EnhancerDB

Chrom.	Start	End	Enhancer ID	TSS of gene	Distance between enhancer and TSS	Tissues that enhancer appears
chr17	66966365	66970515	enh95520	67057205	86690	Ovary
chr17	66973403	66973581	vista25716	67057205	83624	VISTA
chr17	67040465	67044933	enh65066	67057205	12272	Uterus Heart
chr17	67055729	67056007	vista25717	67057205	1198	VISTA
chr17	67064985	67071075	enh92751	67057205	7780	Liver (HepG2) Peripheral Blood (MM.1S) Stomach
chr17	67087525	67091675	enh91179	67057205	30320	Bone Marrow (K562)
chr17	67089514	67089753	vista25718	67057205	32309	VISTA
chr17	67095790	67095894	vista25719	67057205	38585	VISTA
chr17	67139403	67139524	vista25720	67057205	82198	VISTA

Transcript facotrs that regulate ABCA9[ENSG00000154258.12]

Chrom.	Start	End	TF name	Source	Predicted site?	Tissue	TSS of gene	Distance between TFBS and gene	id
chr17	67052956	67057526	ZNF143	GTRD	no	Epithelial (MCF-7)	67057205	321	108287870
chr17	67052992	67058975	ZNF143	GTRD	no	Epithelial (MCF-7)	67057205	1770	108287871
chr17	67055668	67057107	TCF7L2	GTRD	no	Colon (HCT116)	67057205	98	108287872
chr17	67055688	67056627	TCF7L2	GTRD	no	Colon (HCT116)	67057205	578	108287873
chr17	67055703	67056898	ZNF143	GTRD	no	Epithelial (MCF-7)	67057205	307	108287874
chr17	67055730	67057641	ZNF143	GTRD	no	Epithelial (MCF-7)	67057205	436	108287875
chr17	67055736	67055749	EOMES	JASPAR	yes		67057205	1456	21283463
chr17	67055738	67055749	TBX20	JASPAR	yes		67057205	1456	21283464
chr17	67055739	67055749	TBX21	JASPAR	yes		67057205	1456	21283465
chr17	67055740	67055748	MGA	JASPAR	yes		67057205	1457	21283466
chr17	67055740	67055748	TBX15	JASPAR	yes		67057205	1457	21283467
chr17	67055740	67055748	TBX1	JASPAR	yes		67057205	1457	21283468
chr17	67055740	67055748	TBX4	JASPAR	yes		67057205	1457	21283469
chr17	67055740	67055748	TBX5	JASPAR	yes		67057205	1457	21283470
chr17	67055740	67056632	TCF7L2	GTRD	no	Colon (HCT116)	67057205	573	108287876
chr17	67055749	67055752	MYB	TRANSFAC	yes		67057205	1453	21283471
chr17	67055759	67056634	TCF7L2	GTRD	no	Colon (HCT116)	67057205	571	108287877
chr17	67055772	67055775	MYB	TRANSFAC	yes		67057205	1430	21283472
chr17	67055775	67055790	FOXP1	JASPAR	yes		67057205	1415	21283473
chr17	67055780	67055786	TCF4	TRANSFAC	yes		67057205	1419	21283474
chr17	67055790	67055799	VENTX	JASPAR	yes		67057205	1406	21283475
chr17	67055793	67055797	YY1	TRANSFAC	yes		67057205	1408	21283476
chr17	67055796	67055811	RUNX2	JASPAR	yes		67057205	1394	21283477
chr17	67055799	67055810	RUNX1	JASPAR	yes		67057205	1395	21283478
chr17	67055800	67055810	RUNX3	JASPAR	yes		67057205	1395	21283479
chr17	67055805	67055809	ESR1	TRANSFAC	yes		67057205	1396	21283480
chr17	67055805	67055826	IRF1	JASPAR	yes		67057205	1379	21283481
chr17	67055808	67055812	YY1	TRANSFAC	yes		67057205	1393	21283482
chr17	67055808	67055823	FOXP1	JASPAR	yes		67057205	1382	21283483
chr17	67055809	67055824	FOXP1	JASPAR	yes		67057205	1381	21283484
chr17	67055810	67055825	FOXP1	JASPAR	yes		67057205	1380	21283485
chr17	67055811	67055826	FOXP1	JASPAR	yes		67057205	1379	21283486
chr17	67055816	67055831	FOXP1	JASPAR	yes		67057205	1374	21283487
chr17	67055829	67055844	PRDM1	JASPAR	yes		67057205	1361	21283488
chr17	67055829	67055844	STAT2	JASPAR	yes		67057205	1361	21283489
chr17	67055830	67056901	ZNF143	GTRD	no	Epithelial (MCF-7)	67057205	304	108287878
chr17	67055842	67055845	MYB	TRANSFAC	yes		67057205	1360	21283490
chr17	67055844	67055864	RREB1	JASPAR	yes		67057205	1341	21283491
chr17	67055847	67055862	NR2C2	JASPAR	yes		67057205	1343	21283492
chr17	67055848	67055858	SP1	JASPAR	yes		67057205	1347	21283493
chr17	67055848	67055869	ZNF263	JASPAR	yes		67057205	1336	21283494
chr17	67055849	67055859	SP1	JASPAR	yes		67057205	1346	21283495
chr17	67055849	67055870	ZNF263	JASPAR	yes		67057205	1335	21283496
chr17	67055850	67055854	LFA1	TRANSFAC	yes		67057205	1351	21283497
chr17	67055857	67056559	TCF7L2	GTRD	no	Colon (HCT116)	67057205	646	108287879
chr17	67055860	67056629	TCF7L2	GTRD	no	Colon (HCT116)	67057205	576	108287880
chr17	67055861	67055871	SP1	JASPAR	yes		67057205	1334	21283498
chr17	67055862	67055867	ETS2	TRANSFAC	yes		67057205	1338	21283499
chr17	67055874	67055889	TFAP2A	JASPAR	yes		67057205	1316	21283500
chr17	67055876	67055891	TFAP2C	JASPAR	yes		67057205	1314	21283501
chr17	67055877	67055888	TFAP2A	JASPAR	yes		67057205	1317	21283502
chr17	67055877	67055888	TFAP2B	JASPAR	yes		67057205	1317	21283503
chr17	67055877	67055888	TFAP2C	JASPAR	yes		67057205	1317	21283504
chr17	67055895	67055908	ELF1	JASPAR	yes		67057205	1297	21283505
chr17	67055898	67055908	GABPA	JASPAR	yes		67057205	1297	21283506
chr17	67055902	67055922	TP53	JASPAR	yes		67057205	1283	21283507
chr17	67055917	67055921	YY1	TRANSFAC	yes		67057205	1284	21283508
chr17	67055921	67055925	YY1	TRANSFAC	yes		67057205	1280	21283509
chr17	67055922	67055932	HOXC10	JASPAR	yes		67057205	1273	21283510
chr17	67055922	67055932	HOXD11	JASPAR	yes		67057205	1273	21283511
chr17	67055922	67055932	HOXD13	JASPAR	yes		67057205	1273	21283512
chr17	67055922	67055933	HOXA10	JASPAR	yes		67057205	1272	21283513
chr17	67055922	67055933	HOXC11	JASPAR	yes		67057205	1272	21283514
chr17	67055922	67055933	HOXC12	JASPAR	yes		67057205	1272	21283515
chr17	67055922	67055933	HOXC13	JASPAR	yes		67057205	1272	21283516
chr17	67055922	67055933	HOXD12	JASPAR	yes		67057205	1272	21283517
chr17	67055923	67055932	CDX1	JASPAR	yes		67057205	1273	21283518
chr17	67055925	67055939	CREB3	JASPAR	yes		67057205	1266	21283519
chr17	67055926	67055940	XBP1	JASPAR	yes		67057205	1265	21283520
chr17	67055928	67055933	ATF1	TRANSFAC	yes		67057205	1272	21283521
chr17	67055929	67055950	MAFG	JASPAR	yes		67057205	1255	21283522
chr17	67055931	67055942	NFE2	JASPAR	yes		67057205	1263	21283523
chr17	67055934	67055952	MAFF	JASPAR	yes		67057205	1253	21283524
chr17	67055939	67055950	NRL	JASPAR	yes		67057205	1255	21283525
chr17	67055948	67055954	SOX10	JASPAR	yes		67057205	1251	21283526
chr17	67055955	67056690	ZNF274	GTRD	no	Blood (GM12878)	67057205	515	108287881
chr17	67055956	67055960	LFA1	TRANSFAC	yes		67057205	1245	21283527
chr17	67055962	67055974	BHLHE23	JASPAR	yes		67057205	1231	21283528
chr17	67055963	67055973	NEUROG2	JASPAR	yes		67057205	1232	21283529
chr17	67055967	67055975	FOXL1	JASPAR	yes		67057205	1230	21283530
chr17	67055975	67055990	HSF1	JASPAR	yes		67057205	1215	21283531
chr17	67055979	67055983	NFE	TRANSFAC	yes		67057205	1222	21283532

Chrom.	Position	dbSNP ID	Reference Allele	Alternative Allele	Distance between TSS and SNP	Tissue	q Value	id
chr17	67063615	rs7210174	T	C,G	6410	Esophagus	0.0691938	5017331
chr17	67066822	rs7214438	C	T	9617	Esophagus	5.41839e-05	5017358
chr17	67421400	rs112314682	A	G	364195	Heart	0.222038	5018341
chr17	66386081	rs9906218	C	G	584548	Uterus	0.715321	5012768
chr17	66225650	rs59956579	G	C	744979	Adrenal	0.342414	5011245

Genomic Location	chr17:66970629-67057205[-]
TSS	67057205
Gene Name	ABCA9
Ensembl ID	ENSG00000154258.12
ENTREZID	10350
Uniprot
Uniprot	Q8IUA7
Protein Name
Protein Name	ATP-binding cassette sub-family A member 9

EnhancerDB

Enhancers that regulate ABCA9[ENSG00000154258.12]

Transcript facotrs that regulate ABCA9[ENSG00000154258.12]

SNPs associated with ABCA9[ENSG00000154258.12], confirmed by eQTL

Details of ABCA9[ENSG00000154258.12]

Expression levels of ABCA9[ENSG00000154258.12]