Enhancers that regulate HLA-DQB2[ENSG00000232629.4]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr6 32629205 32633595 enh9046 32731311 97716
chr6 32647025 32662243 enh9047 32731311 69068
chr6 32653438 32653801 vista51605 32731311 77510
chr6 32657421 32657546 vista51606 32731311 73765
chr6 32728735 32729127 vista51607 32731311 2184
chr6 32732829 32733005 vista51608 32731311 1518
chr6 32740985 32745135 enh55712 32731311 9674
chr6 32742286 32742469 vista51609 32731311 10975
chr6 32760425 32769287 enh9048 32731311 29114
chr6 32762261 32762648 vista51610 32731311 30950
chr6 32783377 32783532 vista51611 32731311 52066
chr6 32787339 32787575 vista51612 32731311 56028
chr6 32789030 32789171 vista51613 32731311 57719
chr6 32802290 32802518 vista51614 32731311 70979
chr6 32819276 32819643 vista51615 32731311 87965

Transcript facotrs that regulate HLA-DQB2[ENSG00000232629.4]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr6 32728737 32728741 YY1 TRANSFAC yes 32731311 2570 70347768
chr6 32728738 32728753 HNF1A JASPAR yes 32731311 2558 70347769
chr6 32728739 32728752 HNF1B JASPAR yes 32731311 2559 70347770
chr6 32728742 32728752 POU6F1 JASPAR yes 32731311 2559 70347771
chr6 32728745 32728749 YY1 TRANSFAC yes 32731311 2562 70347772
chr6 32728753 32728756 MYB TRANSFAC yes 32731311 2555 70347773
chr6 32728767 32728774 JUN TRANSFAC yes 32731311 2537 70347774
chr6 32728776 32728786 TFEB JASPAR yes 32731311 2525 70347775
chr6 32728786 32728790 H4TF2 TRANSFAC yes 32731311 2521 70347776
chr6 32728842 32728853 YY2 JASPAR yes 32731311 2458 70347777
chr6 32728859 32728869 BARHL2 JASPAR yes 32731311 2442 70347778
chr6 32728863 32728878 FOXP1 JASPAR yes 32731311 2433 70347779
chr6 32728864 32728875 FOXA1 JASPAR yes 32731311 2436 70347780
chr6 32728865 32728877 FOXC2 JASPAR yes 32731311 2434 70347781
chr6 32728866 32728877 FOXP2 JASPAR yes 32731311 2434 70347782
chr6 32728901 32728915 IRF7 JASPAR yes 32731311 2396 70347783
chr6 32728919 32728923 YY1 TRANSFAC yes 32731311 2388 70347784
chr6 32728919 32728930 CEBPB JASPAR yes 32731311 2381 70347785
chr6 32728920 32728930 CEBPB JASPAR yes 32731311 2381 70347786
chr6 32728920 32728930 CEBPD JASPAR yes 32731311 2381 70347787
chr6 32728920 32728930 CEBPE JASPAR yes 32731311 2381 70347788
chr6 32728920 32728931 CEBPA JASPAR yes 32731311 2380 70347789
chr6 32728923 32728936 ZBTB18 JASPAR yes 32731311 2375 70347790
chr6 32728925 32728940 SOX21 JASPAR yes 32731311 2371 70347791
chr6 32728925 32728941 SOX4 JASPAR yes 32731311 2370 70347792
chr6 32728931 32728939 DLX6 JASPAR yes 32731311 2372 70347793
chr6 32728931 32728939 MSX1 JASPAR yes 32731311 2372 70347794
chr6 32728954 32728959 MYC TRANSFAC yes 32731311 2352 70347795
chr6 32728971 32728974 MYB TRANSFAC yes 32731311 2337 70347796
chr6 32728981 32728995 PAX6 JASPAR yes 32731311 2316 70347797
chr6 32728987 32728998 TFAP2A JASPAR yes 32731311 2313 70347798
chr6 32728987 32728998 TFAP2B JASPAR yes 32731311 2313 70347799
chr6 32728987 32728998 TFAP2C JASPAR yes 32731311 2313 70347800
chr6 32728993 32729004 FLI1 JASPAR yes 32731311 2307 70347801
chr6 32729033 32729038 SP1 TRANSFAC yes 32731311 2273 70347802
chr6 32729037 32729041 LFA1 TRANSFAC yes 32731311 2270 70347803
chr6 32729049 32729070 ZNF263 JASPAR yes 32731311 2241 70347804
chr6 32729051 32729056 SP1 TRANSFAC yes 32731311 2255 70347805
chr6 32729059 32729063 LFA1 TRANSFAC yes 32731311 2248 70347806
chr6 32729062 32729077 NR2C2 JASPAR yes 32731311 2234 70347807
chr6 32729065 32729070 ETS2 TRANSFAC yes 32731311 2241 70347808
chr6 32729071 32729077 SP1 TRANSFAC yes 32731311 2234 70347809
chr6 32729072 32729077 SP1 TRANSFAC yes 32731311 2234 70347810
chr6 32729073 32729078 SP1 TRANSFAC yes 32731311 2233 70347811
chr6 32729073 32729082 HIC2 JASPAR yes 32731311 2229 70347812
chr6 32729076 32729080 LFA1 TRANSFAC yes 32731311 2231 70347813
chr6 32729081 32729090 THAP1 JASPAR yes 32731311 2221 70347814
chr6 32729081 32729093 E2F8 JASPAR yes 32731311 2218 70347815
chr6 32729084 32729088 LFA1 TRANSFAC yes 32731311 2223 70347816
chr6 32732838 32732855 RARA JASPAR yes 32731311 1527 70347817
chr6 32732869 32732875 MZF1 JASPAR yes 32731311 1558 70347818
chr6 32732895 32732910 HNF4A JASPAR yes 32731311 1584 70347819
chr6 32732896 32732911 HNF4G JASPAR yes 32731311 1585 70347820
chr6 32732906 32732927 ZNF263 JASPAR yes 32731311 1595 70347821
chr6 32732913 32732924 FLI1 JASPAR yes 32731311 1602 70347822
chr6 32732914 32732925 ELF5 JASPAR yes 32731311 1603 70347823
chr6 32732914 32732927 ELF1 JASPAR yes 32731311 1603 70347824
chr6 32732914 32732928 SPIC JASPAR yes 32731311 1603 70347825
chr6 32732919 32732933 TCF7L2 JASPAR yes 32731311 1608 70347826
chr6 32732923 32732929 TCF1 TRANSFAC yes 32731311 1612 70347827
chr6 32732976 32732981 ATF1 TRANSFAC yes 32731311 1665 70347828
chr6 32732987 32732998 NFKB1 JASPAR yes 32731311 1676 70347829
chr6 32732988 32732998 NFKB1 JASPAR yes 32731311 1677 70347830
chr6 32732993 32732999 MZF1 JASPAR yes 32731311 1682 70347831

Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr6 32608304 rs9272643 G A 115571 Esophagus 1.03053e-08 8966120
chr6 32626925 rs9273382 A G 96950 Heart 1.28327e-34 8967110
chr6 32634655 rs9274537 G A 89220 Pancreas 7.85054e-36 8967969
chr6 32620827 rs17843621 C T 103048 Breast 8.58703e-38 8966850
chr6 32608508 rs9272647 A T 115367 Ovary 9.80744e-15 8966145
chr6 32626925 rs9273382 A G 96950 Uterus 1.16311e-13 8967110
chr6 32612726 rs9273122 A G 111149 Liver 5.14382e-12 8966587
chr6 32630794 rs9274207 A G 93081 Stomach 3.76151e-45 8967552
chr6 32630794 rs9274207 A G 93081 Adrenal 1.15355e-19 8967552

Genomic Location chr6:32723875-32731311[-]
TSS 32731311
Gene Name HLA-DQB2
Ensembl ID ENSG00000232629.4
ENTREZID 3120
Uniprot
A2ADX3
Q5SR05
P05538
Protein Name
DQ beta 2
DQ beta 2 chain
class II
HLA class II histocompatibility antigen
Major histocompatibility complex