EnhancerDB
  1. Home
  2. Gene
  3. CDK17[ENSG00000059758.3]
Enhancers that regulate CDK17[ENSG00000059758.3]
Back to top
Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr12 96707345 96711735 enh2538 96794338 82603
Uterus Blood (Karpas-422)
chr12 96718045 96725535 enh2539 96794338 68803
Thymus Blood (OCI-LY7) Blood (Karpas-422) Neural Stem Cells (H9) Blood (T-cell)
chr12 96729865 96735175 enh51357 96794338 59163
Liver Liver (HepG2) Large Intestine
chr12 96735185 96775015 enh2540 96794338 19323
Bone Marrow (K562) Cervix (HeLa-S3) Large Intestine Astrocyte Blood (OCI-LY7) Blood (GM12878) Stomach Muscle (A673) Thyroid Peripheral Blood (MM.1S) Blood (Karpas-422) Neural Stem Cells (H9) Blood (T-cell) Heart
chr12 96752607 96752772 vista14571 96794338 41566
VISTA
chr12 96773991 96774080 vista14572 96794338 20258
VISTA
chr12 96775845 96784015 enh29893 96794338 10323
Astrocyte Uterus Blood (OCI-LY7)
chr12 96784265 96788677 enh64625 96794338 5661
Uterus Heart
chr12 96794959 96795305 vista14573 96794338 621
VISTA
chr12 96795782 96855361 enh14922 96794338 1444
Brain (SK-N-MC) Astrocyte Colon (HCT116) Uterus Blood (T-cell) Epithelial (MCF-7) Stomach Skin (Keratinocyte) Bone (Osteoblast) Blood (OCI-LY7) Peripheral Blood (MM.1S) Pancreas (Panc1) Thymus Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Esophagus Placenta Lung (PC-9) Muscle (Myoblast) Breast Spleen Prostate (RWPE1) Muscle (A673) Heart
chr12 96810217 96810461 vista14574 96794338 15879
VISTA
chr12 96813963 96814102 vista14575 96794338 19625
VISTA
chr12 96819131 96819446 vista14576 96794338 24793
VISTA
chr12 96819918 96820022 vista14577 96794338 25580
VISTA
chr12 96828064 96828263 vista14578 96794338 33726
VISTA
chr12 96830136 96830532 vista14579 96794338 35798
VISTA
chr12 96839212 96840356 vista14580 96794338 44874
VISTA
chr12 96842223 96842407 vista14581 96794338 47885
VISTA
chr12 96859045 96870355 enh29894 96794338 64707
Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Astrocyte Lung (PC-9) Muscle (Myoblast) Blood (T-cell)
chr12 96887085 96892255 enh75161 96794338 92747
Muscle (A673) Peripheral Blood (MM.1S) Brain (SK-N-MC)
chr12 96892585 96897535 enh103788 96794338 98247
Peripheral Blood (MM.1S)
Transcript facotrs that regulate CDK17[ENSG00000059758.3]
Back to top
Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
chr12 96792377 96795459 POLR2A UCSC Txn Factor no Conserved 96794338 1121 108053241
chr12 96794602 96795206 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 264 108053242
chr12 96794607 96795043 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 269 108053243
chr12 96794643 96795053 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 305 108053244
chr12 96794744 96795428 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 406 108053245
chr12 96794820 96795176 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 96794338 482 108053246
chr12 96794877 96795365 CTCF UCSC Txn Factor no Conserved 96794338 539 108053247
chr12 96794922 96795518 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 584 108053248
chr12 96794942 96795218 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 604 108053249
chr12 96794958 96795368 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 620 108053250
chr12 96794959 96795435 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 621 108053251
chr12 96794960 96795344 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 622 108053252
chr12 96794964 96795268 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 626 108053253
chr12 96794964 96795500 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 626 108053254
chr12 96794968 96795302 RAD21 UCSC Txn Factor no Conserved 96794338 630 108053255
chr12 96794969 96795329 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 631 108053256
chr12 96794975 96794993 IRF2 JASPAR yes 96794338 637 82461510
chr12 96794975 96794995 RREB1 JASPAR yes 96794338 637 82461511
chr12 96794978 96794993 STAT2 JASPAR yes 96794338 640 82461512
chr12 96794979 96794993 STAT1 JASPAR yes 96794338 641 82461513
chr12 96794980 96794992 IRF1 JASPAR yes 96794338 642 82461514
chr12 96794980 96794994 IRF7 JASPAR yes 96794338 642 82461515
chr12 96794980 96794995 IRF9 JASPAR yes 96794338 642 82461516
chr12 96794981 96795241 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 643 108053257
chr12 96794981 96795278 SMC3 UCSC Txn Factor no Conserved 96794338 643 108053258
chr12 96794982 96794988 TCF4 TRANSFAC yes 96794338 644 82461517
chr12 96794982 96794997 FOXP1 JASPAR yes 96794338 644 82461518
chr12 96794983 96794992 SRY JASPAR yes 96794338 645 82461519
chr12 96794983 96794994 FOXP2 JASPAR yes 96794338 645 82461520
chr12 96794989 96795001 INSM1 JASPAR yes 96794338 651 82461521
chr12 96794994 96795004 SP1 JASPAR yes 96794338 656 82461522
chr12 96794999 96795004 SP1 TRANSFAC yes 96794338 661 82461523
chr12 96795000 96795005 SP1 TRANSFAC yes 96794338 662 82461524
chr12 96795008 96795278 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 670 108053259
chr12 96795016 96795030 RORA JASPAR yes 96794338 678 82461525
chr12 96795021 96795768 TCF7L2 UCSC Txn Factor no Conserved 96794338 683 108053260
chr12 96795028 96795524 ZNF217 ENCODE Uniform TFBS no Epithelial (MCF-7) 96794338 690 108053261
chr12 96795029 96795236 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 691 108053262
chr12 96795032 96795053 IRF1 JASPAR yes 96794338 694 82461526
chr12 96795032 96795322 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 694 108053263
chr12 96795034 96795049 FOXP1 JASPAR yes 96794338 696 82461527
chr12 96795036 96795048 IRF1 JASPAR yes 96794338 698 82461528
chr12 96795036 96795050 IRF7 JASPAR yes 96794338 698 82461529
chr12 96795037 96795055 IRF2 JASPAR yes 96794338 699 82461530
chr12 96795039 96795369 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 701 108053264
chr12 96795040 96795055 PRDM1 JASPAR yes 96794338 702 82461531
chr12 96795040 96795055 STAT2 JASPAR yes 96794338 702 82461532
chr12 96795042 96795422 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 704 108053265
chr12 96795044 96795548 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 706 108053266
chr12 96795049 96795064 STAT1 JASPAR yes 96794338 711 82461533
chr12 96795051 96795062 STAT1 JASPAR yes 96794338 713 82461534
chr12 96795051 96795301 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 713 108053267
chr12 96795051 96795381 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 713 108053268
chr12 96795052 96795067 TFAP2A JASPAR yes 96794338 714 82461535
chr12 96795052 96795067 TFAP2C JASPAR yes 96794338 714 82461536
chr12 96795055 96795345 ZBTB33 ENCODE Uniform TFBS no Colon (HCT116) 96794338 717 108053269
chr12 96795062 96795306 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 96794338 724 108053270
chr12 96795070 96795446 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 732 108053271
chr12 96795082 96795442 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 96794338 744 108053272
chr12 96795109 96795129 PPARG JASPAR yes 96794338 771 82461537
chr12 96795110 96795441 GABPA UCSC Txn Factor no Conserved 96794338 772 108053273
chr12 96795110 96795441 ZBTB33 ENCODE Uniform TFBS no Lung (A549) 96794338 772 108053274
chr12 96795112 96795302 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 774 108053275
chr12 96795120 96795134 RORA JASPAR yes 96794338 782 82461538
chr12 96795123 96795459 POL24H8 ENCODE Uniform TFBS no Brain (SK-N-MC) 96794338 785 108053276
chr12 96795130 96795140 NFATC3 JASPAR yes 96794338 792 82461539
chr12 96795131 96795138 NFATC2 JASPAR yes 96794338 793 82461540
chr12 96795132 96795150 SRF JASPAR yes 96794338 794 82461541
chr12 96795134 96795358 RUNX3 UCSC Txn Factor no Conserved 96794338 796 108053277
chr12 96795134 96795358 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 796 108053278
chr12 96795141 96795517 ZBTB33 ENCODE Uniform TFBS no Colon (HCT116) 96794338 803 108053279
chr12 96795143 96795158 LEF1 JASPAR yes 96794338 805 82461542
chr12 96795145 96795150 GATA2 JASPAR yes 96794338 807 82461543
chr12 96795156 96795520 ELF1 UCSC Txn Factor no Conserved 96794338 818 108053280
chr12 96795156 96795520 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 818 108053281
chr12 96795158 96795634 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 96794338 820 108053282
chr12 96795164 96795179 IRF9 JASPAR yes 96794338 826 82461544
chr12 96795174 96795193 CTCF JASPAR yes 96794338 836 82461545
chr12 96795176 96795189 TFAP2B JASPAR yes 96794338 838 82461546
chr12 96795176 96795189 TFAP2C JASPAR yes 96794338 838 82461547
chr12 96795181 96795457 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Liver (HepG2) 96794338 843 108053283
chr12 96795196 96795217 ZNF263 JASPAR yes 96794338 858 82461548
chr12 96795201 96795206 MYB TRANSFAC yes 96794338 863 82461549
chr12 96795211 96795647 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 96794338 873 108053284
chr12 96795220 96795231 ETV2 JASPAR yes 96794338 882 82461550
chr12 96795220 96795231 SPDEF JASPAR yes 96794338 882 82461551
chr12 96795221 96795230 ELK4 JASPAR yes 96794338 883 82461552
chr12 96795221 96795231 ELK1 JASPAR yes 96794338 883 82461553
chr12 96795221 96795231 ELK3 JASPAR yes 96794338 883 82461554
chr12 96795221 96795231 ERF JASPAR yes 96794338 883 82461555
chr12 96795221 96795231 ERG JASPAR yes 96794338 883 82461556
chr12 96795221 96795231 ETS1 JASPAR yes 96794338 883 82461557
chr12 96795221 96795231 ETV1 JASPAR yes 96794338 883 82461558
chr12 96795221 96795231 ETV3 JASPAR yes 96794338 883 82461559
chr12 96795221 96795231 ETV4 JASPAR yes 96794338 883 82461560
chr12 96795221 96795231 ETV5 JASPAR yes 96794338 883 82461561
chr12 96795221 96795231 FEV JASPAR yes 96794338 883 82461562
chr12 96795221 96795231 FLI1 JASPAR yes 96794338 883 82461563
chr12 96795224 96795410 ZBTB33 ENCODE Uniform TFBS no Lung (A549) 96794338 886 108053285
chr12 96795232 96795246 FOXF2 JASPAR yes 96794338 894 82461564
chr12 96795234 96795245 FOXC1 JASPAR yes 96794338 896 82461565
chr12 96795234 96795246 FOXC2 JASPAR yes 96794338 896 82461566
chr12 96795235 96795247 FOXI1 JASPAR yes 96794338 897 82461567
chr12 96795237 96795245 FOXG1 JASPAR yes 96794338 899 82461568
chr12 96795237 96795245 FOXO3 JASPAR yes 96794338 899 82461569
chr12 96795240 96795255 FOXP1 JASPAR yes 96794338 902 82461570
chr12 96795240 96795261 IRF1 JASPAR yes 96794338 902 82461571
chr12 96795244 96795259 STAT2 JASPAR yes 96794338 906 82461572
chr12 96795246 96795395 TCF7L2 ENCODE Uniform TFBS no Pancreas (Panc1) 96794338 908 108053286
chr12 96795252 96795267 RUNX2 JASPAR yes 96794338 914 82461573
chr12 96795301 96795304 MYB TRANSFAC yes 96794338 963 82461574
chr12 96799035 96799577 ZNF143 GTRD no Epithelial (MCF-7) 96794338 4697 21567671
SNPs associated with CDK17[ENSG00000059758.3], confirmed by eQTL
Back to top
Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr12 96002327 rs74714387 G C 669712 Esophagus 0.365113 2827981
chr12 96445364 rs76435919 G T 226675 Esophagus 0.283653 2830581
chr12 96134899 rs142585599 T C 537140 Heart 0.265356 2829362
chr12 96561524 rs61585277 C T 110515 Heart 0.260797 2831658
chr12 96827104 rs186054713 G A,C,T 32766 Pancreas 0.12036 2834150
chr12 97662883 rs4762375 C T 868545 Breast 0.407854 2836576
chr12 96811783 rs7958686 A C 17445 Uterus 0.209888 2833916
Details of CDK17[ENSG00000059758.3]
Back to top
Genomic Location chr12:96672039-96794338[-]
TSS 96794338
Gene Name CDK17
Ensembl ID ENSG00000059758.3
ENTREZID 5128
Uniprot
A0A024RBH0
Q00537
Protein Name
Cyclin-dependent kinase 17
Expression levels of CDK17[ENSG00000059758.3]
Back to top