EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. RARS2[ENSG00000146282.13]
Enhancers that regulate RARS2[ENSG00000146282.13]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr6 88213981 88214157 vista52694 88299721 85564
VISTA
chr6 88242205 88247235 enh55880 88299721 52486
Liver (HepG2) Large Intestine
chr6 88279425 88295795 enh39232 88299721 3926
Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Large Intestine Astrocyte Uterus Thymus Epithelial (MCF-7)
chr6 88326445 88330595 enh49119 88299721 26724
Thymus
chr6 88336245 88340835 enh55881 88299721 36524
Large Intestine
chr6 88353005 88357155 enh108068 88299721 53284
Blood (T-cell)
chr6 88366325 88372315 enh39233 88299721 66604
Muscle (Myoblast) Astrocyte Muscle (Myotube) Bone (Osteoblast)
chr6 88378508 88384635 enh55882 88299721 78787
Liver (HepG2) Large Intestine Blood (OCI-LY7) Lung (PC-9) Neural Stem Cells (H9)
chr6 88392825 88397275 enh55883 88299721 93104
Large Intestine
chr6 88397485 88409515 enh61392 88299721 97764
Heart Blood (OCI-LY7) Neural Stem Cells (H9) Blood (T-cell) Stomach
chr6 88398633 88398672 vista52695 88299721 98912
VISTA
Transcript facotrs that regulate RARS2[ENSG00000146282.13]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr6 88294719 88294728 THAP1 JASPAR yes 88299721 4993 103316552
chr6 88294726 88294733 NKX3-1 JASPAR yes 88299721 4988 103316553
chr6 88294732 88294743 FOXP2 JASPAR yes 88299721 4978 103316554
chr6 88294733 88294737 TEAD2 TRANSFAC yes 88299721 4984 103316555
chr6 88294733 88294738 TBP TRANSFAC yes 88299721 4983 103316556
chr6 88294743 88294751 GATA3 JASPAR yes 88299721 4970 103316557
chr6 88294765 88294780 STAT1 JASPAR yes 88299721 4941 103316558
chr6 88294767 88294778 STAT1 JASPAR yes 88299721 4943 103316559
chr6 88294767 88294778 STAT3 JASPAR yes 88299721 4943 103316560
chr6 88294778 88294783 TFAP2A TRANSFAC yes 88299721 4938 103316561
chr6 88294778 88294784 MZF1 JASPAR yes 88299721 4937 103316562
chr6 88294781 88294786 GATA2 JASPAR yes 88299721 4935 103316563
chr6 88294789 88294800 FOXA1 JASPAR yes 88299721 4921 103316564
chr6 88294789 88294804 FOXA1 JASPAR yes 88299721 4917 103316565
chr6 88294790 88294801 FOXB1 JASPAR yes 88299721 4920 103316566
chr6 88294790 88294801 FOXC1 JASPAR yes 88299721 4920 103316567
chr6 88294790 88294802 FOXC2 JASPAR yes 88299721 4919 103316568
chr6 88294795 88294807 YY1 JASPAR yes 88299721 4914 103316569
chr6 88294806 88294815 POU5F1B JASPAR yes 88299721 4906 103316570
chr6 88294815 88294827 YY1 JASPAR yes 88299721 4894 103316571
chr6 88294825 88294830 ETS2 TRANSFAC yes 88299721 4891 103316572
chr6 88294838 88294852 XBP1 JASPAR yes 88299721 4869 103316573
chr6 88294839 88294853 CREB3 JASPAR yes 88299721 4868 103316574
chr6 88294839 88294853 CREB3L1 JASPAR yes 88299721 4868 103316575
chr6 88294844 88294849 ATF1 TRANSFAC yes 88299721 4872 103316576
chr6 88294859 88294877 RARA JASPAR yes 88299721 4844 103316577
chr6 88294888 88294902 POU4F1 JASPAR yes 88299721 4819 103316578
chr6 88294888 88294904 POU4F2 JASPAR yes 88299721 4817 103316579
chr6 88294888 88294904 POU4F3 JASPAR yes 88299721 4817 103316580
chr6 88294893 88294897 YY1 TRANSFAC yes 88299721 4824 103316581
chr6 88294897 88294912 JUND JASPAR yes 88299721 4809 103316582
chr6 88294900 88294915 JUND JASPAR yes 88299721 4806 103316583
chr6 88294901 88294914 JUN JASPAR yes 88299721 4807 103316584
chr6 88294937 88294948 FOXH1 JASPAR yes 88299721 4773 103316585
chr6 88294946 88294950 YY1 TRANSFAC yes 88299721 4771 103316586
chr6 88294965 88294969 LFA1 TRANSFAC yes 88299721 4752 103316587
chr6 88294970 88294976 TCF4 TRANSFAC yes 88299721 4745 103316588
chr6 88294974 88294989 RFX5 JASPAR yes 88299721 4732 103316589
chr6 88294983 88294991 FEV JASPAR yes 88299721 4730 103316590
chr6 88294984 88294999 PRDM1 JASPAR yes 88299721 4722 103316591
chr6 88294995 88295009 POU4F1 JASPAR yes 88299721 4712 103316592
chr6 88294997 88295015 NR3C1 JASPAR yes 88299721 4706 103316593
chr6 88295000 88295020 TP53 JASPAR yes 88299721 4701 103316594
chr6 88295011 88295015 NFE TRANSFAC yes 88299721 4706 103316595
chr6 88295030 88295037 SPIB JASPAR yes 88299721 4684 103316596
chr6 88295031 88295046 IRF9 JASPAR yes 88299721 4675 103316597
chr6 88295033 88295047 STAT1 JASPAR yes 88299721 4674 103316598
chr6 88295035 88295056 IRF1 JASPAR yes 88299721 4665 103316599
chr6 88295059 88295068 SRY JASPAR yes 88299721 4653 103316600
chr6 88295146 88295161 MEF2C JASPAR yes 88299721 4560 103316601
chr6 88295147 88295162 MEF2A JASPAR yes 88299721 4559 103316602
chr6 88295156 88295166 TEAD4 JASPAR yes 88299721 4555 103316603
chr6 88295160 88295165 ETS2 TRANSFAC yes 88299721 4556 103316604
chr6 88295175 88295186 FOSL2 JASPAR yes 88299721 4535 103316605
chr6 88295220 88295237 RXRA JASPAR yes 88299721 4484 103316606
chr6 88295221 88295227 ZNF354C JASPAR yes 88299721 4494 103316607
chr6 88295224 88295239 JUND JASPAR yes 88299721 4482 103316608
chr6 88295225 88295238 JUN JASPAR yes 88299721 4483 103316609
chr6 88295228 88295241 NR2F1 JASPAR yes 88299721 4480 103316610
chr6 88295229 88295237 CREB1 JASPAR yes 88299721 4484 103316611
chr6 88295232 88295236 ESR1 TRANSFAC yes 88299721 4485 103316612
chr6 88295258 88295261 MYB TRANSFAC yes 88299721 4460 103316613
chr6 88295263 88295276 NFKB1 JASPAR yes 88299721 4445 103316614
chr6 88295263 88295276 NFKB2 JASPAR yes 88299721 4445 103316615
chr6 88295279 88295294 MEF2C JASPAR yes 88299721 4427 103316616
chr6 88295280 88295295 MEF2A JASPAR yes 88299721 4426 103316617
chr6 88295281 88295293 MEF2A JASPAR yes 88299721 4428 103316618
chr6 88295281 88295293 MEF2B JASPAR yes 88299721 4428 103316619
chr6 88295281 88295293 MEF2D JASPAR yes 88299721 4428 103316620
chr6 88295315 88295320 SP1 TRANSFAC yes 88299721 4401 103316621
chr6 88295315 88295324 HIC2 JASPAR yes 88299721 4397 103316622
chr6 88295318 88295322 LFA1 TRANSFAC yes 88299721 4399 103316623
chr6 88295319 88295329 ID4 JASPAR yes 88299721 4392 103316624
chr6 88295319 88295329 TCF3 JASPAR yes 88299721 4392 103316625
chr6 88295319 88295329 TCF4 JASPAR yes 88299721 4392 103316626
chr6 88295320 88295329 SNAI2 JASPAR yes 88299721 4392 103316627
chr6 88295321 88295326 USF2 TRANSFAC yes 88299721 4395 103316628
chr6 88295343 88295364 ZNF263 JASPAR yes 88299721 4357 103316629
chr6 88295351 88295359 TBX15 JASPAR yes 88299721 4362 103316630
chr6 88295352 88295357 SP1 TRANSFAC yes 88299721 4364 103316631
chr6 88295361 88295371 SREBF2 JASPAR yes 88299721 4350 103316632
chr6 88295375 88295385 SP1 JASPAR yes 88299721 4336 103316633
chr6 88295377 88295382 SP1 TRANSFAC yes 88299721 4339 103316634
chr6 88295386 88295400 MTF1 JASPAR yes 88299721 4321 103316635
chr6 88295401 88295411 SREBF1 JASPAR yes 88299721 4310 103316636
chr6 88295401 88295411 SREBF2 JASPAR yes 88299721 4310 103316637
chr6 88295443 88295458 MEF2C JASPAR yes 88299721 4263 103316638
chr6 88295444 88295459 MEF2A JASPAR yes 88299721 4262 103316639
chr6 88295445 88295457 MEF2A JASPAR yes 88299721 4264 103316640
chr6 88295445 88295457 MEF2D JASPAR yes 88299721 4264 103316641
chr6 88295447 88295461 FOXF2 JASPAR yes 88299721 4260 103316642
chr6 88295447 88295461 ONECUT3 JASPAR yes 88299721 4260 103316643
chr6 88295447 88295462 FOXP1 JASPAR yes 88299721 4259 103316644
chr6 88295448 88295459 FOXA1 JASPAR yes 88299721 4262 103316645
chr6 88295448 88295463 FOXA1 JASPAR yes 88299721 4258 103316646
chr6 88295449 88295460 FOXB1 JASPAR yes 88299721 4261 103316647
chr6 88295449 88295460 FOXC1 JASPAR yes 88299721 4261 103316648
chr6 88295449 88295461 FOXC2 JASPAR yes 88299721 4260 103316649
chr6 88295450 88295462 FOXI1 JASPAR yes 88299721 4259 103316650
chr6 88295451 88295465 ONECUT2 JASPAR yes 88299721 4256 103316651
chr6 88295451 88295465 ONECUT3 JASPAR yes 88299721 4256 103316652
chr6 88295451 88295466 FOXP1 JASPAR yes 88299721 4255 103316653
chr6 88295451 88295466 HNF1A JASPAR yes 88299721 4255 103316654
chr6 88295452 88295466 POU4F1 JASPAR yes 88299721 4255 103316655
chr6 88295452 88295467 FOXA1 JASPAR yes 88299721 4254 103316656
chr6 88295452 88295468 POU4F2 JASPAR yes 88299721 4253 103316657
chr6 88295452 88295468 POU4F3 JASPAR yes 88299721 4253 103316658
chr6 88295453 88295464 FOXB1 JASPAR yes 88299721 4257 103316659
chr6 88295453 88295464 FOXC1 JASPAR yes 88299721 4257 103316660
chr6 88295453 88295464 PROP1 JASPAR yes 88299721 4257 103316661
chr6 88295453 88295465 FOXC2 JASPAR yes 88299721 4256 103316662
chr6 88295454 88295466 FOXI1 JASPAR yes 88299721 4255 103316663
chr6 88295455 88295469 ONECUT2 JASPAR yes 88299721 4252 103316664
chr6 88295455 88295469 ONECUT3 JASPAR yes 88299721 4252 103316665
chr6 88295455 88295470 FOXP1 JASPAR yes 88299721 4251 103316666
chr6 88295455 88295470 HNF1A JASPAR yes 88299721 4251 103316667
chr6 88295456 88295470 POU4F1 JASPAR yes 88299721 4251 103316668
chr6 88295456 88295471 FOXA1 JASPAR yes 88299721 4250 103316669
chr6 88295456 88295472 POU4F2 JASPAR yes 88299721 4249 103316670
chr6 88295456 88295472 POU4F3 JASPAR yes 88299721 4249 103316671
chr6 88295457 88295468 FOXB1 JASPAR yes 88299721 4253 103316672
chr6 88295457 88295468 FOXC1 JASPAR yes 88299721 4253 103316673
chr6 88295457 88295468 PROP1 JASPAR yes 88299721 4253 103316674
chr6 88295457 88295469 FOXC2 JASPAR yes 88299721 4252 103316675
chr6 88295458 88295470 FOXI1 JASPAR yes 88299721 4251 103316676
chr6 88295459 88295473 ONECUT2 JASPAR yes 88299721 4248 103316677
chr6 88295459 88295473 ONECUT3 JASPAR yes 88299721 4248 103316678
chr6 88295459 88295474 FOXP1 JASPAR yes 88299721 4247 103316679
chr6 88295459 88295474 HNF1A JASPAR yes 88299721 4247 103316680
chr6 88295460 88295474 POU4F1 JASPAR yes 88299721 4247 103316681
chr6 88295460 88295475 FOXA1 JASPAR yes 88299721 4246 103316682
chr6 88295460 88295476 POU4F3 JASPAR yes 88299721 4245 103316683
chr6 88295461 88295472 FOXB1 JASPAR yes 88299721 4249 103316684
chr6 88295461 88295472 FOXC1 JASPAR yes 88299721 4249 103316685
chr6 88295461 88295472 PROP1 JASPAR yes 88299721 4249 103316686
chr6 88295461 88295473 FOXC2 JASPAR yes 88299721 4248 103316687
chr6 88295462 88295474 FOXI1 JASPAR yes 88299721 4247 103316688
chr6 88295465 88295480 FOXP1 JASPAR yes 88299721 4241 103316689
chr6 88295465 88295480 MEF2C JASPAR yes 88299721 4241 103316690
chr6 88295465 88295486 IRF1 JASPAR yes 88299721 4235 103316691
chr6 88295466 88295481 MEF2A JASPAR yes 88299721 4240 103316692
chr6 88295467 88295479 FOXC2 JASPAR yes 88299721 4242 103316693
chr6 88295467 88295479 MEF2A JASPAR yes 88299721 4242 103316694
chr6 88295467 88295479 MEF2B JASPAR yes 88299721 4242 103316695
chr6 88295467 88295479 MEF2D JASPAR yes 88299721 4242 103316696
chr6 88295468 88295478 MEF2A JASPAR yes 88299721 4243 103316697
chr6 88295470 88295482 IRF1 JASPAR yes 88299721 4239 103316698
chr6 88295471 88295486 MEF2C JASPAR yes 88299721 4235 103316699
chr6 88295472 88295487 MEF2A JASPAR yes 88299721 4234 103316700
chr6 88295473 88295485 FOXC2 JASPAR yes 88299721 4236 103316701
chr6 88295473 88295485 MEF2A JASPAR yes 88299721 4236 103316702
chr6 88295473 88295485 MEF2B JASPAR yes 88299721 4236 103316703
chr6 88295473 88295485 MEF2D JASPAR yes 88299721 4236 103316704
chr6 88295474 88295484 MEF2A JASPAR yes 88299721 4237 103316705
chr6 88295511 88295517 TBP TRANSFAC yes 88299721 4204 103316706
chr6 88295522 88295526 TEAD2 TRANSFAC yes 88299721 4195 103316707
chr6 88295522 88295527 TBP TRANSFAC yes 88299721 4194 103316708
chr6 88295522 88295528 TFIID TRANSFAC yes 88299721 4193 103316709
chr6 88295541 88295556 FOXA1 JASPAR yes 88299721 4165 103316710
chr6 88295542 88295553 FOXB1 JASPAR yes 88299721 4168 103316711
chr6 88295542 88295553 FOXC1 JASPAR yes 88299721 4168 103316712
chr6 88295544 88295548 TEAD2 TRANSFAC yes 88299721 4173 103316713
chr6 88295544 88295549 TBP TRANSFAC yes 88299721 4172 103316714
chr6 88295544 88295550 TMF TRANSFAC yes 88299721 4171 103316715
chr6 88295545 88295561 SOX8 JASPAR yes 88299721 4160 103316716
chr6 88295550 88295557 NKX3-1 JASPAR yes 88299721 4164 103316717
chr6 88295555 88295564 SRY JASPAR yes 88299721 4157 103316718
chr6 88295595 88295599 TEAD2 TRANSFAC yes 88299721 4122 103316719
chr6 88295595 88295600 TBP TRANSFAC yes 88299721 4121 103316720
chr6 88295595 88295601 TFIID TRANSFAC yes 88299721 4120 103316721
chr6 88295604 88295608 YY1 TRANSFAC yes 88299721 4113 103316722
chr6 88295620 88295625 ETS2 TRANSFAC yes 88299721 4096 103316723
chr6 88295639 88295653 STAT1 JASPAR yes 88299721 4068 103316724
chr6 88295639 88295654 STAT2 JASPAR yes 88299721 4067 103316725
chr6 88295642 88295652 NFATC3 JASPAR yes 88299721 4069 103316726
chr6 88295644 88295655 NFKB1 JASPAR yes 88299721 4066 103316727
chr6 88295645 88295655 REL JASPAR yes 88299721 4066 103316728
chr6 88295661 88295676 FOXP1 JASPAR yes 88299721 4045 103316729
chr6 88295663 88295675 FOXC2 JASPAR yes 88299721 4046 103316730
chr6 88295667 88295678 PROP1 JASPAR yes 88299721 4043 103316731
chr6 88295670 88295680 NOTO JASPAR yes 88299721 4041 103316732
chr6 88295671 88295685 POU1F1 JASPAR yes 88299721 4036 103316733
chr6 88295672 88295685 POU3F3 JASPAR yes 88299721 4036 103316734
chr6 88295676 88295679 MYB TRANSFAC yes 88299721 4042 103316735
chr6 88295714 88295718 LFA1 TRANSFAC yes 88299721 4003 103316736
chr6 88295726 88295744 RARA JASPAR yes 88299721 3977 103316737
chr6 88295764 88295770 SOX10 JASPAR yes 88299721 3951 103316738
SNPs associated with RARS2[ENSG00000146282.13], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr6 88369843 rs10498961 G A 70122 Esophagus 0.341154 9175485
chr6 88194810 rs2300901 T C 29286 Esophagus 0.00410529 9174924
chr6 88426361 rs2754268 A G 126640 Esophagus 0.00874589 9175922
chr6 88354837 rs6932733 A G 55116 Spleen 0.115062 9175401
chr6 89274838 rs4707492 G C 975117 Uterus 0.248983 9179507
Details of RARS2[ENSG00000146282.13]
Back to top
Genomic Location chr6:88224096-88299721[-]
TSS 88299721
Gene Name RARS2
Ensembl ID ENSG00000146282.13
ENTREZID 57038
Uniprot
Q5T160
H0UI22
Protein Name
mitochondrial
Probable arginine--tRNA ligase
Expression levels of RARS2[ENSG00000146282.13]
Back to top