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Enhancers that regulate S100A9[ENSG00000163220.10]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr1 153259149 153268139 enh61907 153330330 62191
Esophagus
chr1 153285394 153285679 vista3332 153330330 44651
VISTA
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Blood (GM12878)
chr1 153332949 153346154 enh12267 153330330 2619
Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Prostate (RWPE1) Large Intestine Esophagus Placenta Lung (PC-9) Epithelial (MCF-7)
chr1 153337774 153338142 vista3333 153330330 7444
VISTA
chr1 153355413 153361362 enh12268 153330330 25083
Esophagus Skin (Keratinocyte) Placenta Prostate (RWPE1)
chr1 153358841 153359368 vista3334 153330330 28511
VISTA
chr1 153361312 153361704 vista3335 153330330 30982
VISTA
chr1 153366487 153366797 vista3336 153330330 36157
VISTA
chr1 153402025 153408055 enh90716 153330330 71695
Bone Marrow (K562)
chr1 153418065 153422515 enh79217 153330330 87735
Prostate (PC-3)
Transcript facotrs that regulate S100A9[ENSG00000163220.10]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr1 153332963 153332972 SOX9 JASPAR yes 153330330 2633 32245963
chr1 153332965 153332986 MAFG JASPAR yes 153330330 2635 32245964
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chr1 153333977 153333987 NFATC3 JASPAR yes 153330330 3647 32246099
chr1 153333979 153333987 FOXO3 JASPAR yes 153330330 3649 32246100
chr1 153333991 153334001 ERF JASPAR yes 153330330 3661 32246101
chr1 153333991 153334001 ETV3 JASPAR yes 153330330 3661 32246102
chr1 153333992 153334001 ELK4 JASPAR yes 153330330 3662 32246103
chr1 153333998 153334013 FOXA1 JASPAR yes 153330330 3668 32246104
chr1 153333999 153334014 FOXP1 JASPAR yes 153330330 3669 32246105
chr1 153334000 153334011 FOXP2 JASPAR yes 153330330 3670 32246106
chr1 153334000 153334012 FOXC2 JASPAR yes 153330330 3670 32246107
chr1 153334000 153334014 FOXF2 JASPAR yes 153330330 3670 32246108
chr1 153334001 153334009 FOXD1 JASPAR yes 153330330 3671 32246109
chr1 153334001 153334009 FOXG1 JASPAR yes 153330330 3671 32246110
chr1 153334001 153334009 FOXO3 JASPAR yes 153330330 3671 32246111
chr1 153334002 153334009 FOXD2 JASPAR yes 153330330 3672 32246112
chr1 153334002 153334009 FOXI1 JASPAR yes 153330330 3672 32246113
chr1 153334002 153334009 FOXL1 JASPAR yes 153330330 3672 32246114
chr1 153334002 153334009 FOXO4 JASPAR yes 153330330 3672 32246115
chr1 153334002 153334009 FOXO6 JASPAR yes 153330330 3672 32246116
chr1 153334002 153334009 FOXP3 JASPAR yes 153330330 3672 32246117
chr1 153334002 153334013 FOXA1 JASPAR yes 153330330 3672 32246118
chr1 153334007 153334020 EOMES JASPAR yes 153330330 3677 32246119
chr1 153334009 153334019 TBR1 JASPAR yes 153330330 3679 32246120
chr1 153334009 153334020 TBX20 JASPAR yes 153330330 3679 32246121
chr1 153334009 153334020 TBX2 JASPAR yes 153330330 3679 32246122
chr1 153334010 153334020 TBX21 JASPAR yes 153330330 3680 32246123
chr1 153334011 153334019 MGA JASPAR yes 153330330 3681 32246124
chr1 153334011 153334019 TBX15 JASPAR yes 153330330 3681 32246125
chr1 153334011 153334019 TBX1 JASPAR yes 153330330 3681 32246126
chr1 153334011 153334019 TBX4 JASPAR yes 153330330 3681 32246127
chr1 153334011 153334019 TBX5 JASPAR yes 153330330 3681 32246128
chr1 153334047 153334053 MYC TRANSFAC yes 153330330 3717 32246129
chr1 153334052 153334055 MYB TRANSFAC yes 153330330 3722 32246130
chr1 153334088 153334098 NKX2-3 JASPAR yes 153330330 3758 32246131
chr1 153334117 153334126 HIC2 JASPAR yes 153330330 3787 32246132
chr1 153334136 153334148 YY1 JASPAR yes 153330330 3806 32246133
chr1 153334152 153334158 HiNF-A TRANSFAC yes 153330330 3822 32246134
chr1 153334221 153334225 H4TF2 TRANSFAC yes 153330330 3891 32246135
chr1 153334229 153334244 TFAP2C JASPAR yes 153330330 3899 32246136
chr1 153334230 153334241 TFAP2A JASPAR yes 153330330 3900 32246137
chr1 153334230 153334241 TFAP2B JASPAR yes 153330330 3900 32246138
chr1 153334230 153334241 TFAP2C JASPAR yes 153330330 3900 32246139
chr1 153334231 153334240 TFAP2A JASPAR yes 153330330 3901 32246140
chr1 153334265 153334283 ESR2 JASPAR yes 153330330 3935 32246141
chr1 153334269 153334279 MSC JASPAR yes 153330330 3939 32246142
chr1 153334274 153334278 NFE TRANSFAC yes 153330330 3944 32246143
chr1 153334285 153334290 SP1 TRANSFAC yes 153330330 3955 32246144
chr1 153334316 153334321 GATA1 TRANSFAC yes 153330330 3986 32246145
chr1 153334331 153334337 TCF4 TRANSFAC yes 153330330 4001 32246146
chr1 153334359 153334374 TFAP2A JASPAR yes 153330330 4029 32246147
chr1 153334359 153334374 TFAP2C JASPAR yes 153330330 4029 32246148
chr1 153334362 153334373 TFAP2A JASPAR yes 153330330 4032 32246149
chr1 153334362 153334374 TFAP2A JASPAR yes 153330330 4032 32246150
chr1 153334362 153334374 TFAP2B JASPAR yes 153330330 4032 32246151
chr1 153334362 153334374 TFAP2C JASPAR yes 153330330 4032 32246152
chr1 153334384 153334394 MZF1 JASPAR yes 153330330 4054 32246153
chr1 153334384 153334396 INSM1 JASPAR yes 153330330 4054 32246154
chr1 153334397 153334403 NFE2 TRANSFAC yes 153330330 4067 32246155
chr1 153334432 153334444 YY1 JASPAR yes 153330330 4102 32246156
chr1 153334434 153334451 RXRA JASPAR yes 153330330 4104 32246157
chr1 153334435 153334441 YY1 JASPAR yes 153330330 4105 32246158
chr1 153334444 153334459 HNF4A JASPAR yes 153330330 4114 32246159
chr1 153334445 153334460 HNF4G JASPAR yes 153330330 4115 32246160
chr1 153334445 153334460 TFAP2A JASPAR yes 153330330 4115 32246161
chr1 153334453 153334460 GATA1 TRANSFAC yes 153330330 4123 32246162
chr1 153334456 153334460 TEAD2 TRANSFAC yes 153330330 4126 32246163
chr1 153334456 153334461 TBP TRANSFAC yes 153330330 4126 32246164
chr1 153334477 153334481 TEAD2 TRANSFAC yes 153330330 4147 32246165
chr1 153334479 153334482 MYB TRANSFAC yes 153330330 4149 32246166
chr1 153334502 153334517 HNF4G JASPAR yes 153330330 4172 32246167
chr1 153334503 153334518 HNF4A JASPAR yes 153330330 4173 32246168
chr1 153334514 153334529 HNF4G JASPAR yes 153330330 4184 32246169
chr1 153334515 153334530 HNF4A JASPAR yes 153330330 4185 32246170
chr1 153334519 153334536 RXRA JASPAR yes 153330330 4189 32246171
chr1 153334520 153334532 HINFP JASPAR yes 153330330 4190 32246172
chr1 153334523 153334527 H4TF2 TRANSFAC yes 153330330 4193 32246173
chr1 153334523 153334537 RXRB JASPAR yes 153330330 4193 32246174
chr1 153334526 153334539 NR2F1 JASPAR yes 153330330 4196 32246175
chr1 153334529 153334544 HNF4A JASPAR yes 153330330 4199 32246176
chr1 153334530 153334542 PKNOX1 JASPAR yes 153330330 4200 32246177
chr1 153334530 153334542 TGIF2 JASPAR yes 153330330 4200 32246178
chr1 153334530 153334544 RXRG JASPAR yes 153330330 4200 32246179
chr1 153334530 153334545 HNF4G JASPAR yes 153330330 4200 32246180
chr1 153334530 153334545 NR2C2 JASPAR yes 153330330 4200 32246181
chr1 153334536 153334540 NFE TRANSFAC yes 153330330 4206 32246182
chr1 153334576 153334581 TFAP2A TRANSFAC yes 153330330 4246 32246183
chr1 153334576 153334582 MZF1 JASPAR yes 153330330 4246 32246184
chr1 153334578 153334583 ETS2 TRANSFAC yes 153330330 4248 32246185
chr1 153334586 153334591 ETS2 TRANSFAC yes 153330330 4256 32246186
chr1 153334604 153334619 PRDM1 JASPAR yes 153330330 4274 32246187
chr1 153334634 153334645 TBX20 JASPAR yes 153330330 4304 32246188
chr1 153334671 153334686 SOX21 JASPAR yes 153330330 4341 32246189
chr1 153334684 153334699 MEF2C JASPAR yes 153330330 4354 32246190
chr1 153334685 153334700 MEF2A JASPAR yes 153330330 4355 32246191
chr1 153334686 153334698 MEF2D JASPAR yes 153330330 4356 32246192
chr1 153334716 153334722 JUN TRANSFAC yes 153330330 4386 32246193
chr1 153334726 153334732 NFE2 TRANSFAC yes 153330330 4396 32246194
chr1 153334727 153334740 TFAP2A JASPAR yes 153330330 4397 32246195
chr1 153334741 153334762 ZNF263 JASPAR yes 153330330 4411 32246196
chr1 153334742 153334763 ZNF263 JASPAR yes 153330330 4412 32246197
chr1 153334745 153334751 MZF1 JASPAR yes 153330330 4415 32246198
chr1 153334747 153334755 SP1 TRANSFAC yes 153330330 4417 32246199
chr1 153334752 153334762 SP1 JASPAR yes 153330330 4422 32246200
chr1 153334757 153334763 MZF1 JASPAR yes 153330330 4427 32246201
chr1 153334767 153334780 ELF1 JASPAR yes 153330330 4437 32246202
chr1 153334798 153334803 H4TF1 TRANSFAC yes 153330330 4468 32246203
chr1 153334842 153334857 SCRT1 JASPAR yes 153330330 4512 32246204
chr1 153334844 153334857 SCRT2 JASPAR yes 153330330 4514 32246205
chr1 153334868 153334883 TFAP2A JASPAR yes 153330330 4538 32246206
chr1 153334870 153334885 TFAP2C JASPAR yes 153330330 4540 32246207
chr1 153334871 153334883 INSM1 JASPAR yes 153330330 4541 32246208
chr1 153334871 153334883 TFAP2A JASPAR yes 153330330 4541 32246209
chr1 153334871 153334883 TFAP2B JASPAR yes 153330330 4541 32246210
chr1 153334871 153334883 TFAP2C JASPAR yes 153330330 4541 32246211
chr1 153334872 153334881 TFAP2A JASPAR yes 153330330 4542 32246212
chr1 153334912 153334921 NKX2-8 JASPAR yes 153330330 4582 32246213
chr1 153334926 153334933 PEA3 TRANSFAC yes 153330330 4596 32246214
chr1 153334928 153334943 HSF1 JASPAR yes 153330330 4598 32246215
chr1 153334931 153334939 FOXO3 JASPAR yes 153330330 4601 32246216
chr1 153334931 153334946 STAT1 JASPAR yes 153330330 4601 32246217
chr1 153334933 153334944 STAT1 JASPAR yes 153330330 4603 32246218
chr1 153334933 153334944 STAT3 JASPAR yes 153330330 4603 32246219
chr1 153334943 153334947 NFE TRANSFAC yes 153330330 4613 32246220
chr1 153334954 153334975 MAFG JASPAR yes 153330330 4624 32246221
chr1 153334967 153334982 HSF1 JASPAR yes 153330330 4637 32246222
chr1 153335017 153335036 CTCF JASPAR yes 153330330 4687 32246223
chr1 153335019 153335029 TFAP4 JASPAR yes 153330330 4689 32246224
chr1 153335025 153335030 TFAP2A TRANSFAC yes 153330330 4695 32246225
chr1 153335025 153335031 MZF1 JASPAR yes 153330330 4695 32246226
chr1 153335035 153335039 YY1 TRANSFAC yes 153330330 4705 32246227
chr1 153335085 153335089 NFE TRANSFAC yes 153330330 4755 32246228
chr1 153335114 153335124 HOXA2 JASPAR yes 153330330 4784 32246229
chr1 153335114 153335124 MEOX1 JASPAR yes 153330330 4784 32246230
chr1 153335115 153335125 POU6F2 JASPAR yes 153330330 4785 32246231
chr1 153335138 153335143 TFAP2A TRANSFAC yes 153330330 4808 32246232
chr1 153335138 153335144 MZF1 JASPAR yes 153330330 4808 32246233
chr1 153335142 153335147 NFY TRANSFAC yes 153330330 4812 32246234
chr1 153335149 153335163 NR2F1 JASPAR yes 153330330 4819 32246235
chr1 153335156 153335168 TAL1 JASPAR yes 153330330 4826 32246236
chr1 153335161 153335176 HSF1 JASPAR yes 153330330 4831 32246237
chr1 153335162 153335175 HSF4 JASPAR yes 153330330 4832 32246238
chr1 153335187 153335197 MZF1 JASPAR yes 153330330 4857 32246239
chr1 153335188 153335202 PLAG1 JASPAR yes 153330330 4858 32246240
chr1 153335189 153335203 PLAG1 JASPAR yes 153330330 4859 32246241
chr1 153335217 153335232 AR JASPAR yes 153330330 4887 32246242
chr1 153335233 153335245 POU2F1 JASPAR yes 153330330 4903 32246243
chr1 153335233 153335246 POU3F3 JASPAR yes 153330330 4903 32246244
chr1 153335233 153335247 POU1F1 JASPAR yes 153330330 4903 32246245
chr1 153335234 153335246 POU3F1 JASPAR yes 153330330 4904 32246246
chr1 153335234 153335246 POU3F2 JASPAR yes 153330330 4904 32246247
chr1 153335235 153335243 FOXL1 JASPAR yes 153330330 4905 32246248
chr1 153335235 153335249 FOXF2 JASPAR yes 153330330 4905 32246249
chr1 153335236 153335244 FOXG1 JASPAR yes 153330330 4906 32246250
chr1 153335237 153335247 HOXC10 JASPAR yes 153330330 4907 32246251
chr1 153335237 153335247 HOXD11 JASPAR yes 153330330 4907 32246252
chr1 153335237 153335248 HOXA10 JASPAR yes 153330330 4907 32246253
chr1 153335237 153335248 HOXC11 JASPAR yes 153330330 4907 32246254
chr1 153335237 153335248 HOXC12 JASPAR yes 153330330 4907 32246255
chr1 153335237 153335248 HOXD12 JASPAR yes 153330330 4907 32246256
chr1 153335238 153335247 CDX1 JASPAR yes 153330330 4908 32246257
chr1 153335238 153335249 CDX2 JASPAR yes 153330330 4908 32246258
chr1 153335242 153335253 NFE2L2 JASPAR yes 153330330 4912 32246259
chr1 153335252 153335262 MZF1 JASPAR yes 153330330 4922 32246260
chr1 153335255 153335261 SP1 TRANSFAC yes 153330330 4925 32246261
chr1 153335269 153335272 MYB TRANSFAC yes 153330330 4939 32246262
chr1 153335277 153335292 HNF4G JASPAR yes 153330330 4947 32246263
chr1 153335277 153335292 NR2C2 JASPAR yes 153330330 4947 32246264
chr1 153335278 153335292 NR2F1 JASPAR yes 153330330 4948 32246265
chr1 153335278 153335293 HNF4A JASPAR yes 153330330 4948 32246266
chr1 153335286 153335298 TAL1 JASPAR yes 153330330 4956 32246267
chr1 153335288 153335300 TAL1 JASPAR yes 153330330 4958 32246268
chr1 153335291 153335306 FOXP1 JASPAR yes 153330330 4961 32246269
chr1 153335291 153335312 IRF1 JASPAR yes 153330330 4961 32246270
chr1 153335292 153335303 FOXP2 JASPAR yes 153330330 4962 32246271
chr1 153335292 153335307 STAT2 JASPAR yes 153330330 4962 32246272
chr1 153335293 153335308 FOXP1 JASPAR yes 153330330 4963 32246273
chr1 153335297 153335312 FOXP1 JASPAR yes 153330330 4967 32246274
chr1 153335297 153335318 IRF1 JASPAR yes 153330330 4967 32246275
chr1 153335316 153335337 REST JASPAR yes 153330330 4986 32246276
SNPs associated with S100A9[ENSG00000163220.10], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr1 153344374 rs3014880 C A,G,T 10871 Esophagus 0.0478713 633362
chr1 153631198 rs58021050 T C 297695 Esophagus 0.24756 635689
chr1 153582067 rs9660389 A G 248564 Esophagus 0.148154 635392
chr1 153339782 rs60752752 A G 6279 Heart 0.0160976 633290
chr1 153339782 rs60752752 A G 6279 Heart 0.0913839 633290
chr1 152479752 rs7549858 A G 850578 Spleen 0.394582 630654
chr1 152830033 rs75742937 A G 500297 Thyroid 0.0588463 631184
chr1 153339314 rs11580993 A C 5811 Adrenal 0.00103952 633287
Details of S100A9[ENSG00000163220.10]
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Genomic Location chr1:153330330-153333503[+]
TSS 153330330
Gene Name S100A9
Ensembl ID ENSG00000163220.10
ENTREZID 6280
Uniprot
P06702
Protein Name
Protein S100-A9
Expression levels of S100A9[ENSG00000163220.10]
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