EnhancerDB
  1. Home
  2. Enhancers
  3. vista5464[chr1:229366402-229366798]
View enhancers around input chromosomal region
Back to top

Input Chromosomal region, for example: chr1:1000-10000 to view the enhancers around this region

Chromosome characteristics of vista5464[chr1:229366402-229366798]
Back to top
Tissue distribution of vista5464
Back to top
Transcription factor that possibly regulate vista5464[chr1:229366402-229366798]
Back to top
Chrom. Start End TF Name Source Predicted site? Tissue/Cell line id More
chr1 229366033 229366487 ESR1 UCSC Txn Factor no Conserved 107878011
chr1 229366403 229366593 FOS UCSC Txn Factor no Conserved 107878028
chr1 229366394 229366402 RHOXF1 JASPAR yes 35977668
chr1 229366394 229366402 RHOXF1 JASPAR yes 118476160
chr1 229366397 229366403 ZNF354C JASPAR yes 35977669
chr1 229366397 229366403 ZNF354C JASPAR yes 118476161
chr1 229366405 229366411 HiNF-A TRANSFAC yes 35977670
chr1 229366405 229366411 HiNF-A TRANSFAC yes 118476162
chr1 229366408 229366419 ESRRB JASPAR yes 35977671
chr1 229366408 229366419 ESRRB JASPAR yes 118476163
chr1 229366413 229366421 EHF JASPAR yes 35977672
chr1 229366413 229366421 EHF JASPAR yes 118476164
chr1 229366415 229366420 ETS2 TRANSFAC yes 35977673
chr1 229366415 229366420 ETS2 TRANSFAC yes 118476165
chr1 229366415 229366430 PRDM1 JASPAR yes 35977674
chr1 229366415 229366430 PRDM1 JASPAR yes 118476166
chr1 229366451 229366465 SPI1 JASPAR yes 35977675
chr1 229366451 229366465 SPI1 JASPAR yes 118476167
chr1 229366468 229366483 HNF1A JASPAR yes 35977676
chr1 229366468 229366483 HNF1A JASPAR yes 118476168
chr1 229366475 229366493 RARA JASPAR yes 35977677
chr1 229366475 229366493 RARA JASPAR yes 118476169
chr1 229366480 229366494 JUN JASPAR yes 35977678
chr1 229366480 229366494 JUN JASPAR yes 118476170
chr1 229366481 229366485 YY1 TRANSFAC yes 35977679
chr1 229366481 229366485 YY1 TRANSFAC yes 118476171
chr1 229366482 229366493 BATF JASPAR yes 35977680
chr1 229366482 229366493 BATF JASPAR yes 118476172
chr1 229366483 229366494 FOSL2 JASPAR yes 35977681
chr1 229366483 229366494 JUNB JASPAR yes 35977682
chr1 229366483 229366494 FOSL2 JASPAR yes 118476173
chr1 229366483 229366494 JUNB JASPAR yes 118476174
chr1 229366484 229366495 FOS JASPAR yes 35977683
chr1 229366484 229366495 FOSL1 JASPAR yes 35977684
chr1 229366484 229366495 JUND JASPAR yes 35977685
chr1 229366484 229366495 NFE2 JASPAR yes 35977686
chr1 229366484 229366495 FOS JASPAR yes 118476175
chr1 229366484 229366495 FOSL1 JASPAR yes 118476176
chr1 229366484 229366495 JUND JASPAR yes 118476177
chr1 229366484 229366495 NFE2 JASPAR yes 118476178
chr1 229366485 229366494 JDP2 JASPAR yes 35977687
chr1 229366485 229366494 JDP2 JASPAR yes 118476179
chr1 229366485 229366496 FOSL2 JASPAR yes 35977688
chr1 229366485 229366496 JUNB JASPAR yes 35977689
chr1 229366485 229366496 FOSL2 JASPAR yes 118476180
chr1 229366485 229366496 JUNB JASPAR yes 118476181
chr1 229366485 229366499 JUN JASPAR yes 35977690
chr1 229366485 229366499 JUN JASPAR yes 118476182
chr1 229366490 229366500 MZF1 JASPAR yes 35977691
chr1 229366490 229366500 MZF1 JASPAR yes 118476183
chr1 229366519 229366533 FOXF2 JASPAR yes 35977692
chr1 229366519 229366533 FOXF2 JASPAR yes 118476184
chr1 229366520 229366531 FOXA1 JASPAR yes 35977693
chr1 229366520 229366531 FOXA1 JASPAR yes 118476185
chr1 229366522 229366533 FOXP2 JASPAR yes 35977694
chr1 229366522 229366533 FOXP2 JASPAR yes 118476186
chr1 229366524 229366531 FOXD2 JASPAR yes 35977695
chr1 229366524 229366531 FOXI1 JASPAR yes 35977696
chr1 229366524 229366531 FOXL1 JASPAR yes 35977697
chr1 229366524 229366531 FOXO4 JASPAR yes 35977698
chr1 229366524 229366531 FOXO6 JASPAR yes 35977699
chr1 229366524 229366531 FOXP3 JASPAR yes 35977700
chr1 229366524 229366531 FOXD2 JASPAR yes 118476187
chr1 229366524 229366531 FOXI1 JASPAR yes 118476188
chr1 229366524 229366531 FOXL1 JASPAR yes 118476189
chr1 229366524 229366531 FOXO4 JASPAR yes 118476190
chr1 229366524 229366531 FOXO6 JASPAR yes 118476191
chr1 229366524 229366531 FOXP3 JASPAR yes 118476192
chr1 229366524 229366532 FOXD1 JASPAR yes 35977701
chr1 229366524 229366532 FOXG1 JASPAR yes 35977702
chr1 229366524 229366532 FOXO3 JASPAR yes 35977703
chr1 229366524 229366532 FOXD1 JASPAR yes 118476193
chr1 229366524 229366532 FOXG1 JASPAR yes 118476194
chr1 229366524 229366532 FOXO3 JASPAR yes 118476195
chr1 229366527 229366537 FIGLA JASPAR yes 35977704
chr1 229366527 229366537 ID4 JASPAR yes 35977705
chr1 229366527 229366537 MSC JASPAR yes 35977706
chr1 229366527 229366537 MYF6 JASPAR yes 35977707
chr1 229366527 229366537 TCF3 JASPAR yes 35977708
chr1 229366527 229366537 TCF4 JASPAR yes 35977709
chr1 229366527 229366537 FIGLA JASPAR yes 118476196
chr1 229366527 229366537 ID4 JASPAR yes 118476197
chr1 229366527 229366537 MSC JASPAR yes 118476198
chr1 229366527 229366537 MYF6 JASPAR yes 118476199
chr1 229366527 229366537 TCF3 JASPAR yes 118476200
chr1 229366527 229366537 TCF4 JASPAR yes 118476201
chr1 229366528 229366537 SNAI2 JASPAR yes 35977710
chr1 229366528 229366537 SNAI2 JASPAR yes 118476202
chr1 229366529 229366534 USF2 TRANSFAC yes 35977711
chr1 229366529 229366534 USF2 TRANSFAC yes 118476203
chr1 229366554 229366565 NFE2L2 JASPAR yes 35977712
chr1 229366554 229366565 NFE2L2 JASPAR yes 118476204
chr1 229366572 229366578 TCF4 TRANSFAC yes 35977713
chr1 229366572 229366578 TCF4 TRANSFAC yes 118476205
chr1 229366577 229366586 SRY JASPAR yes 35977714
chr1 229366577 229366586 SRY JASPAR yes 118476206
chr1 229366602 229366606 NFE TRANSFAC yes 35977715
chr1 229366602 229366606 NFE TRANSFAC yes 118476207
chr1 229366617 229366623 PEA3 TRANSFAC yes 35977716
chr1 229366617 229366623 PEA3 TRANSFAC yes 118476208
chr1 229366657 229366661 YY1 TRANSFAC yes 35977717
chr1 229366657 229366661 YY1 TRANSFAC yes 118476209
chr1 229366687 229366702 LEF1 JASPAR yes 35977718
chr1 229366687 229366702 LEF1 JASPAR yes 118476210
chr1 229366688 229366702 TCF7L2 JASPAR yes 35977719
chr1 229366688 229366702 TCF7L2 JASPAR yes 118476211
chr1 229366701 229366715 SPIC JASPAR yes 35977720
chr1 229366701 229366715 SPIC JASPAR yes 118476212
chr1 229366711 229366732 IRF1 JASPAR yes 35977721
chr1 229366711 229366732 IRF1 JASPAR yes 118476213
chr1 229366714 229366728 IRF7 JASPAR yes 35977722
chr1 229366714 229366728 IRF7 JASPAR yes 118476214
chr1 229366716 229366728 IRF1 JASPAR yes 35977723
chr1 229366716 229366728 IRF1 JASPAR yes 118476215
chr1 229366717 229366732 FOXP1 JASPAR yes 35977724
chr1 229366717 229366732 MEF2C JASPAR yes 35977725
chr1 229366717 229366732 FOXP1 JASPAR yes 118476216
chr1 229366717 229366732 MEF2C JASPAR yes 118476217
chr1 229366717 229366738 IRF1 JASPAR yes 35977726
chr1 229366717 229366738 IRF1 JASPAR yes 118476218
chr1 229366718 229366733 MEF2A JASPAR yes 35977727
chr1 229366718 229366733 MEF2A JASPAR yes 118476219
chr1 229366718 229366739 IRF1 JASPAR yes 35977728
chr1 229366718 229366739 IRF1 JASPAR yes 118476220
chr1 229366719 229366731 FOXC2 JASPAR yes 35977729
chr1 229366719 229366731 MEF2A JASPAR yes 35977730
chr1 229366719 229366731 MEF2B JASPAR yes 35977731
chr1 229366719 229366731 MEF2D JASPAR yes 35977732
chr1 229366719 229366731 FOXC2 JASPAR yes 118476221
chr1 229366719 229366731 MEF2A JASPAR yes 118476222
chr1 229366719 229366731 MEF2B JASPAR yes 118476223
chr1 229366719 229366731 MEF2D JASPAR yes 118476224
chr1 229366720 229366730 MEF2A JASPAR yes 35977733
chr1 229366720 229366730 MEF2A JASPAR yes 118476225
chr1 229366722 229366734 IRF1 JASPAR yes 35977734
chr1 229366722 229366734 IRF1 JASPAR yes 118476226
chr1 229366722 229366737 STAT2 JASPAR yes 35977735
chr1 229366722 229366737 STAT2 JASPAR yes 118476227
chr1 229366728 229366748 RREB1 JASPAR yes 35977736
chr1 229366728 229366748 RREB1 JASPAR yes 118476228
chr1 229366729 229366744 RUNX2 JASPAR yes 35977737
chr1 229366729 229366744 RUNX2 JASPAR yes 118476229
chr1 229366730 229366739 RUNX2 JASPAR yes 35977738
chr1 229366730 229366739 RUNX2 JASPAR yes 118476230
chr1 229366730 229366740 RUNX3 JASPAR yes 35977739
chr1 229366730 229366740 RUNX3 JASPAR yes 118476231
chr1 229366730 229366750 RREB1 JASPAR yes 35977740
chr1 229366730 229366750 RREB1 JASPAR yes 118476232
chr1 229366756 229366760 YY1 TRANSFAC yes 35977741
chr1 229366756 229366760 YY1 TRANSFAC yes 118476233
chr1 229366788 229366800 GLI2 JASPAR yes 35977742
chr1 229366788 229366800 GLI2 JASPAR yes 118476234
SNP sites on vista5464[chr1:229366402-229366798]
Back to top
chrom Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele is SNP in TFBS id More
chr1 229366425 rs144065699 C G
ESR1 FOS PRDM1
1009623
chr1 229366557 rs78409559 C T
FOS NFE2L2
1009624
chr1 229366635 rs375345523 G A no 1009625
chr1 229366662 rs575730108 T G no 1009626
chr1 229366730 rs74142355 A G
FOXC2 FOXP1 IRF1 MEF2A MEF2B MEF2C MEF2D RREB1 RUNX2 RUNX3 STAT2
1009627
Genes possibly regulated by vista5464[chr1:229366402-229366798]
Back to top
Details of Genes
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand Gene Name Ensembl ID TSS TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues Distance between enhancer and TSS id More
chr1 229385383 229387557 + TMEM78 ENSG00000177800.2 229385383 0.93 0.96 1928 81415
chr1 229406822 229441641 + RAB4A ENSG00000168118.7 229406822 0.61 1.0 1929 59976
chr1 229440129 229441248 + SPHAR ENSG00000213029.2 229440129 0.0 0.0 1930 26669
Expression level of Genes
Back to top
miRNAs possibly regulated by vista5464[chr1:229366402-229366798]
Back to top
Details of miRNAs
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom Start End Strand miRNA Name miRBase ID TSS Score TSI of Normal tissues TSI of Cancer tissues id More
Expression level of miRNAs
Back to top
No results