EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. PHTF2[ENSG00000006576.12]
Enhancers that regulate PHTF2[ENSG00000006576.12]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr7 77331125 77335275 enh93613 77428122 92847
Liver (HepG2)
chr7 77342265 77346415 enh86678 77428122 81707
Colon (HCT116) Liver (HepG2) Lung (PC-9)
chr7 77344619 77344946 vista56362 77428122 83176
VISTA
chr7 77348120 77352470 enh59787 77428122 75652
Skin (Keratinocyte) Prostate (RWPE1)
chr7 77354985 77360602 enh24280 77428122 67520
Bone Marrow (K562) Skin (Keratinocyte) Liver (HepG2) Cervix (HeLa-S3) Brain (SK-N-SH) Prostate (RWPE1) Blood (T-cell) Esophagus Stomach Placenta Uterus Pancreas Neural Stem Cells (H9) Thymus Epithelial (MCF-7)
chr7 77365845 77371795 enh24281 77428122 56327
Cervix (HeLa-S3) Liver (HepG2) Placenta Lung (PC-9) Epithelial (MCF-7)
chr7 77373845 77378715 enh93614 77428122 49407
Liver (HepG2)
chr7 77380565 77384715 enh84667 77428122 43407
Prostate (PC-3)
chr7 77386725 77392775 enh9874 77428122 35347
Blood (Karpas-422)
chr7 77418425 77422955 enh98024 77428122 5167
Stomach Epithelial (MCF-7)
chr7 77428722 77429286 vista56363 77428122 600
VISTA
chr7 77439285 77443966 enh40284 77428122 11163
Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Astrocyte Bone (Osteoblast) Lung (PC-9) Epithelial (MCF-7)
chr7 77449245 77455880 enh9875 77428122 21123
Blood (OCI-LY7) Bone Marrow (K562) Peripheral Blood (MM.1S) Blood (Karpas-422)
chr7 77458405 77469515 enh9876 77428122 30283
Bone Marrow (K562) Skin (Keratinocyte) Cervix (HeLa-S3) Epithelial (MCF-7) Prostate (RWPE1) Esophagus Blood (OCI-LY7) Placenta Colon (HCT116) Blood (Karpas-422) Lung (PC-9) Pancreas (Panc1) Blood (T-cell) Heart
chr7 77473945 77478095 enh91784 77428122 45823
Bone Marrow (K562)
chr7 77486690 77490990 enh9877 77428122 58568
Blood (OCI-LY7) Blood (Karpas-422)
chr7 77494096 77499135 enh9878 77428122 65974
Skin (Keratinocyte) Liver (HepG2) Brain (SK-N-MC) Large Intestine Astrocyte Lung (A549) Placenta Blood (Karpas-422) Lung (PC-9)
chr7 77500785 77504990 enh91785 77428122 72663
Bone Marrow (K562)
chr7 77515005 77519155 enh40285 77428122 86883
Astrocyte
Transcript facotrs that regulate PHTF2[ENSG00000006576.12]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr7 77428734 77428755 ZNF263 JASPAR yes 77428122 612 26086324
chr7 77428744 77428759 ZIC3 JASPAR yes 77428122 622 26086325
chr7 77428748 77428754 MAZ TRANSFAC yes 77428122 626 26086326
chr7 77428752 77428759 SP1 TRANSFAC yes 77428122 630 26086327
chr7 77428752 77428762 SP1 JASPAR yes 77428122 630 26086328
chr7 77428753 77428763 SP1 TRANSFAC yes 77428122 631 26086329
chr7 77428754 77428759 SP1 TRANSFAC yes 77428122 632 26086330
chr7 77428762 77428773 E2F1 JASPAR yes 77428122 640 26086331
chr7 77428768 77428783 ZIC3 JASPAR yes 77428122 646 26086332
chr7 77428773 77428794 ZNF263 JASPAR yes 77428122 651 26086333
chr7 77428797 77428806 SP1 TRANSFAC yes 77428122 675 26086334
chr7 77428798 77428808 SP1 JASPAR yes 77428122 676 26086335
chr7 77428800 77428806 NFE2 TRANSFAC yes 77428122 678 26086336
chr7 77428815 77428820 SP1 TRANSFAC yes 77428122 693 26086337
chr7 77428857 77428868 TFAP2C JASPAR yes 77428122 735 26086338
chr7 77428868 77428882 PLAG1 JASPAR yes 77428122 746 26086339
chr7 77428879 77428884 GATA2 JASPAR yes 77428122 757 26086340
chr7 77428893 77428901 FOXO3 JASPAR yes 77428122 771 26086341
chr7 77428894 77428903 SRY JASPAR yes 77428122 772 26086342
chr7 77428920 77428934 SPI1 JASPAR yes 77428122 798 26086343
chr7 77428931 77428946 MEF2A JASPAR yes 77428122 809 26086344
chr7 77428932 77428947 MEF2C JASPAR yes 77428122 810 26086345
chr7 77428933 77428945 MEF2A JASPAR yes 77428122 811 26086346
chr7 77428934 77428944 MEF2A JASPAR yes 77428122 812 26086347
chr7 77428934 77428948 GATA2 JASPAR yes 77428122 812 26086348
chr7 77428935 77428939 YY1 TRANSFAC yes 77428122 813 26086349
chr7 77428938 77428946 GATA3 JASPAR yes 77428122 816 26086350
chr7 77428954 77428961 MEIS1 JASPAR yes 77428122 832 26086351
chr7 77428954 77428962 MEIS2 JASPAR yes 77428122 832 26086352
chr7 77428954 77428962 MEIS3 JASPAR yes 77428122 832 26086353
chr7 77428996 77429014 MAFF JASPAR yes 77428122 874 26086354
chr7 77428997 77429012 MAFK JASPAR yes 77428122 875 26086355
chr7 77428998 77429001 MYB TRANSFAC yes 77428122 876 26086356
chr7 77429013 77429021 NF-IL6 TRANSFAC yes 77428122 891 26086357
chr7 77429018 77429021 MYB TRANSFAC yes 77428122 896 26086358
chr7 77429026 77429034 RHOXF1 JASPAR yes 77428122 904 26086359
chr7 77429035 77429039 NFE TRANSFAC yes 77428122 913 26086360
chr7 77429046 77429050 NFE TRANSFAC yes 77428122 924 26086361
chr7 77429055 77429070 MEF2A JASPAR yes 77428122 933 26086362
chr7 77429056 77429071 MEF2C JASPAR yes 77428122 934 26086363
chr7 77429057 77429069 MEF2A JASPAR yes 77428122 935 26086364
chr7 77429057 77429069 MEF2B JASPAR yes 77428122 935 26086365
chr7 77429057 77429069 MEF2D JASPAR yes 77428122 935 26086366
chr7 77429058 77429068 MEF2A JASPAR yes 77428122 936 26086367
chr7 77429059 77429063 YY1 TRANSFAC yes 77428122 937 26086368
chr7 77429080 77429085 ETS2 TRANSFAC yes 77428122 958 26086369
chr7 77429097 77429100 MYB TRANSFAC yes 77428122 975 26086370
chr7 77429103 77429107 LFA1 TRANSFAC yes 77428122 981 26086371
chr7 77429134 77429149 AR JASPAR yes 77428122 1012 26086372
chr7 77429136 77429151 FOXA1 JASPAR yes 77428122 1014 26086373
chr7 77429151 77429160 NFIX JASPAR yes 77428122 1029 26086374
chr7 77429151 77429161 NFIA JASPAR yes 77428122 1029 26086375
chr7 77429153 77429159 NFIC JASPAR yes 77428122 1031 26086376
chr7 77429161 77429172 CEBPA JASPAR yes 77428122 1039 26086377
chr7 77429162 77429173 CEBPB JASPAR yes 77428122 1040 26086378
chr7 77429177 77429191 POU4F1 JASPAR yes 77428122 1055 26086379
chr7 77429177 77429193 POU4F2 JASPAR yes 77428122 1055 26086380
chr7 77429177 77429193 POU4F3 JASPAR yes 77428122 1055 26086381
chr7 77429189 77429193 YY1 TRANSFAC yes 77428122 1067 26086382
chr7 77429198 77429212 IRF8 JASPAR yes 77428122 1076 26086383
chr7 77429198 77429213 IRF9 JASPAR yes 77428122 1076 26086384
chr7 77429206 77429221 PRDM1 JASPAR yes 77428122 1084 26086385
chr7 77429213 77429219 LEF1 TRANSFAC yes 77428122 1091 26086386
chr7 77429213 77429219 SOX10 JASPAR yes 77428122 1091 26086387
chr7 77429227 77429232 GATA2 JASPAR yes 77428122 1105 26086388
chr7 77429254 77429263 ZEB1 JASPAR yes 77428122 1132 26086389
chr7 77429254 77429264 TBX21 JASPAR yes 77428122 1132 26086390
chr7 77429254 77429265 TBX2 JASPAR yes 77428122 1132 26086391
chr7 77429254 77429267 EOMES JASPAR yes 77428122 1132 26086392
chr7 77429255 77429263 MGA JASPAR yes 77428122 1133 26086393
chr7 77429255 77429263 TBX15 JASPAR yes 77428122 1133 26086394
chr7 77429255 77429263 TBX1 JASPAR yes 77428122 1133 26086395
chr7 77429255 77429263 TBX4 JASPAR yes 77428122 1133 26086396
chr7 77429255 77429263 TBX5 JASPAR yes 77428122 1133 26086397
chr7 77429255 77429265 TBR1 JASPAR yes 77428122 1133 26086398
chr7 77429261 77429276 LEF1 JASPAR yes 77428122 1139 26086399
SNPs associated with PHTF2[ENSG00000006576.12], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr7 77722039 rs117107737 G A 135221 Esophagus 0.0159797 9906484
chr7 77056056 rs150691614 G A 372066 Esophagus 0.230765 9903103
chr7 77116952 rs78080452 C T 311170 Esophagus 0.340898 9903701
chr7 77635119 rs7805185 A C,G 48301 Liver 0.264393 9906126
Details of PHTF2[ENSG00000006576.12]
Back to top
Genomic Location chr7:77428122-77586818[+]
TSS 77428122
Gene Name PHTF2
Ensembl ID ENSG00000006576.12
ENTREZID 57157
Uniprot
Q8N3S3
Protein Name
PHTF2 protein
Putative homeodomain transcription factor 2
Expression levels of PHTF2[ENSG00000006576.12]
Back to top