EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista4676[chr1:204255998-204256379]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista4676[chr1:204255998-204256379]
Back to top
Tissue distribution of vista4676
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista4676[chr1:204255998-204256379]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 204255965 204256675 GATA3 UCSC Txn Factor no Conserved 107859802
chr1 204255972 204256659 GATA2 UCSC Txn Factor no Conserved 107859804
chr1 204256223 204256512 USF2 UCSC Txn Factor no Conserved 107859814
chr1 204256270 204256550 FOXA1 UCSC Txn Factor no Conserved 107859819
chr1 204256040 204256053 SMAD2 JASPAR yes 34688417
chr1 204256040 204256053 SMAD2 JASPAR yes 118437728
chr1 204256052 204256062 MZF1 JASPAR yes 34688418
chr1 204256052 204256062 MZF1 JASPAR yes 118437729
chr1 204256065 204256086 IRF1 JASPAR yes 34688419
chr1 204256065 204256086 IRF1 JASPAR yes 118437730
chr1 204256067 204256082 STAT2 JASPAR yes 34688420
chr1 204256067 204256082 STAT2 JASPAR yes 118437731
chr1 204256068 204256082 STAT1 JASPAR yes 34688421
chr1 204256068 204256082 STAT1 JASPAR yes 118437732
chr1 204256071 204256086 FOXA1 JASPAR yes 34688422
chr1 204256071 204256086 FOXA1 JASPAR yes 118437733
chr1 204256075 204256086 FOXA1 JASPAR yes 34688423
chr1 204256075 204256086 FOXA1 JASPAR yes 118437734
chr1 204256079 204256091 TFAP2B JASPAR yes 34688424
chr1 204256079 204256091 TFAP2C JASPAR yes 34688425
chr1 204256079 204256091 TFAP2B JASPAR yes 118437735
chr1 204256079 204256091 TFAP2C JASPAR yes 118437736
chr1 204256085 204256104 REST JASPAR yes 34688426
chr1 204256085 204256104 REST JASPAR yes 118437737
chr1 204256086 204256090 LFA1 TRANSFAC yes 34688427
chr1 204256086 204256090 LFA1 TRANSFAC yes 118437738
chr1 204256099 204256106 SPIB JASPAR yes 34688428
chr1 204256099 204256106 SPIB JASPAR yes 118437739
chr1 204256110 204256120 TFAP4 JASPAR yes 34688429
chr1 204256110 204256120 TFAP4 JASPAR yes 118437740
chr1 204256119 204256138 CTCF JASPAR yes 34688430
chr1 204256119 204256138 CTCF JASPAR yes 118437741
chr1 204256129 204256139 SP1 JASPAR yes 34688431
chr1 204256129 204256139 SP1 JASPAR yes 118437742
chr1 204256129 204256146 ESR1 JASPAR yes 34688432
chr1 204256129 204256146 ESR1 JASPAR yes 118437743
chr1 204256177 204256194 NR3C1 JASPAR yes 34688433
chr1 204256177 204256194 NR3C2 JASPAR yes 34688434
chr1 204256177 204256194 NR3C1 JASPAR yes 118437744
chr1 204256177 204256194 NR3C2 JASPAR yes 118437745
chr1 204256179 204256194 AR JASPAR yes 34688435
chr1 204256179 204256194 AR JASPAR yes 118437746
chr1 204256187 204256201 E2F7 JASPAR yes 34688436
chr1 204256187 204256201 E2F7 JASPAR yes 118437747
chr1 204256188 204256199 TBX20 JASPAR yes 34688437
chr1 204256188 204256199 TBX20 JASPAR yes 118437748
chr1 204256188 204256200 E2F8 JASPAR yes 34688438
chr1 204256188 204256200 E2F8 JASPAR yes 118437749
chr1 204256190 204256198 TBX15 JASPAR yes 34688439
chr1 204256190 204256198 TBX15 JASPAR yes 118437750
chr1 204256309 204256316 SP1 TRANSFAC yes 34688440
chr1 204256309 204256316 SP1 TRANSFAC yes 118437751
chr1 204256309 204256319 SP1 JASPAR yes 34688441
chr1 204256309 204256319 SP1 JASPAR yes 118437752
chr1 204256309 204256330 ZNF263 JASPAR yes 34688442
chr1 204256309 204256330 ZNF263 JASPAR yes 118437753
chr1 204256310 204256321 E2F1 JASPAR yes 34688443
chr1 204256310 204256321 E2F1 JASPAR yes 118437754
chr1 204256311 204256316 SP1 TRANSFAC yes 34688444
chr1 204256311 204256316 SP1 TRANSFAC yes 118437755
chr1 204256311 204256322 E2F4 JASPAR yes 34688445
chr1 204256311 204256322 E2F6 JASPAR yes 34688446
chr1 204256311 204256322 E2F4 JASPAR yes 118437756
chr1 204256311 204256322 E2F6 JASPAR yes 118437757
chr1 204256312 204256317 SP1 TRANSFAC yes 34688447
chr1 204256312 204256317 SP1 TRANSFAC yes 118437758
chr1 204256324 204256342 MAFF JASPAR yes 34688448
chr1 204256324 204256342 MAFF JASPAR yes 118437759
chr1 204256333 204256344 FLI1 JASPAR yes 34688449
chr1 204256333 204256344 FLI1 JASPAR yes 118437760
chr1 204256333 204256346 ELF3 JASPAR yes 34688450
chr1 204256333 204256346 ELF3 JASPAR yes 118437761
chr1 204256334 204256344 GABPA JASPAR yes 34688451
chr1 204256334 204256344 GABPA JASPAR yes 118437762
chr1 204256334 204256345 ELF5 JASPAR yes 34688452
chr1 204256334 204256345 ELF5 JASPAR yes 118437763
chr1 204256334 204256346 EHF JASPAR yes 34688453
chr1 204256334 204256346 EHF JASPAR yes 118437764
chr1 204256334 204256347 ELF1 JASPAR yes 34688454
chr1 204256334 204256347 ELF1 JASPAR yes 118437765
chr1 204256334 204256348 SPI1 JASPAR yes 34688455
chr1 204256334 204256348 SPIC JASPAR yes 34688456
chr1 204256334 204256348 SPI1 JASPAR yes 118437766
chr1 204256334 204256348 SPIC JASPAR yes 118437767
chr1 204256335 204256342 SPI1 JASPAR yes 34688457
chr1 204256335 204256342 SPI1 JASPAR yes 118437768
chr1 204256335 204256343 FEV JASPAR yes 34688458
chr1 204256335 204256343 FEV JASPAR yes 118437769
chr1 204256337 204256342 ETS2 TRANSFAC yes 34688459
chr1 204256337 204256342 ETS2 TRANSFAC yes 118437770
chr1 204256351 204256364 SMAD2 JASPAR yes 34688460
chr1 204256351 204256364 SMAD2 JASPAR yes 118437771
chr1 204256354 204256375 IRF1 JASPAR yes 34688461
chr1 204256354 204256375 IRF1 JASPAR yes 118437772
chr1 204256356 204256377 IRF1 JASPAR yes 34688462
chr1 204256356 204256377 IRF1 JASPAR yes 118437773
chr1 204256359 204256374 FOXP1 JASPAR yes 34688463
chr1 204256359 204256374 FOXP1 JASPAR yes 118437774
chr1 204256361 204256376 FOXP1 JASPAR yes 34688464
chr1 204256361 204256376 FOXP1 JASPAR yes 118437775
chr1 204256362 204256377 FOXP1 JASPAR yes 34688465
chr1 204256362 204256377 FOXP1 JASPAR yes 118437776
chr1 204256363 204256378 FOXP1 JASPAR yes 34688466
chr1 204256363 204256378 FOXP1 JASPAR yes 118437777
chr1 204256364 204256379 FOXP1 JASPAR yes 34688467
chr1 204256364 204256379 FOXP1 JASPAR yes 118437778
chr1 204256365 204256380 FOXP1 JASPAR yes 34688468
chr1 204256365 204256380 FOXP1 JASPAR yes 118437779
chr1 204256367 204256382 MEF2C JASPAR yes 34688469
chr1 204256367 204256382 MEF2C JASPAR yes 118437780
chr1 204256378 204256388 MAX JASPAR yes 34688470
chr1 204256378 204256388 MAX JASPAR yes 118437781
chr1 204256378 204256389 USF1 JASPAR yes 34688471
chr1 204256378 204256389 USF2 JASPAR yes 34688472
chr1 204256378 204256389 USF1 JASPAR yes 118437782
chr1 204256378 204256389 USF2 JASPAR yes 118437783
chr1 204256379 204256389 MAX JASPAR yes 34688473
chr1 204256379 204256389 MLXIPL JASPAR yes 34688474
chr1 204256379 204256389 MLX JASPAR yes 34688475
chr1 204256379 204256389 MNT JASPAR yes 34688476
chr1 204256379 204256389 SREBF2 JASPAR yes 34688477
chr1 204256379 204256389 TFE3 JASPAR yes 34688478
chr1 204256379 204256389 TFEB JASPAR yes 34688479
chr1 204256379 204256389 TFEC JASPAR yes 34688480
chr1 204256379 204256389 MAX JASPAR yes 118437784
chr1 204256379 204256389 MLXIPL JASPAR yes 118437785
chr1 204256379 204256389 MLX JASPAR yes 118437786
chr1 204256379 204256389 MNT JASPAR yes 118437787
chr1 204256379 204256389 SREBF2 JASPAR yes 118437788
chr1 204256379 204256389 TFE3 JASPAR yes 118437789
chr1 204256379 204256389 TFEB JASPAR yes 118437790
chr1 204256379 204256389 TFEC JASPAR yes 118437791
SNP sites on vista4676[chr1:204255998-204256379]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 204256062 rs145591696 T C
GATA2 GATA3 MZF1
874743
chr1 204256086 rs115490868 T C
FOXA1 GATA2 GATA3 IRF1 LFA1 REST TFAP2B TFAP2C
874744
chr1 204256133 rs73075572 G T
CTCF ESR1 GATA2 GATA3 SP1
874745
chr1 204256219 rs183614476 G A
GATA2 GATA3
874746
chr1 204256259 rs145415406 G A
GATA2 GATA3 USF2
874747
chr1 204256315 rs561256610 C T
E2F1 E2F4 E2F6 FOXA1 GATA2 GATA3 SP1 USF2 ZNF263
874748
Genes possibly regulated by vista4676[chr1:204255998-204256379]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 204159469 204165614 - KISS1 ENSG00000170498.7 204165614 1.0 0.99 1749 9616
chr1 204167288 204183220 - GOLT1A ENSG00000174567.7 204183220 0.98 1.0 1750 27222
chr1 204187979 204346793 - PLEKHA6 ENSG00000143850.8 204346793 0.89 1.0 1751 9586
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista4676[chr1:204255998-204256379]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results