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Enhancers that regulate C4orf48[ENSG00000243449.2]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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VISTA
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VISTA
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VISTA
Transcript facotrs that regulate C4orf48[ENSG00000243449.2]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr4 2040297 2040311 RORA JASPAR yes 2043689 3378 87841116
chr4 2040303 2040314 PROP1 JASPAR yes 2043689 3375 87841117
chr4 2040309 2040324 MEF2A JASPAR yes 2043689 3365 87841118
chr4 2040310 2040322 MEF2A JASPAR yes 2043689 3367 87841119
chr4 2040332 2040339 NKX3-1 JASPAR yes 2043689 3350 87841120
chr4 2040356 2040361 GATA2 JASPAR yes 2043689 3328 87841121
chr4 2040379 2040389 ALX3 JASPAR yes 2043689 3300 87841122
chr4 2040379 2040389 LBX2 JASPAR yes 2043689 3300 87841123
chr4 2040379 2040389 MIXL1 JASPAR yes 2043689 3300 87841124
chr4 2040380 2040388 LHX9 JASPAR yes 2043689 3301 87841125
chr4 2040380 2040388 SHOX JASPAR yes 2043689 3301 87841126
chr4 2040413 2040431 RARA JASPAR yes 2043689 3258 87841127
chr4 2040416 2040421 GATA2 JASPAR yes 2043689 3268 87841128
chr4 2040429 2040440 ELK4 JASPAR yes 2043689 3249 87841129
chr4 2040429 2040440 FLI1 JASPAR yes 2043689 3249 87841130
chr4 2040429 2040442 ELF3 JASPAR yes 2043689 3247 87841131
chr4 2040430 2040434 YY1 TRANSFAC yes 2043689 3255 87841132
chr4 2040430 2040440 ERF JASPAR yes 2043689 3249 87841133
chr4 2040430 2040440 ERG JASPAR yes 2043689 3249 87841134
chr4 2040430 2040440 ETS1 JASPAR yes 2043689 3249 87841135
chr4 2040430 2040440 FEV JASPAR yes 2043689 3249 87841136
chr4 2040430 2040440 FLI1 JASPAR yes 2043689 3249 87841137
chr4 2040430 2040441 ELF5 JASPAR yes 2043689 3248 87841138
chr4 2040430 2040441 ETV2 JASPAR yes 2043689 3248 87841139
chr4 2040430 2040442 EHF JASPAR yes 2043689 3247 87841140
chr4 2040430 2040442 ELF1 JASPAR yes 2043689 3247 87841141
chr4 2040430 2040442 ELF4 JASPAR yes 2043689 3247 87841142
chr4 2040430 2040443 ELF1 JASPAR yes 2043689 3246 87841143
chr4 2040431 2040439 FEV JASPAR yes 2043689 3250 87841144
chr4 2040443 2040453 EVX1 JASPAR yes 2043689 3236 87841145
chr4 2040443 2040453 POU6F1 JASPAR yes 2043689 3236 87841146
chr4 2040479 2040483 TEAD2 TRANSFAC yes 2043689 3206 87841147
chr4 2040488 2040504 POU4F2 JASPAR yes 2043689 3185 87841148
chr4 2040488 2040504 POU4F3 JASPAR yes 2043689 3185 87841149
chr4 2040490 2040504 POU4F1 JASPAR yes 2043689 3185 87841150
chr4 2040490 2040505 HNF1A JASPAR yes 2043689 3184 87841151
chr4 2040491 2040501 LHX6 JASPAR yes 2043689 3188 87841152
chr4 2040491 2040501 MNX1 JASPAR yes 2043689 3188 87841153
chr4 2040491 2040501 POU6F1 JASPAR yes 2043689 3188 87841154
chr4 2040491 2040504 HNF1B JASPAR yes 2043689 3185 87841155
chr4 2040492 2040500 LMX1A JASPAR yes 2043689 3189 87841156
chr4 2040492 2040500 LMX1B JASPAR yes 2043689 3189 87841157
chr4 2040492 2040500 NKX6-1 JASPAR yes 2043689 3189 87841158
chr4 2040492 2040500 NKX6-2 JASPAR yes 2043689 3189 87841159
chr4 2040492 2040500 VAX1 JASPAR yes 2043689 3189 87841160
chr4 2040492 2040500 VAX2 JASPAR yes 2043689 3189 87841161
chr4 2040492 2040500 VSX1 JASPAR yes 2043689 3189 87841162
chr4 2040492 2040500 VSX2 JASPAR yes 2043689 3189 87841163
chr4 2040497 2040501 YY1 TRANSFAC yes 2043689 3188 87841164
chr4 2040512 2040520 MEIS2 JASPAR yes 2043689 3169 87841165
chr4 2040513 2040517 NFE TRANSFAC yes 2043689 3172 87841166
chr4 2040513 2040520 MEIS1 JASPAR yes 2043689 3169 87841167
chr4 2040522 2040537 PRDM1 JASPAR yes 2043689 3152 87841168
chr4 2040524 2040536 IRF1 JASPAR yes 2043689 3153 87841169
chr4 2040532 2040536 YY1 TRANSFAC yes 2043689 3153 87841170
chr4 2040542 2040548 LEF1 TRANSFAC yes 2043689 3141 87841171
chr4 2040542 2040548 SOX10 JASPAR yes 2043689 3141 87841172
chr4 2040545 2040557 FOXI1 JASPAR yes 2043689 3132 87841173
chr4 2040548 2040552 YY1 TRANSFAC yes 2043689 3137 87841174
chr4 2040560 2040571 NFE2L2 JASPAR yes 2043689 3118 87841175
chr4 2040580 2040587 JUN TRANSFAC yes 2043689 3102 87841176
chr4 2040584 2040605 REST JASPAR yes 2043689 3084 87841177
chr4 2040617 2040626 PITX3 JASPAR yes 2043689 3063 87841178
chr4 2040653 2040661 MEIS2 JASPAR yes 2043689 3028 87841179
chr4 2040654 2040658 NFE TRANSFAC yes 2043689 3031 87841180
chr4 2040654 2040661 MEIS1 JASPAR yes 2043689 3028 87841181
chr4 2040673 2040678 USF2 TRANSFAC yes 2043689 3011 87841182
chr4 2040685 2040696 FOXB1 JASPAR yes 2043689 2993 87841183
chr4 2040685 2040696 FOXC1 JASPAR yes 2043689 2993 87841184
chr4 2040685 2040697 FOXC2 JASPAR yes 2043689 2992 87841185
chr4 2040698 2040710 IRF1 JASPAR yes 2043689 2979 87841186
chr4 2040698 2040713 IRF9 JASPAR yes 2043689 2976 87841187
chr4 2040709 2040721 IRF1 JASPAR yes 2043689 2968 87841188
chr4 2040709 2040723 TCF7L2 JASPAR yes 2043689 2966 87841189
chr4 2040709 2040724 LEF1 JASPAR yes 2043689 2965 87841190
chr4 2040724 2040728 YY1 TRANSFAC yes 2043689 2961 87841191
chr4 2040738 2040748 TBX21 JASPAR yes 2043689 2941 87841192
chr4 2040738 2040749 TBX20 JASPAR yes 2043689 2940 87841193
chr4 2040738 2040749 TBX2 JASPAR yes 2043689 2940 87841194
chr4 2040738 2040751 EOMES JASPAR yes 2043689 2938 87841195
chr4 2040739 2040749 TBR1 JASPAR yes 2043689 2940 87841196
chr4 2040748 2040751 MYB TRANSFAC yes 2043689 2938 87841197
chr4 2040763 2040775 POU3F2 JASPAR yes 2043689 2914 87841198
chr4 2040774 2040778 YY1 TRANSFAC yes 2043689 2911 87841199
chr4 2048665 2048677 IRF1 JASPAR yes 2043689 4976 87841200
chr4 2048670 2048691 ZNF263 JASPAR yes 2043689 4981 87841201
chr4 2048671 2048692 ZNF263 JASPAR yes 2043689 4982 87841202
chr4 2048672 2048685 ELF1 JASPAR yes 2043689 4983 87841203
chr4 2048677 2048698 ZNF263 JASPAR yes 2043689 4988 87841204
chr4 2048685 2048692 SPIB JASPAR yes 2043689 4996 87841205
SNPs associated with C4orf48[ENSG00000243449.2], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr4 1570348 rs11942617 A C 473341 Esophagus 0.276181 7347533
chr4 2574614 rs376774152 AGTGGCGAT A 528917 Esophagus 0.247086 7353085
chr4 1165764 rs11538062 C T 877925 Heart 0.27712 7344554
chr4 2772756 rs73791862 G C 727059 Liver 0.35663 7354285
chr4 2411043 rs4974687 G A 365346 Lung 0.177646 7352274
chr4 2766089 rs2137836 C T 720392 Adrenal 0.360449 7354147
Details of C4orf48[ENSG00000243449.2]
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Genomic Location chr4:2043689-2045697[+]
TSS 2043689
Gene Name C4orf48
Ensembl ID ENSG00000243449.2
ENTREZID 401115
Uniprot
Protein Name
Neuropeptide-like protein C4orf48
Expression levels of C4orf48[ENSG00000243449.2]
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