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Enhancers that regulate GDPD3[ENSG00000102886.10]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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VISTA
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Colon (HCT116)
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Lung (PC-9) Uterus Blood (Karpas-422) Heart
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Liver (HepG2)
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Liver (HepG2) Blood (T-cell)
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Liver (HepG2) Large Intestine Thymus Stomach Blood (T-cell) Epithelial (MCF-7)
chr16 30157305 30165335 enh104234 30125177 32128
Peripheral Blood (MM.1S) Cervix (HeLa-S3)
Transcript facotrs that regulate GDPD3[ENSG00000102886.10]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr16 30121140 30121160 RREB1 JASPAR yes 30125177 4017 10293444
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chr16 30121207 30121215 ISL2 JASPAR yes 30125177 3962 10293452
chr16 30121224 30121234 POU6F2 JASPAR yes 30125177 3943 10293453
chr16 30121225 30121235 ALX3 JASPAR yes 30125177 3942 10293454
chr16 30121225 30121235 EMX1 JASPAR yes 30125177 3942 10293455
chr16 30121225 30121235 EMX2 JASPAR yes 30125177 3942 10293456
chr16 30121225 30121235 ESX1 JASPAR yes 30125177 3942 10293457
chr16 30121225 30121235 EVX1 JASPAR yes 30125177 3942 10293458
chr16 30121225 30121235 EVX2 JASPAR yes 30125177 3942 10293459
chr16 30121225 30121235 GBX1 JASPAR yes 30125177 3942 10293460
chr16 30121225 30121235 GSX1 JASPAR yes 30125177 3942 10293461
chr16 30121225 30121235 HOXA2 JASPAR yes 30125177 3942 10293462
chr16 30121225 30121235 HOXB2 JASPAR yes 30125177 3942 10293463
chr16 30121225 30121235 LHX2 JASPAR yes 30125177 3942 10293464
chr16 30121225 30121235 MEOX1 JASPAR yes 30125177 3942 10293465
chr16 30121225 30121235 NOTO JASPAR yes 30125177 3942 10293466
chr16 30121226 30121234 LBX1 JASPAR yes 30125177 3943 10293467
chr16 30121226 30121234 PDX1 JASPAR yes 30125177 3943 10293468
chr16 30121226 30121234 VAX1 JASPAR yes 30125177 3943 10293469
chr16 30121226 30121234 VAX2 JASPAR yes 30125177 3943 10293470
chr16 30121226 30121234 VSX1 JASPAR yes 30125177 3943 10293471
chr16 30121226 30121234 VSX2 JASPAR yes 30125177 3943 10293472
chr16 30121231 30121236 GATA2 JASPAR yes 30125177 3941 10293473
chr16 30121262 30121269 MEIS1 JASPAR yes 30125177 3908 10293474
chr16 30121276 30121280 LFA1 TRANSFAC yes 30125177 3897 10293475
chr16 30121315 30121325 RELA JASPAR yes 30125177 3852 10293476
chr16 30121318 30121323 H4TF1 TRANSFAC yes 30125177 3854 10293477
chr16 30121320 30121333 ZBTB18 JASPAR yes 30125177 3844 10293478
chr16 30121330 30121341 ESRRA JASPAR yes 30125177 3836 10293479
chr16 30121339 30121343 LFA1 TRANSFAC yes 30125177 3834 10293480
chr16 30121344 30121356 TEF JASPAR yes 30125177 3821 10293481
chr16 30121354 30121368 PLAG1 JASPAR yes 30125177 3809 10293482
chr16 30121370 30121384 EBF1 JASPAR yes 30125177 3793 10293483
chr16 30121376 30121392 ZNF143 JASPAR yes 30125177 3785 10293484
chr16 30121379 30121393 EBF1 JASPAR yes 30125177 3784 10293485
chr16 30121388 30121396 UEF1 TRANSFAC yes 30125177 3781 10293486
chr16 30121403 30121422 CTCF JASPAR yes 30125177 3755 10293487
chr16 30121405 30121416 EBF1 JASPAR yes 30125177 3761 10293488
chr16 30121422 30121442 PPARG JASPAR yes 30125177 3735 10293489
chr16 30121440 30121450 OLIG1 JASPAR yes 30125177 3727 10293490
chr16 30121440 30121450 OLIG2 JASPAR yes 30125177 3727 10293491
chr16 30121440 30121450 OLIG3 JASPAR yes 30125177 3727 10293492
chr16 30121442 30121454 POU2F1 JASPAR yes 30125177 3723 10293493
chr16 30121459 30121463 TEAD2 TRANSFAC yes 30125177 3714 10293494
chr16 30121459 30121464 TBP TRANSFAC yes 30125177 3713 10293495
chr16 30121459 30121465 TMF TRANSFAC yes 30125177 3712 10293496
chr16 30121470 30121474 TEAD2 TRANSFAC yes 30125177 3703 10293497
chr16 30121481 30121495 RORA JASPAR yes 30125177 3682 10293498
chr16 30121487 30121493 ESR1 TRANSFAC yes 30125177 3684 10293499
chr16 30121489 30121493 ESR1 TRANSFAC yes 30125177 3684 10293500
chr16 30121500 30121521 LUN1 TRANSFAC yes 30125177 3656 10293501
chr16 30121528 30121533 SP1 TRANSFAC yes 30125177 3644 10293502
chr16 30121531 30121549 RARA JASPAR yes 30125177 3628 10293503
chr16 30121533 30121548 JUND JASPAR yes 30125177 3629 10293504
chr16 30121534 30121547 JUN JASPAR yes 30125177 3630 10293505
chr16 30121538 30121546 CREB1 JASPAR yes 30125177 3631 10293506
chr16 30121538 30121556 ESR2 JASPAR yes 30125177 3621 10293507
chr16 30121539 30121556 ESR1 JASPAR yes 30125177 3621 10293508
chr16 30121540 30121555 ESR2 JASPAR yes 30125177 3622 10293509
chr16 30121541 30121545 ESR1 TRANSFAC yes 30125177 3632 10293510
chr16 30121566 30121579 NFKB1 JASPAR yes 30125177 3598 10293511
chr16 30121566 30121579 NFKB2 JASPAR yes 30125177 3598 10293512
chr16 30121582 30121597 FOXP1 JASPAR yes 30125177 3580 10293513
chr16 30121589 30121595 HiNF-A TRANSFAC yes 30125177 3582 10293514
chr16 30121617 30121622 SP1 TRANSFAC yes 30125177 3555 10293515
chr16 30121663 30121673 SREBF2 JASPAR yes 30125177 3504 10293516
chr16 30121703 30121713 SREBF1 JASPAR yes 30125177 3464 10293517
chr16 30121703 30121713 SREBF2 JASPAR yes 30125177 3464 10293518
chr16 30121719 30121738 RFX2 JASPAR yes 30125177 3439 10293519
chr16 30121726 30121730 LFA1 TRANSFAC yes 30125177 3447 10293520
chr16 30121729 30121743 SPIC JASPAR yes 30125177 3434 10293521
chr16 30121735 30121740 ETS2 TRANSFAC yes 30125177 3437 10293522
chr16 30121737 30121749 PROX1 JASPAR yes 30125177 3428 10293523
chr16 30121744 30121759 FOXP1 JASPAR yes 30125177 3418 10293524
chr16 30121748 30121768 RREB1 JASPAR yes 30125177 3409 10293525
chr16 30121751 30121757 HiNF-A TRANSFAC yes 30125177 3420 10293526
chr16 30121770 30121774 TEAD2 TRANSFAC yes 30125177 3403 10293527
chr16 30121770 30121775 TBP TRANSFAC yes 30125177 3402 10293528
chr16 30121770 30121776 TFIID TRANSFAC yes 30125177 3401 10293529
chr16 30121784 30121796 FOXI1 JASPAR yes 30125177 3381 10293530
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chr16 30121792 30121806 ONECUT1 JASPAR yes 30125177 3371 10293532
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chr16 30121792 30121806 ONECUT3 JASPAR yes 30125177 3371 10293534
chr16 30121803 30121809 LEF1 TRANSFAC yes 30125177 3368 10293535
chr16 30121803 30121809 SOX10 JASPAR yes 30125177 3368 10293536
chr16 30121823 30121837 PLAG1 JASPAR yes 30125177 3340 10293537
chr16 30121833 30121843 NFKB1 JASPAR yes 30125177 3334 10293538
chr16 30121836 30121843 SPI1 JASPAR yes 30125177 3334 10293539
chr16 30121836 30121844 FEV JASPAR yes 30125177 3333 10293540
chr16 30121838 30121843 ETS2 TRANSFAC yes 30125177 3334 10293541
chr16 30121845 30121864 CTCF JASPAR yes 30125177 3313 10293542
chr16 30121891 30121895 NFE TRANSFAC yes 30125177 3282 10293543
chr16 30121959 30121967 TBX15 JASPAR yes 30125177 3210 10293544
chr16 30121959 30121972 SMAD2 JASPAR yes 30125177 3205 10293545
chr16 30121960 30121965 SP1 TRANSFAC yes 30125177 3212 10293546
SNPs associated with GDPD3[ENSG00000102886.10], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr16 29304414 rs2370317 T C 811717 Uterus 0.030575 4403877
Details of GDPD3[ENSG00000102886.10]
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Genomic Location chr16:30116131-30125177[-]
TSS 30125177
Gene Name GDPD3
Ensembl ID ENSG00000102886.10
ENTREZID 79153
Uniprot
Q7L5L3
Protein Name
Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 3
Expression levels of GDPD3[ENSG00000102886.10]
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