494 TBX19 JASPAR yes 25652464 2010 100870255
chr6 25654476 25654492 T JASPAR yes 25652464 2012 100870256
chr6 25654483 25654493 TFEC JASPAR yes 25652464 2019 100870257
chr6 25654503 25654518 AR JASPAR yes 25652464 2039 100870258
chr6 25654536 25654556 RREB1 JASPAR yes 25652464 2072 100870259
chr6 25654537 25654542 TFAP2A TRANSFAC yes 25652464 2073 100870260
chr6 25654537 25654543 MZF1 JASPAR yes 25652464 2073 100870261
chr6 25654537 25654547 SP1 JASPAR yes 25652464 2073 100870262
chr6 25654539 25654545 MAZ TRANSFAC yes 25652464 2075 100870263
chr6 25654541 25654555 PLAG1 JASPAR yes 25652464 2077 100870264
chr6 25654542 25654559 RARA JASPAR yes 25652464 2078 100870265
chr6 25654544 25654560 GLIS1 JASPAR yes 25652464 2080 100870266
chr6 25654545 25654559 GLIS2 JASPAR yes 25652464 2081 100870267
chr6 25654545 25654559 GLIS3 JASPAR yes 25652464 2081 100870268
chr6 25654552 25654562 SP1 JASPAR yes 25652464 2088 100870269
chr6 25654553 25654563 SP1 JASPAR yes 25652464 2089 100870270
chr6 25654554 25654558 LFA1 TRANSFAC yes 25652464 2090 100870271
chr6 25654560 25654565 ETS2 TRANSFAC yes 25652464 2096 100870272
chr6 25654587 25654600 ELF3 JASPAR yes 25652464 2123 100870273
chr6 25654588 25654600 ELF1 JASPAR yes 25652464 2124 100870274
chr6 25654588 25654601 ELF1 JASPAR yes 25652464 2124 100870275
chr6 25654588 25654602 SPI1 JASPAR yes 25652464 2124 100870276
chr6 25654590 25654596 ETS1 JASPAR yes 25652464 2126 100870277
chr6 25654590 25654596 SPI1 JASPAR yes 25652464 2126 100870278
chr6 25654621 25654625 H4TF2 TRANSFAC yes 25652464 2157 100870279
chr6 25654626 25654647 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2162 100870280
chr6 25654636 25654640 NFE TRANSFAC yes 25652464 2172 100870281
chr6 25654636 25654649 SMAD2 JASPAR yes 25652464 2172 100870282
chr6 25654654 25654658 NFE TRANSFAC yes 25652464 2190 100870283
chr6 25654654 25654667 SMAD2 JASPAR yes 25652464 2190 100870284
chr6 25654655 25654676 IRF1 JASPAR yes 25652464 2191 100870285
chr6 25654658 25654662 NFE TRANSFAC yes 25652464 2194 100870286
chr6 25654672 25654680 FOXL1 JASPAR yes 25652464 2208 100870287
chr6 25654677 25654681 NFE TRANSFAC yes 25652464 2213 100870288
chr6 25654677 25654682 GATA1 TRANSFAC yes 25652464 2213 100870289
chr6 25654677 25654683 GATA3 JASPAR yes 25652464 2213 100870290
chr6 25654682 25654694 IRF1 JASPAR yes 25652464 2218 100870291
chr6 25654683 25654687 NFE TRANSFAC yes 25652464 2219 100870292
chr6 25654687 25654691 YY1 TRANSFAC yes 25652464 2223 100870293
chr6 25654705 25654719 GATA2 JASPAR yes 25652464 2241 100870294
chr6 25654709 25654717 GATA3 JASPAR yes 25652464 2245 100870295
chr6 25654709 25654717 GATA5 JASPAR yes 25652464 2245 100870296
chr6 25654751 25654766 PRDM1 JASPAR yes 25652464 2287 100870297
chr6 25654756 25654771 NR2C2 JASPAR yes 25652464 2292 100870298
chr6 25654759 25654772 NR2F1 JASPAR yes 25652464 2295 100870299
chr6 25654763 25654780 RARA JASPAR yes 25652464 2299 100870300
chr6 25654784 25654805 IRF1 JASPAR yes 25652464 2320 100870301
chr6 25654790 25654811 IRF1 JASPAR yes 25652464 2326 100870302
chr6 25654801 25654805 YY1 TRANSFAC yes 25652464 2337 100870303
chr6 25654820 25654824 NFE TRANSFAC yes 25652464 2356 100870304
chr6 25654826 25654841 FOXP1 JASPAR yes 25652464 2362 100870305
chr6 25654826 25654847 IRF1 JASPAR yes 25652464 2362 100870306
chr6 25654829 25654837 FOXO3 JASPAR yes 25652464 2365 100870307
chr6 25654842 25654852 NFATC3 JASPAR yes 25652464 2378 100870308
chr6 25654843 25654850 NFATC2 JASPAR yes 25652464 2379 100870309
chr6 25654848 25654861 SMAD2 JASPAR yes 25652464 2384 100870310
chr6 25654875 25654885 REL JASPAR yes 25652464 2411 100870311
chr6 25654881 25654888 SPIB JASPAR yes 25652464 2417 100870312
chr6 25654887 25654893 MZF1 JASPAR yes 25652464 2423 100870313
chr6 25654891 25654912 IRF1 JASPAR yes 25652464 2427 100870314
chr6 25654895 25654916 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2431 100870315
chr6 25654897 25654918 IRF1 JASPAR yes 25652464 2433 100870316
chr6 25654900 25654904 YY1 TRANSFAC yes 25652464 2436 100870317
chr6 25654902 25654923 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2438 100870318
chr6 25654903 25654924 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2439 100870319
chr6 25654904 25654919 LEF1 JASPAR yes 25652464 2440 100870320
chr6 25654905 25654919 TCF7L2 JASPAR yes 25652464 2441 100870321
chr6 25654911 25654932 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2447 100870322
chr6 25654935 25654946 ESRRA JASPAR yes 25652464 2471 100870323
chr6 25654935 25654946 ESRRB JASPAR yes 25652464 2471 100870324
chr6 25654936 25654944 NR4A2 JASPAR yes 25652464 2472 100870325
chr6 25654936 25654950 RORA JASPAR yes 25652464 2472 100870326
chr6 25654937 25654947 RORA JASPAR yes 25652464 2473 100870327
chr6 25654940 25654961 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2476 100870328
chr6 25654944 25654948 YY1 TRANSFAC yes 25652464 2480 100870329
chr6 25654951 25654972 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2487 100870330
chr6 25654954 25654975 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2490 100870331
chr6 25654955 25654976 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2491 100870332
chr6 25654958 25654973 PRDM1 JASPAR yes 25652464 2494 100870333
chr6 25654959 25654963 YY1 TRANSFAC yes 25652464 2495 100870334
chr6 25654961 25654982 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2497 100870335
chr6 25654963 25654984 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2499 100870336
chr6 25654980 25654986 SOX10 JASPAR yes 25652464 2516 100870337
chr6 25654983 25654997 GATA2 JASPAR yes 25652464 2519 100870338
chr6 25654985 25654991 MYC TRANSFAC yes 25652464 2521 100870339
chr6 25654987 25654995 GATA3 JASPAR yes 25652464 2523 100870340
chr6 25654987 25654995 GATA5 JASPAR yes 25652464 2523 100870341
chr6 25654992 25655013 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2528 100870342
chr6 25655009 25655019 HOXA13 JASPAR yes 25652464 2545 100870343
chr6 25655009 25655019 HOXB13 JASPAR yes 25652464 2545 100870344
chr6 25655009 25655019 HOXD13 JASPAR yes 25652464 2545 100870345
chr6 25655009 25655020 HOXA10 JASPAR yes 25652464 2545 100870346
chr6 25655010 25655019 CDX1 JASPAR yes 25652464 2546 100870347
chr6 25655010 25655021 CDX2 JASPAR yes 25652464 2546 100870348
chr6 25655020 25655026 SOX10 JASPAR yes 25652464 2556 100870349
chr6 25655060 25655075 PRDM1 JASPAR yes 25652464 2596 100870350
chr6 25655088 25655093 GATA2 JASPAR yes 25652464 2624 100870351
chr6 25655111 25655118 SPIB JASPAR yes 25652464 2647 100870352
chr6 25655118 25655122 ESR1 TRANSFAC yes 25652464 2654 100870353
chr6 25655119 25655129 SREBF2 JASPAR yes 25652464 2655 100870354
chr6 25655133 25655154 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2669 100870355
chr6 25655136 25655157 ZNF263 JASPAR yes 25652464 2672 100870356
chr6 25655146 25655151 GATA2 JASPAR yes 25652464 2682 100870357
chr6 25655170 25655183 SCRT2 JASPAR yes 25652464 2706 100870358
chr6 25655170 25655185 SCRT1 JASPAR yes 25652464 2706 100870359
chr6 25655236 25655246 BHLHE40 JASPAR yes 25652464 2772 100870360
chr6 25655236 25655246 BHLHE41 JASPAR yes 25652464 2772 100870361
chr6 25655236 25655246 MAX JASPAR yes 25652464 2772 100870362
chr6 25655236 25655246 MLXIPL JASPAR yes 25652464 2772 100870363
chr6 25655236 25655246 MLX JASPAR yes 25652464 2772 100870364
chr6 25655236 25655246 MNT JASPAR yes 25652464 2772 100870365
chr6 25655236 25655246 TFE3 JASPAR yes 25652464 2772 100870366
chr6 25655237 25655247 MAX JASPAR yes 25652464 2773 100870367
chr6 25655238 25655243 MYC TRANSFAC yes 25652464 2774 100870368
chr6 25655238 25655243 USF1 TRANSFAC yes 25652464 2774 100870369
chr6 25655238 25655243 USF2 TRANSFAC yes 25652464 2774 100870370
chr6 25655273 25655282 THAP1 JASPAR yes 25652464 2809 100870371
chr6 25655274 25655287 TFAP2A JASPAR yes 25652464 2810 100870372
chr6 25655274 25655287 TFAP2B JASPAR yes 25652464 2810 100870373
chr6 25655274 25655287 TFAP2C JASPAR yes 25652464 2810 100870374
chr6 25655302 25655316 NR2F1 JASPAR yes 25652464 2838 100870375
chr6 25655309 25655326 NR3C1 JASPAR yes 25652464 2845 100870376
chr6 25655309 25655326 NR3C2 JASPAR yes 25652464 2845 100870377
chr6 25655311 25655326 AR JASPAR yes 25652464 2847 100870378
chr6 25655317 25655334 BCL6B JASPAR yes 25652464 2853 100870379
chr6 25655334 25655342 GATA3 JASPAR yes 25652464 2870 100870380
chr6 25655334 25655342 GATA5 JASPAR yes 25652464 2870 100870381
chr6 25655340 25655344 NFE TRANSFAC yes 25652464 2876 100870382
chr6 25655356 25655360 YY1 TRANSFAC yes 25652464 2892 100870383
chr6 25655362 25655376 IRF7 JASPAR yes 25652464 2898 100870384
chr6 25655364 25655376 IRF1 JASPAR yes 25652464 2900 100870385
chr6 25655376 25655382 SOX10 JASPAR yes 25652464 2912 100870386
chr6 25655413 25655419 YY1 JASPAR yes 25652464 2949 100870387
chr6 25655432 25655447 TFAP2C JASPAR yes 25652464 2968 100870388
chr6 25655433 25655437 NFE TRANSFAC yes 25652464 2969 100870389
chr6 25655446 25655464 RARA JASPAR yes 25652464 2982 100870390
chr6 25655451 25655464 EOMES JASPAR yes 25652464 2987 100870391
chr6 25655453 25655463 TBR1 JASPAR yes 25652464 2989 100870392
chr6 25655453 25655464 TBX20 JASPAR yes 25652464 2989 100870393
chr6 25655453 25655464 TBX2 JASPAR yes 25652464 2989 100870394
chr6 25655454 25655464 TBX21 JASPAR yes 25652464 2990 100870395
chr6 25655487 25655491 YY1 TRANSFAC yes 25652464 3023 100870396
chr6 25655491 25655495 TEAD2 TRANSFAC yes 25652464 3027 100870397
chr6 25655491 25655496 TBP TRANSFAC yes 25652464 3027 100870398
chr6 25655491 25655497 TFIID TRANSFAC yes 25652464 3027 100870399
chr6 25655506 25655524 MAFF JASPAR yes 25652464 3042 100870400
chr6 25655513 25655521 MEIS2 JASPAR yes 25652464 3049 100870401
chr6 25655513 25655521 MEIS3 JASPAR yes 25652464 3049 100870402
chr6 25655514 25655518 NFE TRANSFAC yes 25652464 3050 100870403
chr6 25655533 25655549 POU4F2 JASPAR yes 25652464 3069 100870404
chr6 25655533 25655549 POU4F3 JASPAR yes 25652464 3069 100870405
chr6 25655534 25655539 GATA1 TRANSFAC yes 25652464 3070 100870406
chr6 25655535 25655549 POU4F1 JASPAR yes 25652464 3071 100870407
chr6 25655613 25655616 MYB TRANSFAC yes 25652464 3149 100870408
chr6 25655626 25655641 RFX5 JASPAR yes 25652464 3162 100870409
chr6 25655673 25655688 MEF2C JASPAR yes 25652464 3209 100870410
chr6 25655675 25655690 FOXP1 JASPAR yes 25652464 3211 100870411
chr6 25655693 25655697 NFE TRANSFAC yes 25652464 3229 100870412
chr6 25655693 25655698 GATA1 TRANSFAC yes 25652464 3229 100870413
chr6 25655693 25655699 GATA3 JASPAR yes 25652464 3229 100870414
chr6 25655706 25655710 H4TF2 TRANSFAC yes 25652464 3242 100870415
chr6 25655733 25655737 LFA1 TRANSFAC yes 25652464 3269 100870416
chr6 25655740 25655750 GSC2 JASPAR yes 25652464 3276 100870417
chr6 25655741 25655749 OTX2 JASPAR yes 25652464 3277 100870418
chr6 25655799 25655810 FOXA1 JASPAR yes 25652464 3335 100870419
chr6 25655799 25655814 FOXA1 JASPAR yes 25652464 3335 100870420
chr6 25655843 25655851 OTX2 JASPAR yes 25652464 3379 100870421
chr6 25655851 25655854 MYB TRANSFAC yes 25652464 3387 100870422
chr6 25655862 25655873 PROP1 JASPAR yes 25652464 3398 100870423
chr6 25655891 25655895 YY1 TRANSFAC yes 25652464 3427 100870424
chr6 25655896 25655902 TCF4 TRANSFAC yes 25652464 3432 100870425
chr6 25655935 25655939 YY1 TRANSFAC yes 25652464 3471 100870426
chr6 25655935 25655944 POU5F1B JASPAR yes 25652464 3471 100870427
chr6 25655936 25655945 POU5F1B JASPAR yes 25652464 3472 100870428
chr6 25655945 25655949 YY1 TRANSFAC yes 25652464 3481 100870429
chr6 25655956 25655962 NFIC JASPAR yes 25652464 3492 100870430
chr6 25655965 25655979 IRF7 JASPAR yes 25652464 3501 100870431
chr6 25655965 25655979 IRF8 JASPAR yes 25652464 3501 100870432
chr6 25655970 25655974 YY1 TRANSFAC yes 25652464 3506 100870433
chr6 25655999 25656010 FOXC1 JASPAR yes 25652464 3535 100870434
chr6 25656001 25656016 FOXP1 JASPAR yes 25652464 3537 100870435
chr6 25656003 25656024 ZNF263 JASPAR yes 25652464 3539 100870436
chr6 25656004 25656018 SPIC JASPAR yes 25652464 3540 100870437
chr6 25656017 25656024 SPIB JASPAR yes 25652464 3553 100870438
chr6 25656024 25656039 AR JASPAR yes 25652464 3560 100870439
chr6 25656053 25656064 PHOX2A JASPAR yes 25652464 3589 100870440
chr6 25656053 25656064 PROP1 JASPAR yes 25652464 3589 100870441
chr6 25656054 25656066 MEF2A JASPAR yes 25652464 3590 100870442
chr6 25656055 25656065 MEF2A JASPAR yes 25652464 3591 100870443
chr6 25656056 25656060 TEAD2 TRANSFAC yes 25652464 3592 100870444
chr6 25656056 25656066 ALX3 JASPAR yes 25652464 3592 100870445
chr6 25656056 25656066 GSX1 JASPAR yes 25652464 3592 100870446
chr6 25656056 25656066 MEOX1 JASPAR yes 25652464 3592 100870447
chr6 25656056 25656070 RORA JASPAR yes 25652464 3592 100870448
chr6 25656057 25656065 LBX1 JASPAR yes 25652464 3593 100870449
chr6 25656057 25656065 PDX1 JASPAR yes 25652464 3593 100870450
chr6 25656057 25656065 VAX1 JASPAR yes 25652464 3593 100870451
chr6 25656057 25656065 VAX2 JASPAR yes 25652464 3593 100870452
chr6 25656057 25656065 VSX1 JASPAR yes 25652464 3593 100870453
chr6 25656057 25656065 VSX2 JASPAR yes 25652464 3593 100870454
chr6 25656057 25656067 POU6F2 JASPAR yes 25652464 3593 100870455
chr6 25656066 25656070 H1TF2 TRANSFAC yes 25652464 3602 100870456
chr6 25656066 25656070 NFE TRANSFAC yes 25652464 3602 100870457
chr6 25656066 25656070 SRF TRANSFAC yes 25652464 3602 100870458
chr6 25656087 25656102 TFAP2A JASPAR yes 25652464 3623 100870459
chr6 25656087 25656102 TFAP2C JASPAR yes 25652464 3623 100870460
chr6 25656089 25656104 TFAP2A JASPAR yes 25652464 3625 100870461
chr6 25656090 25656101 TFAP2A JASPAR yes 25652464 3626 100870462
chr6 25656090 25656101 TFAP2B JASPAR yes 25652464 3626 100870463
chr6 25656090 25656101 TFAP2C JASPAR yes 25652464 3626 100870464
chr6 25656121 25656126 ETS2 TRANSFAC yes 25652464 3657 100870465
chr6 25656146 25656152 GATA1 TRANSFAC yes 25652464 3682 100870466
chr6 25656155 25656169 RXRB JASPAR yes 25652464 3691 100870467
chr6 25656161 25656171 HMBOX1 JASPAR yes 25652464 3697 100870468
chr6 25656162 25656170 LBX1 JASPAR yes 25652464 3698 100870469
chr6 25656163 25656166 MYB TRANSFAC yes 25652464 3699 100870470
chr6 25656168 25656174 HiNF-A TRANSFAC yes 25652464 3704 100870471
chr6 25656168 25656183 JUND JASPAR yes 25652464 3704 100870472
chr6 25656171 25656183 JDP2 JASPAR yes 25652464 3707 100870473
chr6 25656171 25656186 JUND JASPAR yes 25652464 3707 100870474
chr6 25656213 25656217 YY1 TRANSFAC yes 25652464 3749 100870475
chr6 25656217 25656228 EBF1 JASPAR yes 25652464 3753 100870476
chr6 25656221 25656226 TFAP2A TRANSFAC yes 25652464 3757 100870477
chr6 25656221 25656227 MZF1 JASPAR yes 25652464 3757 100870478
chr6 25656247 25656256 HIC2 JASPAR yes 25652464 3783 100870479
chr6 25656250 25656254 LFA1 TRANSFAC yes 25652464 3786 100870480
chr6 25656282 25656287 ETS2 TRANSFAC yes 25652464 3818 100870481
chr6 25656292 25656307 MEF2A JASPAR yes 25652464 3828 100870482
chr6 25656293 25656308 MEF2C JASPAR yes 25652464 3829 100870483
chr6 25656298 25656312 IRF7 JASPAR yes 25652464 3834 100870484
chr6 25656315 25656326 FOSL2 JASPAR yes 25652464 3851 100870485
chr6 25656315 25656326 JUNB JASPAR yes 25652464 3851 100870486
chr6 25656316 25656327 FOS JASPAR yes 25652464 3852 100870487
chr6 25656316 25656327 FOSL1 JASPAR yes 25652464 3852 100870488
chr6 25656316 25656327 JUND JASPAR yes 25652464 3852 100870489
chr6 25656317 25656326 JDP2 JASPAR yes 25652464 3853 100870490
chr6 25656318 25656324 JUN TRANSFAC yes 25652464 3854 100870491
chr6 25656346 25656355 SRY JASPAR yes 25652464 3882 100870492
chr6 25656348 25656351 MYB TRANSFAC yes 25652464 3884 100870493
chr6 25656348 25656357 SOX9 JASPAR yes 25652464 3884 100870494
chr6 25656356 25656360 LFA1 TRANSFAC yes 25652464 3892 100870495
chr6 25656368 25656380 YY1 JASPAR yes 25652464 3904 100870496
chr6 25656385 25656390 MYC TRANSFAC yes 25652464 3921 100870497
chr6 25656403 25656407 YY1 TRANSFAC yes 25652464 3939 100870498
chr6 25656411 25656422 TBX2 JASPAR yes 25652464 3947 100870499
chr6 25656413 25656421 TBX15 JASPAR yes 25652464 3949 100870500
chr6 25656413 25656421 TBX1 JASPAR yes 25652464 3949 100870501
chr6 25656413 25656421 TBX4 JASPAR yes 25652464 3949 100870502
chr6 25656413 25656421 TBX5 JASPAR yes 25652464 3949 100870503
chr6 25656414 25656424 ID4 JASPAR yes 25652464 3950 100870504
chr6 25656414 25656424 MSC JASPAR yes 25652464 3950 100870505
chr6 25656414 25656424 TCF3 JASPAR yes 25652464 3950 100870506
chr6 25656414 25656424 TCF4 JASPAR yes 25652464 3950 100870507
chr6 25656415 25656424 SNAI2 JASPAR yes 25652464 3951 100870508
chr6 25656416 25656421 USF2 TRANSFAC yes 25652464 3952 100870509
chr6 25656419 25656437 NFYA JASPAR yes 25652464 3955 100870510
chr6 25656423 25656433 HOXA13 JASPAR yes 25652464 3959 100870511
chr6 25656424 25656436 PBX1 JASPAR yes 25652464 3960 100870512
chr6 25656427 25656432 NFY TRANSFAC yes 25652464 3963 100870513
chr6 25656435 25656444 HIC2 JASPAR yes 25652464 3971 100870514
chr6 25656455 25656474 REST JASPAR yes 25652464 3991 100870515
chr6 25656456 25656471 ZIC3 JASPAR yes 25652464 3992 100870516
chr6 25656457 25656471 ZIC1 JASPAR yes 25652464 3993 100870517
chr6 25656524 25656543 REST JASPAR yes 25652464 4060 100870518
chr6 25656543 25656555 TEAD1 JASPAR yes 25652464 4079 100870519
chr6 25656546 25656561 LEF1 JASPAR yes 25652464 4082 100870520
chr6 25656547 25656554 SPIB JASPAR yes 25652464 4083 100870521
chr6 25656554 25656564 EVX1 JASPAR yes 25652464 4090 100870522
chr6 25656554 25656564 EVX2 JASPAR yes 25652464 4090 100870523
chr6 25656564 25656581 RXRA JASPAR yes 25652464 4100 100870524
chr6 25656586 25656601 MEF2C JASPAR yes 25652464 4122 100870525
chr6 25656589 25656593 YY1 TRANSFAC yes 25652464 4125 100870526
chr6 25656591 25656602 RUNX1 JASPAR yes 25652464 4127 100870527
chr6 25656603 25656606 MYB TRANSFAC yes 25652464 4139 100870528
chr6 25656625 25656629 NFE TRANSFAC yes 25652464 4161 100870529
chr6 25656626 25656631 GATA2 JASPAR yes 25652464 4162 100870530
chr6 25656651 25656661 EVX1 JASPAR yes 25652464 4187 100870531
chr6 25656651 25656661 EVX2 JASPAR yes 25652464 4187 100870532
chr6 25656651 25656661 HOXA2 JASPAR yes 25652464 4187 100870533
chr6 25656651 25656661 HOXB2 JASPAR yes 25652464 4187 100870534
chr6 25656651 25656661 MEOX1 JASPAR yes 25652464 4187 100870535
chr6 25656651 25656661 MEOX2 JASPAR yes 25652464 4187 100870536
chr6 25656652 25656668 POU4F2 JASPAR yes 25652464 4188 100870537
chr6 25656750 25656768 MAFF JASPAR yes 25652464 4286 100870538
chr6 25656752 25656767 MAFK JASPAR yes 25652464 4288 100870539
chr6 25656776 25656790 FOXF2 JASPAR yes 25652464 4312 100870540
chr6 25656778 25656789 FOXC1 JASPAR yes 25652464 4314 100870541
chr6 25656779 25656784 GATA2 JASPAR yes 25652464 4315 100870542
chr6 25656781 25656789 FOXG1 JASPAR yes 25652464 4317 100870543
chr6 25656794 25656809 FOXA1 JASPAR yes 25652464 4330 100870544
chr6 25656797 25656808 FOXB1 JASPAR yes 25652464 4333 100870545
chr6 25656805 25656821 GLIS1 JASPAR yes 25652464 4341 100870546
chr6 25656816 25656831 AR JASPAR yes 25652464 4352 100870547
chr6 25656857 25656865 RHOXF1 JASPAR yes 25652464 4393 100870548
chr6 25656889 25656897 GATA1 TRANSFAC yes 25652464 4425 100870549
chr6 25656889 25656903 GATA2 JASPAR yes 25652464 4425 100870550
chr6 25656891 25656899 GATA3 JASPAR yes 25652464 4427 100870551
chr6 25656891 25656899 GATA5 JASPAR yes 25652464 4427 100870552
chr6 25656900 25656911 STAT3 JASPAR yes 25652464 4436 100870553
chr6 25656905 25656915 NFKB1 JASPAR yes 25652464 4441 100870554
chr6 25656905 25656916 NFKB1 JASPAR yes 25652464 4441 100870555
chr6 25656914 25656928 SPIC JASPAR yes 25652464 4450 100870556
chr6 25656918 25656925 SPIB JASPAR yes 25652464 4454 100870557
chr6 25656920 25656930 NFKB1 JASPAR yes 25652464 4456 100870558
chr6 25656928 25656943 STAT2 JASPAR yes 25652464 4464 100870559
chr6 25656929 25656943 STAT1 JASPAR yes 25652464 4465 100870560
chr6 25656930 25656945 IRF9 JASPAR yes 25652464 4466 100870561
chr6 25656934 25656948 IRF7 JASPAR yes 25652464 4470 100870562
chr6 25656938 25656952 RORA JASPAR yes 25652464 4474 100870563
chr6 25656943 25656958 LEF1 JASPAR yes 25652464 4479 100870564
chr6 25656944 25656962 RARA JASPAR yes 25652464 4480 100870565
chr6 25656946 25656950 ESR1 TRANSFAC yes 25652464 4482 100870566
chr6 25656954 25656959 GATA2 JASPAR yes 25652464 4490 100870567
chr6 25656970 25656985 NR2C2 JASPAR yes 25652464 4506 100870568
chr6 25656971 25656985 RXRB JASPAR yes 25652464 4507 100870569
chr6 25656971 25656985 RXRG JASPAR yes 25652464 4507 100870570
chr6 25656973 25656985 INSM1 JASPAR yes 25652464 4509 100870571
chr6 25657061 25657065 YY1 TRANSFAC yes 25652464 4597 100870572
chr6 25657061 25657076 FOXA1 JASPAR yes 25652464 4597 100870573
chr6 25657062 25657077 FOXP1 JASPAR yes 25652464 4598 100870574
chr6 25657063 25657074 FOXP2 JASPAR yes 25652464 4599 100870575
chr6 25657063 25657075 FOXC2 JASPAR yes 25652464 4599 100870576
chr6 25657063 25657077 FOXF2 JASPAR yes 25652464 4599 100870577
chr6 25657064 25657075 FOXB1 JASPAR yes 25652464 4600 100870578
chr6 25657064 25657075 FOXC1 JASPAR yes 25652464 4600 100870579
chr6 25657065 25657069 YY1 TRANSFAC yes 25652464 4601 100870580
chr6 25657065 25657076 FOXA1 JASPAR yes 25652464 4601 100870581
chr6 25657076 25657087 PHOX2A JASPAR yes 25652464 4612 100870582
chr6 25657076 25657087 PROP1 JASPAR yes 25652464 4612 100870583
chr6 25657105 25657115 HMBOX1 JASPAR yes 25652464 4641 100870584
chr6 25657111 25657114 MYB TRANSFAC yes 25652464 4647 100870585
chr6 25657111 25657122 FLI1 JASPAR yes 25652464 4647 100870586
chr6 25657113 25657120 SPI1 JASPAR yes 25652464 4649 100870587
chr6 25657113 25657121 FEV JASPAR yes 25652464 4649 100870588
chr6 25657114 25657128 EBF1 JASPAR yes 25652464 4650 100870589
chr6 25657115 25657120 ETS2 TRANSFAC yes 25652464 4651 100870590
chr6 25657121 25657131 RELA JASPAR yes 25652464 4657 100870591
chr6 25657121 25657131 REL JASPAR yes 25652464 4657 100870592
chr6 25657121 25657132 NFKB1 JASPAR yes 25652464 4657 100870593
chr6 25657122 25657132 NFKB1 JASPAR yes 25652464 4658 100870594
chr6 25657122 25657132 RELA JASPAR yes 25652464 4658 100870595
chr6 25657122 25657133 NFKB1 JASPAR yes 25652464 4658 100870596
chr6 25657123 25657133 RELA JASPAR yes 25652464 4659 100870597
chr6 25657123 25657133 REL JASPAR yes 25652464 4659 100870598
chr6 25657129 25657146 ZNF410 JASPAR yes 25652464 4665 100870599
chr6 25657144 25657160 POU4F2 JASPAR yes 25652464 4680 100870600
chr6 25657144 25657160 POU4F3 JASPAR yes 25652464 4680 100870601
chr6 25657146 25657160 POU4F1 JASPAR yes 25652464 4682 100870602
chr6 25657147 25657157 BARHL2 JASPAR yes 25652464 4683 100870603
chr6 25657149 25657153 YY1 TRANSFAC yes 25652464 4685 100870604
chr6 25657160 25657164 H1TF2 TRANSFAC yes 25652464 4696 100870605
chr6 25657160 25657164 NFE TRANSFAC yes 25652464 4696 100870606
chr6 25657160 25657164 SRF TRANSFAC yes 25652464 4696 100870607
chr6 25657161 25657177 ZNF143 JASPAR yes 25652464 4697 100870608
chr6 25657178 25657193 FOXP1 JASPAR yes 25652464 4714 100870609
chr6 25657179 25657193 GATA2 JASPAR yes 25652464 4715 100870610
chr6 25657181 25657189 GATA3 JASPAR yes 25652464 4717 100870611
chr6 25657187 25657193 HiNF-A TRANSFAC yes 25652464 4723 100870612
chr6 25657223 25657238 LEF1 JASPAR yes 25652464 4759 100870613
chr6 25657235 25657249 TCF7L2 JASPAR yes 25652464 4771 100870614
chr6 25657239 25657245 TCF1 TRANSFAC yes 25652464 4775 100870615
chr6 25657267 25657272 H4TF1 TRANSFAC yes 25652464 4803 100870616
chr6 25657272 25657281 SOX9 JASPAR yes 25652464 4808 100870617
chr6 25657330 25657345 MAFK JASPAR yes 25652464 4866 100870618
chr6 25657350 25657359 PITX3 JASPAR yes 25652464 4886 100870619
chr6 25657350 25657360 GSC2 JASPAR yes 25652464 4886 100870620
chr6 25657350 25657360 GSC JASPAR yes 25652464 4886 100870621
chr6 25657351 25657359 OTX1 JASPAR yes 25652464 4887 100870622
chr6 25657351 25657359 OTX2 JASPAR yes 25652464 4887 100870623
chr6 25657351 25657359 RHOXF1 JASPAR yes 25652464 4887 100870624
chr6 25657375 25657386 USF1 JASPAR yes 25652464 4911 100870625
chr6 25657375 25657386 USF2 JASPAR yes 25652464 4911 100870626
chr6 25657376 25657386 TFEC JASPAR yes 25652464 4912 100870627
chr6 25657377 25657392 JUND JASPAR yes 25652464 4913 100870628
chr6 25657378 25657391 JUN JASPAR yes 25652464 4914 100870629
chr6 25657387 25657390 MYB TRANSFAC yes 25652464 4923 100870630
chr6 25657395 25657402 MEIS1 JASPAR yes 25652464 4931 100870631
chr6 25657395 25657403 MEIS2 JASPAR yes 25652464 4931 100870632
chr6 25657420 25657432 GRHL1 JASPAR yes 25652464 4956 100870633
chr6 25657423 25657429 PTF TRANSFAC yes 25652464 4959 100870634
chr6 25657430 25657442 TEAD1 JASPAR yes 25652464 4966 100870635
chr6 25657440 25657455 FOXP1 JASPAR yes 25652464 4976 100870636
chr6 25657446 25657452 TBP TRANSFAC yes 25652464 4982 100870637
chr6 25657452 25657470 RARA JASPAR yes 25652464 4988 100870638
SNPs associated with SCGN[ENSG00000079689.9], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr6 24886536 rs79496401 A G 765928 Esophagus 0.0997923 8916758
chr6 25656661 rs10484591 C G 0 Breast 0.00110024 8924161
chr6 25622571 rs6918563 G T 29893 Liver 0.000465857 8923944
chr6 24958714 rs115086705 C T 693750 Lung 0.225861 8917460
Details of SCGN[ENSG00000079689.9]
Back to top
Genomic Location chr6:25652464-25702011[+]
TSS 25652464
Gene Name SCGN
Ensembl ID ENSG00000079689.9
ENTREZID 10590
Uniprot
O76038
Protein Name
Secretagogin
Expression levels of SCGN[ENSG00000079689.9]
Back to top