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Enhancers that regulate TMEM9B[ENSG00000175348.6]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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Stomach
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Spleen
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Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Bone (Osteoblast) Muscle (A673) Placenta Lung (PC-9) Muscle (Myoblast)
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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Esophagus Spleen Placenta Stomach
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Thyroid Cervix (HeLa-S3)
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VISTA
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VISTA
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VISTA
Transcript facotrs that regulate TMEM9B[ENSG00000175348.6]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr11 8988332 8989163 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 8986558 1774 107955217
chr11 8988346 8989224 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 8986558 1788 107955218
chr11 8988347 8988995 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 8986558 1789 107955219
chr11 8988349 8988947 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 8986558 1791 107955220
chr11 8988364 8989018 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 8986558 1806 107955221
chr11 8988364 8989020 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 8986558 1806 107955222
chr11 8988371 8989144 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 8986558 1813 107955223
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chr11 8988692 8988960 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 8986558 2134 107955239
chr11 8988694 8989044 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 8986558 2136 107955240
chr11 8988722 8988996 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 8986558 2164 107955241
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chr11 8988740 8989096 ZBTB33 GTRD no Brain (SK-N-SH) 8986558 2182 107955243
chr11 8988747 8989019 ZNF274 GTRD no Cervix (HeLa-S3) 8986558 2189 107955244
chr11 8988783 8989059 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 8986558 2225 107955245
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chr11 8988854 8988875 ZNF263 JASPAR yes 8986558 2296 114037136
chr11 8988860 8988864 YY1 TRANSFAC yes 8986558 2302 114037137
chr11 8988864 8988869 ETS2 TRANSFAC yes 8986558 2306 114037138
chr11 8988872 8988877 ETS2 TRANSFAC yes 8986558 2314 114037139
chr11 8988877 8988881 TEAD2 TRANSFAC yes 8986558 2319 114037140
chr11 8988879 8988882 MYB TRANSFAC yes 8986558 2321 114037141
chr11 8988892 8989523 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 8986558 2334 107955247
chr11 8988896 8988907 FLI1 JASPAR yes 8986558 2338 114037142
chr11 8988897 8988907 ETV6 JASPAR yes 8986558 2339 114037143
chr11 8988898 8988905 SPI1 JASPAR yes 8986558 2340 114037144
chr11 8988898 8988906 EHF JASPAR yes 8986558 2340 114037145
chr11 8988917 8989345 ZNF274 GTRD no Bone Marrow (K562) 8986558 2359 107955248
chr11 8988921 8988925 H4TF2 TRANSFAC yes 8986558 2363 114037146
chr11 8988923 8988933 CLOCK JASPAR yes 8986558 2365 114037147
chr11 8988924 8988931 USF1 JASPAR yes 8986558 2366 114037148
chr11 8988925 8988930 MYC TRANSFAC yes 8986558 2367 114037149
chr11 8988925 8988930 USF1 TRANSFAC yes 8986558 2367 114037150
chr11 8988925 8988930 USF2 TRANSFAC yes 8986558 2367 114037151
chr11 8988938 8988959 REST JASPAR yes 8986558 2380 114037152
chr11 8988939 8988958 REST JASPAR yes 8986558 2381 114037153
chr11 8988950 8988954 H4TF2 TRANSFAC yes 8986558 2392 114037154
chr11 8988951 8988966 PRDM1 JASPAR yes 8986558 2393 114037155
chr11 8988963 8988969 LEF1 TRANSFAC yes 8986558 2405 114037156
chr11 8988963 8988969 SOX10 JASPAR yes 8986558 2405 114037157
chr11 8988988 8988993 SP1 TRANSFAC yes 8986558 2430 114037158
chr11 8988991 8989012 ZNF263 JASPAR yes 8986558 2433 114037159
chr11 8989002 8989015 ELF1 JASPAR yes 8986558 2444 114037160
chr11 8989005 8989015 GABPA JASPAR yes 8986558 2447 114037161
chr11 8989006 8989011 ETS2 TRANSFAC yes 8986558 2448 114037162
chr11 8989011 8989018 SPIB JASPAR yes 8986558 2453 114037163
chr11 8989022 8989028 LEF1 TRANSFAC yes 8986558 2464 114037164
chr11 8989022 8989028 SOX10 JASPAR yes 8986558 2464 114037165
chr11 8989036 8989057 ZNF263 JASPAR yes 8986558 2478 114037166
chr11 8989044 8989065 ZNF263 JASPAR yes 8986558 2486 114037167
chr11 8989046 8989052 MAZ TRANSFAC yes 8986558 2488 114037168
chr11 8989046 8989057 E2F6 JASPAR yes 8986558 2488 114037169
chr11 8989055 8989067 IRF1 JASPAR yes 8986558 2497 114037170
SNPs associated with TMEM9B[ENSG00000175348.6], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr11 8890079 rs10840137 G A 78762 Esophagus 0.000423904 1831184
chr11 8762162 rs12296005 T G 206679 Esophagus 0.100052 1829947
chr11 9788673 rs360144 C G,T 802115 Heart 0.044739 1836653
chr11 8986019 rs7940895 G A,C,T 0 Pancreas 5.28414e-05 1831525
chr11 8753552 rs905289 A G 215289 Breast 0.0135417 1829848
chr11 8986019 rs7940895 G A,C,T 0 Spleen 0.000552762 1831525
chr11 8709337 rs2036422 G A 259504 Ovary 0.121606 1829610
chr11 8986019 rs7940895 G A,C,T 0 Thyroid 2.05856e-13 1831525
chr11 9061821 rs56273565 TAATAA T 75263 Liver 0.274679 1831791
chr11 8811300 rs368527537 CACA C 157541 Lung 0.000150276 1830461
chr11 8986019 rs7940895 G A,C,T 0 Adrenal 0.137527 1831525
Details of TMEM9B[ENSG00000175348.6]
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Genomic Location chr11:8968841-8986558[-]
TSS 8986558
Gene Name TMEM9B
Ensembl ID ENSG00000175348.6
ENTREZID 56674
Uniprot
Q543A1
B7Z6P5
Q9NQ34
Protein Name
Alternative protein TMEM9B
Putative NFkB activating protein
Transmembrane protein 9B
Expression levels of TMEM9B[ENSG00000175348.6]
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