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Enhancers that regulate LGALS3BP[ENSG00000108679.8]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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Bone Marrow (K562) Brain (SK-N-MC) Astrocyte Colon (HCT116) Pancreas Uterus Blood (T-cell) Epithelial (MCF-7) Stomach Brain (SK-N-SH) Ovary Bone (Osteoblast) Pancreas (Panc1) Thymus Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Esophagus Placenta Lung (PC-9) Muscle (Myotube) Prostate (RWPE1) Lung Muscle (A673) Heart
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VISTA
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Muscle (Myoblast) Placenta Bone (Osteoblast) Heart
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Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Brain (SK-N-SH) Prostate (RWPE1) Blood (T-cell) Esophagus Astrocyte Bone (Osteoblast) Stomach Placenta Colon (HCT116) Breast Lung (PC-9) Pancreas Thymus Heart
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VISTA
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VISTA
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Brain (SK-N-MC) Astrocyte Colon (HCT116) Pancreas Uterus Blood (T-cell) Epithelial (MCF-7) Stomach Brain (SK-N-SH) Ovary Peripheral Blood (MM.1S) Pancreas (Panc1) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Esophagus Placenta Lung (PC-9) Breast Muscle (Myoblast) Liver (HepG2) Prostate (RWPE1) Lung Muscle (A673) Heart
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VISTA
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VISTA
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Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Cervix (HeLa-S3) Brain (SK-N-SH) Large Intestine Prostate (RWPE1) Ovary Astrocyte Bone (Osteoblast) Placenta Colon (HCT116) Peripheral Blood (MM.1S) Lung (PC-9) Pancreas Muscle (Myotube) Uterus Stomach
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Uterus
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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Transcript facotrs that regulate LGALS3BP[ENSG00000108679.8]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr17 76971889 76971904 FOXP1 JASPAR yes 76976191 4287 56196091
chr17 76971890 76971905 FOXP1 JASPAR yes 76976191 4286 56196092
chr17 76971890 76971911 IRF1 JASPAR yes 76976191 4280 56196093
chr17 76971891 76971906 FOXP1 JASPAR yes 76976191 4285 56196094
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chr17 76972127 76972131 H4TF2 TRANSFAC yes 76976191 4060 56196131
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chr17 76973195 76973205 REL JASPAR yes 76976191 2986 56196245
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chr17 76973196 76973206 NFKB1 JASPAR yes 76976191 2985 56196247
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chr17 76974241 76974254 NR2F1 JASPAR yes 76976191 1937 56196399
chr17 76974243 76974254 ESRRA JASPAR yes 76976191 1937 56196400
chr17 76974243 76974254 ESRRB JASPAR yes 76976191 1937 56196401
chr17 76974244 76974252 NR4A2 JASPAR yes 76976191 1939 56196402
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chr17 76975027 76975036 SNAI2 JASPAR yes 76976191 1155 56196491
chr17 76975028 76975033 USF2 TRANSFAC yes 76976191 1158 56196492
chr17 76975053 76975066 ATF4 JASPAR yes 76976191 1125 56196493
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chr17 76975138 76975142 NFE TRANSFAC yes 76976191 1049 56196496
SNPs associated with LGALS3BP[ENSG00000108679.8], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr17 77141880 rs55975030 C T 165689 Esophagus 0.0533679 5093469
chr17 76362772 rs56203718 G A 604548 Esophagus 0.00228224 5085952
chr17 76136712 rs73999647 G A 830608 Esophagus 0.0621868 5082942
chr17 76168080 rs143144653 G C 799240 Breast 0.299364 5083385
chr17 77962038 rs9891664 G C,T 985847 Spleen 0.0665173 5098992
chr17 77951270 rs72847498 G C 975079 Ovary 0.410765 5098848
chr17 76943421 rs72852336 A G 23899 Thyroid 0.0578029 5091942
chr17 77972129 rs147229702 G T 995938 Lung 0.042581 5099109
Details of LGALS3BP[ENSG00000108679.8]
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Genomic Location chr17:76967320-76976191[-]
TSS 76976191
Gene Name LGALS3BP
Ensembl ID ENSG00000108679.8
ENTREZID 3959
Uniprot
Q08380
A0A0S2Z3Y1
Protein Name
Galectin-3-binding protein
Lectin galactoside-binding soluble 3 binding protein isoform 1
Expression levels of LGALS3BP[ENSG00000108679.8]
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