EnhancerDB
  1. Home
  2. SNP
  3. rs578001178[chr17:38753266]
Enhancers that have rs578001178[chr17:38753266]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID Tissues that enhancer appears More
chr17 38750565 38781175 enh17142
Brain (SK-N-MC) Pancreas Uterus Blood (T-cell) Stomach Epithelial (MCF-7) Ovary Bone (Osteoblast) Blood (OCI-LY7) Thyroid Peripheral Blood (MM.1S) Neural Stem Cells (H9) Thymus Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Esophagus Blood (GM12878) Placenta Lung (PC-9) Spleen Muscle (Myotube) Prostate (RWPE1)
Transcript factors that have rs578001178[chr17:38753266]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue id More
chr17 38745313 38753560 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756390
chr17 38745313 38753560 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257077
chr17 38745329 38753579 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257078
chr17 38745344 38753416 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257079
chr17 38745359 38753392 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257080
chr17 38745417 38753548 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756391
chr17 38745417 38753548 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257081
chr17 38745453 38754188 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257082
chr17 38745453 38754188 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257083
chr17 38745454 38753691 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257084
chr17 38745524 38753520 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257085
chr17 38745645 38753464 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257086
chr17 38745720 38753542 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756392
chr17 38745720 38753542 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257087
chr17 38745876 38753560 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257088
chr17 38745879 38753580 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257089
chr17 38746097 38753476 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257090
chr17 38746263 38753542 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257091
chr17 38746464 38753641 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257092
chr17 38746566 38753954 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257093
chr17 38747178 38753450 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257094
chr17 38747213 38753610 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257095
chr17 38747243 38753573 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257096
chr17 38747415 38753548 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257097
chr17 38748223 38753332 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257099
chr17 38748227 38753632 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257100
chr17 38748238 38753637 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257101
chr17 38748239 38753443 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257102
chr17 38748254 38753640 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257103
chr17 38748338 38753572 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756400
chr17 38748338 38753572 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257105
chr17 38748348 38753487 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257106
chr17 38748364 38753693 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257107
chr17 38748388 38753632 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257109
chr17 38749097 38753304 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257110
chr17 38749125 38753323 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257111
chr17 38749156 38753406 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257113
chr17 38749336 38753270 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756403
chr17 38749336 38753270 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257115
chr17 38749592 38753299 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257116
chr17 38749802 38753394 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108257117
chr17 38750356 38753368 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257119
chr17 38750437 38753553 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756405
chr17 38750437 38753553 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257120
chr17 38750465 38753318 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257122
chr17 38750592 38753432 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257124
chr17 38750592 38753538 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257125
chr17 38750630 38753392 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257128
chr17 38750718 38753373 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756408
chr17 38750718 38753373 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257133
chr17 38751002 38753306 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257146
chr17 38751033 38753270 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756416
chr17 38751033 38753270 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257147
chr17 38751049 38753429 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756417
chr17 38751049 38753429 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257148
chr17 38751086 38753493 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21756418
chr17 38751086 38753493 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108257149
chr17 38751092 38753482 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756419
chr17 38751092 38753482 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257151
chr17 38751181 38753419 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756423
chr17 38751181 38753419 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257156
chr17 38751223 38753312 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257157
chr17 38751229 38753508 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21756424
chr17 38751229 38753508 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108257158
chr17 38751252 38753642 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21756425
chr17 38751252 38753642 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108257160
chr17 38751256 38753596 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257161
chr17 38751322 38753494 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257166
chr17 38751340 38753559 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257168
chr17 38751375 38753575 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257173
chr17 38751389 38753415 STAT3 GTRD no Blood (OCI-LY7) 21756430
chr17 38751389 38753415 STAT3 GTRD no Blood (OCI-LY7) 108257176
chr17 38751393 38753609 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257177
chr17 38751400 38753358 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257178
chr17 38751421 38753541 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257180
chr17 38751433 38753405 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257181
chr17 38751443 38753437 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257186
chr17 38751446 38753375 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756432
chr17 38751446 38753375 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257188
chr17 38751450 38753435 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21756433
chr17 38751450 38753435 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108257189
chr17 38751462 38753551 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756434
chr17 38751462 38753551 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257193
chr17 38751484 38753583 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257197
chr17 38751488 38753625 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257198
chr17 38751490 38753618 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756436
chr17 38751490 38753618 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257199
chr17 38751502 38753564 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257201
chr17 38751523 38753282 ZBTB33 GTRD no Lung (A549) 108257203
chr17 38751549 38753409 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756441
chr17 38751549 38753409 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257206
chr17 38751560 38753382 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257212
chr17 38751562 38753309 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257213
chr17 38751562 38753368 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21756446
chr17 38751562 38753368 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108257214
chr17 38751571 38753461 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257217
chr17 38751572 38753434 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108257218
chr17 38751610 38753455 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21756453
chr17 38751610 38753455 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108257227
chr17 38751611 38753292 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257229
chr17 38751615 38753338 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257232
chr17 38751617 38753455 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257233
chr17 38751624 38753373 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756459
chr17 38751624 38753373 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257236
chr17 38751664 38753557 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756465
chr17 38751664 38753557 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257247
chr17 38751693 38753562 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108257251
chr17 38751696 38753488 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257253
chr17 38751720 38753674 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108257259
chr17 38751742 38753453 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21756474
chr17 38751742 38753453 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108257263
chr17 38751758 38753532 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257264
chr17 38751761 38753410 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756479
chr17 38751761 38753410 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257266
chr17 38751765 38753480 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257269
chr17 38751766 38753485 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21756481
chr17 38751766 38753485 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108257270
chr17 38751768 38753285 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257272
chr17 38751768 38753541 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756483
chr17 38751768 38753541 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257273
chr17 38751769 38753297 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21756485
chr17 38751769 38753297 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108257275
chr17 38751769 38753454 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257276
chr17 38751771 38753485 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108257277
chr17 38751775 38753459 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756488
chr17 38751775 38753459 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257279
chr17 38751788 38753387 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756491
chr17 38751788 38753387 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257282
chr17 38752047 38753306 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108257286
chr17 38752055 38753483 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756496
chr17 38752055 38753483 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257287
chr17 38752133 38753325 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257295
chr17 38752261 38753366 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257315
chr17 38752291 38753282 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 108257329
chr17 38752299 38753297 ZNF274 GTRD no Liver (HepG2) 108257330
chr17 38752325 38753266 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756510
chr17 38752325 38753266 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 108257333
chr17 38752335 38753418 TCF7L2 GTRD no Colon (HCT116) 108257336
chr17 38752353 38753346 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 21756513
chr17 38752353 38753346 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 108257339
chr17 38752374 38753467 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 108257343
chr17 38752607 38753281 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21756526
chr17 38752607 38753281 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108257362
chr17 38752731 38753276 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21756530
chr17 38752731 38753276 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 108257372
chr17 38752763 38753274 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 21756532
chr17 38752880 38753280 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 21756536
chr17 38752965 38753375 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 21756539
chr17 38753189 38753396 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756543
chr17 38753195 38753498 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 21756544
chr17 38753261 38753272 BATF JASPAR yes 54229926
chr17 38753263 38753274 FOS JASPAR yes 54229927
chr17 38753263 38753274 FOSL1 JASPAR yes 54229928
chr17 38753263 38753274 JUND JASPAR yes 54229929
chr17 38753263 38753274 NFE2 JASPAR yes 54229930
chr17 38753264 38753275 FOSL2 JASPAR yes 54229931
chr17 38753264 38753275 JUNB JASPAR yes 54229932
chr17 38753264 38753278 JUN JASPAR yes 54229933
Genes associated with rs578001178[chr17:38753266], comfirmed by eQTL
Back to top
Blank TSI value indicates lack of sufficient expression for calculation
Chrom. Start End Strand Gene name Ensembl ID TSS of gene Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More