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Enhancers that regulate CPNE5[ENSG00000124772.7]
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Chrom. Start End Enhancer ID TSS of gene Distance between enhancer and TSS Tissues that enhancer appears More
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VISTA
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VISTA
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VISTA
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Bone Marrow (K562) Brain (SK-N-SH) Epithelial (MCF-7) Prostate (RWPE1) Pancreas Stomach
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VISTA
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VISTA
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Liver (HepG2)
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VISTA
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Liver (HepG2) Large Intestine Prostate (RWPE1) Esophagus Astrocyte Lung (PC-9) Lung Stomach Muscle (A673) Placenta Muscle (Myoblast) Pancreas Muscle (Myotube) Uterus Heart
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VISTA
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Muscle (Myotube) Thymus
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VISTA
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VISTA
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Bone Marrow (K562) Liver (HepG2) Prostate (RWPE1) Esophagus Liver Bone (Osteoblast) Stomach Muscle (Myoblast) Pancreas Muscle (Myotube) Uterus Heart
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VISTA
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Bone Marrow (K562) Skin (Keratinocyte) Epithelial (MCF-7) Esophagus Neural Stem Cells (H9) Heart
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Bone Marrow (K562) Prostate (PC-3) Blood (T-cell) Esophagus Lung Stomach Adrenal Pancreas Uterus Thymus Heart
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Cervix (HeLa-S3) Prostate (RWPE1) Bone (Osteoblast) Placenta Lung (PC-9)
Transcript facotrs that regulate CPNE5[ENSG00000124772.7]
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Chrom. Start End TF name Source Predicted site? Tissue TSS of gene Distance between TFBS and gene id More
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chr6 36805641 36805647 MZF1 JASPAR yes 36807778 2131 101367770
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chr6 36812133 36812153 TP63 JASPAR yes 36807778 4355 70355620
chr6 36812153 36812165 HES7 JASPAR yes 36807778 4375 70355621
chr6 36812154 36812163 SNAI2 JASPAR yes 36807778 4376 70355622
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chr6 36812179 36812192 SMAD2 JASPAR yes 36807778 4401 70355627
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chr6 36812323 36812329 YY1 JASPAR yes 36807778 4545 70355634
chr6 36812332 36812343 FOXA1 JASPAR yes 36807778 4554 70355635
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chr6 36812356 36812366 GSC JASPAR yes 36807778 4578 70355639
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chr6 36812369 36812379 HOXA2 JASPAR yes 36807778 4591 70355641
chr6 36812370 36812378 NKX6-1 JASPAR yes 36807778 4592 70355642
chr6 36812371 36812385 BATF3 JASPAR yes 36807778 4593 70355643
chr6 36812411 36812417 GATA1 TRANSFAC yes 36807778 4633 70355644
chr6 36812411 36812419 GATA5 JASPAR yes 36807778 4633 70355645
chr6 36812417 36812427 MZF1 JASPAR yes 36807778 4639 70355646
SNPs associated with CPNE5[ENSG00000124772.7], confirmed by eQTL
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Chrom. Position dbSNP ID Reference Allele Alternative Allele Distance between TSS and SNP Tissue q Value id More
chr6 37190046 rs1757014 C T 382268 Esophagus 0.158982 8999972
chr6 36817172 rs236351 G A 9394 Heart 2.41843e-05 8996462
chr6 37506415 rs2797780 T C 698637 Breast 0.373626 9001879
chr6 36237045 rs77655809 G A 471507 Spleen 0.388609 8992143
chr6 36796133 rs9380607 A G 0 Ovary 0.00985091 8996263
chr6 37583374 rs6919987 G A 775596 Uterus 0.243016 9002568
chr6 36084765 rs12111171 A C,G 623787 Liver 0.0847689 8991666
chr6 36511382 rs76926220 C A,G 197170 Stomach 0.44658 8993576
Details of CPNE5[ENSG00000124772.7]
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Genomic Location chr6:36708552-36807778[-]
TSS 36807778
Gene Name CPNE5
Ensembl ID ENSG00000124772.7
ENTREZID 57699
Uniprot
Q9HCH3
Protein Name
Copine-5
Expression levels of CPNE5[ENSG00000124772.7]
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