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Enhancers that regulate NELFA[ENSG00000185049.8]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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Bone Marrow (K562) Large Intestine
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Cervix (HeLa-S3) Lung (PC-9)
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VISTA
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Stomach
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VISTA
Transcript facotrs that regulate NELFA[ENSG00000185049.8]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr4 2040271 2040277 MYC TRANSFAC yes 2043630 3353 87841114
chr4 2040276 2040280 TEAD2 TRANSFAC yes 2043630 3350 87841115
chr4 2040297 2040311 RORA JASPAR yes 2043630 3319 87841116
chr4 2040303 2040314 PROP1 JASPAR yes 2043630 3316 87841117
chr4 2040309 2040324 MEF2A JASPAR yes 2043630 3306 87841118
chr4 2040310 2040322 MEF2A JASPAR yes 2043630 3308 87841119
chr4 2040332 2040339 NKX3-1 JASPAR yes 2043630 3291 87841120
chr4 2040356 2040361 GATA2 JASPAR yes 2043630 3269 87841121
chr4 2040379 2040389 ALX3 JASPAR yes 2043630 3241 87841122
chr4 2040379 2040389 LBX2 JASPAR yes 2043630 3241 87841123
chr4 2040379 2040389 MIXL1 JASPAR yes 2043630 3241 87841124
chr4 2040380 2040388 LHX9 JASPAR yes 2043630 3242 87841125
chr4 2040380 2040388 SHOX JASPAR yes 2043630 3242 87841126
chr4 2040413 2040431 RARA JASPAR yes 2043630 3199 87841127
chr4 2040416 2040421 GATA2 JASPAR yes 2043630 3209 87841128
chr4 2040429 2040440 ELK4 JASPAR yes 2043630 3190 87841129
chr4 2040429 2040440 FLI1 JASPAR yes 2043630 3190 87841130
chr4 2040429 2040442 ELF3 JASPAR yes 2043630 3188 87841131
chr4 2040430 2040434 YY1 TRANSFAC yes 2043630 3196 87841132
chr4 2040430 2040440 ERF JASPAR yes 2043630 3190 87841133
chr4 2040430 2040440 ERG JASPAR yes 2043630 3190 87841134
chr4 2040430 2040440 ETS1 JASPAR yes 2043630 3190 87841135
chr4 2040430 2040440 FEV JASPAR yes 2043630 3190 87841136
chr4 2040430 2040440 FLI1 JASPAR yes 2043630 3190 87841137
chr4 2040430 2040441 ELF5 JASPAR yes 2043630 3189 87841138
chr4 2040430 2040441 ETV2 JASPAR yes 2043630 3189 87841139
chr4 2040430 2040442 EHF JASPAR yes 2043630 3188 87841140
chr4 2040430 2040442 ELF1 JASPAR yes 2043630 3188 87841141
chr4 2040430 2040442 ELF4 JASPAR yes 2043630 3188 87841142
chr4 2040430 2040443 ELF1 JASPAR yes 2043630 3187 87841143
chr4 2040431 2040439 FEV JASPAR yes 2043630 3191 87841144
chr4 2040443 2040453 EVX1 JASPAR yes 2043630 3177 87841145
chr4 2040443 2040453 POU6F1 JASPAR yes 2043630 3177 87841146
chr4 2040479 2040483 TEAD2 TRANSFAC yes 2043630 3147 87841147
chr4 2040488 2040504 POU4F2 JASPAR yes 2043630 3126 87841148
chr4 2040488 2040504 POU4F3 JASPAR yes 2043630 3126 87841149
chr4 2040490 2040504 POU4F1 JASPAR yes 2043630 3126 87841150
chr4 2040490 2040505 HNF1A JASPAR yes 2043630 3125 87841151
chr4 2040491 2040501 LHX6 JASPAR yes 2043630 3129 87841152
chr4 2040491 2040501 MNX1 JASPAR yes 2043630 3129 87841153
chr4 2040491 2040501 POU6F1 JASPAR yes 2043630 3129 87841154
chr4 2040491 2040504 HNF1B JASPAR yes 2043630 3126 87841155
chr4 2040492 2040500 LMX1A JASPAR yes 2043630 3130 87841156
chr4 2040492 2040500 LMX1B JASPAR yes 2043630 3130 87841157
chr4 2040492 2040500 NKX6-1 JASPAR yes 2043630 3130 87841158
chr4 2040492 2040500 NKX6-2 JASPAR yes 2043630 3130 87841159
chr4 2040492 2040500 VAX1 JASPAR yes 2043630 3130 87841160
chr4 2040492 2040500 VAX2 JASPAR yes 2043630 3130 87841161
chr4 2040492 2040500 VSX1 JASPAR yes 2043630 3130 87841162
chr4 2040492 2040500 VSX2 JASPAR yes 2043630 3130 87841163
chr4 2040497 2040501 YY1 TRANSFAC yes 2043630 3129 87841164
chr4 2040512 2040520 MEIS2 JASPAR yes 2043630 3110 87841165
chr4 2040513 2040517 NFE TRANSFAC yes 2043630 3113 87841166
chr4 2040513 2040520 MEIS1 JASPAR yes 2043630 3110 87841167
chr4 2040522 2040537 PRDM1 JASPAR yes 2043630 3093 87841168
chr4 2040524 2040536 IRF1 JASPAR yes 2043630 3094 87841169
chr4 2040532 2040536 YY1 TRANSFAC yes 2043630 3094 87841170
chr4 2040542 2040548 LEF1 TRANSFAC yes 2043630 3082 87841171
chr4 2040542 2040548 SOX10 JASPAR yes 2043630 3082 87841172
chr4 2040545 2040557 FOXI1 JASPAR yes 2043630 3073 87841173
chr4 2040548 2040552 YY1 TRANSFAC yes 2043630 3078 87841174
chr4 2040560 2040571 NFE2L2 JASPAR yes 2043630 3059 87841175
chr4 2040580 2040587 JUN TRANSFAC yes 2043630 3043 87841176
chr4 2040584 2040605 REST JASPAR yes 2043630 3025 87841177
chr4 2040617 2040626 PITX3 JASPAR yes 2043630 3004 87841178
chr4 2040653 2040661 MEIS2 JASPAR yes 2043630 2969 87841179
chr4 2040654 2040658 NFE TRANSFAC yes 2043630 2972 87841180
chr4 2040654 2040661 MEIS1 JASPAR yes 2043630 2969 87841181
chr4 2040673 2040678 USF2 TRANSFAC yes 2043630 2952 87841182
chr4 2040685 2040696 FOXB1 JASPAR yes 2043630 2934 87841183
chr4 2040685 2040696 FOXC1 JASPAR yes 2043630 2934 87841184
chr4 2040685 2040697 FOXC2 JASPAR yes 2043630 2933 87841185
chr4 2040698 2040710 IRF1 JASPAR yes 2043630 2920 87841186
chr4 2040698 2040713 IRF9 JASPAR yes 2043630 2917 87841187
chr4 2040709 2040721 IRF1 JASPAR yes 2043630 2909 87841188
chr4 2040709 2040723 TCF7L2 JASPAR yes 2043630 2907 87841189
chr4 2040709 2040724 LEF1 JASPAR yes 2043630 2906 87841190
chr4 2040724 2040728 YY1 TRANSFAC yes 2043630 2902 87841191
chr4 2040738 2040748 TBX21 JASPAR yes 2043630 2882 87841192
chr4 2040738 2040749 TBX20 JASPAR yes 2043630 2881 87841193
chr4 2040738 2040749 TBX2 JASPAR yes 2043630 2881 87841194
chr4 2040738 2040751 EOMES JASPAR yes 2043630 2879 87841195
chr4 2040739 2040749 TBR1 JASPAR yes 2043630 2881 87841196
chr4 2040748 2040751 MYB TRANSFAC yes 2043630 2879 87841197
chr4 2040763 2040775 POU3F2 JASPAR yes 2043630 2855 87841198
chr4 2040774 2040778 YY1 TRANSFAC yes 2043630 2852 87841199
SNPs associated with NELFA[ENSG00000185049.8], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr4 1579865 rs187340202 G A 404576 Pancreas 0.0695656 7347662
chr4 2979380 rs75690781 G A 935750 Ovary 0.243586 7355491
chr4 2001112 rs231199 T C 0 Thyroid 7.64606e-14 7350392
chr4 2304250 rs58973398 C G 260620 Liver 0.0469696 7351316
chr4 1781296 rs10032922 C T 203145 Stomach 0.348575 7349415
chr4 1783773 rs11947145 G A,C 200668 Adrenal 0.121487 7349466
Details of NELFA[ENSG00000185049.8]
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Genomic Location chr4:1984441-2043630[-]
TSS 2043630
Gene Name NELFA
Ensembl ID ENSG00000185049.8
ENTREZID 7469
Uniprot
Q9H3P2
A0A0C4DFX9
Protein Name
Negative elongation factor A
Expression levels of NELFA[ENSG00000185049.8]
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