EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. FAM229A[ENSG00000225828.1]
Enhancers that regulate FAM229A[ENSG00000225828.1]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr1 32714985 32735095 enh209 32829879 94784
Liver (HepG2) Blood (OCI-LY7) Blood (Karpas-422) Blood (T-cell) Stomach
chr1 32732571 32732683 vista1103 32829879 97196
VISTA
chr1 32772385 32781215 enh210 32829879 48664
Bone Marrow (K562) Liver (HepG2) Blood (OCI-LY7) Colon (HCT116) Thyroid Blood (Karpas-422) Stomach
chr1 32783565 32790004 enh211 32829879 39875
Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Large Intestine Blood (T-cell) Liver Blood (OCI-LY7) Peripheral Blood (MM.1S) Blood (Karpas-422) Pancreas Thymus Stomach
chr1 32795805 32800855 enh212 32829879 29024
Placenta Blood (Karpas-422)
chr1 32803558 32803627 vista1104 32829879 26252
VISTA
chr1 32805161 32805466 vista1105 32829879 24413
VISTA
chr1 32821305 32826051 enh60110 32829879 3828
Blood (OCI-LY7) Stomach
chr1 32852365 32859275 enh90667 32829879 22486
Bone Marrow (K562)
chr1 32868607 32874615 enh42928 32829879 38728
Muscle (Myoblast) Muscle (Myotube) Lung (PC-9)
chr1 32877625 32881815 enh90668 32829879 47746
Bone Marrow (K562) Spleen Cervix (HeLa-S3)
chr1 32910065 32916955 enh26615 32829879 80186
Bone Marrow (K562) Astrocyte Prostate (PC-3) Uterus
Transcript facotrs that regulate FAM229A[ENSG00000225828.1]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr1 32824862 32824882 TP63 JASPAR yes 32829879 4997 27990788
chr1 32824863 32824881 TP63 JASPAR yes 32829879 4998 27990789
chr1 32824863 32824881 TP73 JASPAR yes 32829879 4998 27990790
chr1 32824867 32824879 PBX1 JASPAR yes 32829879 5000 27990791
chr1 32824868 32824884 ZNF143 JASPAR yes 32829879 4995 27990792
chr1 32824876 32824885 HIC2 JASPAR yes 32829879 4994 27990793
chr1 32824906 32824925 PAX5 JASPAR yes 32829879 4954 27990794
chr1 32824936 32824946 SREBF1 JASPAR yes 32829879 4933 27990795
chr1 32824936 32824946 SREBF2 JASPAR yes 32829879 4933 27990796
chr1 32824937 32824945 MGA JASPAR yes 32829879 4934 27990797
chr1 32824940 32824951 ESRRA JASPAR yes 32829879 4928 27990798
chr1 32824940 32824951 ESRRB JASPAR yes 32829879 4928 27990799
chr1 32824941 32824949 NR4A2 JASPAR yes 32829879 4930 27990800
chr1 32824984 32824997 ELF1 JASPAR yes 32829879 4882 27990801
chr1 32824988 32825003 TFAP2A JASPAR yes 32829879 4876 27990802
chr1 32824988 32825003 TFAP2C JASPAR yes 32829879 4876 27990803
chr1 32824991 32825002 TFAP2A JASPAR yes 32829879 4877 27990804
chr1 32824991 32825002 TFAP2B JASPAR yes 32829879 4877 27990805
chr1 32824991 32825002 TFAP2C JASPAR yes 32829879 4877 27990806
chr1 32825002 32825021 RFX2 JASPAR yes 32829879 4858 27990807
chr1 32825006 32825022 RFX2 JASPAR yes 32829879 4857 27990808
chr1 32825006 32825022 RFX3 JASPAR yes 32829879 4857 27990809
chr1 32825006 32825022 RFX4 JASPAR yes 32829879 4857 27990810
chr1 32825033 32825042 ZEB1 JASPAR yes 32829879 4837 27990811
chr1 32825039 32825059 RREB1 JASPAR yes 32829879 4820 27990812
chr1 32825044 32825064 RREB1 JASPAR yes 32829879 4815 27990813
chr1 32825045 32825066 IRF1 JASPAR yes 32829879 4813 27990814
chr1 32825046 32825052 TCF4 TRANSFAC yes 32829879 4827 27990815
chr1 32825046 32825061 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4818 27990816
chr1 32825049 32825061 IRF1 JASPAR yes 32829879 4818 27990817
chr1 32825051 32825057 TCF4 TRANSFAC yes 32829879 4822 27990818
chr1 32825051 32825066 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4813 27990819
chr1 32825054 32825066 IRF1 JASPAR yes 32829879 4813 27990820
chr1 32825056 32825062 TCF4 TRANSFAC yes 32829879 4817 27990821
chr1 32825056 32825071 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4808 27990822
chr1 32825056 32825071 MEF2C JASPAR yes 32829879 4808 27990823
chr1 32825057 32825069 MEF2A JASPAR yes 32829879 4810 27990824
chr1 32825082 32825090 FOXO3 JASPAR yes 32829879 4789 27990825
chr1 32825083 32825093 NFATC3 JASPAR yes 32829879 4786 27990826
chr1 32825084 32825091 NFATC2 JASPAR yes 32829879 4788 27990827
chr1 32825157 32825177 TP63 JASPAR yes 32829879 4702 27990828
chr1 32825161 32825172 FOSL2 JASPAR yes 32829879 4707 27990829
chr1 32825175 32825189 RORA JASPAR yes 32829879 4690 27990830
chr1 32825178 32825199 IRF1 JASPAR yes 32829879 4680 27990831
chr1 32825181 32825185 YY1 TRANSFAC yes 32829879 4694 27990832
chr1 32825182 32825197 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4682 27990833
chr1 32825183 32825198 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4681 27990834
chr1 32825184 32825199 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4680 27990835
chr1 32825185 32825200 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4679 27990836
chr1 32825186 32825201 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4678 27990837
chr1 32825187 32825202 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4677 27990838
chr1 32825198 32825219 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4660 27990839
chr1 32825199 32825204 ETS2 TRANSFAC yes 32829879 4675 27990840
chr1 32825203 32825224 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4655 27990841
chr1 32825207 32825228 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4651 27990842
chr1 32825210 32825231 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4648 27990843
chr1 32825213 32825234 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4645 27990844
chr1 32825217 32825238 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4641 27990845
chr1 32825220 32825241 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4638 27990846
chr1 32825223 32825236 ELF1 JASPAR yes 32829879 4643 27990847
chr1 32825223 32825244 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4635 27990848
chr1 32825224 32825237 ELF3 JASPAR yes 32829879 4642 27990849
chr1 32825225 32825236 ELF5 JASPAR yes 32829879 4643 27990850
chr1 32825226 32825237 FLI1 JASPAR yes 32829879 4642 27990851
chr1 32825226 32825247 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4632 27990852
chr1 32825227 32825232 ETS2 TRANSFAC yes 32829879 4647 27990853
chr1 32825227 32825235 FEV JASPAR yes 32829879 4644 27990854
chr1 32825228 32825235 SPI1 JASPAR yes 32829879 4644 27990855
chr1 32825229 32825250 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4629 27990856
chr1 32825235 32825256 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4623 27990857
chr1 32825238 32825259 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4620 27990858
chr1 32825241 32825251 NFATC3 JASPAR yes 32829879 4628 27990859
chr1 32825241 32825262 ZNF263 JASPAR yes 32829879 4617 27990860
chr1 32825243 32825250 NFATC2 JASPAR yes 32829879 4629 27990861
chr1 32825246 32825260 SPI1 JASPAR yes 32829879 4619 27990862
chr1 32825246 32825260 SPIC JASPAR yes 32829879 4619 27990863
chr1 32825247 32825260 ELF1 JASPAR yes 32829879 4619 27990864
chr1 32825251 32825256 ETS2 TRANSFAC yes 32829879 4623 27990865
chr1 32825274 32825278 YY1 TRANSFAC yes 32829879 4601 27990866
chr1 32825301 32825313 NHLH1 JASPAR yes 32829879 4566 27990867
chr1 32825302 32825312 MSC JASPAR yes 32829879 4567 27990868
chr1 32825302 32825312 TFAP4 JASPAR yes 32829879 4567 27990869
chr1 32825315 32825330 MEF2C JASPAR yes 32829879 4549 27990870
chr1 32825333 32825341 FEV JASPAR yes 32829879 4538 27990871
chr1 32825366 32825371 TFAP2A TRANSFAC yes 32829879 4508 27990872
chr1 32825366 32825372 MZF1 JASPAR yes 32829879 4507 27990873
chr1 32825385 32825389 YY1 TRANSFAC yes 32829879 4490 27990874
chr1 32825410 32825415 GATA2 JASPAR yes 32829879 4464 27990875
chr1 32825418 32825430 CREB1 JASPAR yes 32829879 4449 27990876
chr1 32825420 32825434 CREB3 JASPAR yes 32829879 4445 27990877
chr1 32825420 32825434 CREB3L1 JASPAR yes 32829879 4445 27990878
chr1 32825421 32825435 XBP1 JASPAR yes 32829879 4444 27990879
chr1 32825423 32825428 ATF1 TRANSFAC yes 32829879 4451 27990880
chr1 32825427 32825437 TEAD4 JASPAR yes 32829879 4442 27990881
chr1 32825475 32825485 GSC2 JASPAR yes 32829879 4394 27990882
chr1 32825475 32825485 GSC JASPAR yes 32829879 4394 27990883
chr1 32825476 32825484 OTX2 JASPAR yes 32829879 4395 27990884
chr1 32825483 32825490 CEBPA TRANSFAC yes 32829879 4389 27990885
chr1 32825494 32825500 JUN TRANSFAC yes 32829879 4379 27990886
chr1 32825503 32825518 LEF1 JASPAR yes 32829879 4361 27990887
chr1 32825511 32825525 EBF1 JASPAR yes 32829879 4354 27990888
chr1 32825513 32825524 EBF1 JASPAR yes 32829879 4355 27990889
chr1 32825519 32825533 STAT1 JASPAR yes 32829879 4346 27990890
chr1 32825533 32825546 NR2F1 JASPAR yes 32829879 4333 27990891
chr1 32825535 32825546 ESRRA JASPAR yes 32829879 4333 27990892
chr1 32825536 32825544 NR4A2 JASPAR yes 32829879 4335 27990893
chr1 32825537 32825547 RORA JASPAR yes 32829879 4332 27990894
chr1 32825537 32825554 RARA JASPAR yes 32829879 4325 27990895
chr1 32825562 32825565 MYB TRANSFAC yes 32829879 4314 27990896
chr1 32825566 32825580 SPIC JASPAR yes 32829879 4299 27990897
chr1 32825569 32825579 NFATC3 JASPAR yes 32829879 4300 27990898
chr1 32825589 32825599 POU6F2 JASPAR yes 32829879 4280 27990899
chr1 32825590 32825600 GSX2 JASPAR yes 32829879 4279 27990900
chr1 32825590 32825601 HOXC13 JASPAR yes 32829879 4278 27990901
chr1 32825591 32825599 NKX6-1 JASPAR yes 32829879 4280 27990902
chr1 32825591 32825599 NKX6-2 JASPAR yes 32829879 4280 27990903
chr1 32825593 32825597 YY1 TRANSFAC yes 32829879 4282 27990904
chr1 32825605 32825615 NFATC3 JASPAR yes 32829879 4264 27990905
chr1 32825614 32825622 FEV JASPAR yes 32829879 4257 27990906
chr1 32825625 32825633 FOXO3 JASPAR yes 32829879 4246 27990907
chr1 32825644 32825656 TFAP2A JASPAR yes 32829879 4223 27990908
chr1 32825644 32825656 TFAP2B JASPAR yes 32829879 4223 27990909
chr1 32825655 32825666 FLI1 JASPAR yes 32829879 4213 27990910
chr1 32825656 32825666 GABPA JASPAR yes 32829879 4213 27990911
chr1 32825661 32825669 MEIS2 JASPAR yes 32829879 4210 27990912
chr1 32825661 32825669 MEIS3 JASPAR yes 32829879 4210 27990913
chr1 32825662 32825666 NFE TRANSFAC yes 32829879 4213 27990914
chr1 32825672 32825678 SP1 TRANSFAC yes 32829879 4201 27990915
chr1 32825681 32825685 LFA1 TRANSFAC yes 32829879 4194 27990916
chr1 32825690 32825710 PPARG JASPAR yes 32829879 4169 27990917
chr1 32825693 32825697 ESR1 TRANSFAC yes 32829879 4182 27990918
chr1 32825693 32825704 USF1 JASPAR yes 32829879 4175 27990919
chr1 32825694 32825704 TFE3 JASPAR yes 32829879 4175 27990920
chr1 32825694 32825704 TFEB JASPAR yes 32829879 4175 27990921
chr1 32825694 32825704 TFEC JASPAR yes 32829879 4175 27990922
chr1 32825694 32825705 USF1 JASPAR yes 32829879 4174 27990923
chr1 32825694 32825705 USF2 JASPAR yes 32829879 4174 27990924
chr1 32825695 32825705 MAX JASPAR yes 32829879 4174 27990925
chr1 32825713 32825725 TEAD1 JASPAR yes 32829879 4154 27990926
chr1 32825720 32825733 SMAD2 JASPAR yes 32829879 4146 27990927
chr1 32825729 32825745 NFYA JASPAR yes 32829879 4134 27990928
chr1 32825739 32825750 ESRRA JASPAR yes 32829879 4129 27990929
chr1 32825771 32825785 PAX6 JASPAR yes 32829879 4094 27990930
chr1 32825781 32825795 SPI1 JASPAR yes 32829879 4084 27990931
chr1 32825781 32825795 SPIC JASPAR yes 32829879 4084 27990932
chr1 32825787 32825794 SPI1 JASPAR yes 32829879 4085 27990933
chr1 32825787 32825801 STAT1 JASPAR yes 32829879 4078 27990934
chr1 32825800 32825821 IRF1 JASPAR yes 32829879 4058 27990935
chr1 32825804 32825825 IRF1 JASPAR yes 32829879 4054 27990936
chr1 32825806 32825821 PRDM1 JASPAR yes 32829879 4058 27990937
chr1 32825808 32825829 IRF1 JASPAR yes 32829879 4050 27990938
chr1 32825810 32825825 PRDM1 JASPAR yes 32829879 4054 27990939
chr1 32825810 32825831 IRF1 JASPAR yes 32829879 4048 27990940
chr1 32825812 32825833 IRF1 JASPAR yes 32829879 4046 27990941
chr1 32825814 32825835 IRF1 JASPAR yes 32829879 4044 27990942
chr1 32825815 32825830 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4049 27990943
chr1 32825815 32825836 IRF1 JASPAR yes 32829879 4043 27990944
chr1 32825816 32825831 STAT2 JASPAR yes 32829879 4048 27990945
chr1 32825817 32825832 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4047 27990946
chr1 32825819 32825834 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4045 27990947
chr1 32825820 32825835 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4044 27990948
chr1 32825821 32825836 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4043 27990949
chr1 32825822 32825837 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4042 27990950
chr1 32825823 32825838 FOXP1 JASPAR yes 32829879 4041 27990951
chr1 32825826 32825841 MEF2C JASPAR yes 32829879 4038 27990952
chr1 32825836 32825841 GATA2 JASPAR yes 32829879 4038 27990953
chr1 32825843 32825862 PAX5 JASPAR yes 32829879 4017 27990954
chr1 32825883 32825893 SREBF1 JASPAR yes 32829879 3986 27990955
chr1 32825885 32825902 ESR1 JASPAR yes 32829879 3977 27990956
chr1 32825910 32825925 STAT1 JASPAR yes 32829879 3954 27990957
chr1 32825912 32825923 STAT1 JASPAR yes 32829879 3956 27990958
chr1 32825916 32825921 ETS2 TRANSFAC yes 32829879 3958 27990959
chr1 32825955 32825964 SNAI2 JASPAR yes 32829879 3915 27990960
chr1 32825955 32825965 ID4 JASPAR yes 32829879 3914 27990961
chr1 32825955 32825965 TCF3 JASPAR yes 32829879 3914 27990962
chr1 32825955 32825965 TCF4 JASPAR yes 32829879 3914 27990963
chr1 32825957 32825966 ZEB1 JASPAR yes 32829879 3913 27990964
chr1 32825986 32826001 MEF2A JASPAR yes 32829879 3878 27990965
chr1 32825987 32826002 MEF2C JASPAR yes 32829879 3877 27990966
chr1 32825988 32826000 MEF2A JASPAR yes 32829879 3879 27990967
chr1 32825988 32826000 MEF2B JASPAR yes 32829879 3879 27990968
chr1 32825988 32826000 MEF2D JASPAR yes 32829879 3879 27990969
chr1 32825990 32825994 YY1 TRANSFAC yes 32829879 3885 27990970
chr1 32826008 32826020 HLF JASPAR yes 32829879 3859 27990971
chr1 32826010 32826021 YY2 JASPAR yes 32829879 3858 27990972
chr1 32826011 32826023 YY1 JASPAR yes 32829879 3856 27990973
chr1 32826033 32826051 RARA JASPAR yes 32829879 3828 27990974
chr1 32826043 32826051 NR4A2 JASPAR yes 32829879 3828 27990975
SNPs associated with FAM229A[ENSG00000225828.1], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr1 33451806 rs77641871 G A 621927 Esophagus 0.0354005 221337
chr1 32824838 rs58508187 C T 2033 Heart 0.0354774 218142
chr1 32410643 rs7518297 T C 416228 Heart 0.0183495 215999
chr1 32398990 rs684475 C G 427881 Pancreas 0.128989 215921
chr1 32803797 rs72878759 G A 23074 Breast 0.0582757 217946
chr1 33813967 rs368589779 T C 984088 Ovary 0.466417 223476
chr1 32136537 rs58547340 A C,G 690334 Liver 0.206739 213987
chr1 32428975 rs6669579 A T 397896 Adrenal 0.133541 216186
Details of FAM229A[ENSG00000225828.1]
Back to top
Genomic Location chr1:32826871-32829879[-]
TSS 32829879
Gene Name FAM229A
Ensembl ID ENSG00000225828.1
ENTREZID 100128071
Uniprot
H3BQW9
Protein Name
Protein FAM229A
Expression levels of FAM229A[ENSG00000225828.1]
Back to top