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Enhancers that regulate ARL5C[ENSG00000141748.8]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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Brain (SK-N-SH)
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Brain (SK-N-SH) Brain (SK-N-MC) Ovary Blood (T-cell) Stomach Muscle (A673) Placenta Blood (Karpas-422) Muscle (Myotube) Uterus Thymus Heart
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VISTA
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Spleen Peripheral Blood (MM.1S) Uterus Blood (Karpas-422)
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Uterus
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VISTA
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Thymus
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Prostate (RWPE1)
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Blood (Karpas-422)
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VISTA
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Prostate (RWPE1) Blood (T-cell) Bone (Osteoblast) Muscle (A673) Colon (HCT116) Peripheral Blood (MM.1S) Blood (Karpas-422) Muscle (Myotube) Neural Stem Cells (H9) Thymus
chr17 37366071 37366159 vista24646 37323737 42334
VISTA
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Bone (Osteoblast)
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Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Prostate (RWPE1) Blood (T-cell) Bone (Osteoblast) Blood (OCI-LY7) Stomach Placenta Colon (HCT116) Breast Thymus Heart
Transcript facotrs that regulate ARL5C[ENSG00000141748.8]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr17 37324305 37324326 IRF1 JASPAR yes 37323737 568 54149777
chr17 37324309 37324324 IRF9 JASPAR yes 37323737 572 54149778
chr17 37324310 37324322 IRF1 JASPAR yes 37323737 573 54149779
chr17 37324310 37324330 RREB1 JASPAR yes 37323737 573 54149780
chr17 37324311 37324332 IRF1 JASPAR yes 37323737 574 54149781
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chr17 37326272 37326284 ZBTB7C JASPAR yes 37323737 2535 54150088
chr17 37326281 37326300 PAX5 JASPAR yes 37323737 2544 54150089
chr17 37326298 37326313 MEF2A JASPAR yes 37323737 2561 54150090
chr17 37326299 37326314 MEF2C JASPAR yes 37323737 2562 54150091
chr17 37326300 37326312 MEF2A JASPAR yes 37323737 2563 54150092
chr17 37326300 37326312 MEF2B JASPAR yes 37323737 2563 54150093
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chr17 37326478 37326487 SNAI2 JASPAR yes 37323737 2741 54150113
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chr17 37327385 37327397 MEF2A JASPAR yes 37323737 3648 54150243
chr17 37327385 37327397 MEF2B JASPAR yes 37323737 3648 54150244
chr17 37327385 37327397 MEF2D JASPAR yes 37323737 3648 54150245
chr17 37327387 37327391 YY1 TRANSFAC yes 37323737 3650 54150246
chr17 37327408 37327420 YY1 JASPAR yes 37323737 3671 54150247
chr17 37327422 37327434 GRHL1 JASPAR yes 37323737 3685 54150248
chr17 37327423 37327433 TFCP2 JASPAR yes 37323737 3686 54150249
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chr17 37327503 37327513 TCF4 JASPAR yes 37323737 3766 54150268
chr17 37327505 37327510 USF2 TRANSFAC yes 37323737 3768 54150269
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chr17 37327990 37327998 FEV JASPAR yes 37323737 4253 54150375
chr17 37328008 37328014 ZNF354C JASPAR yes 37323737 4271 54150376
chr17 37328029 37328033 NFE TRANSFAC yes 37323737 4292 54150377
SNPs associated with ARL5C[ENSG00000141748.8], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr17 37321672 rs16526 A C 0 Pancreas 3.56126e-08 4860602
Details of ARL5C[ENSG00000141748.8]
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Genomic Location chr17:37313147-37323737[-]
TSS 37323737
Gene Name ARL5C
Ensembl ID ENSG00000141748.8
ENTREZID 390790
Uniprot
A6NH57
Protein Name
Putative ADP-ribosylation factor-like protein 5C
Expression levels of ARL5C[ENSG00000141748.8]
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