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Enhancers that regulate MS4A6E[ENSG00000166926.4]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr11 60020095 60020344 vista10408 60102304 81960
VISTA
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Placenta
chr11 60049087 60049291 vista10409 60102304 53013
VISTA
chr11 60051045 60055475 enh13948 60102304 46829
Placenta
chr11 60066083 60066220 vista10410 60102304 36084
VISTA
chr11 60068025 60073395 enh13949 60102304 28909
Placenta
chr11 60078625 60088495 enh13950 60102304 13809
Placenta
chr11 60100447 60100839 vista10411 60102304 1465
VISTA
chr11 60104289 60104578 vista10412 60102304 1985
VISTA
chr11 60111065 60115215 enh94133 60102304 8761
Spleen
chr11 60123325 60127475 enh1800 60102304 21021
Blood (Karpas-422)
chr11 60128956 60140775 enh1801 60102304 26652
Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Blood (OCI-LY7) Blood (GM12878) Stomach Peripheral Blood (MM.1S) Blood (Karpas-422) Pancreas Pancreas (Panc1) Neural Stem Cells (H9) Epithelial (MCF-7)
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VISTA
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VISTA
Transcript facotrs that regulate MS4A6E[ENSG00000166926.4]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr11 60099971 60100467 ZNF217 ENCODE Uniform TFBS no Epithelial (MCF-7) 60102304 1837 107971685
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chr11 60104463 60104473 RORA JASPAR yes 60102304 2159 114076387
chr11 60104504 60104518 ZIC1 JASPAR yes 60102304 2200 114076388
chr11 60104504 60104519 ZIC3 JASPAR yes 60102304 2200 114076389
chr11 60104504 60104519 ZIC4 JASPAR yes 60102304 2200 114076390
chr11 60104525 60104529 YY1 TRANSFAC yes 60102304 2221 114076391
chr11 60104525 60104536 CEBPB JASPAR yes 60102304 2221 114076392
chr11 60104525 60104537 HLF JASPAR yes 60102304 2221 114076393
chr11 60104526 60104537 CEBPA JASPAR yes 60102304 2222 114076394
chr11 60104552 60104567 HNF4G JASPAR yes 60102304 2248 114076395
chr11 60104558 60104567 THAP1 JASPAR yes 60102304 2254 114076396
chr11 60104558 60104573 RUNX2 JASPAR yes 60102304 2254 114076397
SNPs associated with MS4A6E[ENSG00000166926.4], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr11 60072047 rs10792262 T G 30257 Spleen 0.0661362 2019511
Details of MS4A6E[ENSG00000166926.4]
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Genomic Location chr11:60102304-60164069[+]
TSS 60102304
Gene Name MS4A6E
Ensembl ID ENSG00000166926.4
ENTREZID 245802
Uniprot
Q96DS6
Protein Name
Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E
Expression levels of MS4A6E[ENSG00000166926.4]
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