EnhancerDB
  1. Home
  2. SNP
  3. rs115903979[chr16:25048560]
Enhancers that have rs115903979[chr16:25048560]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr16 25036065 25069195 enh3955
Bone Marrow (K562) Astrocyte Blood (Karpas-422) Uterus Stomach Epithelial (MCF-7) Skin (Keratinocyte) Bone (Osteoblast) Blood (OCI-LY7) Peripheral Blood (MM.1S) Pancreas (Panc1) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Blood (GM12878) Placenta Lung (PC-9) Spleen Muscle (Myotube) Prostate (RWPE1) Muscle (A673)
Transcript factors that have rs115903979[chr16:25048560]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr16 25047668 25051087 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108189518
chr16 25047687 25050539 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108189519
chr16 25047835 25050365 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699661
chr16 25047835 25050365 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108189520
chr16 25047852 25048934 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699663
chr16 25047870 25050428 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699664
chr16 25047870 25050428 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108189521
chr16 25047883 25050271 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108189522
chr16 25047887 25050826 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108189523
chr16 25047904 25050342 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699665
chr16 25047904 25050342 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108189524
chr16 25047904 25050948 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108189525
chr16 25047944 25049236 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699668
chr16 25047945 25050325 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699669
chr16 25047945 25050325 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108189526
chr16 25047945 25051035 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108189527
chr16 25047953 25050314 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699670
chr16 25047953 25050314 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108189528
chr16 25047958 25049322 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699671
chr16 25047963 25050308 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699672
chr16 25047963 25050308 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108189529
chr16 25048022 25050257 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699673
chr16 25048022 25050257 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108189530
chr16 25048023 25050360 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21699674
chr16 25048023 25050360 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108189531
chr16 25048025 25050323 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108189532
chr16 25048030 25049021 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699675
chr16 25048031 25050219 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699676
chr16 25048031 25050219 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108189533
chr16 25048032 25049148 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699677
chr16 25048048 25050456 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699678
chr16 25048048 25050456 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108189534
chr16 25048064 25050079 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699679
chr16 25048064 25050079 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108189535
chr16 25048089 25050341 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699680
chr16 25048089 25050341 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108189536
chr16 25048093 25049136 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699681
chr16 25048099 25049097 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699682
chr16 25048100 25050274 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108189537
chr16 25048100 25050826 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108189538
chr16 25048123 25049385 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699683
chr16 25048129 25050146 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699684
chr16 25048129 25050146 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108189539
chr16 25048138 25049365 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699685
chr16 25048140 25050030 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699686
chr16 25048140 25050030 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108189540
chr16 25048141 25048978 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699687
chr16 25048160 25049230 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699688
chr16 25048207 25050288 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699689
chr16 25048207 25050288 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108189541
chr16 25048224 25050209 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699690
chr16 25048224 25050209 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108189542
chr16 25048237 25049231 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699691
chr16 25048242 25049153 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699692
chr16 25048250 25049341 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699693
chr16 25048251 25049096 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699694
chr16 25048288 25049987 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699695
chr16 25048288 25049987 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108189543
chr16 25048296 25050367 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21699696
chr16 25048296 25050367 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108189544
chr16 25048306 25049832 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699697
chr16 25048308 25048999 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699698
chr16 25048313 25049151 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699699
chr16 25048321 25050456 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699700
chr16 25048321 25050456 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108189545
chr16 25048324 25049309 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699701
chr16 25048325 25049340 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699702
chr16 25048337 25049194 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699703
chr16 25048339 25050004 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699704
chr16 25048339 25050004 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108189546
chr16 25048343 25049300 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699705
chr16 25048371 25049109 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699706
chr16 25048388 25049124 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699707
chr16 25048403 25049204 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699708
chr16 25048404 25049168 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699709
chr16 25048404 25049318 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699710
chr16 25048413 25049332 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699711
chr16 25048421 25050275 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108189547
chr16 25048423 25049285 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699712
chr16 25048423 25049435 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699713
chr16 25048426 25049172 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699714
chr16 25048426 25049174 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699715
chr16 25048429 25049023 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699716
chr16 25048429 25049682 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699717
chr16 25048429 25050428 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21699718
chr16 25048429 25050428 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108189548
chr16 25048430 25049311 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699719
chr16 25048432 25049383 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699720
chr16 25048438 25048915 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699721
chr16 25048441 25048961 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21699722
chr16 25048442 25048809 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699723
chr16 25048443 25049372 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699724
chr16 25048444 25048917 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699725
chr16 25048448 25049237 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699726
chr16 25048454 25049302 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699727
chr16 25048457 25049051 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699728
chr16 25048463 25049345 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21699729
chr16 25048463 25049365 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21699730
chr16 25048468 25048841 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699731
chr16 25048475 25049396 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699732
chr16 25048476 25049389 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21699733
chr16 25048478 25048945 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699734
chr16 25048478 25049214 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699735
chr16 25048484 25048970 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21699736
chr16 25048486 25049219 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699737
chr16 25048495 25049236 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699738
chr16 25048497 25049169 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699739
chr16 25048509 25048832 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699740
chr16 25048513 25048904 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699741
chr16 25048514 25048921 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699742
chr16 25048514 25049321 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21699743
chr16 25048531 25049328 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21699744
chr16 25048541 25048990 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21699745
chr16 25048544 25048830 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21699746
chr16 25048551 25048561 SREBF1 JASPAR yes 10097992
chr16 25048556 25048560 H1TF2 TRANSFAC yes 10097993
chr16 25048556 25048560 NFE TRANSFAC yes 10097994
chr16 25048556 25048560 SRF TRANSFAC yes 10097995
chr16 25048560 25048568 TBX15 JASPAR yes 10097996
chr16 25048560 25048568 TBX4 JASPAR yes 10097997
chr16 25048560 25048569 ZEB1 JASPAR yes 10097998
Genes associated with rs115903979[chr16:25048560], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More