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Enhancers that regulate TULP1[ENSG00000112041.8]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
chr6 35380365 35385400 enh38954 35480715 95315
Prostate (PC-3) Liver (HepG2) Epithelial (MCF-7) Brain (SK-N-SH) Prostate (RWPE1) Ovary Esophagus Astrocyte Bone (Osteoblast) Stomach Colon (HCT116) Thyroid Lung (PC-9) Muscle (Myotube) Heart
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Placenta Heart
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Heart
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Placenta Blood (Karpas-422)
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VISTA
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Brain (SK-N-SH) Brain (SK-N-MC) Esophagus Bone (Osteoblast) Stomach Muscle (A673) Placenta Thyroid Pancreas Heart
chr6 35453228 35453566 vista51713 35480715 27149
VISTA
chr6 35457129 35460603 vista1429 35480715 20112
VISTA
chr6 35457906 35458213 vista51714 35480715 22502
VISTA
chr6 35481825 35494615 enh23180 35480715 1110
Bone Marrow (K562) Prostate (RWPE1) Placenta Pancreas Blood (T-cell)
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Muscle (A673) Brain (SK-N-SH) Thymus
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Placenta Epithelial (MCF-7)
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Thyroid Muscle (Myotube) Lung
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VISTA
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Liver Uterus Thymus Prostate (RWPE1)
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Skin (Keratinocyte) Brain (SK-N-SH) Prostate (RWPE1) Blood (T-cell) Esophagus Lung Stomach Colon (HCT116) Blood (Karpas-422) Spleen Uterus Thymus Heart
chr6 35560685 35576643 enh9078 35480715 79970
Astrocyte Colon (HCT116) Blood (Karpas-422) Pancreas Uterus Blood (T-cell) Epithelial (MCF-7) Stomach Brain (SK-N-SH) Peripheral Blood (MM.1S) Thyroid Neural Stem Cells (H9) Thymus Prostate (PC-3) Esophagus Blood (GM12878) Placenta Lung (PC-9) Breast Muscle (Myoblast) Muscle (Myotube) Liver (HepG2) Prostate (RWPE1) Muscle (A673) Heart
chr6 35561770 35562146 vista51716 35480715 81055
VISTA
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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Brain (SK-N-MC) Thyroid Peripheral Blood (MM.1S) Blood (T-cell) Stomach
Transcript facotrs that regulate TULP1[ENSG00000112041.8]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr6 35484442 35484453 TBX2 JASPAR yes 35480715 3727 101287438
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chr6 35484569 35484580 CEBPB JASPAR yes 35480715 3854 101287444
chr6 35484570 35484581 CEBPA JASPAR yes 35480715 3855 101287445
chr6 35484590 35484610 PPARG JASPAR yes 35480715 3875 101287446
chr6 35484591 35484611 PPARG JASPAR yes 35480715 3876 101287447
chr6 35484595 35484606 NFE2L2 JASPAR yes 35480715 3880 101287448
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chr6 35485182 35485193 NFKB1 JASPAR yes 35480715 4467 101287546
chr6 35485185 35485195 NFATC3 JASPAR yes 35480715 4470 101287547
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chr6 35485227 35485237 NFKB1 JASPAR yes 35480715 4512 101287552
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chr6 35485227 35485238 NFKB1 JASPAR yes 35480715 4512 101287555
chr6 35485230 35485235 H4TF1 TRANSFAC yes 35480715 4515 101287556
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chr6 35485335 35485339 YY1 TRANSFAC yes 35480715 4620 101287581
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chr6 35485366 35485370 YY1 TRANSFAC yes 35480715 4651 101287598
chr6 35485375 35485386 DUX4 JASPAR yes 35480715 4660 101287599
chr6 35485398 35485410 NHLH1 JASPAR yes 35480715 4683 101287600
chr6 35485403 35485412 HIC2 JASPAR yes 35480715 4688 101287601
chr6 35485406 35485410 LFA1 TRANSFAC yes 35480715 4691 101287602
chr6 35485411 35485422 FOSL2 JASPAR yes 35480715 4696 101287603
chr6 35485412 35485423 NFE2 JASPAR yes 35480715 4697 101287604
chr6 35485425 35485429 TEAD2 TRANSFAC yes 35480715 4710 101287605
chr6 35485426 35485434 RHOXF1 JASPAR yes 35480715 4711 101287606
chr6 35485427 35485448 LUN1 TRANSFAC yes 35480715 4712 101287607
chr6 35485444 35485458 PLAG1 JASPAR yes 35480715 4729 101287608
chr6 35485451 35485456 SP1 TRANSFAC yes 35480715 4736 101287609
chr6 35485452 35485457 SP1 TRANSFAC yes 35480715 4737 101287610
chr6 35485452 35485461 THAP1 JASPAR yes 35480715 4737 101287611
chr6 35485455 35485459 LFA1 TRANSFAC yes 35480715 4740 101287612
chr6 35485460 35485471 USF1 JASPAR yes 35480715 4745 101287613
chr6 35485460 35485471 USF2 JASPAR yes 35480715 4745 101287614
chr6 35485461 35485471 SREBF2 JASPAR yes 35480715 4746 101287615
chr6 35485463 35485468 USF2 TRANSFAC yes 35480715 4748 101287616
chr6 35485466 35485479 NR2F1 JASPAR yes 35480715 4751 101287617
chr6 35485467 35485475 CREB1 JASPAR yes 35480715 4752 101287618
chr6 35485468 35485486 RARA JASPAR yes 35480715 4753 101287619
chr6 35485470 35485474 ESR1 TRANSFAC yes 35480715 4755 101287620
chr6 35485496 35485508 YY1 JASPAR yes 35480715 4781 101287621
chr6 35485500 35485511 CEBPB JASPAR yes 35480715 4785 101287622
chr6 35485501 35485514 NFKB1 JASPAR yes 35480715 4786 101287623
chr6 35485501 35485514 NFKB2 JASPAR yes 35480715 4786 101287624
chr6 35485521 35485524 MYB TRANSFAC yes 35480715 4806 101287625
chr6 35485540 35485550 SP1 JASPAR yes 35480715 4825 101287626
chr6 35485617 35485634 ESR1 JASPAR yes 35480715 4902 101287627
chr6 35485617 35485635 ESR1 JASPAR yes 35480715 4902 101287628
chr6 35485621 35485630 RUNX2 JASPAR yes 35480715 4906 101287629
chr6 35485626 35485636 SREBF1 JASPAR yes 35480715 4911 101287630
chr6 35485634 35485648 ATF7 JASPAR yes 35480715 4919 101287631
chr6 35485634 35485648 BATF3 JASPAR yes 35480715 4919 101287632
chr6 35485636 35485646 MLX JASPAR yes 35480715 4921 101287633
chr6 35485636 35485646 SREBF1 JASPAR yes 35480715 4921 101287634
chr6 35485636 35485646 SREBF2 JASPAR yes 35480715 4921 101287635
chr6 35485639 35485644 ATF1 TRANSFAC yes 35480715 4924 101287636
chr6 35485647 35485656 NKX2-8 JASPAR yes 35480715 4932 101287637
chr6 35485657 35485676 PAX5 JASPAR yes 35480715 4942 101287638
chr6 35485661 35485672 NFE2L2 JASPAR yes 35480715 4946 101287639
chr6 35485675 35485679 NFE TRANSFAC yes 35480715 4960 101287640
chr6 35485688 35485699 CDX2 JASPAR yes 35480715 4973 101287641
chr6 35485689 35485700 HOXA10 JASPAR yes 35480715 4974 101287642
chr6 35485690 35485699 CDX1 JASPAR yes 35480715 4975 101287643
chr6 35485690 35485700 HOXA13 JASPAR yes 35480715 4975 101287644
chr6 35485690 35485700 HOXB13 JASPAR yes 35480715 4975 101287645
chr6 35485690 35485700 HOXD13 JASPAR yes 35480715 4975 101287646
SNPs associated with TULP1[ENSG00000112041.8], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr6 35895170 rs141748353 C T 414455 Esophagus 0.173492 8990681
chr6 35531515 rs60645405 T C 50800 Breast 0.0942569 8988588
chr6 35534371 rs6910300 A G 53656 Uterus 0.230475 8988601
chr6 34563298 rs17700462 T G 902353 Adrenal 0.0930884 8982488
Details of TULP1[ENSG00000112041.8]
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Genomic Location chr6:35465651-35480715[-]
TSS 35480715
Gene Name TULP1
Ensembl ID ENSG00000112041.8
ENTREZID 7287
Uniprot
Q0QD38
O00294
F1T0I9
Protein Name
Tubby like protein 1
Tubby-like protein
Tubby-related protein 1
Expression levels of TULP1[ENSG00000112041.8]
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