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Enhancers that regulate CTCF[ENSG00000102974.10]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr16 67488020 67506590 enh4091 67596310 89720
Skin (Keratinocyte) Cervix (HeLa-S3) Brain (SK-N-SH) Large Intestine Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Ovary Liver Bone (Osteoblast) Blood (OCI-LY7) Stomach Muscle (A673) Thyroid Breast Blood (Karpas-422) Pancreas Muscle (Myotube) Uterus Epithelial (MCF-7)
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Large Intestine Esophagus Placenta Pancreas Stomach
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VISTA
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Spleen
chr16 67536277 67540603 enh60623 67596310 55707
Bone Marrow (K562) Liver (HepG2) Cervix (HeLa-S3) Blood (OCI-LY7) Colon (HCT116) Peripheral Blood (MM.1S) Lung (PC-9) Blood (T-cell)
chr16 67538327 67538734 vista22788 67596310 57576
VISTA
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Blood (T-cell)
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Prostate (RWPE1) Uterus Blood (Karpas-422)
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VISTA
chr16 67565199 67565482 vista22790 67596310 30828
VISTA
chr16 67565969 67570595 enh62559 67596310 25715
Esophagus Stomach Lung (PC-9)
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Stomach
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Esophagus Blood (OCI-LY7) Blood (GM12878) Stomach Peripheral Blood (MM.1S) Uterus Heart
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VISTA
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Blood (Karpas-422)
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VISTA
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Prostate (RWPE1) Astrocyte Muscle (A673) Pancreas Blood (T-cell)
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Prostate (RWPE1) Large Intestine Astrocyte Stomach Thyroid Neural Stem Cells (H9) Kidney
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Muscle (A673) Epithelial (MCF-7)
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VISTA
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VISTA
Transcript facotrs that regulate CTCF[ENSG00000102974.10]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr16 67597021 67597523 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 67596310 711 108201569
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chr16 67597073 67597437 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 67596310 763 108201585
chr16 67597081 67597597 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 67596310 771 108201586
chr16 67597101 67597461 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 67596310 791 108201587
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chr16 67597331 67597655 ZNF143 ENCODE Uniform TFBS no Embryonic Stem Cell Line (H1-hESC) 67596310 1021 108201616
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chr16 67597416 67597431 ZIC4 JASPAR yes 67596310 1106 49385383
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chr16 67597417 67597425 WT1 TRANSFAC yes 67596310 1107 49385384
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chr16 67597475 67597489 ZIC1 JASPAR yes 67596310 1165 49385391
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chr16 67597475 67597490 ZIC4 JASPAR yes 67596310 1165 49385393
chr16 67597482 67597494 ZBTB7C JASPAR yes 67596310 1172 11164028
chr16 67597482 67597494 ZBTB7C JASPAR yes 67596310 1172 49385394
chr16 67597483 67597495 ZBTB7A JASPAR yes 67596310 1173 11164029
chr16 67597483 67597495 ZBTB7A JASPAR yes 67596310 1173 49385395
chr16 67597485 67597490 SP1 TRANSFAC yes 67596310 1175 11164030
chr16 67597485 67597490 SP1 TRANSFAC yes 67596310 1175 49385396
chr16 67597486 67597498 E2F8 JASPAR yes 67596310 1176 11164031
chr16 67597486 67597498 E2F8 JASPAR yes 67596310 1176 49385397
chr16 67597488 67597493 SP1 TRANSFAC yes 67596310 1178 11164032
chr16 67597488 67597493 SP1 TRANSFAC yes 67596310 1178 49385398
chr16 67597491 67597497 ETS1 JASPAR yes 67596310 1181 11164033
chr16 67597491 67597497 ETS1 JASPAR yes 67596310 1181 49385399
chr16 67597525 67597530 GATA2 JASPAR yes 67596310 1215 11164034
chr16 67597525 67597530 GATA2 JASPAR yes 67596310 1215 49385400
chr16 67597537 67597893 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 67596310 1227 108201623
chr16 67597544 67597550 MZF1 JASPAR yes 67596310 1234 11164035
chr16 67597544 67597550 MZF1 JASPAR yes 67596310 1234 49385401
chr16 67597550 67597930 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 67596310 1240 108201624
chr16 67597557 67597575 ESR2 JASPAR yes 67596310 1247 11164036
chr16 67597557 67597575 ESR2 JASPAR yes 67596310 1247 49385402
chr16 67597570 67597576 SOX10 JASPAR yes 67596310 1260 11164037
chr16 67597570 67597576 SOX10 JASPAR yes 67596310 1260 49385403
chr16 67597580 67597950 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 67596310 1270 108201625
chr16 67597584 67597874 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 67596310 1274 108201626
chr16 67597593 67597607 STAT1 JASPAR yes 67596310 1283 11164038
chr16 67597593 67597607 STAT1 JASPAR yes 67596310 1283 49385404
chr16 67597593 67597608 STAT2 JASPAR yes 67596310 1283 11164039
chr16 67597593 67597608 STAT2 JASPAR yes 67596310 1283 49385405
chr16 67597597 67597612 IRF9 JASPAR yes 67596310 1287 11164040
chr16 67597597 67597612 IRF9 JASPAR yes 67596310 1287 49385406
chr16 67597610 67597970 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 67596310 1300 108201627
chr16 67597625 67597639 ATF7 JASPAR yes 67596310 1315 11164041
chr16 67597625 67597639 CREB3 JASPAR yes 67596310 1315 11164042
chr16 67597625 67597639 ATF7 JASPAR yes 67596310 1315 49385407
chr16 67597625 67597639 CREB3 JASPAR yes 67596310 1315 49385408
chr16 67597626 67597640 XBP1 JASPAR yes 67596310 1316 11164043
chr16 67597626 67597640 XBP1 JASPAR yes 67596310 1316 49385409
chr16 67597626 67597902 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Liver (HepG2) 67596310 1316 108201628
chr16 67597627 67597637 SREBF1 JASPAR yes 67596310 1317 11164044
chr16 67597627 67597637 SREBF2 JASPAR yes 67596310 1317 11164045
chr16 67597627 67597637 SREBF1 JASPAR yes 67596310 1317 49385410
chr16 67597627 67597637 SREBF2 JASPAR yes 67596310 1317 49385411
chr16 67597627 67597957 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 67596310 1317 108201629
chr16 67597628 67597633 ATF1 TRANSFAC yes 67596310 1318 11164046
chr16 67597628 67597633 ATF1 TRANSFAC yes 67596310 1318 49385412
chr16 67597631 67597949 CEBPB UCSC Txn Factor no Conserved 67596310 1321 108201630
chr16 67597631 67597949 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 67596310 1321 108201631
chr16 67597641 67598045 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 67596310 1331 108201632
chr16 67597646 67597910 ZNF143 ENCODE Uniform TFBS no Embryonic Stem Cell Line (H1-hESC) 67596310 1336 108201633
chr16 67597651 67597895 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 67596310 1341 108201634
chr16 67597657 67597671 NR2F1 JASPAR yes 67596310 1347 11164047
chr16 67597657 67597671 NR2F1 JASPAR yes 67596310 1347 49385413
chr16 67597670 67597691 IRF1 JASPAR yes 67596310 1360 11164048
chr16 67597670 67597691 IRF1 JASPAR yes 67596310 1360 49385414
chr16 67597671 67597681 RELA JASPAR yes 67596310 1361 11164049
chr16 67597671 67597681 RELA JASPAR yes 67596310 1361 49385415
chr16 67597671 67597840 ZBTB33 ENCODE Uniform TFBS no Lung (A549) 67596310 1361 108201635
chr16 67597675 67597686 E2F6 JASPAR yes 67596310 1365 11164050
chr16 67597675 67597686 E2F6 JASPAR yes 67596310 1365 49385416
chr16 67597679 67597690 E2F4 JASPAR yes 67596310 1369 11164051
chr16 67597679 67597690 E2F6 JASPAR yes 67596310 1369 11164052
chr16 67597679 67597690 E2F4 JASPAR yes 67596310 1369 49385417
chr16 67597679 67597690 E2F6 JASPAR yes 67596310 1369 49385418
chr16 67597680 67597691 E2F1 JASPAR yes 67596310 1370 11164053
chr16 67597680 67597691 E2F1 JASPAR yes 67596310 1370 49385419
chr16 67597690 67598066 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Cervix (HeLa-S3) 67596310 1380 108201636
chr16 67597694 67597707 JUN JASPAR yes 67596310 1384 11164054
chr16 67597694 67597707 JUN JASPAR yes 67596310 1384 49385420
chr16 67597696 67597814 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Liver (HepG2) 67596310 1386 108201637
chr16 67597706 67597709 MYB TRANSFAC yes 67596310 1396 11164055
chr16 67597706 67597709 MYB TRANSFAC yes 67596310 1396 49385421
chr16 67597714 67598094 ZZZ3 ENCODE Uniform TFBS no Blood (GM12878) 67596310 1404 108201638
chr16 67597739 67597744 SP1 TRANSFAC yes 67596310 1429 11164056
chr16 67597739 67597744 SP1 TRANSFAC yes 67596310 1429 49385422
chr16 67597747 67597753 NFE2 TRANSFAC yes 67596310 1437 11164057
chr16 67597747 67597753 NFE2 TRANSFAC yes 67596310 1437 49385423
chr16 67597751 67597763 TEAD1 JASPAR yes 67596310 1441 11164058
chr16 67597751 67597763 TEAD1 JASPAR yes 67596310 1441 49385424
chr16 67597756 67597767 CEBPA JASPAR yes 67596310 1446 11164059
chr16 67597756 67597767 CEBPA JASPAR yes 67596310 1446 49385425
chr16 67597757 67597767 CEBPB JASPAR yes 67596310 1447 11164060
chr16 67597757 67597767 CEBPD JASPAR yes 67596310 1447 11164061
chr16 67597757 67597767 CEBPE JASPAR yes 67596310 1447 11164062
chr16 67597757 67597767 CEBPG JASPAR yes 67596310 1447 11164063
chr16 67597757 67597767 CEBPB JASPAR yes 67596310 1447 49385426
chr16 67597757 67597767 CEBPD JASPAR yes 67596310 1447 49385427
chr16 67597757 67597767 CEBPE JASPAR yes 67596310 1447 49385428
chr16 67597757 67597767 CEBPG JASPAR yes 67596310 1447 49385429
chr16 67597757 67597768 CEBPB JASPAR yes 67596310 1447 11164064
chr16 67597757 67597768 CEBPB JASPAR yes 67596310 1447 49385430
chr16 67597777 67597784 E2F1 TRANSFAC yes 67596310 1467 11164065
chr16 67597777 67597784 E2F1 TRANSFAC yes 67596310 1467 49385431
chr16 67597785 67597802 RXRA JASPAR yes 67596310 1475 11164066
chr16 67597785 67597802 RXRA JASPAR yes 67596310 1475 49385432
chr16 67597786 67597790 LFA1 TRANSFAC yes 67596310 1476 11164067
chr16 67597786 67597790 LFA1 TRANSFAC yes 67596310 1476 49385433
chr16 67597854 67597864 ALX3 JASPAR yes 67596310 1544 11164068
chr16 67597854 67597864 ALX3 JASPAR yes 67596310 1544 49385434
chr16 67597857 67597873 ZNF143 JASPAR yes 67596310 1547 11164069
chr16 67597857 67597873 ZNF143 JASPAR yes 67596310 1547 49385435
chr16 67597858 67597863 MYB TRANSFAC yes 67596310 1548 11164070
chr16 67597858 67597863 MYB TRANSFAC yes 67596310 1548 49385436
chr16 67597862 67598044 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Liver (HepG2) 67596310 1552 108201639
chr16 67597867 67597873 ESR1 TRANSFAC yes 67596310 1557 11164071
chr16 67597867 67597873 ESR1 TRANSFAC yes 67596310 1557 49385437
chr16 67597869 67597873 ESR1 TRANSFAC yes 67596310 1559 11164072
chr16 67597869 67597873 ESR1 TRANSFAC yes 67596310 1559 49385438
chr16 67597869 67598373 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Bone Marrow (K562) 67596310 1559 108201640
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chr16 67597879 67597891 TAL1 JASPAR yes 67596310 1569 49385439
chr16 67597887 67597902 MEF2A JASPAR yes 67596310 1577 11164074
chr16 67597887 67597902 MEF2A JASPAR yes 67596310 1577 49385440
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chr16 67597890 67597896 TMF TRANSFAC yes 67596310 1580 11164081
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chr16 67597911 67597914 MYB TRANSFAC yes 67596310 1601 49385448
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chr16 67597912 67598042 ZNF274 ENCODE Uniform TFBS no Liver (HepG2) 67596310 1602 108201641
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chr16 67597930 67597943 ELF1 JASPAR yes 67596310 1620 49385459
chr16 67597931 67597938 SPI1 JASPAR yes 67596310 1621 11164094
chr16 67597931 67597938 SPI1 JASPAR yes 67596310 1621 49385460
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chr16 67598686 67598696 OLIG3 JASPAR yes 67596310 2376 11164245
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chr16 67600671 67600684 NFKB1 JASPAR yes 67596310 4361 11164554
chr16 67600671 67600684 NFKB2 JASPAR yes 67596310 4361 11164555
chr16 67600679 67600684 MYC TRANSFAC yes 67596310 4369 11164556
chr16 67600696 67600710 STAT1 JASPAR yes 67596310 4386 11164557
chr16 67600705 67600726 ZNF263 JASPAR yes 67596310 4395 11164558
chr16 67600714 67600723 THAP1 JASPAR yes 67596310 4404 11164559
chr16 67600722 67600730 SP1 TRANSFAC yes 67596310 4412 11164560
chr16 67600753 67600764 FOSL2 JASPAR yes 67596310 4443 11164561
chr16 67600759 67600764 MYC TRANSFAC yes 67596310 4449 11164562
chr16 67600771 67600791 RREB1 JASPAR yes 67596310 4461 11164563
chr16 67600772 67600792 RREB1 JASPAR yes 67596310 4462 11164564
chr16 67600775 67600795 RREB1 JASPAR yes 67596310 4465 11164565
chr16 67600776 67600796 RREB1 JASPAR yes 67596310 4466 11164566
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chr16 67600784 67600796 FOXC2 JASPAR yes 67596310 4474 11164570
chr16 67600786 67600797 FOXA1 JASPAR yes 67596310 4476 11164571
chr16 67600801 67600822 IRF1 JASPAR yes 67596310 4491 11164572
chr16 67600803 67600818 PRDM1 JASPAR yes 67596310 4493 11164573
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chr16 67600834 67600844 SREBF2 JASPAR yes 67596310 4524 11164576
chr16 67600834 67600847 EOMES JASPAR yes 67596310 4524 11164577
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chr16 67600849 67600870 ZNF263 JASPAR yes 67596310 4539 11164579
chr16 67600885 67600899 CREB3L1 JASPAR yes 67596310 4575 11164580
chr16 67600909 67600927 NR3C1 JASPAR yes 67596310 4599 11164581
chr16 67600919 67600936 BCL6B JASPAR yes 67596310 4609 11164582
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chr16 67600971 67600986 TFAP2C JASPAR yes 67596310 4661 11164584
chr16 67600981 67600994 SMAD2 JASPAR yes 67596310 4671 11164585
chr16 67600985 67600989 NFE TRANSFAC yes 67596310 4675 11164586
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chr16 67601011 67601021 GSC JASPAR yes 67596310 4701 11164589
chr16 67601012 67601020 OTX1 JASPAR yes 67596310 4702 11164590
chr16 67601012 67601021 PITX3 JASPAR yes 67596310 4702 11164591
chr16 67601017 67601027 TBX21 JASPAR yes 67596310 4707 11164592
chr16 67601017 67601028 TBX20 JASPAR yes 67596310 4707 11164593
chr16 67601017 67601028 TBX2 JASPAR yes 67596310 4707 11164594
chr16 67601017 67601030 EOMES JASPAR yes 67596310 4707 11164595
chr16 67601018 67601026 MGA JASPAR yes 67596310 4708 11164596
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chr16 67601018 67601026 TBX1 JASPAR yes 67596310 4708 11164598
chr16 67601018 67601026 TBX4 JASPAR yes 67596310 4708 11164599
chr16 67601018 67601026 TBX5 JASPAR yes 67596310 4708 11164600
chr16 67601018 67601028 TBR1 JASPAR yes 67596310 4708 11164601
chr16 67601018 67601031 SMAD2 JASPAR yes 67596310 4708 11164602
chr16 67601022 67601033 FOSL2 JASPAR yes 67596310 4712 11164603
chr16 67601028 67601033 MYC TRANSFAC yes 67596310 4718 11164604
chr16 67601042 67601046 YY1 TRANSFAC yes 67596310 4732 11164605
chr16 67601052 67601065 ZBTB18 JASPAR yes 67596310 4742 11164606
chr16 67601052 67601067 SCRT1 JASPAR yes 67596310 4742 11164607
chr16 67601053 67601063 FIGLA JASPAR yes 67596310 4743 11164608
chr16 67601053 67601063 ID4 JASPAR yes 67596310 4743 11164609
chr16 67601053 67601063 MSC JASPAR yes 67596310 4743 11164610
chr16 67601053 67601063 TCF3 JASPAR yes 67596310 4743 11164611
chr16 67601053 67601063 TCF4 JASPAR yes 67596310 4743 11164612
chr16 67601054 67601063 SNAI2 JASPAR yes 67596310 4744 11164613
chr16 67601055 67601060 USF2 TRANSFAC yes 67596310 4745 11164614
chr16 67601076 67601080 NFE TRANSFAC yes 67596310 4766 11164615
chr16 67601084 67601089 GATA1 TRANSFAC yes 67596310 4774 11164616
chr16 67601099 67601104 GATA1 TRANSFAC yes 67596310 4789 11164617
chr16 67601103 67601109 SOX10 JASPAR yes 67596310 4793 11164618
chr16 67601110 67601114 YY1 TRANSFAC yes 67596310 4800 11164619
chr16 67601120 67601136 POU4F2 JASPAR yes 67596310 4810 11164620
chr16 67601125 67601137 HNF1B JASPAR yes 67596310 4815 11164621
chr16 67601129 67601133 YY1 TRANSFAC yes 67596310 4819 11164622
chr16 67601137 67601143 TCF4 TRANSFAC yes 67596310 4827 11164623
chr16 67601164 67601170 NFIC JASPAR yes 67596310 4854 11164624
chr16 67601173 67601188 HNF4G JASPAR yes 67596310 4863 11164625
chr16 67601174 67601188 RXRB JASPAR yes 67596310 4864 11164626
chr16 67601174 67601188 RXRG JASPAR yes 67596310 4864 11164627
chr16 67601203 67601216 EOMES JASPAR yes 67596310 4893 11164628
chr16 67601205 67601215 TBR1 JASPAR yes 67596310 4895 11164629
chr16 67601205 67601216 TBX2 JASPAR yes 67596310 4895 11164630
chr16 67601206 67601216 TBX21 JASPAR yes 67596310 4896 11164631
chr16 67601207 67601215 MGA JASPAR yes 67596310 4897 11164632
chr16 67601207 67601215 TBX15 JASPAR yes 67596310 4897 11164633
chr16 67601207 67601215 TBX1 JASPAR yes 67596310 4897 11164634
chr16 67601207 67601215 TBX4 JASPAR yes 67596310 4897 11164635
chr16 67601207 67601215 TBX5 JASPAR yes 67596310 4897 11164636
chr16 67601228 67601232 ESR1 TRANSFAC yes 67596310 4918 11164637
chr16 67601237 67601248 NFKB1 JASPAR yes 67596310 4927 11164638
chr16 67601243 67601255 INSM1 JASPAR yes 67596310 4933 11164639
chr16 67601271 67601287 ZNF143 JASPAR yes 67596310 4961 11164640
chr16 67601276 67601286 GCM2 JASPAR yes 67596310 4966 11164641
chr16 67601276 67601287 GCM1 JASPAR yes 67596310 4966 11164642
SNPs associated with CTCF[ENSG00000102974.10], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr16 66638219 rs146585124 A T 958091 Esophagus 0.074356 4493375
chr16 67435558 rs80180406 G A 160752 Esophagus 0.254934 4496009
chr16 67527104 rs77919558 A G 69206 Breast 0.302943 4496671
chr16 68435204 rs11647934 G A 762118 Spleen 0.0652627 4500370
chr16 68417203 rs35808102 A G 744117 Ovary 0.302985 4500255
chr16 68301727 rs72790400 G A 628641 Thyroid 0.134519 4499764
chr16 68416144 rs12598731 G T 743058 Liver 0.0857456 4500244
chr16 67666028 rs200827597 T TTCAGAAA 0 Lung 0.227599 4497394
Details of CTCF[ENSG00000102974.10]
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Genomic Location chr16:67596310-67673086[+]
TSS 67596310
Gene Name CTCF
Ensembl ID ENSG00000102974.10
ENTREZID 10664
Uniprot
P49711
Protein Name
Transcriptional repressor CTCF
Expression levels of CTCF[ENSG00000102974.10]
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