EnhancerDB

Enhancers that regulate WNT10A[ENSG00000135925.4]

Chrom.	Start	End	Enhancer ID	TSS of gene	Distance between enhancer and TSS	Tissues that enhancer appears
chr2	219647945	219652095	enh97069	219745085	92990	Epithelial (MCF-7)
chr2	219648056	219648806	vista34786	219745085	96279	VISTA
chr2	219661905	219669335	enh109927	219745085	75750	Stomach
chr2	219676094	219676389	vista34787	219745085	68696	VISTA
chr2	219683782	219684203	vista34788	219745085	60882	VISTA
chr2	219685114	219685474	vista34789	219745085	59611	VISTA
chr2	219698234	219698613	vista34790	219745085	46472	VISTA
chr2	219702205	219706615	enh62915	219745085	38470	Esophagus Lung (PC-9)
chr2	219704181	219704419	vista34791	219745085	40666	VISTA
chr2	219711166	219717235	enh86389	219745085	27850	Colon (HCT116) Lung (PC-9)
chr2	219730685	219735095	enh19243	219745085	9990	Placenta Uterus
chr2	219742138	219742379	vista34792	219745085	2706	VISTA
chr2	219744343	219744437	vista34793	219745085	648	VISTA
chr2	219749385	219753535	enh104930	219745085	4300	Peripheral Blood (MM.1S)
chr2	219750853	219751263	vista34794	219745085	5768	VISTA
chr2	219755128	219763895	enh44998	219745085	10043	Skin (Keratinocyte) Prostate (PC-3) Cervix (HeLa-S3) Blood (T-cell) Peripheral Blood (MM.1S) Pancreas (Panc1) Muscle (Myotube) Thymus
chr2	219759139	219759434	vista34795	219745085	14054	VISTA
chr2	219760047	219760178	vista34796	219745085	14962	VISTA
chr2	219761045	219761550	vista34797	219745085	15960	VISTA
chr2	219771610	219776224	enh116208	219745085	26525	Pancreas (Panc1)
chr2	219773515	219774011	vista34798	219745085	28430	VISTA
chr2	219774108	219774202	vista34799	219745085	29023	VISTA
chr2	219786865	219791715	enh6156	219745085	41780	Blood (Karpas-422)
chr2	219819543	219819875	vista34800	219745085	74458	VISTA
chr2	219825645	219831689	enh34276	219745085	80560	Prostate (PC-3) Brain (SK-N-SH) Astrocyte Colon (HCT116) Lung (PC-9) Stomach
chr2	219827943	219828258	vista34801	219745085	82858	VISTA
chr2	219838225	219842375	enh53570	219745085	93140	Large Intestine
chr2	219844869	219844996	vista34802	219745085	99784	VISTA

Transcript facotrs that regulate WNT10A[ENSG00000135925.4]

Chrom.	Start	End	TF name	Source	Predicted site?	TSS of gene	Distance between TFBS and gene	id
chr2	219742150	219742156	GATA3	JASPAR	yes	219745085	2929	22211730
chr2	219742160	219742179	RFX2	JASPAR	yes	219745085	2906	22211731
chr2	219742180	219742185	ETS2	TRANSFAC	yes	219745085	2900	22211732
chr2	219742180	219742192	INSM1	JASPAR	yes	219745085	2893	22211733
chr2	219742181	219742196	HSF1	JASPAR	yes	219745085	2889	22211734
chr2	219742185	219742190	SP1	TRANSFAC	yes	219745085	2895	22211735
chr2	219742185	219742192	SP1	TRANSFAC	yes	219745085	2893	22211736
chr2	219742185	219742198	ELF1	JASPAR	yes	219745085	2887	22211737
chr2	219742186	219742196	ELK1	JASPAR	yes	219745085	2889	22211738
chr2	219742186	219742198	EHF	JASPAR	yes	219745085	2887	22211739
chr2	219742186	219742198	ELF1	JASPAR	yes	219745085	2887	22211740
chr2	219742186	219742198	ELF4	JASPAR	yes	219745085	2887	22211741
chr2	219742186	219742199	ELF3	JASPAR	yes	219745085	2886	22211742
chr2	219742187	219742198	ELF5	JASPAR	yes	219745085	2887	22211743
chr2	219742187	219742198	ETV2	JASPAR	yes	219745085	2887	22211744
chr2	219742188	219742197	ELK4	JASPAR	yes	219745085	2888	22211745
chr2	219742188	219742198	ELK1	JASPAR	yes	219745085	2887	22211746
chr2	219742188	219742198	ELK3	JASPAR	yes	219745085	2887	22211747
chr2	219742188	219742198	ERF	JASPAR	yes	219745085	2887	22211748
chr2	219742188	219742198	ERG	JASPAR	yes	219745085	2887	22211749
chr2	219742188	219742198	ETS1	JASPAR	yes	219745085	2887	22211750
chr2	219742188	219742198	ETV1	JASPAR	yes	219745085	2887	22211751
chr2	219742188	219742198	ETV3	JASPAR	yes	219745085	2887	22211752
chr2	219742188	219742198	ETV4	JASPAR	yes	219745085	2887	22211753
chr2	219742188	219742198	ETV5	JASPAR	yes	219745085	2887	22211754
chr2	219742188	219742198	ETV6	JASPAR	yes	219745085	2887	22211755
chr2	219742188	219742198	FEV	JASPAR	yes	219745085	2887	22211756
chr2	219742188	219742198	FLI1	JASPAR	yes	219745085	2887	22211757
chr2	219742188	219742199	ELK4	JASPAR	yes	219745085	2886	22211758
chr2	219742188	219742199	FLI1	JASPAR	yes	219745085	2886	22211759
chr2	219742189	219742197	FEV	JASPAR	yes	219745085	2888	22211760
chr2	219742190	219742196	ETS1	JASPAR	yes	219745085	2889	22211761
chr2	219742190	219742196	SPI1	JASPAR	yes	219745085	2889	22211762
chr2	219742201	219742222	ZNF263	JASPAR	yes	219745085	2863	22211763
chr2	219742203	219742223	RREB1	JASPAR	yes	219745085	2862	22211764
chr2	219742206	219742218	ZBTB7C	JASPAR	yes	219745085	2867	22211765
chr2	219742206	219742227	ZNF263	JASPAR	yes	219745085	2858	22211766
chr2	219742207	219742227	RREB1	JASPAR	yes	219745085	2858	22211767
chr2	219742209	219742230	ZNF263	JASPAR	yes	219745085	2855	22211768
chr2	219742225	219742238	ZBTB18	JASPAR	yes	219745085	2847	22211769
chr2	219742226	219742238	NHLH1	JASPAR	yes	219745085	2847	22211770
chr2	219742227	219742237	MSC	JASPAR	yes	219745085	2848	22211771
chr2	219742235	219742250	TFAP2C	JASPAR	yes	219745085	2835	22211772
chr2	219742238	219742249	TFAP2A	JASPAR	yes	219745085	2836	22211773
chr2	219742238	219742249	TFAP2B	JASPAR	yes	219745085	2836	22211774
chr2	219742238	219742249	TFAP2C	JASPAR	yes	219745085	2836	22211775
chr2	219742251	219742262	FOSL2	JASPAR	yes	219745085	2823	22211776
chr2	219742255	219742261	YY1	JASPAR	yes	219745085	2824	22211777
chr2	219742260	219742279	CTCF	JASPAR	yes	219745085	2806	22211778
chr2	219742301	219742306	TFAP2A	TRANSFAC	yes	219745085	2779	22211779
chr2	219742301	219742307	MZF1	JASPAR	yes	219745085	2778	22211780
chr2	219742306	219742320	SPI1	JASPAR	yes	219745085	2765	22211781
chr2	219742310	219742320	ETV6	JASPAR	yes	219745085	2765	22211782
chr2	219742312	219742317	ETS2	TRANSFAC	yes	219745085	2768	22211783
chr2	219742318	219742324	TCF4	TRANSFAC	yes	219745085	2761	22211784
chr2	219742329	219742342	ZBTB18	JASPAR	yes	219745085	2743	22211785
chr2	219742348	219742361	ZBTB18	JASPAR	yes	219745085	2724	22211786
chr2	219742355	219742370	AR	JASPAR	yes	219745085	2715	22211787
chr2	219742361	219742366	SP1	TRANSFAC	yes	219745085	2719	22211788
chr2	219744348	219744369	ZNF263	JASPAR	yes	219745085	716	22211789
chr2	219744359	219744368	SNAI2	JASPAR	yes	219745085	717	22211790
chr2	219744359	219744369	TCF3	JASPAR	yes	219745085	716	22211791
chr2	219744359	219744369	TCF4	JASPAR	yes	219745085	716	22211792
chr2	219744361	219744370	ZEB1	JASPAR	yes	219745085	715	22211793
chr2	219744363	219744368	SP1	TRANSFAC	yes	219745085	717	22211794
chr2	219744363	219744378	RFX5	JASPAR	yes	219745085	707	22211795
chr2	219744366	219744371	SP1	TRANSFAC	yes	219745085	714	22211796
chr2	219744373	219744379	MAZ	TRANSFAC	yes	219745085	706	22211797
chr2	219744397	219744402	GATA1	TRANSFAC	yes	219745085	683	22211798
chr2	219744400	219744411	GCM1	JASPAR	yes	219745085	674	22211799
chr2	219744402	219744411	THAP1	JASPAR	yes	219745085	674	22211800
chr2	219744405	219744409	LFA1	TRANSFAC	yes	219745085	676	22211801
chr2	219744431	219744436	TFAP2A	TRANSFAC	yes	219745085	649	22211802
chr2	219749390	219749394	LFA1	TRANSFAC	yes	219745085	4305	81017382
chr2	219749397	219749401	YY1	TRANSFAC	yes	219745085	4312	81017383
chr2	219749447	219749463	ZNF143	JASPAR	yes	219745085	4362	81017384
chr2	219749466	219749484	ESR2	JASPAR	yes	219745085	4381	81017385
chr2	219749486	219749497	FLI1	JASPAR	yes	219745085	4401	81017386
chr2	219749488	219749495	SPI1	JASPAR	yes	219745085	4403	81017387
chr2	219749488	219749496	FEV	JASPAR	yes	219745085	4403	81017388
chr2	219749490	219749495	ETS2	TRANSFAC	yes	219745085	4405	81017389
chr2	219749533	219749549	GLIS1	JASPAR	yes	219745085	4448	81017390
chr2	219749534	219749548	GLIS2	JASPAR	yes	219745085	4449	81017391
chr2	219749534	219749548	GLIS3	JASPAR	yes	219745085	4449	81017392
chr2	219749542	219749557	ESR2	JASPAR	yes	219745085	4457	81017393
chr2	219749544	219749548	ESR1	TRANSFAC	yes	219745085	4459	81017394
chr2	219749544	219749555	USF1	JASPAR	yes	219745085	4459	81017395
chr2	219749545	219749555	SREBF1	JASPAR	yes	219745085	4460	81017396
chr2	219749545	219749555	SREBF2	JASPAR	yes	219745085	4460	81017397
chr2	219749545	219749555	TFEC	JASPAR	yes	219745085	4460	81017398
chr2	219749545	219749556	USF1	JASPAR	yes	219745085	4460	81017399
chr2	219749545	219749556	USF2	JASPAR	yes	219745085	4460	81017400
chr2	219749547	219749560	NR2F1	JASPAR	yes	219745085	4462	81017401
chr2	219749550	219749558	NR4A2	JASPAR	yes	219745085	4465	81017402
chr2	219749557	219749568	FLI1	JASPAR	yes	219745085	4472	81017403
chr2	219749630	219749638	ISL2	JASPAR	yes	219745085	4545	81017404
chr2	219749630	219749639	NKX3-2	JASPAR	yes	219745085	4545	81017405
chr2	219749635	219749646	FOXH1	JASPAR	yes	219745085	4550	81017406
chr2	219749636	219749642	ZNF354C	JASPAR	yes	219745085	4551	81017407
chr2	219749642	219749654	YY1	JASPAR	yes	219745085	4557	81017408
chr2	219749666	219749679	DUXA	JASPAR	yes	219745085	4581	81017409
chr2	219749666	219749681	NFYB	JASPAR	yes	219745085	4581	81017410
chr2	219749667	219749678	DUX4	JASPAR	yes	219745085	4582	81017411
chr2	219749668	219749673	NFY	TRANSFAC	yes	219745085	4583	81017412
chr2	219749675	219749695	PPARG	JASPAR	yes	219745085	4590	81017413
chr2	219749679	219749683	H4TF2	TRANSFAC	yes	219745085	4594	81017414
chr2	219749686	219749690	H4TF2	TRANSFAC	yes	219745085	4601	81017415
chr2	219749686	219749700	EBF1	JASPAR	yes	219745085	4601	81017416
chr2	219749688	219749699	EBF1	JASPAR	yes	219745085	4603	81017417
chr2	219749714	219749731	ZNF410	JASPAR	yes	219745085	4629	81017418
chr2	219749715	219749719	NFE	TRANSFAC	yes	219745085	4630	81017419
chr2	219749722	219749730	BARX1	JASPAR	yes	219745085	4637	81017420
chr2	219749730	219749741	TBX2	JASPAR	yes	219745085	4645	81017421
chr2	219749732	219749740	TBX15	JASPAR	yes	219745085	4647	81017422
chr2	219749732	219749740	TBX1	JASPAR	yes	219745085	4647	81017423
chr2	219749732	219749740	TBX4	JASPAR	yes	219745085	4647	81017424
chr2	219749732	219749740	TBX5	JASPAR	yes	219745085	4647	81017425
chr2	219749745	219749755	POU6F2	JASPAR	yes	219745085	4660	81017426
chr2	219749752	219749772	RREB1	JASPAR	yes	219745085	4667	81017427
chr2	219749775	219749796	ZNF263	JASPAR	yes	219745085	4690	81017428
chr2	219749782	219749788	MAZ	TRANSFAC	yes	219745085	4697	81017429
chr2	219749782	219749793	E2F6	JASPAR	yes	219745085	4697	81017430
chr2	219749807	219749816	NKX2-8	JASPAR	yes	219745085	4722	81017431
chr2	219749807	219749817	NKX2-3	JASPAR	yes	219745085	4722	81017432
chr2	219749829	219749840	NFE2	JASPAR	yes	219745085	4744	81017433
chr2	219749859	219749880	ZNF263	JASPAR	yes	219745085	4774	81017434
chr2	219749862	219749882	RREB1	JASPAR	yes	219745085	4777	81017435
chr2	219749865	219749879	PLAG1	JASPAR	yes	219745085	4780	81017436
chr2	219749869	219749890	ZNF263	JASPAR	yes	219745085	4784	81017437
chr2	219749899	219749909	SP1	JASPAR	yes	219745085	4814	81017438
chr2	219749912	219749917	SP1	TRANSFAC	yes	219745085	4827	81017439
chr2	219749916	219749930	EBF1	JASPAR	yes	219745085	4831	81017440
chr2	219749936	219749940	ESR1	TRANSFAC	yes	219745085	4851	81017441
chr2	219749952	219749958	MAZ	TRANSFAC	yes	219745085	4867	81017442
chr2	219749955	219749970	ESR2	JASPAR	yes	219745085	4870	81017443
chr2	219749956	219749960	LFA1	TRANSFAC	yes	219745085	4871	81017444
chr2	219749959	219749979	TP63	JASPAR	yes	219745085	4874	81017445
chr2	219749960	219749970	SP1	JASPAR	yes	219745085	4875	81017446
chr2	219750001	219750012	ESRRB	JASPAR	yes	219745085	4916	81017447
chr2	219750012	219750018	NFIC	JASPAR	yes	219745085	4927	81017448
chr2	219750014	219750018	H1TF2	TRANSFAC	yes	219745085	4929	81017449
chr2	219750014	219750018	NFE	TRANSFAC	yes	219745085	4929	81017450
chr2	219750014	219750018	SRF	TRANSFAC	yes	219745085	4929	81017451
chr2	219750064	219750085	REST	JASPAR	yes	219745085	4979	81017452
chr2	219750069	219750079	SP1	JASPAR	yes	219745085	4984	81017453
chr2	219750082	219750086	LFA1	TRANSFAC	yes	219745085	4997	81017454

Chrom.	Position	dbSNP ID	Reference Allele	Alternative Allele	Distance between TSS and SNP	Tissue	q Value	id
chr2	219269729	rs3770211	G	T	475356	Esophagus	0.315492	6368399
chr2	220624461	rs72965534	G	A	860158	Heart	0.0729242	6373918
chr2	218911816	rs73082342	T	A	833269	Heart	0.0811306	6366807
chr2	219711742	rs188275405	C	T	33343	Breast	0.117868	6369466
chr2	220300642	rs114709058	C	G	536339	Spleen	0.0612327	6371806
chr2	220150781	rs4432441	G	A	386478	Thyroid	0.105416	6371194
chr2	218867737	rs74270368	C	T	877348	Liver	0.445516	6366401

Genomic Location	chr2:219745085-219764303[+]
TSS	219745085
Gene Name	WNT10A
Ensembl ID	ENSG00000135925.4
ENTREZID	80326
Uniprot
Uniprot	Q9GZT5
Protein Name
	Protein Wnt
	Protein Wnt-10a

EnhancerDB

Enhancers that regulate WNT10A[ENSG00000135925.4]

Transcript facotrs that regulate WNT10A[ENSG00000135925.4]

SNPs associated with WNT10A[ENSG00000135925.4], confirmed by eQTL

Details of WNT10A[ENSG00000135925.4]

Expression levels of WNT10A[ENSG00000135925.4]