EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. PTPN9[ENSG00000169410.5]
Enhancers that regulate PTPN9[ENSG00000169410.5]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr15 75820261 75820616 vista20767 75871630 51014
VISTA
chr15 75821389 75827709 enh3725 75871630 43921
Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Cervix (HeLa-S3) Prostate (RWPE1) Lung (PC-9) Esophagus Astrocyte Bone (Osteoblast) Stomach Muscle (A673) Placenta Breast Uterus Pancreas (Panc1) Blood (Karpas-422) Muscle (Myoblast) Pancreas Spleen Neural Stem Cells (H9) Epithelial (MCF-7)
chr15 75832725 75839352 enh52095 75871630 32278
Brain (SK-N-MC) Large Intestine Muscle (A673) Thyroid Spleen Neural Stem Cells (H9) Stomach
chr15 75841525 75850215 enh3726 75871630 21415
Placenta Bone (Osteoblast) Blood (Karpas-422)
chr15 75856125 75860319 enh31510 75871630 11311
Astrocyte Bone (Osteoblast)
chr15 75863425 75869415 enh3727 75871630 2215
Astrocyte Blood (Karpas-422) Lung (PC-9) Blood (T-cell) Stomach
chr15 75867013 75867354 vista20768 75871630 4276
VISTA
chr15 75882385 75886535 enh52096 75871630 10755
Large Intestine
chr15 75886318 75886335 vista20769 75871630 14688
VISTA
chr15 75891777 75892150 vista20770 75871630 20147
VISTA
chr15 75907172 75911372 enh44156 75871630 35542
Muscle (Myotube)
chr15 75939210 75939595 vista20771 75871630 67580
VISTA
chr15 75950720 75965049 enh16332 75871630 79090
Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Cervix (HeLa-S3) Prostate (RWPE1) Lung (PC-9) Esophagus Liver Bone (Osteoblast) Stomach Muscle (A673) Placenta Breast Muscle (Myoblast) Pancreas Pancreas (Panc1) Heart
chr15 75959061 75959441 vista20772 75871630 87431
VISTA
Transcript facotrs that regulate PTPN9[ENSG00000169410.5]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr15 75866613 75868398 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 75871630 3232 108157673
chr15 75866624 75866644 RREB1 JASPAR yes 75871630 4986 24712339
chr15 75866625 75866640 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4990 24712340
chr15 75866626 75866641 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4989 24712341
chr15 75866627 75866642 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4988 24712342
chr15 75866628 75866643 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4987 24712343
chr15 75866628 75866649 IRF1 JASPAR yes 75871630 4981 24712344
chr15 75866629 75866644 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4986 24712345
chr15 75866629 75866650 IRF1 JASPAR yes 75871630 4980 24712346
chr15 75866630 75866645 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4985 24712347
chr15 75866631 75866646 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4984 24712348
chr15 75866634 75866655 IRF1 JASPAR yes 75871630 4975 24712349
chr15 75866687 75866708 ZNF263 JASPAR yes 75871630 4922 24712350
chr15 75866688 75866692 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 4938 24712351
chr15 75866704 75866709 ETS2 TRANSFAC yes 75871630 4921 24712352
chr15 75866728 75866743 HNF4A JASPAR yes 75871630 4887 24712353
chr15 75866729 75866744 HNF4G JASPAR yes 75871630 4886 24712354
chr15 75866747 75866760 HSF2 JASPAR yes 75871630 4870 24712355
chr15 75866764 75866774 FIGLA JASPAR yes 75871630 4856 24712356
chr15 75866764 75866774 TCF4 JASPAR yes 75871630 4856 24712357
chr15 75866766 75866775 ZEB1 JASPAR yes 75871630 4855 24712358
chr15 75866767 75866775 TBX15 JASPAR yes 75871630 4855 24712359
chr15 75866767 75866778 E2F6 JASPAR yes 75871630 4852 24712360
chr15 75866768 75866773 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4857 24712361
chr15 75866771 75866786 STAT2 JASPAR yes 75871630 4844 24712362
chr15 75866785 75866789 NFE TRANSFAC yes 75871630 4841 24712363
chr15 75866791 75866796 GATA2 JASPAR yes 75871630 4834 24712364
chr15 75866796 75866801 GATA2 JASPAR yes 75871630 4829 24712365
chr15 75866817 75866826 THAP1 JASPAR yes 75871630 4804 24712366
chr15 75866818 75866824 YY1 JASPAR yes 75871630 4806 24712367
chr15 75866832 75866846 TLX1 JASPAR yes 75871630 4784 24712368
chr15 75866835 75866840 ETS2 TRANSFAC yes 75871630 4790 24712369
chr15 75866835 75866850 NFYB JASPAR yes 75871630 4780 24712370
chr15 75866842 75866846 H1TF2 TRANSFAC yes 75871630 4784 24712371
chr15 75866842 75866846 NFE TRANSFAC yes 75871630 4784 24712372
chr15 75866842 75866846 SRF TRANSFAC yes 75871630 4784 24712373
chr15 75866871 75867563 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 75871630 4067 108157674
chr15 75866873 75866876 MYB TRANSFAC yes 75871630 4754 24712374
chr15 75866889 75866900 ESRRA JASPAR yes 75871630 4730 24712375
chr15 75866893 75866897 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 4733 24712376
chr15 75866911 75868615 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 75871630 3015 108157675
chr15 75866914 75866926 PROX1 JASPAR yes 75871630 4704 24712377
chr15 75866921 75866942 IRF1 JASPAR yes 75871630 4688 24712378
chr15 75866925 75866939 IRF8 JASPAR yes 75871630 4691 24712379
chr15 75866925 75866940 IRF9 JASPAR yes 75871630 4690 24712380
chr15 75866929 75866940 FOS JASPAR yes 75871630 4690 24712381
chr15 75866929 75866940 JUND JASPAR yes 75871630 4690 24712382
chr15 75866987 75866997 MEF2A JASPAR yes 75871630 4633 24712383
chr15 75866988 75866992 YY1 TRANSFAC yes 75871630 4638 24712384
chr15 75867005 75869223 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 75871630 2407 108157676
chr15 75867008 75867019 FOSL2 JASPAR yes 75871630 4611 24712385
chr15 75867008 75867019 FOSL2 JASPAR yes 75871630 4611 70562979
chr15 75867024 75867045 LUN1 TRANSFAC yes 75871630 4585 24712386
chr15 75867024 75867045 LUN1 TRANSFAC yes 75871630 4585 70562980
chr15 75867049 75867054 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4576 24712387
chr15 75867049 75867054 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4576 70562981
chr15 75867057 75867072 TFAP2A JASPAR yes 75871630 4558 24712388
chr15 75867057 75867072 TFAP2A JASPAR yes 75871630 4558 70562982
chr15 75867058 75867072 NR2F1 JASPAR yes 75871630 4558 24712389
chr15 75867058 75867072 NR2F1 JASPAR yes 75871630 4558 70562983
chr15 75867059 75867074 TFAP2C JASPAR yes 75871630 4556 24712390
chr15 75867059 75867074 TFAP2C JASPAR yes 75871630 4556 70562984
chr15 75867063 75867076 NR2F1 JASPAR yes 75871630 4554 24712391
chr15 75867063 75867076 NR2F1 JASPAR yes 75871630 4554 70562985
chr15 75867064 75867072 CREB1 JASPAR yes 75871630 4558 24712392
chr15 75867064 75867072 CREB1 JASPAR yes 75871630 4558 70562986
chr15 75867065 75867083 RARA JASPAR yes 75871630 4547 24712393
chr15 75867065 75867083 RARA JASPAR yes 75871630 4547 70562987
chr15 75867067 75867071 ESR1 TRANSFAC yes 75871630 4559 24712394
chr15 75867067 75867071 ESR1 TRANSFAC yes 75871630 4559 70562988
chr15 75867114 75867129 MEF2C JASPAR yes 75871630 4501 24712395
chr15 75867114 75867129 MEF2C JASPAR yes 75871630 4501 70562989
chr15 75867115 75867130 MEF2A JASPAR yes 75871630 4500 24712396
chr15 75867115 75867130 MEF2A JASPAR yes 75871630 4500 70562990
chr15 75867116 75867128 MEF2A JASPAR yes 75871630 4502 24712397
chr15 75867116 75867128 MEF2B JASPAR yes 75871630 4502 24712398
chr15 75867116 75867128 MEF2D JASPAR yes 75871630 4502 24712399
chr15 75867116 75867128 MEF2A JASPAR yes 75871630 4502 70562991
chr15 75867116 75867128 MEF2B JASPAR yes 75871630 4502 70562992
chr15 75867116 75867128 MEF2D JASPAR yes 75871630 4502 70562993
chr15 75867148 75867153 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4477 24712400
chr15 75867148 75867153 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4477 70562994
chr15 75867185 75867200 SOX21 JASPAR yes 75871630 4430 24712401
chr15 75867185 75867200 SOX21 JASPAR yes 75871630 4430 70562995
chr15 75867215 75867232 ESR1 JASPAR yes 75871630 4398 24712402
chr15 75867215 75867232 ESR1 JASPAR yes 75871630 4398 70562996
chr15 75867219 75867233 TLX1 JASPAR yes 75871630 4397 24712403
chr15 75867219 75867233 TLX1 JASPAR yes 75871630 4397 70562997
chr15 75867231 75867239 NR4A2 JASPAR yes 75871630 4391 24712404
chr15 75867231 75867239 NR4A2 JASPAR yes 75871630 4391 70562998
chr15 75867234 75867244 SREBF1 JASPAR yes 75871630 4386 24712405
chr15 75867234 75867244 SREBF2 JASPAR yes 75871630 4386 24712406
chr15 75867234 75867244 SREBF1 JASPAR yes 75871630 4386 70562999
chr15 75867234 75867244 SREBF2 JASPAR yes 75871630 4386 70563000
chr15 75867244 75867254 TEAD1 JASPAR yes 75871630 4376 24712407
chr15 75867244 75867254 TEAD4 JASPAR yes 75871630 4376 24712408
chr15 75867244 75867254 TEAD1 JASPAR yes 75871630 4376 70563001
chr15 75867244 75867254 TEAD4 JASPAR yes 75871630 4376 70563002
chr15 75867244 75867256 TEAD1 JASPAR yes 75871630 4374 24712409
chr15 75867244 75867256 TEAD1 JASPAR yes 75871630 4374 70563003
chr15 75867245 75867253 TEAD3 JASPAR yes 75871630 4377 24712410
chr15 75867245 75867253 TEAD3 JASPAR yes 75871630 4377 70563004
chr15 75867257 75867261 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 4369 24712411
chr15 75867257 75867261 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 4369 70563005
chr15 75867264 75868088 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 75871630 3542 108157677
chr15 75867276 75867280 NFE TRANSFAC yes 75871630 4350 24712412
chr15 75867276 75867280 NFE TRANSFAC yes 75871630 4350 70563006
chr15 75867280 75867295 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4335 24712413
chr15 75867280 75867295 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4335 70563007
chr15 75867281 75867296 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4334 24712414
chr15 75867281 75867296 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4334 70563008
chr15 75867282 75867297 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4333 24712415
chr15 75867282 75867297 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4333 70563009
chr15 75867282 75867303 IRF1 JASPAR yes 75871630 4327 24712416
chr15 75867282 75867303 IRF1 JASPAR yes 75871630 4327 70563010
chr15 75867283 75867298 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4332 24712417
chr15 75867283 75867298 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4332 70563011
chr15 75867283 75867304 IRF1 JASPAR yes 75871630 4326 24712418
chr15 75867283 75867304 IRF1 JASPAR yes 75871630 4326 70563012
chr15 75867284 75867299 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4331 24712419
chr15 75867284 75867299 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4331 70563013
chr15 75867284 75867305 IRF1 JASPAR yes 75871630 4325 24712420
chr15 75867284 75867305 IRF1 JASPAR yes 75871630 4325 70563014
chr15 75867285 75867300 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4330 24712421
chr15 75867285 75867300 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4330 70563015
chr15 75867285 75867306 IRF1 JASPAR yes 75871630 4324 24712422
chr15 75867285 75867306 IRF1 JASPAR yes 75871630 4324 70563016
chr15 75867286 75867301 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4329 24712423
chr15 75867286 75867301 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4329 70563017
chr15 75867286 75867307 IRF1 JASPAR yes 75871630 4323 24712424
chr15 75867286 75867307 IRF1 JASPAR yes 75871630 4323 70563018
chr15 75867287 75867302 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4328 24712425
chr15 75867287 75867302 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4328 70563019
chr15 75867287 75867308 IRF1 JASPAR yes 75871630 4322 24712426
chr15 75867287 75867308 IRF1 JASPAR yes 75871630 4322 70563020
chr15 75867288 75867303 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4327 24712427
chr15 75867288 75867303 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4327 70563021
chr15 75867288 75867659 ZNF274 GTRD no Blood (GM12878) 75871630 3971 108157678
chr15 75867290 75867305 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4325 24712428
chr15 75867290 75867305 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4325 70563022
chr15 75867291 75867312 IRF1 JASPAR yes 75871630 4318 24712429
chr15 75867291 75867312 IRF1 JASPAR yes 75871630 4318 70563023
chr15 75867292 75867307 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4323 24712430
chr15 75867292 75867307 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4323 70563024
chr15 75867295 75867309 SPIC JASPAR yes 75871630 4321 24712431
chr15 75867295 75867309 STAT1 JASPAR yes 75871630 4321 24712432
chr15 75867295 75867309 SPIC JASPAR yes 75871630 4321 70563025
chr15 75867295 75867309 STAT1 JASPAR yes 75871630 4321 70563026
chr15 75867295 75867310 PRDM1 JASPAR yes 75871630 4320 24712433
chr15 75867295 75867310 STAT2 JASPAR yes 75871630 4320 24712434
chr15 75867295 75867310 PRDM1 JASPAR yes 75871630 4320 70563027
chr15 75867295 75867310 STAT2 JASPAR yes 75871630 4320 70563028
chr15 75867295 75867316 IRF1 JASPAR yes 75871630 4314 24712435
chr15 75867295 75867316 IRF1 JASPAR yes 75871630 4314 70563029
chr15 75867297 75867318 IRF1 JASPAR yes 75871630 4312 24712436
chr15 75867297 75867318 IRF1 JASPAR yes 75871630 4312 70563030
chr15 75867305 75867320 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4310 24712437
chr15 75867305 75867320 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4310 70563031
chr15 75867317 75867338 IRF1 JASPAR yes 75871630 4292 24712438
chr15 75867317 75867338 IRF1 JASPAR yes 75871630 4292 70563032
chr15 75867318 75867339 IRF1 JASPAR yes 75871630 4291 24712439
chr15 75867318 75867339 IRF1 JASPAR yes 75871630 4291 70563033
chr15 75867319 75867340 IRF1 JASPAR yes 75871630 4290 24712440
chr15 75867319 75867340 IRF1 JASPAR yes 75871630 4290 70563034
chr15 75867320 75867335 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4295 24712441
chr15 75867320 75867335 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4295 70563035
chr15 75867320 75867341 IRF1 JASPAR yes 75871630 4289 24712442
chr15 75867320 75867341 IRF1 JASPAR yes 75871630 4289 70563036
chr15 75867321 75867342 IRF1 JASPAR yes 75871630 4288 24712443
chr15 75867321 75867342 IRF1 JASPAR yes 75871630 4288 70563037
chr15 75867322 75867337 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4293 24712444
chr15 75867322 75867337 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4293 70563038
chr15 75867322 75867343 IRF1 JASPAR yes 75871630 4287 24712445
chr15 75867322 75867343 IRF1 JASPAR yes 75871630 4287 70563039
chr15 75867323 75867338 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4292 24712446
chr15 75867323 75867338 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4292 70563040
chr15 75867324 75867339 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4291 24712447
chr15 75867324 75867339 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4291 70563041
chr15 75867325 75867340 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4290 24712448
chr15 75867325 75867340 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4290 70563042
chr15 75867326 75867341 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4289 24712449
chr15 75867326 75867341 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4289 70563043
chr15 75867327 75867342 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4288 24712450
chr15 75867327 75867342 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4288 70563044
chr15 75867328 75867343 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4287 24712451
chr15 75867328 75867343 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4287 70563045
chr15 75867329 75867344 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4286 24712452
chr15 75867329 75867344 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4286 70563046
chr15 75867330 75867345 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4285 24712453
chr15 75867330 75867345 FOXP1 JASPAR yes 75871630 4285 70563047
chr15 75867367 75867371 NFE TRANSFAC yes 75871630 4259 24712454
chr15 75867372 75867377 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4253 24712455
chr15 75867395 75867404 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4226 24712456
chr15 75867396 75867404 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4226 24712457
chr15 75867396 75867406 SP1 JASPAR yes 75871630 4224 24712458
chr15 75867410 75867420 SREBF2 JASPAR yes 75871630 4210 24712459
chr15 75867417 75867438 ZNF263 JASPAR yes 75871630 4192 24712460
chr15 75867457 75867473 GLIS1 JASPAR yes 75871630 4157 24712461
chr15 75867469 75867474 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4156 24712462
chr15 75867484 75867499 MEF2A JASPAR yes 75871630 4131 24712463
chr15 75867485 75867500 MEF2C JASPAR yes 75871630 4130 24712464
chr15 75867486 75867498 MEF2A JASPAR yes 75871630 4132 24712465
chr15 75867486 75867498 MEF2B JASPAR yes 75871630 4132 24712466
chr15 75867486 75867498 MEF2D JASPAR yes 75871630 4132 24712467
chr15 75867488 75867492 YY1 TRANSFAC yes 75871630 4138 24712468
chr15 75867498 75867508 SP1 JASPAR yes 75871630 4122 24712469
chr15 75867499 75867509 SP1 JASPAR yes 75871630 4121 24712470
chr15 75867500 75867505 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4125 24712471
chr15 75867501 75867506 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4124 24712472
chr15 75867501 75867507 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4123 24712473
chr15 75867538 75867551 NR2F1 JASPAR yes 75871630 4079 24712474
chr15 75867540 75867555 JUND JASPAR yes 75871630 4075 24712475
chr15 75867541 75867554 JUN JASPAR yes 75871630 4076 24712476
chr15 75867542 75867550 CREB1 JASPAR yes 75871630 4080 24712477
chr15 75867554 75867559 SP1 TRANSFAC yes 75871630 4071 24712478
chr15 75867593 75867604 FOSL2 JASPAR yes 75871630 4026 24712479
chr15 75867641 75867659 SRF JASPAR yes 75871630 3971 24712480
chr15 75867658 75867661 MYB TRANSFAC yes 75871630 3969 24712481
chr15 75867669 75867682 POU2F2 JASPAR yes 75871630 3948 24712482
chr15 75867676 75867689 POU2F2 JASPAR yes 75871630 3941 24712483
chr15 75867699 75867707 RHOXF1 JASPAR yes 75871630 3923 24712484
chr15 75867710 75867720 MEF2A JASPAR yes 75871630 3910 24712485
chr15 75867736 75867751 FOXA1 JASPAR yes 75871630 3879 24712486
chr15 75867736 75867751 MEF2A JASPAR yes 75871630 3879 24712487
chr15 75867737 75867752 MEF2C JASPAR yes 75871630 3878 24712488
chr15 75867738 75867750 MEF2D JASPAR yes 75871630 3880 24712489
chr15 75867739 75867750 FOXB1 JASPAR yes 75871630 3880 24712490
chr15 75867740 75867744 YY1 TRANSFAC yes 75871630 3886 24712491
chr15 75867748 75867766 ESR2 JASPAR yes 75871630 3864 24712492
chr15 75867757 75867764 JUN TRANSFAC yes 75871630 3866 24712493
chr15 75867775 75867786 NFKB1 JASPAR yes 75871630 3844 24712494
chr15 75867795 75867809 TCF7L2 JASPAR yes 75871630 3821 24712495
chr15 75867799 75867805 TCF1 TRANSFAC yes 75871630 3825 24712496
chr15 75867864 75867868 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 3762 24712497
chr15 75867870 75867874 YY1 TRANSFAC yes 75871630 3756 24712498
chr15 75867888 75867903 RFX5 JASPAR yes 75871630 3727 24712499
chr15 75867890 75867906 RFX2 JASPAR yes 75871630 3724 24712500
chr15 75867890 75867906 RFX3 JASPAR yes 75871630 3724 24712501
chr15 75867890 75867906 RFX5 JASPAR yes 75871630 3724 24712502
chr15 75867892 75867903 EBF1 JASPAR yes 75871630 3727 24712503
chr15 75867893 75867904 EBF1 JASPAR yes 75871630 3726 24712504
chr15 75867907 75867913 LEF1 TRANSFAC yes 75871630 3717 24712505
chr15 75867907 75867913 TCF4 TRANSFAC yes 75871630 3717 24712506
chr15 75867910 75867916 GATA1 TRANSFAC yes 75871630 3714 24712507
chr15 75867910 75867918 GATA5 JASPAR yes 75871630 3712 24712508
chr15 75867919 75867922 MYB TRANSFAC yes 75871630 3708 24712509
chr15 75867938 75867950 MEF2A JASPAR yes 75871630 3680 24712510
chr15 75867939 75867953 POU1F1 JASPAR yes 75871630 3677 24712511
chr15 75867940 75867952 POU3F2 JASPAR yes 75871630 3678 24712512
chr15 75867940 75867953 POU3F3 JASPAR yes 75871630 3677 24712513
chr15 75867949 75867953 YY1 TRANSFAC yes 75871630 3677 24712514
chr15 75867981 75867991 SP1 JASPAR yes 75871630 3639 24712515
chr15 75867992 75868002 TBR1 JASPAR yes 75871630 3628 24712516
chr15 75868003 75868024 LUN1 TRANSFAC yes 75871630 3606 24712517
chr15 75868020 75868034 PLAG1 JASPAR yes 75871630 3596 24712518
chr15 75868027 75868032 SP1 TRANSFAC yes 75871630 3598 24712519
chr15 75868028 75868033 SP1 TRANSFAC yes 75871630 3597 24712520
chr15 75868032 75868049 RXRA JASPAR yes 75871630 3581 24712521
chr15 75868033 75868039 ZNF354C JASPAR yes 75871630 3591 24712522
chr15 75868036 75868051 JUND JASPAR yes 75871630 3579 24712523
chr15 75868037 75868050 JUN JASPAR yes 75871630 3580 24712524
chr15 75868040 75868053 NR2F1 JASPAR yes 75871630 3577 24712525
chr15 75868041 75868049 CREB1 JASPAR yes 75871630 3581 24712526
chr15 75868044 75868048 ESR1 TRANSFAC yes 75871630 3582 24712527
chr15 75868070 75868073 MYB TRANSFAC yes 75871630 3557 24712528
chr15 75868075 75868080 TFAP2A TRANSFAC yes 75871630 3550 24712529
chr15 75868075 75868081 MZF1 JASPAR yes 75871630 3549 24712530
chr15 75868075 75868088 NFKB1 JASPAR yes 75871630 3542 24712531
chr15 75868075 75868088 NFKB2 JASPAR yes 75871630 3542 24712532
chr15 75868076 75868087 NFKB1 JASPAR yes 75871630 3543 24712533
chr15 75868077 75868087 NFKB1 JASPAR yes 75871630 3543 24712534
chr15 75868077 75868087 RELA JASPAR yes 75871630 3543 24712535
chr15 75868077 75868088 NFKB1 JASPAR yes 75871630 3542 24712536
chr15 75868078 75868088 RELA JASPAR yes 75871630 3542 24712537
chr15 75868078 75868088 REL JASPAR yes 75871630 3542 24712538
chr15 75868092 75868107 MEF2A JASPAR yes 75871630 3523 24712539
chr15 75868093 75868105 MEF2A JASPAR yes 75871630 3525 24712540
chr15 75868093 75868105 MEF2B JASPAR yes 75871630 3525 24712541
chr15 75868093 75868105 MEF2D JASPAR yes 75871630 3525 24712542
chr15 75868094 75868104 MEF2A JASPAR yes 75871630 3526 24712543
chr15 75868100 75868113 POU2F2 JASPAR yes 75871630 3517 24712544
chr15 75868106 75868125 PAX5 JASPAR yes 75871630 3505 24712545
chr15 75868125 75868130 SP1 TRANSFAC yes 75871630 3500 24712546
chr15 75868172 75868186 TLX1 JASPAR yes 75871630 3444 24712547
chr15 75868179 75868198 CTCF JASPAR yes 75871630 3432 24712548
chr15 75868210 75868221 CEBPB JASPAR yes 75871630 3409 24712549
chr15 75868211 75868221 CEBPB JASPAR yes 75871630 3409 24712550
chr15 75868211 75868221 CEBPD JASPAR yes 75871630 3409 24712551
chr15 75868211 75868221 CEBPE JASPAR yes 75871630 3409 24712552
chr15 75868211 75868221 CEBPG JASPAR yes 75871630 3409 24712553
chr15 75868232 75868251 PAX5 JASPAR yes 75871630 3379 24712554
chr15 75868234 75868238 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 3392 24712555
chr15 75868256 75868271 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3359 24712556
chr15 75868257 75868272 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3358 24712557
chr15 75868258 75868273 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3357 24712558
chr15 75868258 75868279 IRF1 JASPAR yes 75871630 3351 24712559
chr15 75868259 75868274 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3356 24712560
chr15 75868259 75868280 IRF1 JASPAR yes 75871630 3350 24712561
chr15 75868260 75868275 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3355 24712562
chr15 75868260 75868281 IRF1 JASPAR yes 75871630 3349 24712563
chr15 75868261 75868276 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3354 24712564
chr15 75868261 75868282 IRF1 JASPAR yes 75871630 3348 24712565
chr15 75868262 75868277 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3353 24712566
chr15 75868262 75868283 IRF1 JASPAR yes 75871630 3347 24712567
chr15 75868263 75868278 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3352 24712568
chr15 75868263 75868284 IRF1 JASPAR yes 75871630 3346 24712569
chr15 75868264 75868279 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3351 24712570
chr15 75868264 75868285 IRF1 JASPAR yes 75871630 3345 24712571
chr15 75868265 75868280 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3350 24712572
chr15 75868265 75868286 IRF1 JASPAR yes 75871630 3344 24712573
chr15 75868266 75868281 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3349 24712574
chr15 75868266 75868287 IRF1 JASPAR yes 75871630 3343 24712575
chr15 75868267 75868282 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3348 24712576
chr15 75868267 75868288 IRF1 JASPAR yes 75871630 3342 24712577
chr15 75868268 75868283 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3347 24712578
chr15 75868269 75868290 IRF1 JASPAR yes 75871630 3340 24712579
chr15 75868270 75868285 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3345 24712580
chr15 75868293 75868302 HIC2 JASPAR yes 75871630 3328 24712581
chr15 75868296 75868300 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 3330 24712582
chr15 75868326 75868330 YY1 TRANSFAC yes 75871630 3300 24712583
chr15 75868326 75868340 GLIS3 JASPAR yes 75871630 3290 24712584
chr15 75868334 75868348 PLAG1 JASPAR yes 75871630 3282 24712585
chr15 75868341 75868346 SP1 TRANSFAC yes 75871630 3284 24712586
chr15 75868342 75868347 SP1 TRANSFAC yes 75871630 3283 24712587
chr15 75868346 75868363 RXRA JASPAR yes 75871630 3267 24712588
chr15 75868347 75868353 ZNF354C JASPAR yes 75871630 3277 24712589
chr15 75868354 75868367 NR2F1 JASPAR yes 75871630 3263 24712590
chr15 75868358 75868362 ESR1 TRANSFAC yes 75871630 3268 24712591
chr15 75868362 75868376 IRF8 JASPAR yes 75871630 3254 24712592
chr15 75868363 75868377 STAT1 JASPAR yes 75871630 3253 24712593
chr15 75868382 75868394 YY1 JASPAR yes 75871630 3236 24712594
chr15 75868386 75868397 CEBPB JASPAR yes 75871630 3233 24712595
chr15 75868387 75868400 NFKB1 JASPAR yes 75871630 3230 24712596
chr15 75868387 75868400 NFKB2 JASPAR yes 75871630 3230 24712597
chr15 75868402 75868413 HOXC13 JASPAR yes 75871630 3217 24712598
chr15 75868403 75868418 MEF2C JASPAR yes 75871630 3212 24712599
chr15 75868424 75868433 HIC2 JASPAR yes 75871630 3197 24712600
chr15 75868425 75868441 ZNF143 JASPAR yes 75871630 3189 24712601
chr15 75868426 75868436 SP1 JASPAR yes 75871630 3194 24712602
chr15 75868427 75868431 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 3199 24712603
chr15 75868451 75868471 TBX19 JASPAR yes 75871630 3159 24712604
chr15 75868453 75868469 T JASPAR yes 75871630 3161 24712605
chr15 75868490 75868496 JUN TRANSFAC yes 75871630 3134 24712606
chr15 75868539 75868558 RFX2 JASPAR yes 75871630 3072 24712607
chr15 75868541 75868556 RFX5 JASPAR yes 75871630 3074 24712608
chr15 75868565 75868580 FOXP1 JASPAR yes 75871630 3050 24712609
chr15 75868568 75868574 TBP TRANSFAC yes 75871630 3056 24712610
chr15 75868570 75868582 IRF1 JASPAR yes 75871630 3048 24712611
chr15 75868601 75868614 SMAD2 JASPAR yes 75871630 3016 24712612
chr15 75868604 75868614 TBR1 JASPAR yes 75871630 3016 24712613
chr15 75868605 75868615 TBX21 JASPAR yes 75871630 3015 24712614
chr15 75868606 75868614 MGA JASPAR yes 75871630 3016 24712615
chr15 75868606 75868614 TBX15 JASPAR yes 75871630 3016 24712616
chr15 75868606 75868614 TBX1 JASPAR yes 75871630 3016 24712617
chr15 75868606 75868614 TBX4 JASPAR yes 75871630 3016 24712618
chr15 75868606 75868614 TBX5 JASPAR yes 75871630 3016 24712619
chr15 75868606 75868615 ZEB1 JASPAR yes 75871630 3015 24712620
chr15 75868606 75868618 PKNOX1 JASPAR yes 75871630 3012 24712621
chr15 75868606 75868618 PKNOX2 JASPAR yes 75871630 3012 24712622
chr15 75868606 75868618 TGIF1 JASPAR yes 75871630 3012 24712623
chr15 75868607 75868617 FIGLA JASPAR yes 75871630 3013 24712624
chr15 75868607 75868617 ID4 JASPAR yes 75871630 3013 24712625
chr15 75868607 75868617 TCF3 JASPAR yes 75871630 3013 24712626
chr15 75868607 75868617 TCF4 JASPAR yes 75871630 3013 24712627
chr15 75868608 75868617 SNAI2 JASPAR yes 75871630 3013 24712628
chr15 75868609 75868614 USF2 TRANSFAC yes 75871630 3016 24712629
chr15 75868632 75868646 PLAG1 JASPAR yes 75871630 2984 24712630
chr15 75868639 75868644 SP1 TRANSFAC yes 75871630 2986 24712631
chr15 75868640 75868645 SP1 TRANSFAC yes 75871630 2985 24712632
chr15 75868643 75868656 NFKB1 JASPAR yes 75871630 2974 24712633
chr15 75868645 75868651 ZNF354C JASPAR yes 75871630 2979 24712634
chr15 75868648 75868659 USF1 JASPAR yes 75871630 2971 24712635
chr15 75868648 75868659 USF2 JASPAR yes 75871630 2971 24712636
chr15 75868649 75868659 SREBF2 JASPAR yes 75871630 2971 24712637
chr15 75868651 75868656 USF2 TRANSFAC yes 75871630 2974 24712638
chr15 75868656 75868674 RARA JASPAR yes 75871630 2956 24712639
chr15 75868692 75868705 NFKB1 JASPAR yes 75871630 2925 24712640
chr15 75868692 75868705 NFKB2 JASPAR yes 75871630 2925 24712641
chr15 75868708 75868723 MEF2C JASPAR yes 75871630 2907 24712642
chr15 75868709 75868724 MEF2A JASPAR yes 75871630 2906 24712643
chr15 75868710 75868722 MEF2A JASPAR yes 75871630 2908 24712644
chr15 75868710 75868722 MEF2B JASPAR yes 75871630 2908 24712645
chr15 75868710 75868722 MEF2D JASPAR yes 75871630 2908 24712646
chr15 75868729 75868738 HIC2 JASPAR yes 75871630 2892 24712647
chr15 75868730 75868746 ZNF143 JASPAR yes 75871630 2884 24712648
chr15 75868731 75868741 SP1 JASPAR yes 75871630 2889 24712649
chr15 75868732 75868736 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 2894 24712650
chr15 75868738 75868743 SP1 TRANSFAC yes 75871630 2887 24712651
chr15 75868805 75868822 ESR1 JASPAR yes 75871630 2808 24712652
chr15 75868824 75868834 SREBF1 JASPAR yes 75871630 2796 24712653
chr15 75868824 75868834 SREBF2 JASPAR yes 75871630 2796 24712654
chr15 75868830 75868839 SOX9 JASPAR yes 75871630 2791 24712655
chr15 75868847 75868851 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 2779 24712656
chr15 75868850 75868870 RREB1 JASPAR yes 75871630 2760 24712657
chr15 75868851 75868866 IRF9 JASPAR yes 75871630 2764 24712658
chr15 75868854 75868866 IRF1 JASPAR yes 75871630 2764 24712659
chr15 75868880 75868883 MYB TRANSFAC yes 75871630 2747 24712660
chr15 75868917 75868922 SP1 TRANSFAC yes 75871630 2708 24712661
chr15 75868918 75868923 SP1 TRANSFAC yes 75871630 2707 24712662
chr15 75868918 75868927 THAP1 JASPAR yes 75871630 2703 24712663
chr15 75868921 75868925 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 2705 24712664
chr15 75868926 75868941 JUND JASPAR yes 75871630 2689 24712665
chr15 75868927 75868940 JUN JASPAR yes 75871630 2690 24712666
chr15 75868930 75868943 NR2F1 JASPAR yes 75871630 2687 24712667
chr15 75868931 75868939 CREB1 JASPAR yes 75871630 2691 24712668
chr15 75868932 75868950 RARA JASPAR yes 75871630 2680 24712669
chr15 75868934 75868938 ESR1 TRANSFAC yes 75871630 2692 24712670
chr15 75868960 75868972 YY1 JASPAR yes 75871630 2658 24712671
chr15 75868964 75868975 CEBPB JASPAR yes 75871630 2655 24712672
chr15 75868965 75868978 NFKB1 JASPAR yes 75871630 2652 24712673
chr15 75868965 75868978 NFKB2 JASPAR yes 75871630 2652 24712674
chr15 75868981 75868996 MEF2C JASPAR yes 75871630 2634 24712675
chr15 75868982 75868997 MEF2A JASPAR yes 75871630 2633 24712676
chr15 75868983 75868995 MEF2A JASPAR yes 75871630 2635 24712677
chr15 75868983 75868995 MEF2B JASPAR yes 75871630 2635 24712678
chr15 75868983 75868995 MEF2D JASPAR yes 75871630 2635 24712679
chr15 75869002 75869011 HIC2 JASPAR yes 75871630 2619 24712680
chr15 75869003 75869019 ZNF143 JASPAR yes 75871630 2611 24712681
chr15 75869004 75869014 SP1 JASPAR yes 75871630 2616 24712682
chr15 75869005 75869009 LFA1 TRANSFAC yes 75871630 2621 24712683
chr15 75869029 75869041 NHLH1 JASPAR yes 75871630 2589 24712684
chr15 75869030 75869040 NHLH1 JASPAR yes 75871630 2590 24712685
chr15 75869068 75869083 TFAP2C JASPAR yes 75871630 2547 24712686
chr15 75869069 75869080 EBF1 JASPAR yes 75871630 2550 24712687
chr15 75869069 75869081 TFAP2B JASPAR yes 75871630 2549 24712688
chr15 75869069 75869081 TFAP2C JASPAR yes 75871630 2549 24712689
chr15 75869081 75869098 ESR1 JASPAR yes 75871630 2532 24712690
chr15 75869081 75869099 ESR2 JASPAR yes 75871630 2531 24712691
chr15 75869085 75869099 TLX1 JASPAR yes 75871630 2531 24712692
chr15 75869100 75869110 SREBF1 JASPAR yes 75871630 2520 24712693
chr15 75869100 75869110 SREBF2 JASPAR yes 75871630 2520 24712694
chr15 75869125 75869133 MEIS2 JASPAR yes 75871630 2497 24712695
chr15 75869125 75869133 MEIS3 JASPAR yes 75871630 2497 24712696
chr15 75869141 75869145 NFE TRANSFAC yes 75871630 2485 24712697
chr15 75869145 75869160 FOXP1 JASPAR yes 75871630 2470 24712698
chr15 75869147 75869167 RREB1 JASPAR yes 75871630 2463 24712699
chr15 75869148 75869159 FOXP2 JASPAR yes 75871630 2471 24712700
chr15 75869149 75869164 FOXP1 JASPAR yes 75871630 2466 24712701
chr15 75869150 75869161 FOXA1 JASPAR yes 75871630 2469 24712702
chr15 75869150 75869165 FOXA1 JASPAR yes 75871630 2465 24712703
chr15 75869151 75869163 FOXC2 JASPAR yes 75871630 2467 24712704
chr15 75869151 75869171 RREB1 JASPAR yes 75871630 2459 24712705
chr15 75869152 75869164 FOXI1 JASPAR yes 75871630 2466 24712706
chr15 75869152 75869172 RREB1 JASPAR yes 75871630 2458 24712707
chr15 75869155 75869175 RREB1 JASPAR yes 75871630 2455 24712708
chr15 75869156 75869168 FOXI1 JASPAR yes 75871630 2462 24712709
chr15 75869157 75869172 FOXP1 JASPAR yes 75871630 2458 24712710
chr15 75869159 75869179 RREB1 JASPAR yes 75871630 2451 24712711
chr15 75869160 75869172 FOXI1 JASPAR yes 75871630 2458 24712712
chr15 75869168 75869182 ONECUT1 JASPAR yes 75871630 2448 24712713
chr15 75869168 75869182 ONECUT2 JASPAR yes 75871630 2448 24712714
chr15 75869168 75869182 ONECUT3 JASPAR yes 75871630 2448 24712715
chr15 75869169 75869181 IRF1 JASPAR yes 75871630 2449 24712716
chr15 75869169 75869184 STAT2 JASPAR yes 75871630 2446 24712717
chr15 75869170 75869182 IRF1 JASPAR yes 75871630 2448 24712718
chr15 75869188 75869203 FOXP1 JASPAR yes 75871630 2427 24712719
chr15 75869191 75869206 PRDM1 JASPAR yes 75871630 2424 24712720
chr15 75869224 75869236 BHLHE23 JASPAR yes 75871630 2394 24712721
chr15 75869225 75869235 OLIG1 JASPAR yes 75871630 2395 24712722
chr15 75869225 75869235 OLIG2 JASPAR yes 75871630 2395 24712723
chr15 75869225 75869235 OLIG3 JASPAR yes 75871630 2395 24712724
chr15 75869234 75869237 MYB TRANSFAC yes 75871630 2393 24712725
chr15 75869237 75869241 YY1 TRANSFAC yes 75871630 2389 24712726
chr15 75869242 75869256 POU1F1 JASPAR yes 75871630 2374 24712727
chr15 75869243 75869255 POU3F1 JASPAR yes 75871630 2375 24712728
chr15 75869243 75869255 POU3F2 JASPAR yes 75871630 2375 24712729
chr15 75869243 75869256 POU3F3 JASPAR yes 75871630 2374 24712730
chr15 75869244 75869248 YY1 TRANSFAC yes 75871630 2382 24712731
chr15 75869244 75869256 POU2F1 JASPAR yes 75871630 2374 24712732
chr15 75869245 75869254 POU3F4 JASPAR yes 75871630 2376 24712733
chr15 75869245 75869254 POU5F1B JASPAR yes 75871630 2376 24712734
chr15 75869246 75869257 RUNX1 JASPAR yes 75871630 2373 24712735
chr15 75869246 75869261 MEF2C JASPAR yes 75871630 2369 24712736
chr15 75869247 75869262 MEF2A JASPAR yes 75871630 2368 24712737
chr15 75869248 75869260 MEF2A JASPAR yes 75871630 2370 24712738
chr15 75869248 75869260 MEF2B JASPAR yes 75871630 2370 24712739
chr15 75869248 75869260 MEF2D JASPAR yes 75871630 2370 24712740
chr15 75869249 75869259 MEF2A JASPAR yes 75871630 2371 24712741
chr15 75869250 75869260 ALX3 JASPAR yes 75871630 2370 24712742
chr15 75869250 75869260 MEOX2 JASPAR yes 75871630 2370 24712743
chr15 75869251 75869259 LBX1 JASPAR yes 75871630 2371 24712744
chr15 75869251 75869259 PDX1 JASPAR yes 75871630 2371 24712745
chr15 75869251 75869259 VAX1 JASPAR yes 75871630 2371 24712746
chr15 75869251 75869259 VAX2 JASPAR yes 75871630 2371 24712747
chr15 75869251 75869259 VSX1 JASPAR yes 75871630 2371 24712748
chr15 75869251 75869259 VSX2 JASPAR yes 75871630 2371 24712749
chr15 75869270 75869276 TCF4 TRANSFAC yes 75871630 2354 24712750
chr15 75869281 75869285 YY1 TRANSFAC yes 75871630 2345 24712751
chr15 75869281 75869292 CEBPA JASPAR yes 75871630 2338 24712752
chr15 75869282 75869293 CEBPB JASPAR yes 75871630 2337 24712753
chr15 75869292 75869303 HOXC12 JASPAR yes 75871630 2327 24712754
chr15 75869292 75869303 HOXC13 JASPAR yes 75871630 2327 24712755
chr15 75869296 75869309 HNF1B JASPAR yes 75871630 2321 24712756
chr15 75869297 75869303 TBP TRANSFAC yes 75871630 2327 24712757
chr15 75869297 75869308 FOXC1 JASPAR yes 75871630 2322 24712758
chr15 75869297 75869309 FOXC2 JASPAR yes 75871630 2321 24712759
chr15 75869308 75869312 YY1 TRANSFAC yes 75871630 2318 24712760
chr15 75869323 75869337 GATA2 JASPAR yes 75871630 2293 24712761
chr15 75869325 75869333 GATA3 JASPAR yes 75871630 2297 24712762
chr15 75869325 75869333 GATA5 JASPAR yes 75871630 2297 24712763
chr15 75869338 75869358 RREB1 JASPAR yes 75871630 2272 24712764
chr15 75869339 75869345 HiNF-A TRANSFAC yes 75871630 2285 24712765
chr15 75869340 75869360 RREB1 JASPAR yes 75871630 2270 24712766
chr15 75869342 75869362 RREB1 JASPAR yes 75871630 2268 24712767
chr15 75869365 75869379 FOXF2 JASPAR yes 75871630 2251 24712768
chr15 75869366 75869377 FOXH1 JASPAR yes 75871630 2253 24712769
chr15 75869367 75869378 FOXC1 JASPAR yes 75871630 2252 24712770
chr15 75869367 75869379 FOXC2 JASPAR yes 75871630 2251 24712771
chr15 75869367 75869381 POU1F1 JASPAR yes 75871630 2249 24712772
chr15 75869368 75869380 POU3F1 JASPAR yes 75871630 2250 24712773
chr15 75869368 75869381 POU3F3 JASPAR yes 75871630 2249 24712774
chr15 75869370 75869378 FOXG1 JASPAR yes 75871630 2252 24712775
chr15 75869375 75869379 YY1 TRANSFAC yes 75871630 2251 24712776
chr15 75869406 75869415 HIC2 JASPAR yes 75871630 2215 24712777
SNPs associated with PTPN9[ENSG00000169410.5], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr15 75475438 rs1009194 C T 284024 Esophagus 0.191831 4094704
chr15 75467454 rs11857636 A G 292008 Esophagus 0.127837 4094616
chr15 76120924 rs16967527 C A 249294 Esophagus 0.0350436 4097098
chr15 76179427 rs140154456 CATT C 307797 Heart 0.341246 4097378
chr15 76742269 rs201655379 A AT 870639 Breast 0.189701 4099719
chr15 74890842 rs11853859 G A 868620 Ovary 0.399442 4091137
chr15 75333570 rs117265510 G A 425892 Uterus 0.996109 4093270
chr15 75051628 rs72728895 G A 707834 Lung 0.0587202 4091586
chr15 76406046 rs150550966 C A 534416 Stomach 0.332281 4097957
Details of PTPN9[ENSG00000169410.5]
Back to top
Genomic Location chr15:75759462-75871630[-]
TSS 75871630
Gene Name PTPN9
Ensembl ID ENSG00000169410.5
ENTREZID 5780
Uniprot
Q6IQ43
P43378
Protein Name
PTPN9 protein
Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9
Expression levels of PTPN9[ENSG00000169410.5]
Back to top