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Enhancers that have rs139501298[chr11:65894512]
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Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr11 65889425 65921015 enh1832
Bone Marrow (K562) Brain (SK-N-MC) Astrocyte Colon (HCT116) Blood (Karpas-422) Pancreas Uterus Blood (T-cell) Epithelial (MCF-7) Stomach Skin (Keratinocyte) Brain (SK-N-SH) Blood (OCI-LY7) Thyroid Peripheral Blood (MM.1S) Thymus Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Esophagus Blood (GM12878) Placenta Lung (PC-9) Breast Liver (HepG2) Prostate (RWPE1) Lung Muscle (A673) Heart
Transcript factors that have rs139501298[chr11:65894512]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
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chr11 65887304 65895163 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107982263
chr11 65887385 65894664 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107982264
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chr11 65887390 65894793 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 107982265
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chr11 65894437 65894641 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 107982358
chr11 65894455 65895115 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 21496342
chr11 65894455 65895115 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 107982359
chr11 65894461 65894981 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 21496343
chr11 65894461 65894981 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 107982360
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chr11 65894498 65894513 PRDM1 JASPAR yes 39353423
chr11 65894498 65894513 STAT2 JASPAR yes 39353424
chr11 65894499 65894513 STAT1 JASPAR yes 39353425
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chr11 65894502 65894517 STAT2 JASPAR yes 39353427
chr11 65894511 65894521 MZF1 JASPAR yes 39353428
Genes associated with rs139501298[chr11:65894512], comfirmed by eQTL
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Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More