EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. GCFC2[ENSG00000005436.9]
Enhancers that regulate GCFC2[ENSG00000005436.9]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr2 75813119 75843795 enh18695 75938115 94320
Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Kidney Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Prostate (RWPE1) Lung (PC-9) Astrocyte Brain (SK-N-MC) Brain (SK-N-SH) Bone (Osteoblast) Lung (A549) Placenta Muscle (Myoblast) Pancreas Muscle (Myotube) Epithelial (MCF-7)
chr2 75845145 75849807 enh33463 75938115 88308
Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Brain (SK-N-MC) Prostate (RWPE1) Astrocyte Lung (PC-9)
chr2 75857265 75864335 enh95565 75938115 73780
Ovary Thyroid Adrenal Lung (PC-9) Uterus
chr2 75894065 75894458 vista32119 75938115 43657
VISTA
chr2 75902525 75906715 enh99683 75938115 31400
Uterus Brain (SK-N-MC)
chr2 75903279 75903482 vista32120 75938115 34633
VISTA
chr2 75912574 75912759 vista32121 75938115 25356
VISTA
chr2 75931145 75935295 enh5662 75938115 2820
Blood (Karpas-422)
chr2 75955085 75959275 enh76304 75938115 16970
Muscle (A673) Brain (SK-N-MC)
chr2 75961405 75965555 enh112715 75938115 23290
Brain (SK-N-MC)
chr2 75987885 75994015 enh53162 75938115 49770
Large Intestine Stomach
chr2 75994329 75994557 vista32122 75938115 56214
VISTA
chr2 75998145 76002515 enh69757 75938115 60030
Neural Stem Cells (H9)
chr2 76012805 76019475 enh81724 75938115 74690
Prostate (PC-3)
chr2 76025085 76031215 enh76305 75938115 86970
Muscle (A673) Peripheral Blood (MM.1S)
chr2 76025760 76025894 vista32123 75938115 87645
VISTA
chr2 76033285 76040315 enh81725 75938115 95170
Prostate (PC-3) Epithelial (MCF-7)
Transcript facotrs that regulate GCFC2[ENSG00000005436.9]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr2 75933112 75933118 NFIC JASPAR yes 75938115 4997 75157135
chr2 75933115 75933127 INSM1 JASPAR yes 75938115 4988 75157136
chr2 75933115 75933129 RXRG JASPAR yes 75938115 4986 75157137
chr2 75933169 75933173 TEAD2 TRANSFAC yes 75938115 4942 75157138
chr2 75933169 75933174 TBP TRANSFAC yes 75938115 4941 75157139
chr2 75933169 75933175 TFIID TRANSFAC yes 75938115 4940 75157140
chr2 75933171 75933187 SOX4 JASPAR yes 75938115 4928 75157141
chr2 75933171 75933187 SOX8 JASPAR yes 75938115 4928 75157142
chr2 75933200 75933204 TEAD2 TRANSFAC yes 75938115 4911 75157143
chr2 75933207 75933224 RARA JASPAR yes 75938115 4891 75157144
chr2 75933217 75933238 IRF1 JASPAR yes 75938115 4877 75157145
chr2 75933219 75933230 FLI1 JASPAR yes 75938115 4885 75157146
chr2 75933220 75933231 ETV2 JASPAR yes 75938115 4884 75157147
chr2 75933220 75933232 ELF4 JASPAR yes 75938115 4883 75157148
chr2 75933220 75933233 ELF1 JASPAR yes 75938115 4882 75157149
chr2 75933220 75933234 SPI1 JASPAR yes 75938115 4881 75157150
chr2 75933220 75933234 SPIC JASPAR yes 75938115 4881 75157151
chr2 75933221 75933229 EHF JASPAR yes 75938115 4886 75157152
chr2 75933223 75933244 IRF1 JASPAR yes 75938115 4871 75157153
chr2 75933224 75933239 FOXP1 JASPAR yes 75938115 4876 75157154
chr2 75933225 75933236 FOXP2 JASPAR yes 75938115 4879 75157155
chr2 75933225 75933240 STAT2 JASPAR yes 75938115 4875 75157156
chr2 75933226 75933240 STAT1 JASPAR yes 75938115 4875 75157157
chr2 75933227 75933238 FOXA1 JASPAR yes 75938115 4877 75157158
chr2 75933229 75933244 FOXP1 JASPAR yes 75938115 4871 75157159
chr2 75933236 75933241 ETS2 TRANSFAC yes 75938115 4874 75157160
chr2 75933250 75933262 FOXI1 JASPAR yes 75938115 4853 75157161
chr2 75933269 75933284 MEF2A JASPAR yes 75938115 4831 75157162
chr2 75933270 75933285 MEF2C JASPAR yes 75938115 4830 75157163
chr2 75933271 75933283 MEF2A JASPAR yes 75938115 4832 75157164
chr2 75933271 75933283 MEF2B JASPAR yes 75938115 4832 75157165
chr2 75933271 75933283 MEF2D JASPAR yes 75938115 4832 75157166
chr2 75933272 75933282 MEF2A JASPAR yes 75938115 4833 75157167
chr2 75933273 75933277 YY1 TRANSFAC yes 75938115 4838 75157168
chr2 75933279 75933290 FLI1 JASPAR yes 75938115 4825 75157169
chr2 75933296 75933306 TEAD1 JASPAR yes 75938115 4809 75157170
chr2 75933372 75933386 PAX6 JASPAR yes 75938115 4729 75157171
chr2 75933374 75933385 DMRT3 JASPAR yes 75938115 4730 75157172
chr2 75933461 75933471 MEF2A JASPAR yes 75938115 4644 75157173
chr2 75933466 75933470 TEAD2 TRANSFAC yes 75938115 4645 75157174
chr2 75933472 75933476 NFE TRANSFAC yes 75938115 4639 75157175
chr2 75933495 75933506 CDX2 JASPAR yes 75938115 4609 75157176
chr2 75933496 75933507 HOXA10 JASPAR yes 75938115 4608 75157177
chr2 75933497 75933506 CDX1 JASPAR yes 75938115 4609 75157178
chr2 75933497 75933507 HOXA13 JASPAR yes 75938115 4608 75157179
chr2 75933497 75933507 HOXB13 JASPAR yes 75938115 4608 75157180
chr2 75933497 75933507 HOXC10 JASPAR yes 75938115 4608 75157181
chr2 75933497 75933507 HOXD13 JASPAR yes 75938115 4608 75157182
chr2 75933502 75933518 SOX8 JASPAR yes 75938115 4597 75157183
chr2 75933514 75933524 NFIA JASPAR yes 75938115 4591 75157184
chr2 75933515 75933524 NFIX JASPAR yes 75938115 4591 75157185
chr2 75933516 75933522 NFIC JASPAR yes 75938115 4593 75157186
chr2 75933516 75933530 TLX1 JASPAR yes 75938115 4585 75157187
chr2 75933517 75933531 TLX1 JASPAR yes 75938115 4584 75157188
chr2 75933529 75933545 POU4F2 JASPAR yes 75938115 4570 75157189
chr2 75933529 75933545 POU4F3 JASPAR yes 75938115 4570 75157190
chr2 75933535 75933539 YY1 TRANSFAC yes 75938115 4576 75157191
chr2 75933535 75933546 HOXC11 JASPAR yes 75938115 4569 75157192
chr2 75933536 75933546 EMX1 JASPAR yes 75938115 4569 75157193
chr2 75933536 75933546 MEOX2 JASPAR yes 75938115 4569 75157194
chr2 75933537 75933545 NKX6-1 JASPAR yes 75938115 4570 75157195
chr2 75933537 75933547 POU6F2 JASPAR yes 75938115 4568 75157196
chr2 75933538 75933556 RARA JASPAR yes 75938115 4559 75157197
chr2 75933540 75933554 RORA JASPAR yes 75938115 4561 75157198
chr2 75933541 75933551 RORA JASPAR yes 75938115 4564 75157199
chr2 75933558 75933574 SOX8 JASPAR yes 75938115 4541 75157200
chr2 75933569 75933583 ATF7 JASPAR yes 75938115 4532 75157201
chr2 75933569 75933583 BATF3 JASPAR yes 75938115 4532 75157202
chr2 75933570 75933582 DBP JASPAR yes 75938115 4533 75157203
chr2 75933570 75933582 HLF JASPAR yes 75938115 4533 75157204
chr2 75933570 75933582 JDP2 JASPAR yes 75938115 4533 75157205
chr2 75933570 75933585 JUND JASPAR yes 75938115 4530 75157206
chr2 75933576 75933584 NKX6-1 JASPAR yes 75938115 4531 75157207
chr2 75933576 75933586 HOXC10 JASPAR yes 75938115 4529 75157208
chr2 75933576 75933586 HOXD11 JASPAR yes 75938115 4529 75157209
chr2 75933578 75933582 YY1 TRANSFAC yes 75938115 4533 75157210
chr2 75933584 75933587 MYB TRANSFAC yes 75938115 4528 75157211
chr2 75933603 75933618 MEF2C JASPAR yes 75938115 4497 75157212
chr2 75933603 75933624 IRF1 JASPAR yes 75938115 4491 75157213
chr2 75933604 75933619 MEF2A JASPAR yes 75938115 4496 75157214
chr2 75933605 75933617 MEF2A JASPAR yes 75938115 4498 75157215
chr2 75933605 75933617 MEF2B JASPAR yes 75938115 4498 75157216
chr2 75933605 75933617 MEF2D JASPAR yes 75938115 4498 75157217
chr2 75933606 75933616 MEF2A JASPAR yes 75938115 4499 75157218
chr2 75933608 75933623 SOX21 JASPAR yes 75938115 4492 75157219
chr2 75933622 75933625 MYB TRANSFAC yes 75938115 4490 75157220
chr2 75933642 75933657 SCRT1 JASPAR yes 75938115 4458 75157221
chr2 75933644 75933647 MYB TRANSFAC yes 75938115 4468 75157222
chr2 75933644 75933657 SCRT2 JASPAR yes 75938115 4458 75157223
chr2 75933646 75933652 PTF TRANSFAC yes 75938115 4463 75157224
chr2 75933654 75933660 TCF4 TRANSFAC yes 75938115 4455 75157225
chr2 75933686 75933690 NFE TRANSFAC yes 75938115 4425 75157226
chr2 75933699 75933715 SOX8 JASPAR yes 75938115 4400 75157227
chr2 75933733 75933737 YY1 TRANSFAC yes 75938115 4378 75157228
chr2 75933738 75933743 GATA2 JASPAR yes 75938115 4372 75157229
chr2 75933778 75933781 MYB TRANSFAC yes 75938115 4334 75157230
chr2 75933786 75933790 YY1 TRANSFAC yes 75938115 4325 75157231
chr2 75933787 75933802 MEF2C JASPAR yes 75938115 4313 75157232
chr2 75933788 75933803 MEF2A JASPAR yes 75938115 4312 75157233
chr2 75933789 75933801 MEF2A JASPAR yes 75938115 4314 75157234
chr2 75933789 75933801 MEF2D JASPAR yes 75938115 4314 75157235
chr2 75933816 75933831 SOX21 JASPAR yes 75938115 4284 75157236
chr2 75933816 75933832 SOX4 JASPAR yes 75938115 4283 75157237
chr2 75933818 75933829 DUX4 JASPAR yes 75938115 4286 75157238
chr2 75933818 75933829 PHOX2A JASPAR yes 75938115 4286 75157239
chr2 75933818 75933829 PROP1 JASPAR yes 75938115 4286 75157240
chr2 75933821 75933835 POU4F1 JASPAR yes 75938115 4280 75157241
chr2 75933821 75933837 POU4F2 JASPAR yes 75938115 4278 75157242
chr2 75933821 75933837 POU4F3 JASPAR yes 75938115 4278 75157243
chr2 75933822 75933838 POU4F3 JASPAR yes 75938115 4277 75157244
chr2 75933824 75933838 POU4F1 JASPAR yes 75938115 4277 75157245
chr2 75933824 75933839 HNF1A JASPAR yes 75938115 4276 75157246
chr2 75933829 75933837 ISX JASPAR yes 75938115 4278 75157247
chr2 75933829 75933837 LHX9 JASPAR yes 75938115 4278 75157248
chr2 75933829 75933837 LMX1B JASPAR yes 75938115 4278 75157249
chr2 75933829 75933837 PRRX1 JASPAR yes 75938115 4278 75157250
chr2 75933829 75933837 RAX2 JASPAR yes 75938115 4278 75157251
chr2 75933829 75933837 SHOX JASPAR yes 75938115 4278 75157252
chr2 75933829 75933837 UNCX JASPAR yes 75938115 4278 75157253
chr2 75933832 75933837 MYB TRANSFAC yes 75938115 4278 75157254
chr2 75933847 75933857 NEUROG2 JASPAR yes 75938115 4258 75157255
chr2 75933853 75933865 BHLHE23 JASPAR yes 75938115 4250 75157256
chr2 75933858 75933866 FOXL1 JASPAR yes 75938115 4249 75157257
chr2 75933862 75933866 TEAD2 TRANSFAC yes 75938115 4249 75157258
chr2 75933875 75933885 GSC2 JASPAR yes 75938115 4230 75157259
chr2 75933876 75933884 OTX1 JASPAR yes 75938115 4231 75157260
chr2 75933876 75933884 OTX2 JASPAR yes 75938115 4231 75157261
chr2 75933900 75933908 FOXL1 JASPAR yes 75938115 4207 75157262
chr2 75933904 75933918 ONECUT1 JASPAR yes 75938115 4197 75157263
chr2 75933904 75933918 ONECUT2 JASPAR yes 75938115 4197 75157264
chr2 75933904 75933918 ONECUT3 JASPAR yes 75938115 4197 75157265
chr2 75933905 75933916 FOXC1 JASPAR yes 75938115 4199 75157266
chr2 75933920 75933935 PRDM1 JASPAR yes 75938115 4180 75157267
chr2 75933960 75933966 SOX10 JASPAR yes 75938115 4149 75157268
chr2 75933970 75933974 YY1 TRANSFAC yes 75938115 4141 75157269
chr2 75933988 75934003 MEF2A JASPAR yes 75938115 4112 75157270
chr2 75933989 75934001 MEF2A JASPAR yes 75938115 4114 75157271
chr2 75933989 75934001 MEF2B JASPAR yes 75938115 4114 75157272
chr2 75933989 75934001 MEF2D JASPAR yes 75938115 4114 75157273
chr2 75933990 75934000 MEF2A JASPAR yes 75938115 4115 75157274
chr2 75933999 75934003 YY1 TRANSFAC yes 75938115 4112 75157275
chr2 75934015 75934036 ZNF263 JASPAR yes 75938115 4079 75157276
chr2 75934016 75934037 IRF1 JASPAR yes 75938115 4078 75157277
chr2 75934020 75934034 SPI1 JASPAR yes 75938115 4081 75157278
chr2 75934020 75934034 SPIC JASPAR yes 75938115 4081 75157279
chr2 75934026 75934031 ETS2 TRANSFAC yes 75938115 4084 75157280
chr2 75934028 75934049 ZNF263 JASPAR yes 75938115 4066 75157281
chr2 75934036 75934040 YY1 TRANSFAC yes 75938115 4075 75157282
chr2 75934038 75934053 FOXP1 JASPAR yes 75938115 4062 75157283
chr2 75934038 75934059 IRF1 JASPAR yes 75938115 4056 75157284
chr2 75934042 75934057 PRDM1 JASPAR yes 75938115 4058 75157285
chr2 75934042 75934057 STAT2 JASPAR yes 75938115 4058 75157286
chr2 75934057 75934071 SPI1 JASPAR yes 75938115 4044 75157287
chr2 75934057 75934071 SPIC JASPAR yes 75938115 4044 75157288
chr2 75934072 75934076 YY1 TRANSFAC yes 75938115 4039 75157289
chr2 75934097 75934104 POU2F1 TRANSFAC yes 75938115 4011 75157290
chr2 75934109 75934123 POU4F1 JASPAR yes 75938115 3992 75157291
chr2 75934109 75934125 POU4F2 JASPAR yes 75938115 3990 75157292
chr2 75934109 75934125 POU4F3 JASPAR yes 75938115 3990 75157293
chr2 75934109 75934125 SOX8 JASPAR yes 75938115 3990 75157294
chr2 75934114 75934118 YY1 TRANSFAC yes 75938115 3997 75157295
chr2 75934139 75934155 SOX8 JASPAR yes 75938115 3960 75157296
chr2 75934145 75934157 GRHL1 JASPAR yes 75938115 3958 75157297
chr2 75934148 75934154 PTF TRANSFAC yes 75938115 3961 75157298
chr2 75934150 75934163 POU2F2 JASPAR yes 75938115 3952 75157299
chr2 75934156 75934172 POU4F3 JASPAR yes 75938115 3943 75157300
chr2 75934158 75934169 NFE2 JASPAR yes 75938115 3946 75157301
chr2 75934158 75934172 POU4F1 JASPAR yes 75938115 3943 75157302
chr2 75934159 75934168 JDP2 JASPAR yes 75938115 3947 75157303
chr2 75934165 75934169 YY1 TRANSFAC yes 75938115 3946 75157304
chr2 75934184 75934188 TEAD2 TRANSFAC yes 75938115 3927 75157305
chr2 75934184 75934189 TBP TRANSFAC yes 75938115 3926 75157306
chr2 75934198 75934216 MAFF JASPAR yes 75938115 3899 75157307
chr2 75934216 75934237 ZNF263 JASPAR yes 75938115 3878 75157308
chr2 75934228 75934233 GATA2 JASPAR yes 75938115 3882 75157309
chr2 75934247 75934251 LFA1 TRANSFAC yes 75938115 3864 75157310
chr2 75934265 75934273 MEIS2 JASPAR yes 75938115 3842 75157311
chr2 75934265 75934273 MEIS3 JASPAR yes 75938115 3842 75157312
chr2 75934266 75934270 NFE TRANSFAC yes 75938115 3845 75157313
chr2 75934266 75934273 MEIS1 JASPAR yes 75938115 3842 75157314
chr2 75934273 75934282 PITX3 JASPAR yes 75938115 3833 75157315
chr2 75934273 75934283 GSC2 JASPAR yes 75938115 3832 75157316
chr2 75934273 75934283 GSC JASPAR yes 75938115 3832 75157317
chr2 75934274 75934282 OTX1 JASPAR yes 75938115 3833 75157318
chr2 75934304 75934314 MEF2A JASPAR yes 75938115 3801 75157319
chr2 75934321 75934325 YY1 TRANSFAC yes 75938115 3790 75157320
chr2 75934351 75934354 MYB TRANSFAC yes 75938115 3761 75157321
chr2 75934364 75934368 ESR1 TRANSFAC yes 75938115 3747 75157322
chr2 75934366 75934378 HNF1B JASPAR yes 75938115 3737 75157323
chr2 75934381 75934393 YY1 JASPAR yes 75938115 3722 75157324
chr2 75934382 75934386 H4TF2 TRANSFAC yes 75938115 3729 75157325
chr2 75934393 75934407 PAX6 JASPAR yes 75938115 3708 75157326
chr2 75934407 75934412 ETS2 TRANSFAC yes 75938115 3703 75157327
chr2 75934408 75934422 FOXF2 JASPAR yes 75938115 3693 75157328
chr2 75934426 75934439 DUXA JASPAR yes 75938115 3676 75157329
chr2 75934427 75934438 DUX4 JASPAR yes 75938115 3677 75157330
chr2 75934427 75934438 PHOX2A JASPAR yes 75938115 3677 75157331
chr2 75934427 75934438 PROP1 JASPAR yes 75938115 3677 75157332
chr2 75934431 75934439 ISX JASPAR yes 75938115 3676 75157333
chr2 75934431 75934439 LHX9 JASPAR yes 75938115 3676 75157334
chr2 75934431 75934439 LMX1B JASPAR yes 75938115 3676 75157335
chr2 75934431 75934439 PRRX1 JASPAR yes 75938115 3676 75157336
chr2 75934431 75934439 RAX2 JASPAR yes 75938115 3676 75157337
chr2 75934431 75934439 SHOX JASPAR yes 75938115 3676 75157338
chr2 75934431 75934439 UNCX JASPAR yes 75938115 3676 75157339
chr2 75934443 75934452 SRY JASPAR yes 75938115 3663 75157340
chr2 75934447 75934453 SOX10 JASPAR yes 75938115 3662 75157341
chr2 75934449 75934463 GATA2 JASPAR yes 75938115 3652 75157342
chr2 75934451 75934458 GATA3 TRANSFAC yes 75938115 3657 75157343
chr2 75934451 75934459 GATA5 JASPAR yes 75938115 3656 75157344
chr2 75934454 75934457 MYB TRANSFAC yes 75938115 3658 75157345
chr2 75934462 75934470 GATA3 JASPAR yes 75938115 3645 75157346
chr2 75934490 75934495 MYB TRANSFAC yes 75938115 3620 75157347
chr2 75934507 75934512 ETS2 TRANSFAC yes 75938115 3603 75157348
chr2 75934520 75934524 YY1 TRANSFAC yes 75938115 3591 75157349
chr2 75934537 75934542 H4TF1 TRANSFAC yes 75938115 3573 75157350
chr2 75934537 75934548 CEBPB JASPAR yes 75938115 3567 75157351
chr2 75934538 75934549 CEBPA JASPAR yes 75938115 3566 75157352
chr2 75934542 75934551 PITX3 JASPAR yes 75938115 3564 75157353
chr2 75934542 75934552 GSC2 JASPAR yes 75938115 3563 75157354
chr2 75934542 75934552 GSC JASPAR yes 75938115 3563 75157355
chr2 75934542 75934553 FOXH1 JASPAR yes 75938115 3562 75157356
chr2 75934543 75934551 RHOXF1 JASPAR yes 75938115 3564 75157357
chr2 75934546 75934552 ZNF354C JASPAR yes 75938115 3563 75157358
chr2 75934565 75934576 HOXC13 JASPAR yes 75938115 3539 75157359
chr2 75934567 75934578 BATF JASPAR yes 75938115 3537 75157360
chr2 75934569 75934580 FOS JASPAR yes 75938115 3535 75157361
chr2 75934569 75934580 JUND JASPAR yes 75938115 3535 75157362
chr2 75934571 75934577 JUN TRANSFAC yes 75938115 3538 75157363
chr2 75934575 75934578 MYB TRANSFAC yes 75938115 3537 75157364
chr2 75934575 75934589 NR2F1 JASPAR yes 75938115 3526 75157365
chr2 75934598 75934613 HNF1A JASPAR yes 75938115 3502 75157366
chr2 75934601 75934611 POU6F2 JASPAR yes 75938115 3504 75157367
chr2 75934602 75934612 GSX1 JASPAR yes 75938115 3503 75157368
chr2 75934602 75934612 GSX2 JASPAR yes 75938115 3503 75157369
chr2 75934602 75934612 HOXB3 JASPAR yes 75938115 3503 75157370
chr2 75934602 75934612 POU6F1 JASPAR yes 75938115 3503 75157371
chr2 75934603 75934611 NKX6-1 JASPAR yes 75938115 3504 75157372
chr2 75934603 75934611 NKX6-2 JASPAR yes 75938115 3504 75157373
chr2 75934605 75934609 YY1 TRANSFAC yes 75938115 3506 75157374
chr2 75934607 75934620 POU3F3 JASPAR yes 75938115 3495 75157375
chr2 75934610 75934624 IRF7 JASPAR yes 75938115 3491 75157376
chr2 75934634 75934648 RORA JASPAR yes 75938115 3467 75157377
chr2 75934645 75934659 TCF7L2 JASPAR yes 75938115 3456 75157378
chr2 75934645 75934663 SRF JASPAR yes 75938115 3452 75157379
chr2 75934665 75934679 ONECUT2 JASPAR yes 75938115 3436 75157380
chr2 75934665 75934679 ONECUT3 JASPAR yes 75938115 3436 75157381
chr2 75934687 75934693 TBP TRANSFAC yes 75938115 3422 75157382
chr2 75934688 75934699 FOXC1 JASPAR yes 75938115 3416 75157383
chr2 75934723 75934734 FOXC1 JASPAR yes 75938115 3381 75157384
chr2 75934730 75934734 YY1 TRANSFAC yes 75938115 3381 75157385
chr2 75934730 75934740 HOXC10 JASPAR yes 75938115 3375 75157386
chr2 75934730 75934741 HOXC11 JASPAR yes 75938115 3374 75157387
chr2 75934731 75934740 CDX1 JASPAR yes 75938115 3375 75157388
chr2 75934743 75934752 ZEB1 JASPAR yes 75938115 3363 75157389
chr2 75934747 75934753 PTF TRANSFAC yes 75938115 3362 75157390
chr2 75934750 75934758 FOXO3 JASPAR yes 75938115 3357 75157391
chr2 75934759 75934770 FOXH1 JASPAR yes 75938115 3345 75157392
chr2 75934760 75934766 ZNF354C JASPAR yes 75938115 3349 75157393
chr2 75934760 75934770 GSC JASPAR yes 75938115 3345 75157394
chr2 75934761 75934769 RHOXF1 JASPAR yes 75938115 3346 75157395
chr2 75934761 75934770 PITX3 JASPAR yes 75938115 3345 75157396
chr2 75934766 75934769 MYB TRANSFAC yes 75938115 3346 75157397
chr2 75934771 75934787 GLIS1 JASPAR yes 75938115 3328 75157398
chr2 75934786 75934800 PAX6 JASPAR yes 75938115 3315 75157399
chr2 75934805 75934816 EBF1 JASPAR yes 75938115 3299 75157400
chr2 75934811 75934829 ESR1 JASPAR yes 75938115 3286 75157401
chr2 75934813 75934817 H4TF2 TRANSFAC yes 75938115 3298 75157402
chr2 75934837 75934858 IRF1 JASPAR yes 75938115 3257 75157403
chr2 75934841 75934856 STAT2 JASPAR yes 75938115 3259 75157404
chr2 75934842 75934854 IRF1 JASPAR yes 75938115 3261 75157405
chr2 75934870 75934873 MYB TRANSFAC yes 75938115 3242 75157406
chr2 75934878 75934882 YY1 TRANSFAC yes 75938115 3233 75157407
chr2 75934884 75934899 FOXP1 JASPAR yes 75938115 3216 75157408
chr2 75934894 75934906 FOXC2 JASPAR yes 75938115 3209 75157409
chr2 75934895 75934906 FOXB1 JASPAR yes 75938115 3209 75157410
chr2 75934895 75934906 FOXC1 JASPAR yes 75938115 3209 75157411
chr2 75934898 75934913 FOXA1 JASPAR yes 75938115 3202 75157412
chr2 75934898 75934913 MEF2A JASPAR yes 75938115 3202 75157413
chr2 75934899 75934911 FOXI1 JASPAR yes 75938115 3204 75157414
chr2 75934900 75934912 FOXC2 JASPAR yes 75938115 3203 75157415
chr2 75934900 75934912 MEF2A JASPAR yes 75938115 3203 75157416
chr2 75934901 75934912 FOXB1 JASPAR yes 75938115 3203 75157417
chr2 75934901 75934912 FOXC1 JASPAR yes 75938115 3203 75157418
chr2 75934901 75934914 POU3F3 JASPAR yes 75938115 3201 75157419
chr2 75934902 75934906 YY1 TRANSFAC yes 75938115 3209 75157420
chr2 75934905 75934916 NFIL3 JASPAR yes 75938115 3199 75157421
chr2 75934908 75934912 TEAD2 TRANSFAC yes 75938115 3203 75157422
chr2 75934909 75934919 POU6F2 JASPAR yes 75938115 3196 75157423
chr2 75934919 75934938 PAX5 JASPAR yes 75938115 3177 75157424
chr2 75934927 75934937 MZF1 JASPAR yes 75938115 3178 75157425
chr2 75934948 75934958 NFIA JASPAR yes 75938115 3157 75157426
chr2 75934949 75934958 NFIX JASPAR yes 75938115 3157 75157427
chr2 75934950 75934956 NFIC JASPAR yes 75938115 3159 75157428
chr2 75934955 75934968 DUXA JASPAR yes 75938115 3147 75157429
chr2 75934956 75934967 BATF JASPAR yes 75938115 3148 75157430
chr2 75934956 75934967 DUX4 JASPAR yes 75938115 3148 75157431
chr2 75934960 75934966 JUN TRANSFAC yes 75938115 3149 75157432
chr2 75934961 75934971 PAX3 JASPAR yes 75938115 3144 75157433
chr2 75934961 75934971 PAX7 JASPAR yes 75938115 3144 75157434
chr2 75934987 75934991 YY1 TRANSFAC yes 75938115 3124 75157435
chr2 75934992 75934997 ETS2 TRANSFAC yes 75938115 3118 75157436
chr2 75934996 75935003 JUN TRANSFAC yes 75938115 3112 75157437
chr2 75935020 75935025 MYC TRANSFAC yes 75938115 3090 75157438
chr2 75935032 75935045 DUXA JASPAR yes 75938115 3070 75157439
chr2 75935032 75935046 RORA JASPAR yes 75938115 3069 75157440
chr2 75935033 75935044 PHOX2A JASPAR yes 75938115 3071 75157441
chr2 75935035 75935045 POU6F2 JASPAR yes 75938115 3070 75157442
chr2 75935036 75935046 ALX3 JASPAR yes 75938115 3069 75157443
chr2 75935036 75935046 EMX2 JASPAR yes 75938115 3069 75157444
chr2 75935036 75935046 ESX1 JASPAR yes 75938115 3069 75157445
chr2 75935036 75935046 GBX2 JASPAR yes 75938115 3069 75157446
chr2 75935036 75935046 GSX1 JASPAR yes 75938115 3069 75157447
chr2 75935036 75935046 GSX2 JASPAR yes 75938115 3069 75157448
chr2 75935036 75935046 HESX1 JASPAR yes 75938115 3069 75157449
chr2 75935036 75935046 HOXB2 JASPAR yes 75938115 3069 75157450
chr2 75935036 75935046 HOXB3 JASPAR yes 75938115 3069 75157451
chr2 75935036 75935046 LBX2 JASPAR yes 75938115 3069 75157452
chr2 75935036 75935046 LHX2 JASPAR yes 75938115 3069 75157453
chr2 75935036 75935046 LHX6 JASPAR yes 75938115 3069 75157454
chr2 75935036 75935046 MEOX1 JASPAR yes 75938115 3069 75157455
chr2 75935036 75935046 MEOX2 JASPAR yes 75938115 3069 75157456
chr2 75935036 75935046 MIXL1 JASPAR yes 75938115 3069 75157457
chr2 75935036 75935046 MNX1 JASPAR yes 75938115 3069 75157458
chr2 75935036 75935046 NOTO JASPAR yes 75938115 3069 75157459
chr2 75935036 75935046 POU6F1 JASPAR yes 75938115 3069 75157460
chr2 75935036 75935046 RAX JASPAR yes 75938115 3069 75157461
chr2 75935036 75935047 HOXA10 JASPAR yes 75938115 3068 75157462
chr2 75935037 75935045 BSX JASPAR yes 75938115 3070 75157463
chr2 75935037 75935045 DLX6 JASPAR yes 75938115 3070 75157464
chr2 75935037 75935045 EN1 JASPAR yes 75938115 3070 75157465
chr2 75935037 75935045 ISX JASPAR yes 75938115 3070 75157466
chr2 75935037 75935045 LBX1 JASPAR yes 75938115 3070 75157467
chr2 75935037 75935045 LHX9 JASPAR yes 75938115 3070 75157468
chr2 75935037 75935045 LMX1A JASPAR yes 75938115 3070 75157469
chr2 75935037 75935045 LMX1B JASPAR yes 75938115 3070 75157470
chr2 75935037 75935045 NKX6-1 JASPAR yes 75938115 3070 75157471
chr2 75935037 75935045 NKX6-2 JASPAR yes 75938115 3070 75157472
chr2 75935037 75935045 PAX4 JASPAR yes 75938115 3070 75157473
chr2 75935037 75935045 PDX1 JASPAR yes 75938115 3070 75157474
chr2 75935037 75935045 PRRX1 JASPAR yes 75938115 3070 75157475
chr2 75935037 75935045 RAX2 JASPAR yes 75938115 3070 75157476
chr2 75935037 75935045 SHOX JASPAR yes 75938115 3070 75157477
chr2 75935037 75935045 UNCX JASPAR yes 75938115 3070 75157478
chr2 75935037 75935045 VAX1 JASPAR yes 75938115 3070 75157479
chr2 75935037 75935045 VAX2 JASPAR yes 75938115 3070 75157480
chr2 75935037 75935045 VSX1 JASPAR yes 75938115 3070 75157481
chr2 75935037 75935045 VSX2 JASPAR yes 75938115 3070 75157482
chr2 75935037 75935047 HOXB13 JASPAR yes 75938115 3068 75157483
chr2 75935037 75935047 HOXD13 JASPAR yes 75938115 3068 75157484
chr2 75935042 75935048 TBP TRANSFAC yes 75938115 3067 75157485
chr2 75935048 75935057 SRY JASPAR yes 75938115 3058 75157486
chr2 75935052 75935063 PROP1 JASPAR yes 75938115 3052 75157487
chr2 75935053 75935057 YY1 TRANSFAC yes 75938115 3058 75157488
chr2 75935054 75935064 HOXD13 JASPAR yes 75938115 3051 75157489
chr2 75935054 75935065 HOXA10 JASPAR yes 75938115 3050 75157490
chr2 75935057 75935068 PHOX2A JASPAR yes 75938115 3047 75157491
chr2 75935057 75935068 PROP1 JASPAR yes 75938115 3047 75157492
chr2 75935061 75935075 RXRB JASPAR yes 75938115 3040 75157493
chr2 75935061 75935075 RXRG JASPAR yes 75938115 3040 75157494
chr2 75935061 75935076 NR2C2 JASPAR yes 75938115 3039 75157495
chr2 75935064 75935077 NR2F1 JASPAR yes 75938115 3038 75157496
chr2 75935068 75935082 NR2F1 JASPAR yes 75938115 3033 75157497
chr2 75935074 75935089 FOXA1 JASPAR yes 75938115 3026 75157498
chr2 75935077 75935090 ZBTB18 JASPAR yes 75938115 3025 75157499
chr2 75935079 75935089 CLOCK JASPAR yes 75938115 3026 75157500
chr2 75935096 75935102 SOX10 JASPAR yes 75938115 3013 75157501
chr2 75935104 75935116 IRF1 JASPAR yes 75938115 2999 75157502
chr2 75935104 75935119 LEF1 JASPAR yes 75938115 2996 75157503
chr2 75935108 75935116 LEF1 TRANSFAC yes 75938115 2999 75157504
chr2 75935162 75935167 ETS2 TRANSFAC yes 75938115 2948 75157505
chr2 75935171 75935175 YY1 TRANSFAC yes 75938115 2940 75157506
chr2 75935226 75935230 YY1 TRANSFAC yes 75938115 2885 75157507
chr2 75935230 75935244 TCF7L2 JASPAR yes 75938115 2871 75157508
chr2 75935237 75935251 JUN JASPAR yes 75938115 2864 75157509
chr2 75935239 75935250 BATF JASPAR yes 75938115 2865 75157510
chr2 75935240 75935251 FOSL2 JASPAR yes 75938115 2864 75157511
chr2 75935240 75935251 JUNB JASPAR yes 75938115 2864 75157512
chr2 75935241 75935252 FOS JASPAR yes 75938115 2863 75157513
chr2 75935247 75935250 MYB TRANSFAC yes 75938115 2865 75157514
chr2 75935251 75935261 PAX3 JASPAR yes 75938115 2854 75157515
chr2 75935251 75935261 PAX7 JASPAR yes 75938115 2854 75157516
chr2 75935253 75935262 VENTX JASPAR yes 75938115 2853 75157517
chr2 75935268 75935282 TLX1 JASPAR yes 75938115 2833 75157518
chr2 75935272 75935276 NFE TRANSFAC yes 75938115 2839 75157519
chr2 75935272 75935277 GATA1 TRANSFAC yes 75938115 2838 75157520
chr2 75935272 75935278 GATA3 JASPAR yes 75938115 2837 75157521
chr2 75935284 75935288 YY1 TRANSFAC yes 75938115 2827 75157522
SNPs associated with GCFC2[ENSG00000005436.9], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr2 75932846 rs6709041 C T 0 Esophagus 6.45583e-05 5859293
chr2 75809316 rs4444559 T C 69810 Spleen 0.208654 5858578
chr2 76851210 rs71420930 T C 913095 Uterus 0.389683 5861616
chr2 75904610 rs11884647 G A 0 Thyroid 0.00388014 5859238
chr2 75903170 rs7590218 A G 0 Adrenal 1.85865e-09 5859222
Details of GCFC2[ENSG00000005436.9]
Back to top
Genomic Location chr2:75879126-75938115[-]
TSS 75938115
Gene Name GCFC2
Ensembl ID ENSG00000005436.9
ENTREZID 6936
Uniprot
Q9BVX3
P16383
B3KUM5
A4UHR0
Protein Name
GC-rich sequence DNA-binding factor 2
Expression levels of GCFC2[ENSG00000005436.9]
Back to top