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Enhancers that regulate SLFN12L[ENSG00000205045.4]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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VISTA
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VISTA
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Cervix (HeLa-S3) Blood (T-cell)
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Blood (T-cell)
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VISTA
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Muscle (A673) Brain (SK-N-MC)
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Brain (SK-N-MC)
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VISTA
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Blood (T-cell)
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Brain (SK-N-MC) Blood (T-cell) Muscle (A673) Thymus Stomach
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VISTA
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VISTA
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VISTA
chr17 33868194 33868343 vista24540 33864880 3314
VISTA
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Pancreas (Panc1) Uterus Bone (Osteoblast)
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VISTA
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Blood (Karpas-422)
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Astrocyte Prostate (PC-3) Colon (HCT116)
Transcript facotrs that regulate SLFN12L[ENSG00000205045.4]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr17 33860428 33860432 H4TF2 TRANSFAC yes 33864880 4448 54010178
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chr17 33860448 33860455 MEIS1 JASPAR yes 33864880 4425 54010180
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chr17 33860450 33860465 FOXA1 JASPAR yes 33864880 4415 54010184
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chr17 33861533 33861543 OLIG3 JASPAR yes 33864880 3337 54010327
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chr17 33863869 33863882 ATF4 JASPAR yes 33864880 998 21225736
chr17 33863871 33863882 CEBPB JASPAR yes 33864880 998 21225737
chr17 33863871 33863884 DUXA JASPAR yes 33864880 996 21225738
chr17 33863872 33863883 DUX4 JASPAR yes 33864880 997 21225739
chr17 33863872 33863890 NFYA JASPAR yes 33864880 990 21225740
chr17 33863885 33863888 MYB TRANSFAC yes 33864880 992 21225741
chr17 33863906 33864182 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 33864880 698 108251329
chr17 33863910 33863920 SP1 JASPAR yes 33864880 960 21225742
chr17 33863935 33863939 TEAD2 TRANSFAC yes 33864880 941 21225743
chr17 33863936 33863944 RHOXF1 JASPAR yes 33864880 936 21225744
chr17 33863945 33863960 ZIC3 JASPAR yes 33864880 920 21225745
chr17 33863954 33863968 PLAG1 JASPAR yes 33864880 912 21225746
chr17 33863961 33863969 TBX15 JASPAR yes 33864880 911 21225747
chr17 33863962 33863967 SP1 TRANSFAC yes 33864880 913 21225748
chr17 33863976 33863989 NR2F1 JASPAR yes 33864880 891 21225749
chr17 33863977 33863985 CREB1 JASPAR yes 33864880 895 21225750
chr17 33863980 33863984 ESR1 TRANSFAC yes 33864880 896 21225751
chr17 33864003 33864007 ESR1 TRANSFAC yes 33864880 873 21225752
chr17 33864017 33864030 ELF1 JASPAR yes 33864880 850 21225753
chr17 33864018 33864025 SPI1 JASPAR yes 33864880 855 21225754
chr17 33864018 33864026 EHF JASPAR yes 33864880 854 21225755
chr17 33864020 33864027 SPIB JASPAR yes 33864880 853 21225756
chr17 33864088 33864094 TCF1 TRANSFAC yes 33864880 786 21225757
chr17 33867410 33868040 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 33864880 2530 108251330
chr17 33867493 33868009 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 33864880 2613 108251331
chr17 33867531 33868474 POLR2A UCSC Txn Factor no Conserved 33864880 2651 108251332
chr17 33867531 33868474 POLR2A UCSC Txn Factor no Conserved 33864880 2651 108251333
chr17 33867736 33867940 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 33864880 2856 108251334
chr17 33867758 33867776 ESR1 JASPAR yes 33864880 2878 21225758
chr17 33867767 33867782 RFX5 JASPAR yes 33864880 2887 21225759
chr17 33867769 33867839 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 33864880 2889 108251335
chr17 33867783 33867803 ESR1 JASPAR yes 33864880 2903 21225760
chr17 33867788 33867803 ESR2 JASPAR yes 33864880 2908 21225761
chr17 33867788 33867808 ESR1 JASPAR yes 33864880 2908 21225762
chr17 33867789 33867793 LFA1 TRANSFAC yes 33864880 2909 21225763
chr17 33867795 33867806 USF2 JASPAR yes 33864880 2915 21225764
chr17 33867803 33867809 YY1 JASPAR yes 33864880 2923 21225765
chr17 33867816 33867891 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 33864880 2936 108251336
chr17 33867825 33867830 TFAP2A TRANSFAC yes 33864880 2945 21225766
chr17 33867825 33867831 MZF1 JASPAR yes 33864880 2945 21225767
chr17 33867827 33867832 ETS2 TRANSFAC yes 33864880 2947 21225768
chr17 33867852 33867856 NFE TRANSFAC yes 33864880 2972 21225769
chr17 33867856 33867866 EN2 JASPAR yes 33864880 2976 21225770
chr17 33867857 33867865 BARX1 JASPAR yes 33864880 2977 21225771
chr17 33867895 33867901 NFE2 TRANSFAC yes 33864880 3015 21225772
chr17 33867897 33867917 RREB1 JASPAR yes 33864880 3017 21225773
chr17 33867898 33867918 RREB1 JASPAR yes 33864880 3018 21225774
chr17 33867898 33867919 ZNF263 JASPAR yes 33864880 3018 21225775
chr17 33867899 33867919 RREB1 JASPAR yes 33864880 3019 21225776
chr17 33867901 33867921 RREB1 JASPAR yes 33864880 3021 21225777
chr17 33867902 33867922 RREB1 JASPAR yes 33864880 3022 21225778
chr17 33867903 33867913 SP1 JASPAR yes 33864880 3023 21225779
chr17 33867903 33867923 RREB1 JASPAR yes 33864880 3023 21225780
chr17 33867904 33867924 RREB1 JASPAR yes 33864880 3024 21225781
chr17 33867913 33867923 SP1 JASPAR yes 33864880 3033 21225782
chr17 33867924 33867928 YY1 TRANSFAC yes 33864880 3044 21225783
chr17 33867943 33867953 MSC JASPAR yes 33864880 3063 21225784
chr17 33867950 33867971 ZNF263 JASPAR yes 33864880 3070 21225785
chr17 33867956 33867977 ZNF263 JASPAR yes 33864880 3076 21225786
chr17 33867959 33867980 ZNF263 JASPAR yes 33864880 3079 21225787
chr17 33867965 33867981 ZNF143 JASPAR yes 33864880 3085 21225788
chr17 33867965 33867986 ZNF263 JASPAR yes 33864880 3085 21225789
chr17 33867968 33867989 ZNF263 JASPAR yes 33864880 3088 21225790
chr17 33867994 33868370 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 33864880 3114 108251337
chr17 33867994 33868370 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 33864880 3114 108251338
chr17 33868017 33868021 H1TF2 TRANSFAC yes 33864880 3137 21225791
chr17 33868017 33868021 NFE TRANSFAC yes 33864880 3137 21225792
chr17 33868017 33868021 SRF TRANSFAC yes 33864880 3137 21225793
chr17 33868020 33868030 NFATC3 JASPAR yes 33864880 3140 21225794
chr17 33868033 33868037 LFA1 TRANSFAC yes 33864880 3153 21225795
chr17 33868067 33868087 PPARG JASPAR yes 33864880 3187 21225796
chr17 33868083 33868100 RARA JASPAR yes 33864880 3203 21225797
chr17 33868083 33868100 RXRA JASPAR yes 33864880 3203 21225798
chr17 33868094 33868097 MYB TRANSFAC yes 33864880 3214 21225799
chr17 33868112 33868121 JDP2 JASPAR yes 33864880 3232 21225800
chr17 33868123 33868403 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 33864880 3243 108251339
chr17 33868123 33868403 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 33864880 3243 108251340
chr17 33868131 33868152 ZNF263 JASPAR yes 33864880 3251 21225801
chr17 33868134 33868414 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 33864880 3254 108251341
chr17 33868134 33868414 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 33864880 3254 108251342
chr17 33868140 33868155 LEF1 JASPAR yes 33864880 3260 21225802
chr17 33868148 33868161 NR2F1 JASPAR yes 33864880 3268 21225803
chr17 33868152 33868156 ESR1 TRANSFAC yes 33864880 3272 21225804
chr17 33868154 33868402 IRF1 UCSC Txn Factor no Conserved 33864880 3274 108251343
chr17 33868154 33868402 IRF1 UCSC Txn Factor no Conserved 33864880 3274 108251344
chr17 33868160 33868171 CDX2 JASPAR yes 33864880 3280 21225805
chr17 33868162 33868171 CDX1 JASPAR yes 33864880 3282 21225806
chr17 33868162 33868172 HOXA13 JASPAR yes 33864880 3282 21225807
chr17 33868253 33868268 PRDM1 JASPAR yes 33864880 3373 21225808
chr17 33868255 33868276 IRF1 JASPAR yes 33864880 3375 21225809
chr17 33868257 33868272 IRF9 JASPAR yes 33864880 3377 21225810
chr17 33868258 33868272 IRF7 JASPAR yes 33864880 3378 21225811
chr17 33868258 33868272 IRF8 JASPAR yes 33864880 3378 21225812
chr17 33868259 33868273 STAT1 JASPAR yes 33864880 3379 21225813
chr17 33868259 33868274 PRDM1 JASPAR yes 33864880 3379 21225814
chr17 33868259 33868274 STAT2 JASPAR yes 33864880 3379 21225815
chr17 33868259 33868277 IRF2 JASPAR yes 33864880 3379 21225816
chr17 33868260 33868272 IRF1 JASPAR yes 33864880 3380 21225817
chr17 33868268 33868284 SOX4 JASPAR yes 33864880 3388 21225818
chr17 33868276 33868287 FOSL2 JASPAR yes 33864880 3396 21225819
chr17 33868277 33868288 FOS JASPAR yes 33864880 3397 21225820
chr17 33868278 33868289 NFE2L2 JASPAR yes 33864880 3398 21225821
chr17 33868301 33868306 MYB TRANSFAC yes 33864880 3421 21225822
chr17 33868312 33868323 RUNX1 JASPAR yes 33864880 3432 21225823
chr17 33868325 33868329 YY1 TRANSFAC yes 33864880 3445 21225824
SNPs associated with SLFN12L[ENSG00000205045.4], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr17 34465460 rs719827 C T 600580 Esophagus 0.330275 4847945
chr17 33864707 rs8065635 A C,T 0 Esophagus 0.0365731 4844736
chr17 33864830 rs8070030 T A 0 Esophagus 0.00184689 4844739
chr17 33864830 rs8070030 T A 0 Heart 0.000696461 4844739
chr17 33864830 rs8070030 T A 0 Heart 0.110984 4844739
chr17 33864830 rs8070030 T A 0 Breast 0.00268112 4844739
chr17 33882720 rs321616 C T 17840 Spleen 0.0704422 4844883
chr17 33864830 rs8070030 T A 0 Thyroid 0.0486882 4844739
chr17 33046873 rs79768914 G T 744395 Liver 0.361152 4841977
Details of SLFN12L[ENSG00000205045.4]
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Genomic Location chr17:33791268-33864880[-]
TSS 33864880
Gene Name SLFN12L
Ensembl ID ENSG00000205045.4
ENTREZID 100506736
Uniprot
Q6IEE8
Protein Name
Schlafen family member 12-like
Expression levels of SLFN12L[ENSG00000205045.4]
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