EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. LRRC3C[ENSG00000204913.5]
Enhancers that regulate LRRC3C[ENSG00000204913.5]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr17 37997665 38010835 enh48031 38097727 86892
Bone Marrow (K562) Blood (T-cell) Blood (OCI-LY7) Blood (GM12878) Peripheral Blood (MM.1S) Thymus
chr17 38014865 38019015 enh4405 38097727 78712
Blood (Karpas-422)
chr17 38043645 38047795 enh52498 38097727 49932
Large Intestine
chr17 38048180 38053255 enh4406 38097727 44472
Blood (OCI-LY7) Thymus Blood (Karpas-422)
chr17 38053585 38057735 enh101500 38097727 39992
Thyroid
chr17 38084566 38084955 vista24673 38097727 12772
VISTA
chr17 38085522 38085789 vista24674 38097727 11938
VISTA
chr17 38095307 38095463 vista24675 38097727 2264
VISTA
chr17 38096378 38096540 vista24676 38097727 1187
VISTA
chr17 38101317 38107555 enh17136 38097727 3590
Placenta Thymus Prostate (RWPE1) Lung (PC-9)
chr17 38123672 38123938 vista24677 38097727 25945
VISTA
chr17 38158881 38163013 enh44427 38097727 61154
Muscle (Myotube)
chr17 38167965 38174735 enh109765 38097727 70238
Stomach
chr17 38170793 38171091 vista24678 38097727 73066
VISTA
chr17 38175925 38182055 enh99416 38097727 78198
Cervix (HeLa-S3) Uterus
chr17 38192436 38197477 enh32188 38097727 94709
Liver (HepG2) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Bone (Osteoblast) Lung Stomach Colon (HCT116) Pancreas Spleen Uterus Heart
Transcript facotrs that regulate LRRC3C[ENSG00000204913.5]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr17 38095315 38095319 NFE TRANSFAC yes 38097727 2408 21232024
chr17 38095316 38095321 GATA2 JASPAR yes 38097727 2406 21232025
chr17 38095321 38095327 MYC TRANSFAC yes 38097727 2400 21232026
chr17 38095331 38095345 TCF7L2 JASPAR yes 38097727 2382 21232027
chr17 38095343 38095347 NFE TRANSFAC yes 38097727 2380 21232028
chr17 38095404 38095416 NHLH1 JASPAR yes 38097727 2311 21232029
chr17 38095411 38095417 TCF4 TRANSFAC yes 38097727 2310 21232030
chr17 38095414 38095435 ZNF263 JASPAR yes 38097727 2292 21232031
chr17 38095419 38095433 SPI1 JASPAR yes 38097727 2294 21232032
chr17 38095421 38095426 MYB TRANSFAC yes 38097727 2301 21232033
chr17 38095441 38095446 H4TF1 TRANSFAC yes 38097727 2281 21232034
chr17 38095449 38095459 SREBF1 JASPAR yes 38097727 2268 21232035
chr17 38095449 38095459 SREBF2 JASPAR yes 38097727 2268 21232036
chr17 38095870 38096594 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 38097727 1133 108253870
chr17 38096110 38096660 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 38097727 1067 108253871
chr17 38096187 38096707 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1020 108253872
chr17 38096205 38096721 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1006 108253873
chr17 38096210 38096666 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 38097727 1061 108253874
chr17 38096223 38096633 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1094 108253875
chr17 38096228 38096824 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 903 108253876
chr17 38096273 38096657 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1070 108253877
chr17 38096278 38096558 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 38097727 1169 108253878
chr17 38096294 38096658 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 38097727 1069 108253879
chr17 38096300 38096680 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1047 108253880
chr17 38096306 38096626 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1101 108253881
chr17 38096319 38096599 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 38097727 1128 108253882
chr17 38096329 38096656 RUNX3 UCSC Txn Factor no Conserved 38097727 1071 108253883
chr17 38096329 38096656 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1071 108253884
chr17 38096336 38096666 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1061 108253885
chr17 38096343 38096623 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1104 108253886
chr17 38096348 38096615 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1112 108253887
chr17 38096359 38096498 TAF1 ENCODE Uniform TFBS no Brain (SK-N-SH) 38097727 1229 108253888
chr17 38096371 38096607 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1120 108253889
chr17 38096393 38096398 ETS2 TRANSFAC yes 38097727 1329 21232037
chr17 38096398 38096629 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1098 108253890
chr17 38096407 38096418 NFE2L2 JASPAR yes 38097727 1309 21232038
chr17 38096425 38096685 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1042 108253891
chr17 38096427 38096441 BATF3 JASPAR yes 38097727 1286 21232039
chr17 38096430 38096437 JUN TRANSFAC yes 38097727 1290 21232040
chr17 38096435 38096699 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1028 108253892
chr17 38096444 38096459 RUNX2 JASPAR yes 38097727 1268 21232041
chr17 38096453 38096461 FOXC1 JASPAR yes 38097727 1266 21232042
chr17 38096468 38096483 JUND JASPAR yes 38097727 1244 21232043
chr17 38096471 38096483 JDP2 JASPAR yes 38097727 1244 21232044
chr17 38096471 38096486 JUND JASPAR yes 38097727 1241 21232045
chr17 38096482 38096496 TLX1 JASPAR yes 38097727 1231 21232046
chr17 38096490 38096502 TAL1 JASPAR yes 38097727 1225 21232047
chr17 38096492 38096502 OLIG1 JASPAR yes 38097727 1225 21232048
chr17 38096492 38096502 OLIG3 JASPAR yes 38097727 1225 21232049
chr17 38096492 38096504 TAL1 JASPAR yes 38097727 1223 21232050
chr17 38096504 38096508 H4TF2 TRANSFAC yes 38097727 1219 21232051
chr17 38096506 38096512 MZF1 JASPAR yes 38097727 1215 21232052
chr17 38096526 38096627 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 38097727 1100 108253893
chr17 38096533 38096539 TCF1 TRANSFAC yes 38097727 1188 21232053
chr17 38101318 38101328 ID4 JASPAR yes 38097727 3591 54186222
chr17 38101318 38101328 TCF4 JASPAR yes 38097727 3591 54186223
chr17 38101320 38101325 USF2 TRANSFAC yes 38097727 3593 54186224
chr17 38101324 38101336 TFAP2A JASPAR yes 38097727 3597 54186225
chr17 38101324 38101336 TFAP2B JASPAR yes 38097727 3597 54186226
chr17 38101324 38101336 TFAP2C JASPAR yes 38097727 3597 54186227
chr17 38101324 38101339 TFAP2A JASPAR yes 38097727 3597 54186228
chr17 38101326 38101335 TFAP2A JASPAR yes 38097727 3599 54186229
chr17 38101334 38101348 TCF7L2 JASPAR yes 38097727 3607 54186230
chr17 38101335 38101340 H4TF1 TRANSFAC yes 38097727 3608 54186231
chr17 38101338 38101344 TCF1 TRANSFAC yes 38097727 3611 54186232
chr17 38101361 38101379 NR3C1 JASPAR yes 38097727 3634 54186233
chr17 38101397 38101415 MAFF JASPAR yes 38097727 3670 54186234
chr17 38101398 38101413 MAFK JASPAR yes 38097727 3671 54186235
chr17 38101402 38101413 NRL JASPAR yes 38097727 3675 54186236
chr17 38101433 38101450 ESR1 JASPAR yes 38097727 3706 54186237
chr17 38101517 38101527 SP1 JASPAR yes 38097727 3790 54186238
chr17 38101520 38101525 SP1 TRANSFAC yes 38097727 3793 54186239
chr17 38101538 38101542 YY1 TRANSFAC yes 38097727 3811 54186240
chr17 38101554 38101567 NFKB1 JASPAR yes 38097727 3827 54186241
chr17 38101554 38101567 NFKB2 JASPAR yes 38097727 3827 54186242
chr17 38101557 38101568 CEBPB JASPAR yes 38097727 3830 54186243
chr17 38101560 38101572 YY1 JASPAR yes 38097727 3833 54186244
chr17 38101578 38101593 LEF1 JASPAR yes 38097727 3851 54186245
chr17 38101582 38101600 RARA JASPAR yes 38097727 3855 54186246
chr17 38101589 38101602 NR2F1 JASPAR yes 38097727 3862 54186247
chr17 38101605 38101614 THAP1 JASPAR yes 38097727 3878 54186248
chr17 38101608 38101622 PLAG1 JASPAR yes 38097727 3881 54186249
chr17 38101613 38101620 E2F1 TRANSFAC yes 38097727 3886 54186250
chr17 38101647 38101658 E2F1 JASPAR yes 38097727 3920 54186251
chr17 38101659 38101673 JUN JASPAR yes 38097727 3932 54186252
chr17 38101661 38101672 BATF JASPAR yes 38097727 3934 54186253
chr17 38101662 38101673 JUNB JASPAR yes 38097727 3935 54186254
chr17 38101663 38101674 FOS JASPAR yes 38097727 3936 54186255
chr17 38101663 38101674 FOSL1 JASPAR yes 38097727 3936 54186256
chr17 38101663 38101674 JUND JASPAR yes 38097727 3936 54186257
chr17 38101667 38101679 NHLH1 JASPAR yes 38097727 3940 54186258
chr17 38101670 38101679 ZEB1 JASPAR yes 38097727 3943 54186259
chr17 38101672 38101677 SP1 TRANSFAC yes 38097727 3945 54186260
chr17 38101675 38101688 NFKB1 JASPAR yes 38097727 3948 54186261
chr17 38101677 38101683 ZNF354C JASPAR yes 38097727 3950 54186262
chr17 38101744 38101765 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4017 54186263
chr17 38101751 38101762 FLI1 JASPAR yes 38097727 4024 54186264
chr17 38101752 38101765 ELF1 JASPAR yes 38097727 4025 54186265
chr17 38101784 38101799 PRDM1 JASPAR yes 38097727 4057 54186266
chr17 38101803 38101818 TFAP2A JASPAR yes 38097727 4076 54186267
chr17 38101803 38101818 TFAP2C JASPAR yes 38097727 4076 54186268
chr17 38101817 38101829 NHLH1 JASPAR yes 38097727 4090 54186269
chr17 38101818 38101828 NHLH1 JASPAR yes 38097727 4091 54186270
chr17 38101824 38101834 MZF1 JASPAR yes 38097727 4097 54186271
chr17 38101833 38101843 NFKB1 JASPAR yes 38097727 4106 54186272
chr17 38101870 38101885 HSF1 JASPAR yes 38097727 4143 54186273
chr17 38101917 38101936 PAX5 JASPAR yes 38097727 4190 54186274
chr17 38101919 38101923 LFA1 TRANSFAC yes 38097727 4192 54186275
chr17 38101919 38101933 TCF7L2 JASPAR yes 38097727 4192 54186276
chr17 38101919 38101934 LEF1 JASPAR yes 38097727 4192 54186277
chr17 38101960 38101966 MAZ TRANSFAC yes 38097727 4233 54186278
chr17 38101997 38102010 HSF2 JASPAR yes 38097727 4270 54186279
chr17 38102006 38102012 HiNF-A TRANSFAC yes 38097727 4279 54186280
chr17 38102037 38102046 THAP1 JASPAR yes 38097727 4310 54186281
chr17 38102039 38102045 YY1 JASPAR yes 38097727 4312 54186282
chr17 38102043 38102064 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4316 54186283
chr17 38102052 38102058 MYC TRANSFAC yes 38097727 4325 54186284
chr17 38102064 38102069 ETS2 TRANSFAC yes 38097727 4337 54186285
chr17 38102077 38102092 MEF2C JASPAR yes 38097727 4350 54186286
chr17 38102078 38102093 MEF2A JASPAR yes 38097727 4351 54186287
chr17 38102079 38102091 MEF2A JASPAR yes 38097727 4352 54186288
chr17 38102079 38102091 MEF2B JASPAR yes 38097727 4352 54186289
chr17 38102079 38102091 MEF2D JASPAR yes 38097727 4352 54186290
chr17 38102092 38102111 PAX5 JASPAR yes 38097727 4365 54186291
chr17 38102101 38102111 SP1 JASPAR yes 38097727 4374 54186292
chr17 38102107 38102120 SMAD2 JASPAR yes 38097727 4380 54186293
chr17 38102115 38102125 ID4 JASPAR yes 38097727 4388 54186294
chr17 38102115 38102125 TCF3 JASPAR yes 38097727 4388 54186295
chr17 38102115 38102125 TCF4 JASPAR yes 38097727 4388 54186296
chr17 38102116 38102125 SNAI2 JASPAR yes 38097727 4389 54186297
chr17 38102117 38102122 USF2 TRANSFAC yes 38097727 4390 54186298
chr17 38102138 38102159 MAFG JASPAR yes 38097727 4411 54186299
chr17 38102162 38102170 RHOXF1 JASPAR yes 38097727 4435 54186300
chr17 38102166 38102177 EBF1 JASPAR yes 38097727 4439 54186301
chr17 38102178 38102195 ESR1 JASPAR yes 38097727 4451 54186302
chr17 38102187 38102197 SREBF1 JASPAR yes 38097727 4460 54186303
chr17 38102197 38102207 SREBF1 JASPAR yes 38097727 4470 54186304
chr17 38102197 38102207 SREBF2 JASPAR yes 38097727 4470 54186305
chr17 38102198 38102206 MGA JASPAR yes 38097727 4471 54186306
chr17 38102225 38102243 NR3C1 JASPAR yes 38097727 4498 54186307
chr17 38102242 38102257 FOXP1 JASPAR yes 38097727 4515 54186308
chr17 38102243 38102249 TBP TRANSFAC yes 38097727 4516 54186309
chr17 38102243 38102258 FOXP1 JASPAR yes 38097727 4516 54186310
chr17 38102243 38102264 IRF1 JASPAR yes 38097727 4516 54186311
chr17 38102244 38102259 FOXP1 JASPAR yes 38097727 4517 54186312
chr17 38102244 38102265 IRF1 JASPAR yes 38097727 4517 54186313
chr17 38102245 38102260 FOXP1 JASPAR yes 38097727 4518 54186314
chr17 38102245 38102266 IRF1 JASPAR yes 38097727 4518 54186315
chr17 38102246 38102261 FOXP1 JASPAR yes 38097727 4519 54186316
chr17 38102246 38102267 IRF1 JASPAR yes 38097727 4519 54186317
chr17 38102247 38102262 FOXP1 JASPAR yes 38097727 4520 54186318
chr17 38102249 38102264 FOXP1 JASPAR yes 38097727 4522 54186319
chr17 38102249 38102270 IRF1 JASPAR yes 38097727 4522 54186320
chr17 38102259 38102274 AR JASPAR yes 38097727 4532 54186321
chr17 38102278 38102299 IRF1 JASPAR yes 38097727 4551 54186322
chr17 38102306 38102320 TCF7L2 JASPAR yes 38097727 4579 54186323
chr17 38102306 38102321 LEF1 JASPAR yes 38097727 4579 54186324
chr17 38102310 38102316 TCF4 TRANSFAC yes 38097727 4583 54186325
chr17 38102314 38102324 TBX21 JASPAR yes 38097727 4587 54186326
chr17 38102314 38102327 EOMES JASPAR yes 38097727 4587 54186327
chr17 38102315 38102323 TBX5 JASPAR yes 38097727 4588 54186328
chr17 38102330 38102335 ETS2 TRANSFAC yes 38097727 4603 54186329
chr17 38102357 38102366 THAP1 JASPAR yes 38097727 4630 54186330
chr17 38102360 38102364 LFA1 TRANSFAC yes 38097727 4633 54186331
chr17 38102376 38102388 TFAP2A JASPAR yes 38097727 4649 54186332
chr17 38102376 38102391 TFAP2C JASPAR yes 38097727 4649 54186333
chr17 38102377 38102388 TFAP2A JASPAR yes 38097727 4650 54186334
chr17 38102377 38102388 TFAP2B JASPAR yes 38097727 4650 54186335
chr17 38102377 38102388 TFAP2C JASPAR yes 38097727 4650 54186336
chr17 38102378 38102387 TFAP2A JASPAR yes 38097727 4651 54186337
chr17 38102382 38102403 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4655 54186338
chr17 38102388 38102409 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4661 54186339
chr17 38102396 38102410 PLAG1 JASPAR yes 38097727 4669 54186340
chr17 38102399 38102405 TCF4 TRANSFAC yes 38097727 4672 54186341
chr17 38102401 38102422 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4674 54186342
chr17 38102405 38102419 PLAG1 JASPAR yes 38097727 4678 54186343
chr17 38102405 38102420 NR2C2 JASPAR yes 38097727 4678 54186344
chr17 38102407 38102428 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4680 54186345
chr17 38102408 38102412 LFA1 TRANSFAC yes 38097727 4681 54186346
chr17 38102415 38102420 ETS2 TRANSFAC yes 38097727 4688 54186347
chr17 38102420 38102425 SP1 TRANSFAC yes 38097727 4693 54186348
chr17 38102434 38102445 TFAP2A JASPAR yes 38097727 4707 54186349
chr17 38102442 38102455 NR2F1 JASPAR yes 38097727 4715 54186350
chr17 38102443 38102458 HNF4G JASPAR yes 38097727 4716 54186351
chr17 38102443 38102458 NR2C2 JASPAR yes 38097727 4716 54186352
chr17 38102444 38102458 RXRB JASPAR yes 38097727 4717 54186353
chr17 38102444 38102458 RXRG JASPAR yes 38097727 4717 54186354
chr17 38102444 38102459 HNF4A JASPAR yes 38097727 4717 54186355
chr17 38102446 38102450 ESR1 TRANSFAC yes 38097727 4719 54186356
chr17 38102476 38102491 AR JASPAR yes 38097727 4749 54186357
chr17 38102476 38102493 NR3C1 JASPAR yes 38097727 4749 54186358
chr17 38102476 38102493 NR3C2 JASPAR yes 38097727 4749 54186359
chr17 38102489 38102510 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4762 54186360
chr17 38102496 38102500 NFE TRANSFAC yes 38097727 4769 54186361
chr17 38102496 38102517 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4769 54186362
chr17 38102499 38102520 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4772 54186363
chr17 38102507 38102515 SP1 TRANSFAC yes 38097727 4780 54186364
chr17 38102525 38102546 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4798 54186365
chr17 38102547 38102562 TFAP2C JASPAR yes 38097727 4820 54186366
chr17 38102551 38102557 MZF1 JASPAR yes 38097727 4824 54186367
chr17 38102551 38102572 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4824 54186368
chr17 38102560 38102581 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4833 54186369
chr17 38102562 38102575 ELF1 JASPAR yes 38097727 4835 54186370
chr17 38102571 38102590 CTCF JASPAR yes 38097727 4844 54186371
chr17 38102584 38102595 NFKB1 JASPAR yes 38097727 4857 54186372
chr17 38102591 38102597 SP1 TRANSFAC yes 38097727 4864 54186373
chr17 38102591 38102601 SP1 JASPAR yes 38097727 4864 54186374
chr17 38102608 38102612 H4TF2 TRANSFAC yes 38097727 4881 54186375
chr17 38102614 38102617 MYB TRANSFAC yes 38097727 4887 54186376
chr17 38102626 38102647 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4899 54186377
chr17 38102629 38102633 YY1 TRANSFAC yes 38097727 4902 54186378
chr17 38102629 38102650 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4902 54186379
chr17 38102631 38102652 ZNF263 JASPAR yes 38097727 4904 54186380
chr17 38102656 38102665 VENTX JASPAR yes 38097727 4929 54186381
chr17 38102656 38102666 LHX6 JASPAR yes 38097727 4929 54186382
chr17 38102657 38102670 DUXA JASPAR yes 38097727 4930 54186383
chr17 38102658 38102669 DUX4 JASPAR yes 38097727 4931 54186384
chr17 38102671 38102690 CTCF JASPAR yes 38097727 4944 54186385
chr17 38102681 38102695 E2F7 JASPAR yes 38097727 4954 54186386
chr17 38102688 38102693 ETS2 TRANSFAC yes 38097727 4961 54186387
chr17 38102706 38102717 NFE2L2 JASPAR yes 38097727 4979 54186388
chr17 38102716 38102721 TFAP2A TRANSFAC yes 38097727 4989 54186389
chr17 38102716 38102722 MZF1 JASPAR yes 38097727 4989 54186390
SNPs associated with LRRC3C[ENSG00000204913.5], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr17 38090888 rs73985231 T C 6839 Ovary 0.0667584 4864386
Details of LRRC3C[ENSG00000204913.5]
Back to top
Genomic Location chr17:38097727-38101000[+]
TSS 38097727
Gene Name LRRC3C
Ensembl ID ENSG00000204913.5
ENTREZID 100505591
Uniprot
A6NJW4
Protein Name
Leucine-rich repeat-containing protein 3C
Expression levels of LRRC3C[ENSG00000204913.5]
Back to top