EnhancerDB
  1. Home
  2. SNP
  3. rs72729040[chr1:207998118]
Enhancers that have rs72729040[chr1:207998118]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr1 207976785 208007638 enh901
Bone Marrow (K562) Astrocyte Colon (HCT116) Blood (Karpas-422) Pancreas Uterus Blood (T-cell) Epithelial (MCF-7) Skin (Keratinocyte) Brain (SK-N-SH) Ovary Bone (Osteoblast) Blood (OCI-LY7) Lung (A549) Peripheral Blood (MM.1S) Pancreas (Panc1) Thymus Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Esophagus Blood (GM12878) Placenta Breast Muscle (Myoblast) Muscle (Myotube) Prostate (RWPE1) Lung Heart
chr1 207998055 207998202 vista4842
VISTA
Transcript factors that have rs72729040[chr1:207998118]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr1 207997268 207998692 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21374300
chr1 207997268 207998692 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864850
chr1 207997268 207998692 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864851
chr1 207997286 207998763 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21374304
chr1 207997286 207998763 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864855
chr1 207997286 207998763 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864856
chr1 207997314 207999104 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21374311
chr1 207997314 207999104 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107864868
chr1 207997314 207999104 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107864869
chr1 207997317 207998786 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374315
chr1 207997317 207998786 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864874
chr1 207997317 207998786 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864875
chr1 207997333 207998640 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374320
chr1 207997333 207998640 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864883
chr1 207997333 207998640 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864884
chr1 207997373 207998538 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374325
chr1 207997373 207998538 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864889
chr1 207997373 207998538 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864890
chr1 207997427 207998624 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374329
chr1 207997427 207998624 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864894
chr1 207997427 207998624 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864895
chr1 207997432 207998829 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21374330
chr1 207997432 207998829 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864896
chr1 207997432 207998829 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864897
chr1 207997438 207998388 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374332
chr1 207997438 207998388 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864899
chr1 207997438 207998388 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864900
chr1 207997459 207998387 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374334
chr1 207997459 207998387 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864902
chr1 207997459 207998387 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864903
chr1 207997468 207998493 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374335
chr1 207997468 207998493 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864904
chr1 207997468 207998493 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864905
chr1 207997477 207998513 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374336
chr1 207997477 207998513 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864906
chr1 207997477 207998513 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864907
chr1 207997490 207998300 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374337
chr1 207997490 207998300 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864908
chr1 207997490 207998300 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864909
chr1 207997501 207998596 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374338
chr1 207997501 207998596 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864910
chr1 207997501 207998596 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864911
chr1 207997532 207998220 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374339
chr1 207997532 207998220 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864912
chr1 207997532 207998220 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864913
chr1 207997535 207998395 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374340
chr1 207997535 207998395 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864914
chr1 207997535 207998395 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864915
chr1 207997540 207998544 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864916
chr1 207997540 207998544 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864917
chr1 207997547 207998636 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374341
chr1 207997547 207998636 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864918
chr1 207997547 207998636 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864919
chr1 207997554 207998370 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21374342
chr1 207997554 207998370 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107864920
chr1 207997554 207998370 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107864921
chr1 207997561 207998520 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374343
chr1 207997561 207998520 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864922
chr1 207997561 207998520 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864923
chr1 207997576 207998450 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864925
chr1 207997576 207998450 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864926
chr1 207997580 207998590 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21374345
chr1 207997580 207998590 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864927
chr1 207997580 207998590 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864928
chr1 207997593 207998291 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21374346
chr1 207997593 207998291 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864929
chr1 207997593 207998291 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864930
chr1 207997597 207998148 CTCF GTRD no Lung 21374347
chr1 207997597 207998148 CTCF GTRD no Lung 107864931
chr1 207997597 207998148 CTCF GTRD no Lung 107864932
chr1 207997599 207998349 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374348
chr1 207997599 207998349 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864933
chr1 207997599 207998349 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864934
chr1 207997606 207998216 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374349
chr1 207997606 207998216 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864935
chr1 207997606 207998216 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864936
chr1 207997626 207998279 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374351
chr1 207997626 207998279 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864938
chr1 207997626 207998279 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864939
chr1 207997644 207998298 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374352
chr1 207997644 207998298 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864940
chr1 207997644 207998298 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864941
chr1 207997652 207998357 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21374353
chr1 207997652 207998357 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864942
chr1 207997652 207998357 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864943
chr1 207997657 207998295 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374354
chr1 207997657 207998295 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864944
chr1 207997657 207998295 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864945
chr1 207997669 207998171 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374355
chr1 207997669 207998171 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864946
chr1 207997669 207998171 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864947
chr1 207997671 207998287 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374356
chr1 207997671 207998287 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864948
chr1 207997671 207998287 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864949
chr1 207997673 207998262 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374357
chr1 207997673 207998262 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864950
chr1 207997673 207998262 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864951
chr1 207997675 207998286 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374358
chr1 207997675 207998286 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864952
chr1 207997675 207998286 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864953
chr1 207997680 207998291 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374359
chr1 207997680 207998291 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864954
chr1 207997680 207998291 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864955
chr1 207997683 207998243 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21374360
chr1 207997683 207998243 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864956
chr1 207997683 207998243 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107864957
chr1 207997694 207998286 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374362
chr1 207997694 207998286 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864960
chr1 207997694 207998286 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864961
chr1 207997694 207998392 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21374363
chr1 207997694 207998392 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107864962
chr1 207997694 207998392 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107864963
chr1 207997697 207998157 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374364
chr1 207997697 207998157 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864964
chr1 207997697 207998157 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864965
chr1 207997697 207998247 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374365
chr1 207997697 207998247 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864966
chr1 207997697 207998247 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864967
chr1 207997700 207998267 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374366
chr1 207997700 207998267 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864968
chr1 207997700 207998267 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864969
chr1 207997714 207998208 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374367
chr1 207997714 207998208 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864970
chr1 207997714 207998208 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107864971
chr1 207997718 207998278 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864972
chr1 207997718 207998278 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864973
chr1 207997722 207998210 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374368
chr1 207997722 207998210 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864974
chr1 207997722 207998210 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864975
chr1 207997723 207998274 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864976
chr1 207997723 207998274 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864977
chr1 207997726 207998415 CTCF GTRD no Spleen 107864978
chr1 207997726 207998415 CTCF GTRD no Spleen 107864979
chr1 207997731 207998284 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21374369
chr1 207997731 207998284 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864980
chr1 207997731 207998284 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864981
chr1 207997732 207998166 CTCF GTRD no Kidney 107864982
chr1 207997732 207998166 CTCF GTRD no Kidney 107864983
chr1 207997733 207998183 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21374370
chr1 207997733 207998183 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107864984
chr1 207997733 207998183 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107864985
chr1 207997738 207998289 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 21374371
chr1 207997738 207998289 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864986
chr1 207997738 207998289 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107864987
chr1 207997753 207998288 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374372
chr1 207997753 207998288 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864988
chr1 207997753 207998288 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107864989
chr1 207997756 207998228 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864990
chr1 207997756 207998228 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864991
chr1 207997757 207998201 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864992
chr1 207997757 207998201 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107864993
chr1 207997760 207998219 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374373
chr1 207997760 207998219 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864994
chr1 207997760 207998219 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107864995
chr1 207997772 207998219 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374375
chr1 207997772 207998219 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107865000
chr1 207997772 207998219 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107865001
chr1 207997773 207998231 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374376
chr1 207997773 207998231 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107865002
chr1 207997773 207998231 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107865003
chr1 207997777 207998251 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374377
chr1 207997777 207998251 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107865004
chr1 207997777 207998251 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107865005
chr1 207997795 207998291 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374378
chr1 207997795 207998291 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107865006
chr1 207997795 207998291 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107865007
chr1 207997796 207998197 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21374379
chr1 207997796 207998197 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107865008
chr1 207997796 207998197 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 107865009
chr1 207997812 207998249 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374380
chr1 207997812 207998249 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107865010
chr1 207997812 207998249 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107865011
chr1 207997823 207998164 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374381
chr1 207997823 207998164 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107865012
chr1 207997823 207998164 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107865013
chr1 207997830 207998142 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374382
chr1 207997830 207998142 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107865014
chr1 207997830 207998142 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107865015
chr1 207997831 207998251 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21374383
chr1 207997831 207998251 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107865016
chr1 207997831 207998251 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 107865017
chr1 207997840 207998246 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21374385
chr1 207997840 207998246 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107865019
chr1 207997845 207998180 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21374387
chr1 207997845 207998180 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107865020
chr1 207997849 207998215 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107865021
chr1 207997867 207998190 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107865023
chr1 207997871 207998232 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21374389
chr1 207997871 207998232 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107865024
chr1 207997920 207998376 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 21374391
chr1 207997920 207998376 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 107865026
chr1 207997962 207998326 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 21374392
chr1 207997962 207998326 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 107865027
chr1 207997962 207998345 RFX5 UCSC Txn Factor no Conserved 107865028
chr1 207997983 207998313 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 21374393
chr1 207997983 207998313 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 107865029
chr1 207998003 207998283 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 21374394
chr1 207998003 207998283 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 107865030
chr1 207998004 207998284 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 21374395
chr1 207998004 207998284 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 107865031
chr1 207998009 207998345 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 21374396
chr1 207998009 207998345 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 107865032
chr1 207998017 207998297 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 21374397
chr1 207998017 207998297 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 107865033
chr1 207998022 207998302 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 21374398
chr1 207998022 207998302 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 107865034
chr1 207998026 207998262 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 21374399
chr1 207998026 207998262 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 107865035
chr1 207998116 207998126 EN2 JASPAR yes 34879178
chr1 207998116 207998126 GBX1 JASPAR yes 34879179
chr1 207998116 207998126 EN2 JASPAR yes 118446078
chr1 207998116 207998126 GBX1 JASPAR yes 118446079
chr1 207998117 207998125 BSX JASPAR yes 34879180
chr1 207998117 207998125 DLX6 JASPAR yes 34879181
chr1 207998117 207998125 MSX1 JASPAR yes 34879182
chr1 207998117 207998125 MSX2 JASPAR yes 34879183
chr1 207998117 207998125 BSX JASPAR yes 118446080
chr1 207998117 207998125 DLX6 JASPAR yes 118446081
chr1 207998117 207998125 MSX1 JASPAR yes 118446082
chr1 207998117 207998125 MSX2 JASPAR yes 118446083
Genes associated with rs72729040[chr1:207998118], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More