Enhancers that regulate FOXN4[ENSG00000139445.13]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr12 109737565 109742695 enh68272 109747025 4330
chr12 109765585 109770535 enh95456 109747025 18560
chr12 109785262 109785419 vista14848 109747025 38237
chr12 109820805 109825528 enh64635 109747025 73780

Transcript facotrs that regulate FOXN4[ENSG00000139445.13]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr12 109742004 109742025 ZNF263 JASPAR yes 109747025 5000 123639480
chr12 109742006 109742027 IRF1 JASPAR yes 109747025 4998 123639482
chr12 109742010 109742025 STAT2 JASPAR yes 109747025 5000 123639483
chr12 109742010 109742031 IRF1 JASPAR yes 109747025 4994 123639484
chr12 109742011 109742026 FOXP1 JASPAR yes 109747025 4999 123639485
chr12 109742012 109742033 IRF1 JASPAR yes 109747025 4992 123639486
chr12 109742014 109742028 STAT1 JASPAR yes 109747025 4997 123639487
chr12 109742014 109742029 PRDM1 JASPAR yes 109747025 4996 123639488
chr12 109742014 109742029 STAT2 JASPAR yes 109747025 4996 123639489
chr12 109742015 109742036 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4989 123639490
chr12 109742016 109742037 IRF1 JASPAR yes 109747025 4988 123639491
chr12 109742018 109742033 IRF9 JASPAR yes 109747025 4992 123639492
chr12 109742018 109742039 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4986 123639493
chr12 109742019 109742033 IRF7 JASPAR yes 109747025 4992 123639494
chr12 109742019 109742033 IRF8 JASPAR yes 109747025 4992 123639495
chr12 109742020 109742034 SPIC JASPAR yes 109747025 4991 123639496
chr12 109742020 109742034 STAT1 JASPAR yes 109747025 4991 123639497
chr12 109742020 109742035 PRDM1 JASPAR yes 109747025 4990 123639498
chr12 109742020 109742035 STAT2 JASPAR yes 109747025 4990 123639499
chr12 109742020 109742041 IRF1 JASPAR yes 109747025 4984 123639500
chr12 109742021 109742042 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4983 123639501
chr12 109742022 109742043 IRF1 JASPAR yes 109747025 4982 123639502
chr12 109742024 109742045 IRF1 JASPAR yes 109747025 4980 123639503
chr12 109742024 109742045 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4980 123639504
chr12 109742028 109742049 IRF1 JASPAR yes 109747025 4976 123639505
chr12 109742028 109742049 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4976 123639506
chr12 109742032 109742053 IRF1 JASPAR yes 109747025 4972 123639507
chr12 109742032 109742053 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4972 123639508
chr12 109742036 109742057 IRF1 JASPAR yes 109747025 4968 123639509
chr12 109742036 109742057 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4968 123639510
chr12 109742040 109742061 IRF1 JASPAR yes 109747025 4964 123639511
chr12 109742040 109742061 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4964 123639512
chr12 109742044 109742065 IRF1 JASPAR yes 109747025 4960 123639513
chr12 109742044 109742065 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4960 123639514
chr12 109742048 109742069 IRF1 JASPAR yes 109747025 4956 123639515
chr12 109742048 109742069 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4956 123639516
chr12 109742052 109742073 IRF1 JASPAR yes 109747025 4952 123639517
chr12 109742052 109742073 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4952 123639518
chr12 109742056 109742077 IRF1 JASPAR yes 109747025 4948 123639519
chr12 109742056 109742077 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4948 123639520
chr12 109742060 109742081 IRF1 JASPAR yes 109747025 4944 123639521
chr12 109742060 109742081 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4944 123639522
chr12 109742064 109742085 IRF1 JASPAR yes 109747025 4940 123639523
chr12 109742064 109742085 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4940 123639524
chr12 109742068 109742089 IRF1 JASPAR yes 109747025 4936 123639525
chr12 109742068 109742089 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4936 123639526
chr12 109742072 109742093 IRF1 JASPAR yes 109747025 4932 123639527
chr12 109742072 109742093 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4932 123639528
chr12 109742076 109742097 IRF1 JASPAR yes 109747025 4928 123639529
chr12 109742076 109742097 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4928 123639530
chr12 109742080 109742101 IRF1 JASPAR yes 109747025 4924 123639531
chr12 109742080 109742101 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4924 123639532
chr12 109742083 109742104 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4921 123639533
chr12 109742084 109742105 IRF1 JASPAR yes 109747025 4920 123639534
chr12 109742084 109742105 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4920 123639535
chr12 109742087 109742108 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4917 123639536
chr12 109742088 109742109 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4916 123639537
chr12 109742091 109742112 IRF1 JASPAR yes 109747025 4913 123639538
chr12 109742091 109742112 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4913 123639539
chr12 109742092 109742113 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4912 123639540
chr12 109742095 109742110 PRDM1 JASPAR yes 109747025 4915 123639541
chr12 109742095 109742116 IRF1 JASPAR yes 109747025 4909 123639542
chr12 109742096 109742117 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4908 123639543
chr12 109742099 109742120 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4905 123639544
chr12 109742102 109742123 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4902 123639545
chr12 109742103 109742124 IRF1 JASPAR yes 109747025 4901 123639546
chr12 109742103 109742124 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4901 123639547
chr12 109742106 109742127 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4898 123639548
chr12 109742107 109742128 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4897 123639549
chr12 109742110 109742131 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4894 123639550
chr12 109742111 109742116 ETS2 TRANSFAC yes 109747025 4909 123639551
chr12 109742111 109742132 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4893 123639552
chr12 109742114 109742135 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4890 123639553
chr12 109742115 109742136 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4889 123639554
chr12 109742119 109742124 ETS2 TRANSFAC yes 109747025 4901 123639555
chr12 109742128 109742143 FOXP1 JASPAR yes 109747025 4882 123639556
chr12 109742130 109742141 FOXB1 JASPAR yes 109747025 4884 123639557
chr12 109742130 109742142 FOXC2 JASPAR yes 109747025 4883 123639558
chr12 109742131 109742142 FOXP2 JASPAR yes 109747025 4883 123639559
chr12 109742150 109742170 ESR1 JASPAR yes 109747025 4855 123639560
chr12 109742157 109742168 ESRRA JASPAR yes 109747025 4857 123639561
chr12 109742178 109742187 SNAI2 JASPAR yes 109747025 4838 123639562
chr12 109742178 109742188 ID4 JASPAR yes 109747025 4837 123639563
chr12 109742178 109742188 TCF3 JASPAR yes 109747025 4837 123639564
chr12 109742178 109742188 TCF4 JASPAR yes 109747025 4837 123639565
chr12 109742183 109742196 SMAD2 JASPAR yes 109747025 4829 123639566
chr12 109742201 109742208 NKX3-1 JASPAR yes 109747025 4817 123639567
chr12 109742209 109742212 MYB TRANSFAC yes 109747025 4813 123639568
chr12 109742216 109742229 EOMES JASPAR yes 109747025 4796 123639569
chr12 109742218 109742228 TBR1 JASPAR yes 109747025 4797 123639570
chr12 109742218 109742229 TBX2 JASPAR yes 109747025 4796 123639571
chr12 109742235 109742245 RELA JASPAR yes 109747025 4780 123639572
chr12 109742235 109742245 REL JASPAR yes 109747025 4780 123639573
chr12 109742235 109742246 NFKB1 JASPAR yes 109747025 4779 123639574
chr12 109742235 109742250 HNF4G JASPAR yes 109747025 4775 123639575
chr12 109742242 109742253 E2F6 JASPAR yes 109747025 4772 123639576
chr12 109742245 109742260 ZIC3 JASPAR yes 109747025 4765 123639577
chr12 109742276 109742279 MYB TRANSFAC yes 109747025 4746 123639578
chr12 109742295 109742310 FOXA1 JASPAR yes 109747025 4715 123639579
chr12 109742296 109742311 FOXP1 JASPAR yes 109747025 4714 123639580
chr12 109742297 109742308 FOXP2 JASPAR yes 109747025 4717 123639581
chr12 109742297 109742311 FOXF2 JASPAR yes 109747025 4714 123639582
chr12 109742298 109742306 FOXD1 JASPAR yes 109747025 4719 123639583
chr12 109742298 109742306 FOXO3 JASPAR yes 109747025 4719 123639584
chr12 109742299 109742306 FOXD2 JASPAR yes 109747025 4719 123639585
chr12 109742299 109742306 FOXI1 JASPAR yes 109747025 4719 123639586
chr12 109742299 109742306 FOXL1 JASPAR yes 109747025 4719 123639587
chr12 109742299 109742306 FOXO4 JASPAR yes 109747025 4719 123639588
chr12 109742299 109742306 FOXO6 JASPAR yes 109747025 4719 123639589
chr12 109742299 109742306 FOXP3 JASPAR yes 109747025 4719 123639590
chr12 109742299 109742307 FOXO3 JASPAR yes 109747025 4718 123639591
chr12 109742299 109742310 FOXA1 JASPAR yes 109747025 4715 123639592
chr12 109742314 109742327 NR2F1 JASPAR yes 109747025 4698 123639593
chr12 109742315 109742333 ESR2 JASPAR yes 109747025 4692 123639594
chr12 109742317 109742332 ESR2 JASPAR yes 109747025 4693 123639595
chr12 109742318 109742322 ESR1 TRANSFAC yes 109747025 4703 123639596
chr12 109742326 109742347 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4678 123639597
chr12 109742331 109742341 SP1 JASPAR yes 109747025 4684 123639598
chr12 109742337 109742347 SP1 JASPAR yes 109747025 4678 123639599
chr12 109742340 109742346 NFE2 TRANSFAC yes 109747025 4679 123639600
chr12 109742375 109742381 NFIC JASPAR yes 109747025 4644 123639601
chr12 109742377 109742381 H1TF2 TRANSFAC yes 109747025 4644 123639602
chr12 109742377 109742381 NFE TRANSFAC yes 109747025 4644 123639603
chr12 109742377 109742381 SRF TRANSFAC yes 109747025 4644 123639604
chr12 109742377 109742395 MAFF JASPAR yes 109747025 4630 123639605
chr12 109742385 109742389 NFE TRANSFAC yes 109747025 4636 123639606
chr12 109742394 109742400 SP1 TRANSFAC yes 109747025 4625 123639607
chr12 109742403 109742415 PKNOX1 JASPAR yes 109747025 4610 123639608
chr12 109742403 109742415 TGIF2 JASPAR yes 109747025 4610 123639609
chr12 109742415 109742429 EBF1 JASPAR yes 109747025 4596 123639610
chr12 109742416 109742427 EBF1 JASPAR yes 109747025 4598 123639611
chr12 109742416 109742431 RFX5 JASPAR yes 109747025 4594 123639612
chr12 109742417 109742423 MZF1 JASPAR yes 109747025 4602 123639613
chr12 109742429 109742433 LFA1 TRANSFAC yes 109747025 4592 123639614
chr12 109742448 109742454 NFE2 TRANSFAC yes 109747025 4571 123639615
chr12 109742452 109742458 SP1 TRANSFAC yes 109747025 4567 123639616
chr12 109742452 109742462 SP1 JASPAR yes 109747025 4563 123639617
chr12 109742454 109742459 SP1 TRANSFAC yes 109747025 4566 123639618
chr12 109742473 109742488 HNF1A JASPAR yes 109747025 4537 123639619
chr12 109742474 109742479 MYB TRANSFAC yes 109747025 4546 123639620
chr12 109742474 109742487 HNF1B JASPAR yes 109747025 4538 123639621
chr12 109742483 109742486 MYB TRANSFAC yes 109747025 4539 123639622
chr12 109742494 109742509 TFAP2C JASPAR yes 109747025 4516 123639623
chr12 109742497 109742508 EBF1 JASPAR yes 109747025 4517 123639624
chr12 109742497 109742508 TFAP2A JASPAR yes 109747025 4517 123639625
chr12 109742497 109742508 TFAP2B JASPAR yes 109747025 4517 123639626
chr12 109742497 109742509 TFAP2A JASPAR yes 109747025 4516 123639627
chr12 109742497 109742509 TFAP2B JASPAR yes 109747025 4516 123639628
chr12 109742497 109742509 TFAP2C JASPAR yes 109747025 4516 123639629
chr12 109742497 109742510 TFAP2A JASPAR yes 109747025 4515 123639630
chr12 109742497 109742510 TFAP2B JASPAR yes 109747025 4515 123639631
chr12 109742497 109742510 TFAP2C JASPAR yes 109747025 4515 123639632
chr12 109742497 109742511 EBF1 JASPAR yes 109747025 4514 123639633
chr12 109742498 109742507 TFAP2A JASPAR yes 109747025 4518 123639634
chr12 109742499 109742510 EBF1 JASPAR yes 109747025 4515 123639635
chr12 109742504 109742525 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4500 123639636
chr12 109742519 109742524 SP1 TRANSFAC yes 109747025 4501 123639637
chr12 109742549 109742559 NKX2-3 JASPAR yes 109747025 4466 123639638
chr12 109742550 109742559 NKX3-2 JASPAR yes 109747025 4466 123639639
chr12 109742556 109742560 H4TF2 TRANSFAC yes 109747025 4465 123639640
chr12 109742577 109742592 NR2C2 JASPAR yes 109747025 4433 123639641
chr12 109742583 109742589 MAZ TRANSFAC yes 109747025 4436 123639642
chr12 109742599 109742610 CDX2 JASPAR yes 109747025 4415 123639643
chr12 109742601 109742611 HOXA13 JASPAR yes 109747025 4414 123639644
chr12 109742601 109742611 HOXB13 JASPAR yes 109747025 4414 123639645
chr12 109742601 109742611 HOXD13 JASPAR yes 109747025 4414 123639646
chr12 109742624 109742628 YY1 TRANSFAC yes 109747025 4397 123639647
chr12 109742625 109742639 E2F7 JASPAR yes 109747025 4386 123639648
chr12 109742626 109742638 E2F8 JASPAR yes 109747025 4387 123639649
chr12 109742628 109742633 TFAP2A TRANSFAC yes 109747025 4392 123639650
chr12 109742628 109742634 MZF1 JASPAR yes 109747025 4391 123639651
chr12 109742628 109742649 ZNF263 JASPAR yes 109747025 4376 123639652
chr12 109742635 109742650 SOX21 JASPAR yes 109747025 4375 123639653
chr12 109742657 109742662 ETS2 TRANSFAC yes 109747025 4363 123639654
chr12 109742663 109742675 HNF1B JASPAR yes 109747025 4350 123639655
chr12 109742671 109742682 CDX2 JASPAR yes 109747025 4343 123639656
chr12 109742672 109742683 HOXA10 JASPAR yes 109747025 4342 123639657
chr12 109742672 109742683 HOXC11 JASPAR yes 109747025 4342 123639658
chr12 109742672 109742683 HOXC12 JASPAR yes 109747025 4342 123639659
chr12 109742672 109742683 HOXD12 JASPAR yes 109747025 4342 123639660
chr12 109742673 109742682 CDX1 JASPAR yes 109747025 4343 123639661
chr12 109742673 109742683 HOXC10 JASPAR yes 109747025 4342 123639662
chr12 109742673 109742683 HOXD11 JASPAR yes 109747025 4342 123639663

Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr12 110043641 rs12307823 C T 296616 Esophagus 0.203652 2893226

Genomic Location chr12:109715784-109747025[-]
TSS 109747025
Gene Name FOXN4
Ensembl ID ENSG00000139445.13
ENTREZID 121643
Uniprot
Q96NZ1
A6H901
Protein Name
FOXN4 protein
Forkhead box protein N4