EnhancerDB
  1. Home
  2. SNP
  3. rs4246519[chr1:109783555]
Enhancers that have rs4246519[chr1:109783555]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr1 109778260 109787295 enh27060
Bone Marrow (K562) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Brain (SK-N-SH) Brain (SK-N-MC) Ovary Blood (T-cell) Esophagus Astrocyte Stomach Muscle (A673) Uterus Lung (PC-9) Muscle (Myoblast) Neural Stem Cells (H9) Thymus Heart
Transcript factors that have rs4246519[chr1:109783555]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr1 109782442 109784136 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326817
chr1 109782442 109784136 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107819068
chr1 109782653 109784119 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107819069
chr1 109782697 109784096 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107819070
chr1 109782710 109784650 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 107819071
chr1 109782780 109784136 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107819072
chr1 109782796 109784328 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326821
chr1 109782796 109784328 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107819073
chr1 109782913 109783981 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326823
chr1 109782977 109784255 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107819074
chr1 109782980 109784178 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107819075
chr1 109783021 109784140 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107819076
chr1 109783024 109784012 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326824
chr1 109783077 109783743 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326825
chr1 109783077 109784150 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107819077
chr1 109783081 109784367 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326826
chr1 109783081 109784367 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 107819078
chr1 109783090 109783918 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326827
chr1 109783098 109784219 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107819079
chr1 109783156 109783864 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326828
chr1 109783156 109784006 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326829
chr1 109783158 109783953 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326830
chr1 109783159 109784017 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326831
chr1 109783189 109783858 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326832
chr1 109783210 109783706 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 21326833
chr1 109783211 109783949 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326834
chr1 109783215 109783948 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326835
chr1 109783224 109783680 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 21326836
chr1 109783233 109783921 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326837
chr1 109783235 109783860 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326838
chr1 109783236 109783872 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326839
chr1 109783238 109783888 MYOD GTRD no Muscle (Myoblast) 21326840
chr1 109783241 109783809 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326841
chr1 109783245 109783987 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326842
chr1 109783247 109783871 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326843
chr1 109783250 109783892 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326844
chr1 109783252 109783804 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326845
chr1 109783257 109783596 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 21326846
chr1 109783258 109783934 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326847
chr1 109783263 109783834 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326848
chr1 109783266 109783906 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326849
chr1 109783278 109783574 POL24H8 ENCODE Uniform TFBS no Brain (SK-N-MC) 21326851
chr1 109783282 109783857 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326852
chr1 109783286 109784106 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 107819080
chr1 109783290 109783939 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326853
chr1 109783298 109783789 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326854
chr1 109783303 109783903 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326855
chr1 109783307 109783848 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326856
chr1 109783312 109783746 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326857
chr1 109783316 109783693 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326858
chr1 109783317 109783669 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21326859
chr1 109783319 109783926 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326860
chr1 109783332 109783859 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326861
chr1 109783336 109783791 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326862
chr1 109783433 109783804 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 21326863
Genes associated with rs4246519[chr1:109783555], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More